Tema 1: Aminoácidos y proteínas

Bioquímica
Fuerzas intermoleculares
Puentes de hidrógeno Interacciones que se producen entre grupos OH y otros grupos
como NH.
Fuerzas de Van der Waals Son interacciones intermoleculares entre átomos no cargados.
Se trata pues de fuerzas electrostáticas transitorias, que pueden
ser tanto atractivas como repulsivas, y sólo afectan a distancias
de entre 3 y 4 Å.
Fuerzas hidrofóbicas Tendencia de las cadenas no polares a replegarse hacia el
interior de la proteína.
Fuerzas electrostáticas Interacciones entre cargas: F= (Q x Q´) / d 2
Puentes de disulfuro
- Conformación β
- La cadena polipeptídica se extiende a lo largo de un eje, con las amidas y los carbonilos
situados de manera casi perpendicular al eje de la cadena polipeptídica y en posición
trans.
- Se formarán pues puentes de hidrógeno intercatenarios entre las distintas cadenas.
- Todos los enlaces peptídicos intervienen en la formación de estos enlaces.
- La estructura resultante recibe el nombre de lámina β o lámina plegada, de la que
existen 2 tipos distintos:
- Antiparalelo:
- Las cadenas polipeptídicas van en dirección contraria.
- φ: -129º
- ϕ: +125º
- Los Cα se sitúan en las aristas, habiendo 3,5Å de separación entre Cα
contiguos.
- En los planos de la lámina β están los puentes de H y los enlaces peptídicos.
- Las cadenas laterales se sitúan hacia delante y hacia atrás de la lámina.
- Paralelo:
- Está más plegada de manera que sólo hay 3,25 Å de separación entre los
carbonos contiguos.
- φ: -119º
- ϕ: +113º
- La cadena antiparalela es más estable, porque sus puentes de hidrógeno están situados
de manera más perpendicular al eje de la lámina.
- En la lámina β no se producen puentes disulfuro transversales.
- Puede ocurrir que la lámina β se pliegue dando como resultado el giro revertido o giro
en horquilla o giro β.
- Existen estructuras superiores que no tienen sólo carácter estructural, sino también
funcional; se las conoce como estructuras supersecundarias.
- Se tiende siempre a esconder las cadenas laterales hidrofóbicas.
- Estructura del colágeno
- Es una proteína fibrosa que encontramos en el tejido conjuntivo.
- Forma aproximadamente el 75 % del total de proteínas del organismo.
- Aunque suele formar fibrillas, su forma concreta de pende de la función del tejido.
- Por ebullición del colágeno se obtiene una mezcla peptídica, cuya composición viene a
ser:
- 35 % Gly
- 12 % Pro
- 11 % Ala
- 9 % HOPro (Hidroxiprolina)
- Por difracción de rayos X se observa que no presenta ni hélice α ni lámina β.
- El tropocolágeno está unido por un puente covalente de deshidroxinorleucina.
- Al observar con detenimiento la molécula de tropocolágeno encontramos que se trata de
un superhélice de 3 hélices.
Tema 1: Aminoácidos y proteínas
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