Echerichia coli kasvu heterogeensus ja toksiin-antitoksiini süsteemid
Echerichia coli kasvu heterogeensus ja toksiin-antitoksiini süsteemid
Echerichia coli kasvu heterogeensus ja toksiin-antitoksiini süsteemid
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
SissejuhatusMaailm, mida bakterid <strong>ja</strong> teised mikroorganismid asustavad, on nende <strong>ja</strong>oks ohtlik paik. Needpisikesed organismid peavad toime tulema pidevalt muutuvas keskkonnas, mille temperatuur,soolsus, pH <strong>ja</strong> toitainete hulk kogu aeg varieeruvad. Lisaks ohustavad prokarüoote kaümbritsevas keskkonnas leiduvad antibiootikumid, bakteriofaagid, mutageenid, <strong>toksiin</strong>id,radiatsioon <strong>ja</strong> paljud teised ohtlikud ained <strong>ja</strong> tingimused. Vaenulikus <strong>ja</strong> pidevalt muutuvaskeskkonnas ellujäämiseks on bakteritel väl<strong>ja</strong> kujunenud mitmed strateegiad. Üheks strateegiakson stressivastus, mille puhul aktiveeritakse vastusena keskkonnastiimulile va<strong>ja</strong>likud geenid (Storz<strong>ja</strong> Hengge-Aronis, 2000). Teine viis, mis aitab bakteritel erinevate stressiolukordadega kohaneda,on kultuuris eksisteeriv fenotüübiline varieeruvus. Selle näideteks on Bacillus subtilissporulatsioon, kannibalism <strong>ja</strong> geneetiline kompetentsus ning Escherichia <strong>coli</strong> antibiootikumideletolerantsed persistorrakud (Dubnau. D <strong>ja</strong> Losick. R, 2006). Bakteripopulatsioonis leiduvaderinevad stressitolerantsed rakud võivad olla olulised uute keskkondade koloniseerimisel,kliinilisite probleemide pikaa<strong>ja</strong>lisel püsimisel <strong>ja</strong> toiduainete saastamisel (Humpheson jt., 1988;Niven <strong>ja</strong> Mulholland, 1998; Pascual jt., 2001; Robinson jt., 2001; Vidal-Mas jt., 2001).Bakterite fenotüübiline varieeruvuse uurimine on oluline nii nende füsioloogia mõistmise kui kaselle meditsiinilise <strong>ja</strong> toidutööstusliku tähtsuse pärast. Käesolev bakalaureusetöö keskendub<strong>toksiin</strong>-anti<strong>toksiin</strong> süsteemide <strong>ja</strong> fenotüübilise varieeruvuse seoste uurimisele. Kir<strong>ja</strong>nduse osasantakse ülevaade bakteripopulatsioonis esinevatest fenotüübilise <strong>heterogeensus</strong>e vormidest <strong>ja</strong>nende saavutamise mehhanismidest. Seletatakse ka lahti, mis on <strong>toksiin</strong>-anti<strong>toksiin</strong> süsteemid <strong>ja</strong>kirjeldatakse nende põhilisi vorme. Eksperimentaalse osa eesmärk oli uurida bakterite <strong>kasvu</strong><strong>heterogeensus</strong>t erinevates füsioloogilistes tingimustes, kasutades mudelorganismina E. <strong>coli</strong>t.Suurema tähelepanu alla võeti <strong>toksiin</strong>-anti<strong>toksiin</strong> süsteemide roll bakterite <strong>ja</strong>guneva <strong>ja</strong>mitte<strong>ja</strong>guneva populatsiooni tekkimisel.4