Biologia Molecolare Computazionale
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Applicazione: Positional Weight Matrices<br />
◮ Siti di legame di TF:<br />
◮ Brevi sequenze di DNA (∼ 6 − 15 bps)<br />
◮ Non completamente conservate<br />
◮ Una descrizione possibile è la sequenza consensus,<br />
ricavabile da un allineamento multiplo di siti di legame noti:<br />
IUPAC codes:<br />
◮ Y = pyrimidine (C or T)<br />
◮ W = T or A<br />
A C C G G T<br />
A C T G G T<br />
- C T G G A<br />
A C C G G T<br />
A C Y G G W