A Figurer og tabeller til Kapitel 3 - dirac - Roskilde Universitet

More documents

Recommendations

Info

$Guide to Imfufa LaTeX - dirac$

64 Småvinkelrøntgenspredning76I [a.u.]5430 0.1 0.2q [Å -1 ]0.4MåledatasymsymbasymasymbI [a.u.]0.200.2 0.3 0.4 0.5q [Å -1 ]Figur 4.11 De fire modeller fittet til et spekter af ren DMPC (serie 3). Øverstvises den første del af spekteret og nederst vises den sidste del af spekteret. Itabel B.1 findes de fitteparametrerne.
4.3 Model 654.3.9 Model for densiteten af en perturberet membranDensiteten af et system, der deles op i flere elemeter, kan findes ved ataddere del masserne V i ρ i og dividere med totalvolumet, V = ∑ i V i,¯ρ = 1 V∑V i ρ i . (4.42)V i og ρ i er henholdsvis volumet og densiteten af det i’the element. Densitetenaf en perturberet membran kan på denne måde skrives somρ mem = ρ ∗ N ∗ v ∗Vi+ ρ aN a v aV , (4.43)hvor indekset ∗ referer til den rene membran og a til det fremmede molekyle.Dette kan omskrives tilρ mem = ρ ∗ 11 + νn + ρ νna1 + νn , (4.44)hvor ν = va / v∗ og n = N a / N∗ . Det antages at ρ ∗ og ρ a er konstante, hvilketsvarer til en ideal blanding. I grænsen for små perturbationer, νn ≪ 1,gælder atρ mem = ρ ∗ + νn(ρ a − ρ ∗ ), (4.45)ξidet1+ξ → ξ og 11+ξ→ 1 − ξ for ξ → 0 [72].At ρ ∗ og ρ a er konstante, er ikke nødvendigvis en god model idet,der vil forkomme pakning af molekylerne. Dette ses bla. i simuleringerne(afsnit 3.5), i artiklen af Aagaard et al. [2] og i artiklen af Edholm &Nagel [19].Omskrives summen i ligning 4.42 til et integral findes at¯ρ mem =1(z b − z a )A∫ zbz aρ rel (z)Adz = 1 D∫ zbz aρ rel (z)dz, (4.46)hvor D er tykkelsen af dobbeltlaget.For den symmetriske model gælder det at ∫ ρ rel = ρ 0 (2A−1) (ligning4.19).Antages det at massedensiteten og elektrondesiteten er proportionale,se afsnit 4.3.4, ses at for A > 1 / 2 er vesiklerne tungere end solventet og forA < 1 / 2 er de lettere end solventet. For at finde den numeriske størrelseaf membranens densitet er det nødvendigt at kende ρ 0 og D forudenproportionalitetskonstanten i ligning 4.32.Sammenholdes ligning 4.19, 4.45 og 4.46 findes det at,A − 1 / 2 = 2Dρ −10 (ρ∗ + (ρ a − ρ ∗ )νn). (4.47)Denne ligning giver en fysisk fortolkning af A parameteren i ligning 4.18.A − 1 / 2 er den relative densitet af dobbeltlaget (i forhold til solventet)målt i enheder af 2Dρ −10 .
Page 1 and 2:
Strukturelle ændringer af en phosp
Page 3:
3ResuméTitel: Strukturelle ændrin
Page 6 and 7:
6En tak til alle, der har bidraget
Page 8 and 9:
8 Indhold3.9.1 Kommentarer til kraf
Page 11 and 12:
2 IntroduktionI det næste gives en
Page 13 and 14: 2.3 Partitionering af alkoholer 13z
Page 15: 2.4 Notationer 15For n-alkoholer ko
Page 18: 18 MolekyledynamiksimuleringerAr A,
Page 21 and 22: 3.1 Opsætning af simuleringer 21se
Page 23 and 24: 3.2 Termodynamiske størrelser 23p
Page 25 and 26: 3.3 Membranareal 257065DMPC (310 K)
Page 28 and 29: 28 Molekyledynamiksimuleringer3.3.2
Page 30 and 31: 30 Molekyledynamiksimuleringersom d
Page 32 and 33: 32 Molekyledynamiksimuleringer2mass
Page 34 and 35: 34 Molekyledynamiksimuleringer300.8
Page 36 and 37: 36 Molekyledynamiksimuleringerda de
Page 38 and 39: 38 MolekyledynamiksimuleringerFra s
Page 40 and 41: 40 Molekyledynamiksimuleringer0.3|S
Page 42 and 43: 42 Molekyledynamiksimuleringer1010.
Page 45: 3.9 Geometriske overvejelser 45Tall
Page 48 and 49: 48 Småvinkelrøntgenspredningk ind
Page 50 and 51: 50 SmåvinkelrøntgenspredningDetek
Page 52 and 53: 52 SmåvinkelrøntgenspredningQ1Q2i
Page 54 and 55: 54 Småvinkelrøntgenspredningsølv
Page 56 and 57: 56 Småvinkelrøntgenspredning0.2re
Page 58 and 59: 58 Småvinkelrøntgenspredning86420
Page 60 and 61: 60 SmåvinkelrøntgenspredningEn m
Page 62 and 63: 62 Småvinkelrøntgenspredningop, d
Page 66 and 67: 66 Småvinkelrøntgenspredning4.3.1
Page 68 and 69: 68 SmåvinkelrøntgenspredningA Pho
Page 70 and 71: 70 SmåvinkelrøntgenspredningÅ og
Page 72 and 73: 72 Småvinkelrøntgenspredning86Cen
Page 74 and 75: 74 Småvinkelrøntgenspredning1.21.
Page 76 and 77: 76 Småvinkelrøntgenspredningfor v
Page 78 and 79: 78 SmåvinkelrøntgenspredningRene
Page 80 and 81: 80 Småvinkelrøntgenspredning18Tyk
Page 82 and 83: 82 Småvinkelrøntgenspredninger go
Page 85 and 86: 5 Afsluttende bemærkningerI dette
Page 87: 87SAXS målingerne viser, at densit
Page 91 and 92: A Figurer og tabeller til Kapitel 3
Page 93 and 94: 930.070.060.050.040.030.020.010-30
Page 95 and 96: 95DMPCDMPC/HXOL330 K 〈z〉 σ z
Page 97 and 98: 9710.90.80.7∆ z hf=12.91∆ z mem
Page 100 and 101: 100 Figurer og tabeller til Kapitel
Page 114 and 115:
114 Figurer og tabeller til Kapitel
Page 116 and 117:
116 Figurer og tabeller til Kapitel
Page 118 and 119:
118
Page 120 and 121:
120 Inputfiler til NAMD4 DMPC 1 DMP
Page 122 and 123:
122 Inputfiler til NAMDCTL1 CL 200.
Page 124 and 125:
124 Inputfiler til NAMD## force fie
Page 126 and 127:
126 Inputfiler til NAMDpsf-Filerne
Page 128 and 129:
128 Diskussion af metode til bestem
Page 130 and 131:
130 Diskussion af metode til bestem
Page 132 and 133:
132
Page 134 and 135:
134 Litteratur[13] Cantor, R. S. [1
Page 136 and 137:
136 Litteratur[46] Lindahl, E. & Ed
Page 138:
138 Litteratur[76] Tristam-Nagle, S
show all

A Figurer og tabeller til Kapitel 3 - dirac - Roskilde Universitet

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

Delete template?

Save as template?