A Figurer og tabeller til Kapitel 3 - dirac - Roskilde Universitet

More documents

Recommendations

Info

$Guide to Imfufa LaTeX - dirac$

80 Småvinkelrøntgenspredning18Tykkelse af monolag [Å]171615DMPC/hexanol (serie6)D15PC/heptanol (serie12)DPPC/octanol (serie13)DMPC/octanol (serie20)0 0.1 0.2 0.3χ-0.1-0.12-0.14∆L/N fs-0.16-0.18-0.2-0.220.6 0.65 0.7Γz mono. (χ = 0) ∆L * ∆L/N fs Γ = Na+2N fsDMPC/hex. 16.28±0.24 −2.50 ± 0.99 -0.178 0.571D15PC/hep. 17.85±0.06 −3.16 ± 0.25 -0.211 0.600DPPC/oct. 18.42±0.16 −4.19 ± 1.14 -3.00 -0.187 0.625DMPC/oct. 17.39±0.07 −1.29 ± 0.34 -0.092 0.714Figur 4.20 Øverst vises tykkelsen af et monolag, z monolag , som funktionaf χ. Modellen asymb er brugt og tykkelsen af monolaget er fundet somz monolag = 0.938z h . Hældningen til bedste rette linje (—) er vist i tabellen,∆L = dzmono. [Å]. For DPPC/octanol er hældningen af de to første punkterdχvist i kolonnen mærket med *. Som det fremgår af sse i tabel B.4 er det sidstepunkt dårligt. Der ses en korrelation mellem Γ og dz monolag, vist i nederstedχpanel. Punkter fra D15PC/heptanol, DPPC/octanol, DMPC/octanol liggerpå en ret linje, ∆L/N fs = Γ1.05 Å − 0.84 Å, se ligning 4.50. Fra modellen iafsnit 4.3.10 svarer dette til z b = −0.84 Å og z t = (1.05 − 0.84) Å = 0.21 Å.
4.6 Resultater 81findes det atog∆ DM→D15 z monolag = 1.2 Å, (4.64)∆ D15→DP z monolag = 0.3 Å. (4.65)Forøgelsen kan forklares ved den ekstra CH 2 gruppe [45]. Fra tabel 3.4 findesat længden af en methylengruppe langs membrannormalen er z CH2 =1 Å og Nagle & Tristram-Nagle finder z CH2 =1.2 Å [58].I litteraturen findes studier af SAXS målinger på MLV hvor størrelsenD HH reporteres. D HH er defineret udfra der hvor elektrondensiteten harmaksimum [62, 76] og 1 / 2 D HH er nok det bedste at sammenligne medz monolag . For DMPC findes 1 / 2 D HH = 18.0 Å (30℃) og 1 / 2 D HH = 19.3Å (50℃) for DPPC [58]. 1 / 2 D HH er omkring 1.5-2 Å større end z monolag .Dette kan evt. forklares ved at MLV ikke er det samme som ULV. Deabsolutte tykkelser af monolagene, z monolag , er ikke så præcise, da korrektionenfor MLV ikke er perfekt. På trods af dette vil jeg på baggrundaf overstående vurdere, at de absolutte værdier give god mening indenforen usikkerhed under 10%.Membraner med n-alkoholVed tilsætning af n-alkohol bliver membranen tyndere. Dette gælder foralle modeller og alle systemer, som det fremgår af tabellerne i appendixB. På figur 4.20 ses tykkelsen af et monolaget som funktion af alkoholkoncentrationeni membranen, χ. Der ses lineær sammenhæng, ∆L(χ) ∝ χ.Modellen beskrevet i afsnit 4.3.10 er anvendt på dataen. Som vist i figurenfindes∆z t = 0.21 Å (4.66)og∆z b = −0.81 Å. (4.67)Som for simuleringerne ses at ∆z t > 0 mens ∆z b < 0 (tabel 3.4). Kædernebliver længere i toppen af membranen og kortere i bunden. Fra tabel 3.4kan de tilsvarende størrelser udregnes. Fra simuleringerne findes ∆z t =0.21 Å og ∆z b = −0.52 Å (afsnit 4.3.10). For z b findes den samme værdi,mens der for z b findes et større tal i simuleringen. Dette er forklaringenpå at der ikke ses en reduktion i tykkelsen af membranen her.DMPC/hexanol systemet ser ikke ud til at passe ind i systematikken.Dette skal nok forklares ved, at udregningen af koncentrationen af alkoholi membranen, χ, er behæftet med en hvis usikkerhed. Som vist i afsnit 2.3er en stor del af den tilsatte hexanol ikke i membranen, men i vandfasenog værdien af K p har stor betydning. For de andre tilsatte alkoholer erkorrektionen mindre og derfor ses fejlen ikke her.4.6.3 σ h og σ tSes på σ h og σ t er det ikke til at se nogen særlige tendenser ved tilsætningaf alkohol. Disse parameter er desuden dårligt bestemt idet spektret ikke
Page 1 and 2:
Strukturelle ændringer af en phosp
Page 3:
3ResuméTitel: Strukturelle ændrin
Page 6 and 7:
6En tak til alle, der har bidraget
Page 8 and 9:
8 Indhold3.9.1 Kommentarer til kraf
Page 11 and 12:
2 IntroduktionI det næste gives en
Page 13 and 14:
2.3 Partitionering af alkoholer 13z
Page 15:
2.4 Notationer 15For n-alkoholer ko
Page 18:
18 MolekyledynamiksimuleringerAr A,
Page 21 and 22:
3.1 Opsætning af simuleringer 21se
Page 23 and 24:
3.2 Termodynamiske størrelser 23p
Page 25 and 26:
3.3 Membranareal 257065DMPC (310 K)
Page 28 and 29:
28 Molekyledynamiksimuleringer3.3.2
Page 30 and 31: 30 Molekyledynamiksimuleringersom d
Page 32 and 33: 32 Molekyledynamiksimuleringer2mass
Page 34 and 35: 34 Molekyledynamiksimuleringer300.8
Page 36 and 37: 36 Molekyledynamiksimuleringerda de
Page 38 and 39: 38 MolekyledynamiksimuleringerFra s
Page 40 and 41: 40 Molekyledynamiksimuleringer0.3|S
Page 42 and 43: 42 Molekyledynamiksimuleringer1010.
Page 45: 3.9 Geometriske overvejelser 45Tall
Page 48 and 49: 48 Småvinkelrøntgenspredningk ind
Page 50 and 51: 50 SmåvinkelrøntgenspredningDetek
Page 52 and 53: 52 SmåvinkelrøntgenspredningQ1Q2i
Page 54 and 55: 54 Småvinkelrøntgenspredningsølv
Page 56 and 57: 56 Småvinkelrøntgenspredning0.2re
Page 58 and 59: 58 Småvinkelrøntgenspredning86420
Page 60 and 61: 60 SmåvinkelrøntgenspredningEn m
Page 62 and 63: 62 Småvinkelrøntgenspredningop, d
Page 64 and 65: 64 Småvinkelrøntgenspredning76I [
Page 66 and 67: 66 Småvinkelrøntgenspredning4.3.1
Page 68 and 69: 68 SmåvinkelrøntgenspredningA Pho
Page 70 and 71: 70 SmåvinkelrøntgenspredningÅ og
Page 72 and 73: 72 Småvinkelrøntgenspredning86Cen
Page 74 and 75: 74 Småvinkelrøntgenspredning1.21.
Page 76 and 77: 76 Småvinkelrøntgenspredningfor v
Page 78 and 79: 78 SmåvinkelrøntgenspredningRene
Page 82 and 83: 82 Småvinkelrøntgenspredninger go
Page 85 and 86: 5 Afsluttende bemærkningerI dette
Page 87: 87SAXS målingerne viser, at densit
Page 91 and 92: A Figurer og tabeller til Kapitel 3
Page 93 and 94: 930.070.060.050.040.030.020.010-30
Page 95 and 96: 95DMPCDMPC/HXOL330 K 〈z〉 σ z
Page 97 and 98: 9710.90.80.7∆ z hf=12.91∆ z mem
Page 100 and 101: 100 Figurer og tabeller til Kapitel
Page 118 and 119: 118
Page 120 and 121: 120 Inputfiler til NAMD4 DMPC 1 DMP
Page 122 and 123: 122 Inputfiler til NAMDCTL1 CL 200.
Page 124 and 125: 124 Inputfiler til NAMD## force fie
Page 126 and 127: 126 Inputfiler til NAMDpsf-Filerne
Page 128 and 129: 128 Diskussion af metode til bestem
Page 130 and 131:
130 Diskussion af metode til bestem
Page 132 and 133:
132
Page 134 and 135:
134 Litteratur[13] Cantor, R. S. [1
Page 136 and 137:
136 Litteratur[46] Lindahl, E. & Ed
Page 138:
138 Litteratur[76] Tristam-Nagle, S
show all

A Figurer og tabeller til Kapitel 3 - dirac - Roskilde Universitet

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

Delete template?

Save as template?