Sanidad Militar - Ministerio de Defensa

A. Pérez Rico, et al.Tabla 1. Resultados de comparar tres protocolos de extracción de ADN de mosquitos Anopheles atroparvus. Se indica el número demosquitos empleados (Nº), el éxito (+) o fracaso (-) de la amplificación (A) y el ciclo umbral medio de la qPCR (Cq) en diferentesdiluciones de cada extracto.qPCRProtocolo Nº Lavado1/1 1/10 1/100 1/1000A Cq A Cq A Cq A CqColumna 10 si +/- 12,1 + 12,4 + 15,7 + 19,110 no - 26,3 + 15,6 + 18,1 + 22,51 si + 16,2 + 19,8 + 23,5 + 27,11 no + 13,6 + 17,1 + 21,6 + 25,0Digestión 10 si +/- 23.5 + 24,2 + 28,1 + 34,610 no - - + 27,0 + 34,0 - -1 si + 14,7 + 18,2 + 21,0 + 25,11 no + 18,6 + 23,2 + 26,8 + 30,3Resina y digestión 10 si - - + 21,5 + 24,8 + 29,010 no - - + 24,2 + 29,0 + 34,11 si +/- 19,7 + 23,8 + 26,1 + 30,31 no +/- 15,4 + 20,1 + 23,8 + 27,5Tabla 2. Ciclo de cuantificación (Cq) como resultado de la amplificaciónde una secuencia de la unidad 28S ribosómica en muestrasduplicadas de mosquitos de cuatro especies diferentes. Se extraencon columnas (i-genomic CTB ADN Mini Kit, Intron Biotechnology,Inc.) y se diluyen 1/10 antes de su amplificación. Comocontrol de la qPCR sin muestra se usa agua como sustrato de lareacción.IdentificaciónCqmedioCqDesv. estándarControl sin muestra - -Control Positivo 16,03 0,05Culiseta longiareolata 16,85 1,18Anopheles plumbeus 13,70 0,10Ochlerotatus caspius 20,60 0,23Culex pipiens 15,60 0,14Culex perexiguus 16,93 0,45Culex modestus 16,77 2,32protocolos de extracción para 1 y 10 mosquitos del género Anophelesatroparvus a diferentes diluciones (Tabla 1).Los resultados permiten observar que los tres métodos de extracciónde ADN a partir de un solo mosquito son válidos. En elcaso de extraer a partir de colecciones de 10 mosquitos se obtuvouna fuerte inhibición de la qPCR cuando se pretendía amplificar elextracto sin diluir (Figura 1). Los mejores resultados con 10 mosquitosse han obtenido con el método de extracción de las columnas.Los lavados de la muestra previamente a su extracción siemprehan mejorado los resultados en los concentrados de 10 mosquitos,sin embargo cuando se trabaja con un solo ejemplar el efecto dellavado es negativo pues aumenta el Cq en todos los casos.Mediante diluciones decimales de una extracción de unmosquito con columnas (1/1 a 1/10.000) se construye una curvaestándar y se obtiene un alto coeficiente de correlación (R 2 ) de0,9976. Esta curva se usa como referencia en las siguientes amplificaciones.En la Tabla 2 se observan que los Cq obtenidos tras unaextracción de lotes de 10 mosquitos de diferentes especies concolumnas y diluido el extracto a 1/10, se encuentran todos pordebajo de 21.Una extracción directa con Proteinasa K o el empleo de resinasquelantes como Chelex® precedidos de un lavado de lamuestra, pueden ser procedimientos útiles y económicos paratrabajar con grupos de 10 mosquitos. Sin embargo, se apreciaun aumento del número de ciclos necesarios hasta alcanzar elumbral de amplificación (Cq) con respecto al uso de un kit comercialbasado en el empleo de columnas de extracción. Cuandosólo interesa un resultado positivo o negativo, cualquiera de losmétodos puede ser válido pero si interesa cuantificar la cargaparasitaria se debería recurrir al método más eficiente y sensiblecomo es el de columnas.DISCUSIÓNEl tratamiento de las muestras con Chelex® ha sido consideradopor Arez y col. (2000) 1 como una de las técnicas más eficaces.Lardeux y col. (2008) 7 también indicaron que los protocolosbasados en Chelex® pueden ser uno de los más interesantes paraextraer ADN en conjuntos de hasta 100 mosquitos. Sin embargoestos autores detectan una fuerte inhibición de la PCR cuandose supera la cantidad de 2 mosquitos extraídos a la vez, ademásel protocolo propuesto tiene el inconveniente de que no puedeser empleado para cuantificar la cantidad de parásitos presentesdebido a que su eficiencia es irregular.La amplificación de ADN extraído de un enfermo parasitadocon Plasmodium falciparum y mezclado con un lote de 10mosquitos Anopheles atroparvus, no se vio inhibida cuando sesometió esta colección al proceso de extracción de ADN con co-80 Sanid. mil. 2013; 69 (2)