Echerichia coli kasvu heterogeensus ja toksiin-antitoksiini süsteemid

seisukoht on, et aminohappenälja tingimustes inhibeeritakse bakteri kasv (prokarüoot jääb ellu).Persistorite mudelist oli juttu eespool.Välja on pakutud ka mudeleid, kus TA süsteemid aitavad peremeesorganismi temaregulatoorsetest süsteemidest osa võtmata. Sõltuvuse vastase mudeli kohaselt võivadkromosomaalsed TA süsteemid aidata enda peremeestel toime tulla plasmiidides asuvate TAsüsteemide põhjustatud postsegregatsioonilise raku tapmisega (Saavedra jt., 2008).Stabilisatsiooni mudeli järgi aitavad TA süsteemid ära hoida teiste, nendega samas superintegronisasuvate raku jaoks ohverdatavate, kuid kasu toovate geenide (näiteks antibiootikumideresistentsusgeenide) deletsioone (Rowe-Magnus jt., 2003).1.2.2. Toksiin-antitoksiin süsteemide jaotusTüüp II antitoksiinid jaotuvad hetkel aminohapete homoloogiale tuginedes üheksasse perekonda,millest kaheksa on kahekomponentsed ja üks on kolmekomponentne (Tabel 1.). Kõigi üheksaperekonna esindajaid on leitud nii plasmiididest kui ka kromosoomidest (Gerdes, 2000; Pandey jaGerdes, 2005). Kuna toksilisus on ebamäärane parameeter ja paljude valkude üleekspressioon onrakkude kasvule kahjulik, tuleb olla eriti hoolikas mingite valgupaaride liigitamisel TAsüsteemideks. Näiteks replikatsioonifaktori DnaC ületootmine on rakule toksiline kui temapartnervalku DnaB-d samuti samal ajal üle ei toodeta. See näitab, et DnaC ja DnaB suhe on tähtisoptimaalse replikatsiooni saavutamiseks ja DnaC poolse inhibitsiooni vältimiseks (Allen jaKornberg, 1991). Kuna need valgud peavad toksilise efekti saavutamiseks ületoodetud olema janende geenidel puudub homoloogia teiste TA geenidega, siis selliseid valgupaare ei loeta toksiinantitoksiinsüsteemideks.Tabel 1. TA perekonnad ja nende mõjutatavad protsessid. Täiendatud (Gerdes, 2005; Van Melderen,2009).TAperekondAntitoksiin Toksiin Toksiini sihtmärk Aktiivsus Mõjutatavrakuprotsessccd CcdA CcdB DNA güraas Tekitab kaksikahelalisi Replikatsioonkatkeid DNA-srelBE RelB RelE Transleeriv ribosoom Indutseerib mRNA TranslatsioonlõikamistparDE ParD ParE DNA güraas Tekitab kaksikahelalisi Replikatsioon14