Programa General en pdf Clausura - Sociedad Química de México

Bol. Soc. Quím. Méx. 2011, 5 (Número Especial)
T 1
Interacción Proteína-Ligando para el desarrollo de
nuevos compuestos activos
Instructor: DR. CARLOS ANTONIO RIUS ALONSO
FACULTAD DE QUÍMICA – UNAM
Vice Vocal Industrial - SQM
Domingo 11 de septiembre, 2011. Salón: Claustro 3 15:30 – 18:30 h
Debido a los altos costos y complejidad para desarrollar nuevos medicamentos, se han tenido que explorar nuevas formas de
encontrar compuestos activos. Los estudios QSAR han dado buenos resultados, pero se ha visto que tienen muchas
limitaciones. El uso de la Química combinatoria no ha sido tan exitoso como se esperaba. Uno de los métodos que si ha dado
resultado y un número cada vez mayor de medicamentos están entrando al mercado mediante su uso, es el identificar, una
enzima esencial en un organismo y encontrar la forma de bloquearla mediante el desarrollo de un inhibidor selectivo. Para
lograr esto se ha trabajado mucho en las determinación de las estructuras 3D de las proteínas, en la actualidad en el Protein
Data Bank (PDB) están reportadas 75 000 estructuras.
En este taller se aprenderá a usar el PDB para partir de una enzima que se conozca su estructura y mediante varios programas
de Modelación Molecular se le mostrara la forma en la cual se tiene que preparar una proteína para poder ser estudiada y
encontrar su sitio activo, ver la forma en la que un ligando puede interaccionar con la proteína y analizar los requerimientos
para poder predecir si un compuesto puede mostrar una actividad o no.
La ventaja de este procedimiento está en que si se conoce la enzima que se quiere inhibir, se pueden diseñar compuestos con
una gran probabilidad de ser activos y de esta forma se pueden eliminar muchas estructuras que por los métodos tradicionales
de desarrollo de fármacos no tienen posibilidades de mostrar actividad.
Nota: A las personas que deseen participar en este taller, se les sugiere llevar laptop con una memoria Ram de 1 ó 2 Gb.