Relações filogenéticas, biogeografia histórica e evolução da ...

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Capítulo 3Pseudo NADH6Amazona ---CCCACCCAAAAACCCTCACCCTACAACCAATGAAGCCCCCAACACAACAACACCA-------------AGGCGCAAAForpus -AAC----CCAAAATTTCCCCAATAAACAACAGTAAACCCTAATTAC-AAATAAAACAC----------------CCAAAP.barrabandi TACCACCAACCCCCAAAA-CCACCCCAACCACCCC-ATTAAACCCACAAAGCACCCCA----------CAACACCAAAACP.pileata CACC------AGAAAGCT-AACCCCCAACAACACCCCATCAGCCCACCTAAAGCAAT------------------ACAAAPionus TCTCACCCCAAACTCCCCACCACAATAAGCAAGCCTAAACACAACAACACCACCAAATATTAACCCACCCCAAAAGCAAAtriclaria TCCC----GCTAAAAACACCACCC------------------------------------------------GACACAAAAmazona ATAGGCCATAAGForpus --AGGCCATAGAP.barrabandi AAAGGCCATAAGP.pileata ACAGGCCATAAGPionus ATAGGCCATAAGtriclaria ACAGGCCATAAGPseudo RNAt GluAmazona TTTCTCAGATCAAA--CCATCCAAAGCTTATGGCCTATTAACCGCCTC--AGCACATCAACCA-TAAForpus GTCC-CACCCAGA-C---CCCCTCACTCTATGGCCTAAAAGTCCACTC-------------------P.barrabandi CCTC-TACCCAAAAA-TCATCAAAGGCTTATGGCCAAAAAAGC-CAACCCAGCATTTAAACCA-C--P.pileata TCCC-CACTCAAAAA-TGACTGGGGACTTATGGCCTACAAACCACCACTATGTACTTCAACCA-TACPionus CTTT-CAGAGTCGCGTCTGTCCAAAGCTTATGGCCTAAACCATACCTA-GTGTACCTACCATAATAATriclaria CTTC-TACCC--AAA-CTATCTAAAGCTTATGGCCTA-AAACTTCC-CTTAGTACTCTTAACA-TGGFigura 3.5. Seqüência de pseudogenes dos táxons Amazona farinosa (Eberhard e col. 2001), Forpuscrassirostris, Pionopsitta barrabandi, Pionopsitta pileata, Pionus chalcopteris (Eberhard e col. 2001) eTriclaria malachitacea. Regiões de maior homologia entre os táxons estão indicadas em negrito.3.3.1. Mapeamento de hipótesesO mapeamento das ordens gênicas de psitacídeos neotropicais em uma hipótese filogenética(Tavares e col., in prep.) sugere que há ambiguidade quanto ao estado ancestral de alguns grupos (Figura3.6a). A partir desse resultado e dos pseudogenes presentes nos grupos, dois modelos de evolução foramlevantados:a) Duplicações independentes do segmento dos genes RNAt Pro / NADH6/ RNAt Glu / RC teriam ocorridonas linhagens ancestrais dos clados B, D e F. Essas duplicações seriam seguidas de deleções dosgenes RNAt Pro / parte do NADH6 e do RNAt Glu nos clados B e D. No clado F teria ocorrido adeleção parcial dos genes RNAt Pro / NADH6 e total do gene RNAt Glu . Esse modelo presupõe aexistência de pelo menos seis eventos, sendo três de duplicação de genes e três de deleções degenes (Figura 3.6b).b) Um único evento de duplicação gênica teria ocorrido no ancestral dos clados B, C, D, E e F e cincoeventos de deleção de genes, sendo dois eventos convergentes. Nos clados C e E, a deleçãolevaria à organização comum em aves e nos clados C e D, a deleção resultaria em pseudogenesde RNAtGlu e NADH6. Um evento distinto de deleção de genes resultaria no padrão descrito emPionites e Deroptyus (Figura 3.6c).72
Capítulo 3a)b) c)Figura 3.6. a) Mapeamento dos estados da ordem gênica na inferência filogenética de Tavares e col. (inprep.); b) modelo considerando três eventos independentes de duplicação; c) modelo considerando umevento de duplicação. O período estimado para os eventos estão representados em milhões de anos, ma.73
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