Isolierung und Charakterisierung von Bakterien aus ...

Kapitel 4
Mit Hilfe der Software antiSMASH konnte ein Siderophor Gencluster detektiert wer-
den. Ebenfalls fanden sich Hinweise auf die Existenz von Genclustern für nicht näher
annotierte PKS I, Enterocin (PKS II) und PKS III (Tabelle 28). Die Anzahl der vorhan-
denen Gencluster kann nur bestimmt werden, wenn das gesamte Genom sequenziert
wurde.
Tabelle 28: Mit antiSMASH identifizierte NRPS- und PKS-Gencluster. n. d.: nicht identifiziert
Contig Cluster Blastx
Similarität
(%)
nächster Verwandter AS Accession Nr.
1743 NRPS NRPS 61 Streptomyces cattleya
NRRL 8057
761 YP_004915251.1
2371 NPRS Ferritin (Siderophor) 92 Streptomyces ghanaensis
ATCC 14672
574 ZP_06582124.1
993 PKS I modulare PKS I 90 Streptomyces ghanaensis
ATCC 14672
843 ZP_06582131.1
1734 PKS III Dihydroxyphenylacetat
Synthase
77 Streptomyces sp. Tu6071 204 ZP_08451720.1
NRPS Siderophor 100 Streptomyces albus J1074 275 ZP_06590081.1
PKS Germacradienol/
Germacrene D
99 Streptomyces sp. S4 907 ZP_09181893.1
990 PKS II Enterocin B 95 Streptomyces maritimus 252 AAF81729.1
PKS II Enterocin A 97 Streptomyces maritimus 362 AAF81728.1
Bei dem Sequenzvergleich mit dem Tool Blastx und der non-redundanten Protein-
Datenbank von NCBI fanden sich weitere Sequenzabschnitte die für NRPS Produkte
wie Gramicidin, Surfactin, Actinomycin, Enterocin, Tyrocidin, Thaxtomin und Entero-
bactin codieren. Diese Sequenzabschnitte sind zum Teil sehr kurz (