Isolierung und Charakterisierung von Bakterien aus ...

V Material und Methoden
Material und Methoden
V.1 Probennahme der Sedimente
Die Grundlage für die Isolierung von Vertretern möglichst vieler verschiedener Bakteri-
en-Taxa bildeten Sedimentproben aus unterschiedlichen Meeresgebieten. Die Proben
wurden zwischen 1998 und 2010 auf Forschungsfahrten und Tauchgängen genommen
(Tabelle 2). Die Expeditionen zu elf marinen Gebieten für die Probenahme wurden von
den Forschungsschiffen des Geomar│Helmholtz-Zentrum für Ozeanforschung (Kiel)
und der Universität Hamburg durchgeführt und umfassten alle Weltmeere außer dem
Pazifik. Von den elf Expeditionen wurden Proben aus 18 unterschiedlichen Stationen
für die Kultivierung von Bakterien ausgewählt. Darunter sind acht Stationen mit Pro-
benstandorten tiefer als 1000 m. Unter den insgesamt 29 Proben sind 21 Sedimentpro-
ben, eine Probe von der Oberfläche eines Probenahmegerätes (T-Logger) und eine
Muschelfuss-Probe (Tabelle 2). Auf den Forschungsschiffen wurden folgende Geräte
für die Sedimentprobenahme verwendet: Multicorer, Schwerelot, TV-Greifer, Remote
Operate Vehicle und Gravity Corer. Die Proben wurden in sterile Gefäße überführt und
bis zur weiteren Bearbeitung bei -20 °C (Probennahme vor 2007) bzw. 4 °C (Proben-
nahme 2007-2010) gelagert.
Die Isolierung von Sediment-assoziierten Bakterien war schon häufig erfolgreich und
ist ein vielversprechender Ansatz um Bakterien für die Wirkstoffproduktion zu gewin-
nen. Einige Wirkstoffe aus marine Bakterien aus dem Atlantik, der Ostsee, der Nordsee
dem Mittelmeer, dem Indischen Ozean und dem Atlantik sind isoliert und identifiziert
worden (Abdel-Mageed et al., 2010; Bister et al., 2004; Gärtner et al., 2011a; Hawas et
al., 2009; Hughes et al., 2009b; Mitova et al., 2008; Romero et al., 1997). Aus Sedi-
ment-assoziierten Bakterien aus dem Bereich der Arktis und Antarktis sind nach unse-
rem Wissen noch keine Wirkstoffe identifiziert worden. Aber auch die Sedimente, aus
denen schon Wirkstoffe isoliert worden sind, haben ein noch nicht abzuschätzendes
Potential von neuen Bakterien, die unbekannte Substanzen produzieren können. Daher
ist die Isolierung von marinen Sediment-Bakterien auch weiterhin ein aussichtsreicher
Ansatz, um neue Wirkstoffe zu isolieren.
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