Raport de cercetare - Lorentz JÄNTSCHI

}
Procesarea informaţiei de interacţiune la nivelul fragmentului molecular este realizată prin
suprapunerea interacţiunilor pereche obţinute anterior folosind o serie de modele de suprapunere a
interacţiunilor; funcţiile implementate în clasa class_descriptor_3fragm.php implementează:
÷ 2 tipuri de suprapuneri vectoriale folosind drept reper sistemul de coordonate de referinţă al
moleculei (suprapuneri scalare pe proiecţiile axiale ale sistemului de coordonate folosit);
÷ 2 tipuri de suprapuneri vectoriale folosind drept reper un sistem de coordonate local al
fragmentului - calculat ca centru de proprietate - (suprapuneri scalare pe proiecţiile axiale ale
sistemului de coordonate folosit);
÷ 2 tipuri de suprapuneri scalare (ignorând orientarea vectorială şi folosind valoarea absolută) -
interacţiune de tip potenţial;
÷ 2 tipuri de selecţii ale valorilor maxime de interacţiune dintre interacţiunile existente în
fragment între perechi de atomi;
÷ 2 tipuri de selecţii ale valorilor minime de interacţiune dintre interacţiunile existente în fragment
între perechi de atomi;
class descriptor_fragment{
//versori
//descriptori de proprietate -> 1 proprietate, 1 distanta, 1 descriptor
//un fragment -> un fragment & un varf
//->metode de suprapunere
function __construct($vx){
$this->v=$vx;
$this->n=10;
$this->f=array();
}
function calculate($e,&$fr,&$s,&$v){
$this->spp_fr_field($e,$fr,$s,$v,0);/*f*/
$this->spp_vx_field($e,$fr,$s,$v,1);/*F*/
$this->spp_fr_prcen($e,$fr,$s,$v,2);/*c*/
$this->spp_vx_prcen($e,$fr,$s,$v,3);/*C*/
$this->spp_fr_poten($e,$fr,$s,$v,4);/*p*/
$this->spp_vx_poten($e,$fr,$s,$v,5);/*P*/
$this->spp_fr_maxfr($e,$fr,$s,$v,6);/*a*/
$this->spp_vx_maxvx($e,$fr,$s,$v,7);/*A*/
$this->spp_fr_minfr($e,$fr,$s,$v,8);/*i*/
$this->spp_vx_minvx($e,$fr,$s,$v,9);/*I*/
}
function spp_fr_field($e,&$fr,&$s,&$v,$a){
//suprapune proiectii axiale
//interactii in fragment, independente de varf
$this->n=count($fr);
$fr_f_x=0.0;
$fr_f_y=0.0;
$fr_f_z=0.0;
for($i=0;$in-1;$i++){
for($j=$i+1;$jn;$j++){
$val=$s[$fr[$i]][$fr[$j]][$e];
$fr_f_x+=$val*abs($v->val(0,$fr[$i],$fr[$j]));
$fr_f_y+=$val*abs($v->val(1,$fr[$i],$fr[$j]));
$fr_f_z+=$val*abs($v->val(2,$fr[$i],$fr[$j]));
}
}
$fr_f_t=pow(pow($fr_f_x,2)+pow($fr_f_y,2)+pow($fr_f_z,2),0.5);
if(!$fr_f_t) $fr_f_t=1.0;
$fr_f_x/=$fr_f_t;
$fr_f_y/=$fr_f_t;
$fr_f_z/=$fr_f_t;
$this->f[$a]=array($fr_f_t,$fr_f_x,$fr_f_y,$fr_f_z);
}
function spp_vx_field($e,&$fr,&$s,&$v,$a){
//suprapune proiectii axiale
//interactii ale fragmentului cu varful
$fr_f_x=0.0;
$fr_f_y=0.0;
$fr_f_z=0.0;
for($i=0;$in;$i++){
$val=$s[$this->v][$fr[$i]][$e];
$fr_f_x+=$val*$v->val(0,$this->v,$fr[$i]);
$fr_f_y+=$val*$v->val(1,$this->v,$fr[$i]);
$fr_f_z+=$val*$v->val(2,$this->v,$fr[$i]);
}
184