Biologia Molecolare Computazionale
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Ricerca di TFBS<br />
◮ Ogni volta che la sequenza supera un certo score minimo<br />
deciso a priori, la si identifica come un candidato TFBS<br />
◮ Problema: in genere si trovano troppi candidati:<br />
◮ PWM di lunghezza 6<br />
◮ Accettiamo solo il massimo score possibile (1 sola<br />
sequenza)<br />
◮ Su sequenze casuali, otteniamo un candidato ogni<br />
4 6 = 4, 000 basi<br />
◮ Sul genoma umano, ci aspettiamo<br />
3 · 10 9<br />
∼ 7.5 · 105<br />
4 · 103 candidati semplicemente per caso