A Figurer og tabeller til Kapitel 3 - dirac - Roskilde Universitet

1 IndledningEt phospholipid-dobbeltlag benyttes ofte som modelsystem af en cellemembran.Strukturen af, og termodynamikken i dette to komponentsystem (vand tælles med) er velbeskrevet [58, 74, 77]. En cellemembraner i midlertid et mere kompliceret system, der består af flere forskelligephospholipider, transmembrane proteiner, peptider og andre lipidersom cholesterol - listen kunne fortsættes [4]. Fremmede molekyler i membranenhar betydning dens fysiske egenskaber. Dette er et område, derer interesse for [26, 42, 55]. Hydrofobtmismatch mellem det fremmedemolekyle og phospholipidet har bla. betydning for virkemåden af proteiner[36, 59]. Virkningen af bedøvelsesmidler tilskrives dette fænomen[13, 14, 26].I nærværende projekt eksemplificeres problemstillingen ved at perturbereen phospholipidmembran med n-alkohol (der også er et bedøvelsesmidel).I dette system er det muligt at undersøge det hydrofobemishmatch ved at variere kædelængden af n-alkohol eller phospholipidet.Ved tilsætning af meget korte alkoholer ses kun små ændringer i systemet,da disse molekyler er hydrofile og blot vil være i den øverste del afmembranen. Ved tilsætning af lange alkoholer ses ligeledes kun små ændringerda disse ligner en fedtsyrekæde. Er alkoholen omkring den halvelængde af et monolag ses de største ændringer [2]. I dette projekt ønskesdet således;at give en atomistisk beskrivelse af en phospholipidmembranperturberet med en n-alkohol med den halve længde af fedtsyrekæderne.Der svares på denne problemstilling gennem molekyldynamiksimuleringer(MD-simuleringer, Kapitel 3) og småvinkelrøntgenspredningseksperimenter(SAXS, Kapitel 4). Disse metoder er gode til at undersøge strukturenpå den relevante længdeskala (nanometer) [10, 22, 75, 77]. Af andre relevanteteknikker kan nævnes SANS og NMR [11, 32].I MD-simuleringerne er DMPC/hexanol systemet valgt. Dette systemer valgt, da det er her, der forventes de største strukturelle ændringer[2]. Af samme grund er der valgt en relativ høj molbrøk af hexanol påχ hexanol = 0.28. Der er simuleret ved 37℃ og 57℃.Ved SAXS måles på unilammelare vesikler, da disse ligner de simuleredemembraner og membraner in vivo. Systemerne DMPC/hexanol,D15PC/heptanol, DPPC/octanol og DMPC/octanol er undersøgt.9