computer modeling in molecular biology.pdf

~~Christopher J. Thorpe and David S. MossMadden, D. R., Wiley, D. C., Curr. Opin. Struct. Biol. 1992, 2, 300-304.Ohno, S., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992, 89, 4643-4647.Rotzshcke, O., Falk, K., Stevanovic, S., Gnau, V., Jung, G., Rammensee, H.-G., Zmmunogenet.1994, 39, 74-77.Ljunggren, H.-G., Stam, N. S., Ohlen, C., Neefjes, J. J., Hogland, P., Heemels, M. T.,Bastin, J., Schumacher, T. N. M., Townsend, A., Karre, K., Ploegh, H. L., Nature 1990,346, 476-480.Powis, S. J., Deverson, E. V., Coadwell, W. J., Ciruela, A., Huskisson, N. S., Smith, H.,Butcher, G. W., Howard, J. C., Nature 1992, 357, 211-215.Spies, T., Cerundolo, V., Colonna, M., Cresswell, P., Townsend, A., DeMars, R., Nature1992, 644-646.Haldane, J. B. S., La Ricierca Scientifca 1949, 19, Suppl. 19, 68-75.[20] Watkins, D. I., McAdam, S. N., Liu, X., Strang, C. R., Milford, E. L., Levine, C. G.,Garber, T. L., Dogon, A. L., Lord, C. I., Ghim, S. H., Troup, G. M., Hughes, A. L.,Letvin, N. L., Nature 1992, 357, 329-333.[21] Belich, M. P., Madrigal, J. A., Hildebrand, W. H., Zemmour, J., Williams, R. C., Luz,R., Petzl-Erler, M. L., Parham, P., Nature 1992, 357, 326-329.[22] Hill, A. V. S., Elvin, J., Willis, A. C., Aidoo, M., Allsopp, C. E., Gotch, F. M., Gao,X. M., Takiguchi, M., Greenwood, B. M., Townsend, A. R. et al., Nature 1992, 360,434-439.[23] Salter, R. D., Benjamin, R. J., Wesley, P. K., Buxton, S. E., Garrett, T. P. J., Clayberger,C., Krensky, A., Norment, A. M., Littman, D. R., Parham, P., Nature 1990, 345, 41.[24] Bjorkman, P. J., Saper, M. A., Samraoui, B., Bennet, W. S., Strominger, J. L., Wiley,D. C., Nature 1987, 329, 506-512.[25] Bjorkman, P. J., Saper, M. A., Samraoui, B., Bennet, W. S., Strominger, J. L., Wiley,D. C., Nature 1987, 329, 512.[26] Saper, M. A., Bjorkman, P. J., Wiley, D. C., J. Mol. Biol. 1991, 219, 277.[27] Madden, D. R., Garboczi, D. N., Wiley, D. C. Cell. 1993, 75, 693-708.[28] Garrett, T. P. J., Saper, M. A., Bjorkman, P. J., Strominger, J. L., Wiley, D. C., Nature1989, 342, 692.[29] Silver, M. L., Guo, H.-C., Strominger, J. L., Wiley, D. C., Nature 1992, 360, 367-369.[30] Guo, H.-C., Jardetzky, T. S., Garrett, T. P. J., Lane, W. S., Strominger, J. L., Wiley,D. C., Nature 1992, 360, 364-366.[31] Madden, D. R., Gorga, J. C., Strominger, J. L., Wiley, D. C., Nature 1991, 353, 321.[32] Zhang, W., Young, A. C. M., Imarai, M., Nathenson, S. G., Sacchetini, J. C., Proc.Natl. Acad. Sci. USA 1992, 89, 8403-8407.[33] Fremont, D. H., Matsumura, M., Stura, E. A., Peterson, P. A,, Wilson, I., Sciencel992,257, 919-927.[34] Thorpe, C. J., Travers, P. J., Moss, D. S., unpublished results.[35] Overington, J., Johnson, M. S., Sali, A., Blundell, T. L., Proc. R. SOC. London 1990,241, 132-145.[36] Sutcliffe, M. J., Haneef, I., Carney, D., Blundell, T. L., Protein Eng. 1987, Z, 377-384.[37] Sutcliffe, M. J., Hayes, F. R. F., Blundell, T. L., Protein Eng. 1987, I, 385-392.[38] SYBYL 5.5 Manual (Tripos Associates).[39] Weiner, S. J., Kollman, P. A., Case, D. A., Singh, U. C., Ghio, C., Alagona, G., Profeta,S., Weiner, P. K., J. Amer. Chem. SOC. 1984, 106, 765-784.[40] Weiner, S. J., Kollman, P. A., Nguyen, D. T., Case, D. A., 1 Comp. Chem. 1986, 7,230-252.[41] Karplus, M., McCammon, A., Ann. Rev. Biochem. 1983, 52, 263.