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海 大 漁 推 39
定 工 作 不 再 遙 不 可 及 , 主 要 原
因 是 自 DNA 定 序 結 果 所 推 演
建 立 的 大 量 蛋 白 質 序 列 資 料 庫
可 供 查 詢 比 對 。 例 如 進 行 人
類 、 大 腸 桿 菌 或 酵 母 菌 的 研 究
時 , 這 些 生 物 的 DNA 已 完 整 定
序 , 且 得 到 相 對 應 的 蛋 白 質 序
列 。 這 時 相 關 的 蛋 白 質 部 分 鑑
定 僅 需 進 行 序 列 比 對 工 作 , 而
不 用 逐 一 地 進 行 蛋 白 質 定 序 實
驗 。 網 路 資 料 庫 中 有 許 多 參 數
可 供 使 用 , 包 含 蛋 白 質 的 分 子
量 、 等 電 點 、 電 荷 數 、 胺 基 酸
組 成 、 胜 肽 片 段 分 子 量 資 料 、N
端 或 C 端 的 標 示 序 列 等 。
鑑 定 水 產 品 來 源 物 種
搜 尋 硬 骨 魚 類 的 相 關 蛋 白
台 灣 產 主 要 有 毒 和 無 毒 河 魨 魚 種 的 蛋 白 質
二 維 電 泳 圖 上 排 左 邊 是 實 驗 原 圖 , 右 邊 是 電
腦 程 式 模 擬 圖 ,A 是 指 肌 動 蛋 白 ,TM 是 指 原 肌
蛋 白 。 中 排 及 下 排 4 張 是 電 腦 模 擬 圖 , 從 圖 中
得 知 酸 性 低 分 子 量 蛋 白 質 具 有 河 魨 種 別 特 異
性 。
質 序 列 資 料 庫 可 找 到 約 23,000 條 胺 基 酸 序 列 , 相 對 地 核 苷 酸 序 列
卻 可 找 到 約 610,000 條 。 由 此 可 知 在 硬 骨 魚 類 已 知 的 核 苷 酸 序 列
中 , 相 對 應 的 蛋 白 質 序 列 僅 有 約 4% 被 了 解 。 直 至 目 前 , 以 蛋 白 質
體 鑑 定 水 產 品 來 源 物 種 或 相 關 功 能 性 蛋 白 質 , 仍 是 水 產 學 界 努 力
的 目 標 。
目 前 最 常 做 為 魚 種 鑑 定 的 蛋 白 質 標 誌 , 是 輕 鏈 肌 凝 蛋 白 和 魚
類 主 要 過 敏 原 , 它 們 都 是 小 分 子 量 的 蛋 白 質 , 在 不 同 魚 種 中 有 多
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