Thèse Mfegue - Montpellier SupAgro

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Figure 10. Principaux points d’échantillonnage au Cameroun. En vert : souches anciennes ; en rose et violet : prospection 2008 ; en jaune : prospection 2009 Lors des prospections en 2009 nous avons mis un accent particulier sur les 2 zones d’implantation des premières plantations cacaoyères au Cameroun : la zone refuge à Sterculiacées autour du Mont Cameroun (Fako) et l’axe Bipindi-Lolodorf. Dans ces 2 aires d’origine potentielles de P. megakarya, l’échantillonnage s’est fait dans des parcelles distantes d’environ 10 km. Pour les prospections de 2008 et 2009, pour chaque point d’échantillonnage, nous avons noté le nom du village ou lieu-dit, l’âge de la plantation et son état phytosanitaire, les coordonnées GPS et l’altitude de la parcelle. Nous avons ensuite prélevé 5 fruits malades sur des arbres distincts. L’agent pathogène a ensuite été isolé dans le laboratoire de Phytopathologie de l’IRAD Nkolbisson et purifié au CIRAD-BGPI. L’annexe 2 présente les milieux utilisés pour l’isolement et la purification des isolats. Au terme de ce processus, nous avons retenu 2 isolats par point d’échantillonnage pour notre étude. La figure 11 représente les schémas de prospection au Cameroun, ainsi que les points précis d’échantillonnage dans les zones Bipindi-Lolodorf et Mont-Cameroun. 50
Figure 11. Schémas des prospections au Cameroun et points d’échantillonnage sur l’axe Bipindi-Lolodorf Lolodorf et la zone du Mont Mont-Cameroun. Points d'échantillonnage (en vert : souches anciennes ; en rose et violet : prospection 2008 ; en jaune : prospection 2009). Zones des premières plantations cacaoyères. Nous avons également inclus nclus dans cette étude 25 autres Phytophthora (23 P. palmivora et 2 P. capsici) ) isolés sur cacaoyer dans différents pays (Cameroun, Ghana, Côte d’Ivoire, Sao Sao- Tomé, Guyane, Trinidad, Jamaïque, République Dominicaine, Cuba, Guatemala, Equateur, Colombie, Malaisie, aisie, Indonésie ; Annexe 1), afin de tester la spécificité pécificité des marqueurs microsatellites que nous avons développés. 51
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