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rechts: weißer Kreis) überein. Die beiden mit je 15 Basenpaaren kleinsten Fragmente fehlen
hier. Der Vergleich mit den Schnittfragmenten der drei nahverwandten Pseudomonaden zeigt
große Unterschiede in der Anzahl und Länge der Fragmente. Im Falle der mit MboI verdauten
16S rDNAs der beiden Endosymbionten konnten im Vergleich zum virtuellen Schnittmuster
zwei zusätzliche Schnittfragmente (je ca. 300 Basenpaare) erhalten werden (siehe Abb. 57 C,
unten rechts: schwarze Kreise). Die mit 7, 12 und 24 Basenpaaren kleinsten Fragmente
fehlen. Ein großer Unterschied in Anzahl und Größe der Schnittfragmente zum Schnittmuster
von Pseudomonas aeruginosa, P. fluorescens und P. putida ist hier ebenfalls deutlich zu
erkennen. Auch für die mit RsaI verdauten 16S rDNAs der beiden Endosymbionten konnte
ein zusätzliches Schnittfragment (ca. 900 Basenpaare) im Falle des Symbionten von Paederus
sabeus (siehe Abb. 57 D, unten rechts: weißer Kreis) erhalten werden. Ein sichtbarer
Unterschied zum Schnittmuster der drei verwandten Pseudomonaden geht jedoch mit
Ausnahme des Schnittmusters von Pseudomonas fluorescens nur aus dem Vergleich mit den
virtuell erhaltenen Fragmentlängen hervor.
Sequenz Fragmente Fragmentgröße
Endosymb. P. riparius/P. sabeus 8 15 - 86 - 104 - 125 - 145 - 296 - 340 - 389
Pseudomonas aeruginosa 8 2 - 50 - 104 - 125 - 276 - 288 - 295 - 396
Pseudomonas fluorescens 9 2 - 15 - 50 - 87 - 125 - 173 - 296 - 387 - 392
Pseudomonas putida 9 2 - 15 - 50 - 87 - 125 - 173 - 296 - 387 - 392
M
M
rip
sab aer flu
put
Restriktionsenzym: Bsh1236I
Abb. 57 B: Mit Bsh1236I virtuell erzeugte Schnittmuster der 16S rDNAs der beiden Endosymbionten
von Paederus riparius und P. sabeus, Pseudomonas aeruginosa, P. fluorescens und P. putida mit Angabe
der Fragmentgrößen (oben und unten links) im Vergleich mit den in vitro erhaltenen Fragmenten der
verdauten 16s rDNAs auf einem 2%igen Agarosegel (unten rechts). M (Marker): 100bp-DNA-Leiter
(von oben nach unten in bp: 1031, 900-100 in 100er Schritten, 80). Die einzelnen Bahnen des Gels sind
mit Abkürzungen der jeweiligen Organismen beschriftet, von denen die 16S rDNA isoliert wurde (rip:
16s rDNA des Endosymbionten von Paederus riparius; sab: von Paederus sabeus; aer: 16s rDNA von
Pseudomonas aeruginosa; flu: von Pseudomonas fluorescens; put: von Pseudomonas putida). Ein
zusätzlich erhaltenes Fragment wurde mit einem weißen Kreis umrandet.