Biologia Molecolare Computazionale

UPGMA
1. Individuare le due specie più vicine tra le N esistenti
2. Definire un nuovo nodo come loro antenato comune,
ponendolo all’altezza uguale a metà della distanza tra i
due nodi
3. Eliminare le due specie dalla lista e sostituirle con
l’antenato comune
4. Ripetere con la nuova lista di N − 1 specie
5. Ripetere fino a che la lista contiene una sola specie (la
radice = antenato comune)
6. Si può dimostrare che il metodo riproduce l’unico albero
filogenetico con radice che riproduce le distanze evolutive