Biologia Molecolare Computazionale

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Esempio ◮ Costruire l’albero unrooted di 3 specie dalle seguenti distanze: A B C A 0 3 4 B 3 0 5 C 4 5 0 ◮ Localizzare la radice usando l’outgroup D, con distanze d(D, A) = 12 d(D, B) = 11 d(D, C) = 14
Maximum Parsimony ◮ Trovare l’albero che spiega la discendenza delle specie esistenti da un antenato comune con il minimo numero di mutazioni. ◮ Per semplicità ci limiteremo a considerare sostituzioni ◮ Esempio: le specie esistenti sono rappresentate dalle seguenti sequenze: AAG AAA GGA AGA
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