A Figurer og tabeller til Kapitel 3 - dirac - Roskilde Universitet

3.9 Geometriske overvejelser 45Tallene for systemet ved 330 K ser dog lidt mærkelige ud. I den inderstedel af membranen bliver A ⋆ ikke større ved tilsætning af hexanol.Dette virker kontraintuitivt.Patra et al. har med MD-simuleringer undersøgt betydningen af ethanolog methanol i phospholipidmembraner [43, 63]. Ved tilsætning afalkoholer ses en forøgelses af arealet, større uorden og lavere densitet iacylkæderne. Denne antikorrelation mellem ordenen og arealet ses tydeligti DMPC/hexanol systemet, se tabel 3.4. I toppen af membranen sesen reduktion af arealet og en forøgelse af ordenen af fedtsyrekæderne,mens der i bunden ses en forøgelse af arealet og større uorden af fedtsyrekæderne.I Kapitel 5 findes nogle afsluttende bemærkninger, hvor resultaternefra simuleringerne diskuteres i et større perspektiv.3.9.1 Kommentarer til kraftfeltetMed det kraftfelt der benyttes er pakningen i den latterale retning forstor. For den rene membran findes et areal der er for lille med 59.6−53.1 / 59.6 =11% (afsnit 3.3). Omregnet til en afvigelse på en længde findes √ 53.1− √ 59.6/ √ 59.6 =−5.6% idet A ∝ l 2 . Volumet ser ud til at passe bedre (V ∝ l 3 ). Her er afvigelseni enheder af længde kun 3√ 1051− 3√ 1101/ 3√ 1101 = 0.7% (afsnit 3.5).Tykkelsen af dobbeltlaget skal man derfor forventet er for stort med∼10%. For at forbedre kraftfeltet er det nødvendigt at tænke mere overparametriseringen af hovedgruppen, se appendiks D.På trods af afvigelser fra eksperimentelle værdier haves en realistiskmembran i simuleringerne. PC hovedgruppen i simuleringen pakker blotlidt tættere i den latterale retning end en rigtige PC hovedgruppe.