Vankomisine Dirençli Enterokoklar (VRE) - EKMUD
Vankomisine Dirençli Enterokoklar (VRE) - EKMUD
Vankomisine Dirençli Enterokoklar (VRE) - EKMUD
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
Viral Enfeksiyonlarda Direnç:<br />
HIV<br />
ması; dezavantajı ise baskın varyantları (%20-25<br />
üzerindeki mutasyonları saptayabilmesi), pek<br />
çok mutasyonun henüz klinik öneminin belirli<br />
olmaması ve her zaman fenotiple uyumlu olmaması<br />
sayılabilir.<br />
Fenotipik direnç testlerinde HIV’ın revers<br />
transkriptaz ve proteaz bölgeleri amplifiye edildikten<br />
sonra, bir rekombinant HIV vektörüne<br />
sokulur. Hücre kültüründe, test edilecek ilacın<br />
varlığında bu tasarımın ve yabanil tipteki virüsün<br />
üremesini inhibe eden ilaç konsantrasyonu<br />
belirlenir. Sonuç genellikle virüsün %50 (IC50 )<br />
ya da %90 (IC90 )’ını inhibe eden konsantrasyon<br />
şeklinde ifade edilir. IC ya da IC , bir sınır-de-<br />
50 90<br />
ğer (cut-off) ile karşılaştırılarak sonuç, standart<br />
yabanil tipteki kökenin değerinin katları şeklinde<br />
belirtilir. Bu bağlamda farklı sınır değerler<br />
kullanılmaktadır: Piyasada çeşitli ticari fenotipik<br />
test sistemleri bulunmaktadır: Antivirogram ®<br />
(Tibotec-Virco), Pheno Sense ® (Monogram Biosciences)<br />
ve Phenoscript ® (Viralliance).<br />
Genotipik direnç testlerinde ilaç direnci ile<br />
bağlantılı mutasyonlar belirlenir. Genellikle proteaz<br />
bölgesinin tamamı ile revers transkriptaz<br />
bölgesinin ilk 236 aminoasitlik kısmı çoğaltılır.<br />
Genotipik test sonuçlarının güvenilirliği açısından<br />
viral yükün 1000 kopya/mL’nin üzerinde olması<br />
gerekir. Dirençle ilişkili mutasyonlar 2 farklı<br />
yöntemle saptanabilir.<br />
DNA dizi analizi, en yaygın kullanılan yöntemdir.<br />
Test örneğinin (plazma) tedavi altında<br />
olan ve tedavi başarısızlığı düşünülen hastalarda,<br />
mümkün olduğunca henüz tedavi altında iken;<br />
primer infeksiyonlularda da tedavi başlanmayacaksa<br />
bile olabildiğince erken dönemde alınması<br />
önerilmektedir. Dizi analizinin en önemli teknik<br />
kısıtlılıklarından biri, toplam virüs popülasyonu<br />
içinde %20-25’ten düşük bir oranda bulunan<br />
varyantların saptanmasıdır. Klonal dizi analizi<br />
ancak araştırma amaçlı olarak yapılmaktadır.<br />
Pek çok laboratuvarda, ekonomik oluşu nedeniyle<br />
“home-made” yöntemle yapılmaya devam<br />
etmektedir. Ancak ticari kitler ve bunların çoğunun<br />
kendine özel değerlendirme programları da<br />
bulunmaktadır. Ticari genotipik direnç testleri<br />
ViroSeqTM (Celera Diagnostics/Abbott Laboratories),<br />
HIV-1 TrugeneTM (Bayer Healthcare/Siemens<br />
Diagnostics), Virco Type HIV-1 (Virco),<br />
GenoSure (plus) TM (LabCorp) ve GeneSeq TM<br />
(Monogram Biosciences)’dir.<br />
92<br />
Hibridizasyona dayalı yöntemler DNA çip teknolojisine<br />
dayalıdır. Çoğaltılan virüs genomu üzerinde<br />
farklı mutasyonları içeren çok sayıda probların<br />
bulunduğu minyatürize (çip) bir sistemle incelenir.<br />
Eğer ilgili mutasyon varsa, polimeraz zincir<br />
reaksiyonu ürünü probla hibridize olur.<br />
Çok sayıdaki çalışmaya rağmen genotipik ve<br />
fenotipik ilaç direnç testlerinin yorumlanması<br />
gerçekten deneyim gerektiren yöntemlerdir. Genotipik<br />
ilaç testleri önceden tanımlanmış direnç<br />
listelerini ya da komputerize kurala dayalı algoritmlere<br />
göre yapılmış sınıflamaları kullanır ve<br />
virüsleri her bir ilaca karşı duyarlı, muhtemel dirençli<br />
ya da dirençli olarak bildirirler. Algoritmlerin<br />
sıklıkla güncellenmesi gerekir.<br />
Genotipik ve fenotipik testlerin minör varyantları<br />
saptamada duyarlılıkları azdır (dirençli<br />
mutantlar virüs popülasyonunun en az %25-<br />
30’unu oluşturmalıdır). İlaç direnci taşıyan minör<br />
varyantların rolünü araştırmada özel “real-time”<br />
polimeraz zincir reaksiyonu ve dizi analizi<br />
yöntemleri de kullanılmaktadır. Direnç testinin<br />
önerildiği durumlar: Tedaviye başlamadan önce,<br />
primer (akut ve erken) infeksiyonda, kronik HIV-<br />
1 enfeksiyonunda; tedavi altındaki hastalarda tedavi<br />
başarısızlığı söz konusu olduğunda ve gebelerde.<br />
Tedavi altındaki hastada tedavi başarısızlığı<br />
söz konusu olduğunda testin kişi tedavi altında<br />
iken yapılması halinde sonuçlar en güvenilirdir.<br />
Genotipik testlerin uygulanabilmesi için viral yükün<br />
en az 500-1500 kopya/mL HIV-1 RNA olması<br />
gerekir.<br />
KAYNAKLAR<br />
1. Hirsch MS, Gunthard H, Schapiro JM, et al. Antiretroviral<br />
Drug Resistance Testing in Adult HIV-1 Infection:<br />
2008 Recommendations of an International AIDS Society-USA<br />
Panel. Clin Infect Dis 2008;47:266-85.<br />
2. Johnson VA, Brun-Vézinet F, Clotet B, et al. Update of<br />
the Drug Resistance Mutations in HIV-1: December<br />
2008. Topics in HIV Medicine 2008;16:138-45.<br />
3. Griffith BP, Campbell S, Mayo DR. Human immunodeficiency<br />
viruses. In: Murray PR, Baron EJ, Jorgsen EJ,<br />
Landry ML, Pfaller M (eds). Manual of Clinical Microbiology.<br />
9 th ed. 2007:1308-29.<br />
4. Yilmaz G, Midilli K. Retrovirüs ailesi. Topçu AW, Söyletir<br />
G, Doğanay M (editörler). Enfeksiyon Hastalıkları ve Mikrobiyolojisi<br />
2008:1841-70.<br />
2. TÜRKİYE <strong>EKMUD</strong> Bilimsel Platformu 2009
Change language