A Figurer og tabeller til Kapitel 3 - dirac - Roskilde Universitet

4.3 Model 57let over hele rummet af ligning 4.18 er givet ved ρ 0 og A,∫ρ sym dz = ρ 0 (2A − 1). (4.19)Ved brug af ligning 4.17 findes en formfaktor påF sym (q) = I 0[A exp(− 1 2 q2 σ 2 h ) cos(qz h) − 1 2 exp(−1 2 q2 σ 2 t ) ]. (4.20)F sym (q) er vist på figur 4.9 med realistiske parametre.4.3.2 Asymmetrisk korrektionDen asymmetriske, relative elektronfordeling defineres i lighed med ligning4.18 somρ(z) asym = G inderside (z) + G yderside (z) − G t (z), (4.21)hvor G refererer til en Gaussfunktion, G inderside (z) ≠ G yderside (−z) ogG t (z) = G t (−z). I tilfældet hvor G inderside (z) = G yderside (−z) fremkommerligning 4.18.Med SAXS finder Brzustowicz & Brunger at indersiden af vesiklerneforekommer mere ujævn end ydersiden, hvilket giver sig til udtrykved at de to Gaussfunktioner G inderside og G yderside der beskriver hovedgruppenikke er ens [12]. Gaussfunktioner til at beskrive indersiden,G inderside (z), af vesiklen har en større varians end den der beskriver ydersiden,G yderside (z) 8 . For SOPS 9 ULV findes at (± angiver de estimeredeusikkerheder)()(z + 22.4 ± 0.42 Å)2G inderside,SOPS (z) = 1.71 ± 0.03 exp − , (4.22)2(4.87 ± 0.13 Å) 2G yderside,SOPS (z) = 2.78 ± 0.04 exp(−)(z − 19.6 ± 0.46 Å)22(2.11 ± 0.06 Å) 2(4.23)8 I en flade model for et dobbeltlag, kan det ikke afgøres, hvad der er inder- ogyderside. Det kan derfor ikke afgøres hvilken side der er ujævn i 4.21. Kompineresden asymmetriske korrektion med en sphæriske model (se figur B.1), hvor der kankendes forskel på inder- og yderside, viser det sig at det er indersiden der er ujævn[12]9 SOPS; sn-1-stearoyl-sn-oleyl-phosphatidylserine. Hovedgruppen minder om PC,men cholingruppen er udskiftet med en seringruppe, NH 3 (COO)CHCH 2·. PS hovedgruppener negativt ladet. PS pakker tættere i den latterale retning end PC.Dette ses i simuleringer [66]. Fedtsyren stearoyl er 16 lang, med en dobbeltbindingmellem det 5. og 9. kulstof. Fedtsyren oleyl er 18 lang og har en dobbeltbindingmellem det 9. og 10. kulstof. SOPS pakker tættere i den latterale retning og fedtsyrerneer lidt større end DMPC, D15PC og DPPC. Dette er i overnestemmelse medat SOPS-membranen er tykkere end DMPC, D15PC DPPC. Fra ligning 4.22 og4.22 findes en tykkelse af et SOPS monolaget til 21.1 Å. I storetræk ligner SOPSde anvendte phospholipiderlipider