Isolierung und Charakterisierung von Bakterien aus ...

Kapitel 1
des Phyla Firmicutes dominant vertreten und die gewonnen Arten aus dieser Gattung
unterschieden sich nicht zwischen den beiden Behandlungen (Tabelle 12).
Die Zugehörigkeit der Isolate zum nächst verwandten Typstamm erfolgte bei einer Si-
milarität ≥97 % (Stackebrandt and Goebel, 1994).
Tabelle 12: Phylogenetische Zuordnung der Bakterien-Isolate aus den Sedimentproben.
ohne Vorbehandlung
durch Hitzetrocknung
mit Vorbehandlung
durch Hitzetrocknung
Phyla Gattungen Anzahl Arten (Isolate) Anzahl Arten (Isolate)
Actinobacteria Streptomyces 3 (7) -
Dietzia 1 (1) -
Agrococcus 1 (2) 1 (1)
Demetria 1 (1) -
Rhodococcus 1 (1) -
Micromonospora 1 (1) -
Nocardioides 1 (1) -
Knoellia 1 (1) -
Microbacter 1 (2) -
Salinibacter 1 (1) -
Microterricola 1 (1) -
Kocuria - 1 (2)
Micrococcus - 1 (1)
Alphaproteobacteria Erythrobacter 1 (1) -
Hyphomonas 1 (1) -
Paracoccus 3 (4) 1 (1)
Rhodobacter 2 (2) -
Sphingomonas 1 (1) -
Thalassiospira 1 (1) -
Hoeflea 1 (1) -
Firmicutes Bacillus 30 (172) 20 (110)
Halobacillus 1 (1) 1 (1)
Paenibacillus 3 (5) -
Planococcus 1 (1) -
Terribacillus 1 (4) -
Staphylococcus 2 (6) 2 (3)
Salinicoccus 1 (1) -
Flavobacteria Maribacter 1 (1) -
Gammaproteobacteria Cobetia 1 (1) -
Halomonas 1 (3) -
Microbulbifer 1 (1) -
Shewanella 1 (2) -
Vibrio 1 (1) -
Gesamt 69 (229) 28 (119)
Dieser Pool an marinen Bakterien wurde für die Suche nach neuen Sekundärmetaboliten
genutzt. Zunächst wurden molekularbiologische Untersuchungen zum Nachweis von
Genclustern wie NRPS und PKS bei allen Isolaten durchgeführt. Die biologischen Ak-
tivitäten von 304 Extrakten wurden mit Hilfe eines Testpanels von Gram-positiven und
Gram-negativen Bakterien sowie einer Hefe festgestellt. Eine chromato-
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