Echerichia coli kasvu heterogeensus ja toksiin-antitoksiini süsteemid

TA süsteemi valkude sünteesi (0 min). Peale seda valgusünteesi induktor eemaldati ja rakke kasvatati edasi 37°Cjuures. Rakkude jagunemise jälgimine toimus GFP lahjenemise järgi: mida vähem rakud GFP-d sisaldavad, sedarohkem jagunemisi on nad peale GFP sünteesi induktori eemaldamist läbi teinud. Histogrammide kohal on märgitudüleekspresseeritud TA süsteemi toksiini nimi punasega ja TA toksiinide alla mittekuuluva valgu nimi rohelisega. AJigaon tähistatud aeglaselt jagunev, KJ-iga kiiresti jagunev, MJ-iga mitte jagunev ja J-iga jagunev populatsioon.Mustaga on tähistatud 0 min ajapunkt, sinisega 90 min ajapunkt ja oranžiga 150 min ajapunkt.Joonis 9. Toksiinide (märgitud punasega) RelE ja YafQ ning chaperoni (märgitud rohelisega) DnaJ üleekspressioonimõju raku kasvule vaadelduna ühe raku tasemel dotblotina. GFP-d sisaldavates rakkudes indutseeriti tund aega TAsüsteemi toksiinide või mitte TA süsteemi valkude sünteesi (0 min). Peale seda valgusünteesi induktor eemaldati jarakke kasvatati edasi 37°C juures. Rakkude jagunemise jälgimine toimus GFP lahjenemise järgi: mida vähemrakud GFP-d sisaldavad, seda rohkem jagunemisi on nad peale GFP sünteesi induktori eemaldamist läbi teinud. AJigaon tähistatud aeglaselt jagunev, KJ-iga kiiresti jagunev, MJ-iga mitte jagunev ja J-iga jagunev populatsioon.2.2.4. relBE ei mõjuta bakterite jagunemisvõimet statsionaarsest faasistväljudes.Peale statsionaarse faasi bakterite värskesse söötmesse viimist ei hakka kõik bakterid korragakasvama. Suur osa neist jääb mittejegunevaks (Joers jt., 2010; Roostalu jt., 2008). Sellemittejaguneva alampopulatsiooni hulka kuuluvad persistorid. On näidatud, et sellesmittejagunevas alampopulatsioonis on TA geenide, sealhulgas relBE transkriptsioonindutseeritud (viitab toksiinide aktivatsioonile) (Keren jt., 2004; Shah jt., 2006). Katseeesmärgiks oli võrrelda üksikraku tasemel metsiktüübi (MT) ja ∆relBE kasvamahakkamist30