MASTERARBEIT - Fachhochschule Salzburg

7. Bewertung der Ergebnisse 92[27] belegen. Wie die Auswertungen der Scores und deren Entwicklung über mehrereZyklen aber auch zeigen, ist die Trennschärfe der verwendeten Scores sowohl durchden Scoretyp als auch durch das Profil-MSA begrenzt. Die Sequenzen gleicher Familiessetzen sich meist deutlich vom Rest der Sequenzen ab, aber schon die eindeutigeKlassifikation der Superfamily ist nicht immer gewährleistet.Eine Gegenüberstellung der Corrected Scores zeigen Streudiagramme in der Abbildung7.8, in denen auf den X- und Y-Achsen jeweils die Werte eines Scoretyps aufgetragenwerden. Dargestellt werden unterschiedliche Scorepaarungen eines Modells der Familiea.1.1.2. Die cyanfarbigen und roten Punkte zeigen die Scores der Superfamilies undFamilies und die blauen Punkte die Other-Scores. Mit einem farbigen Kreuz sind jeneScores markiert, die das Profil-MSA beim Start der Zyklen definiert haben, und diegrünen Punkte deuten jene Scores an, die im Laufe der sechs Zyklen dem Profil-MSAhinzugefügt wurden.Abbildung 7.8: Ausgewählte Scores der Familie a.1.1.2 in Streudiagrammen.Im Vergleich der Diagramme zeigt sich, dass einige Scores nahezu identische Bewertungenliefern, wie beispielsweise die Kombinationen aus Simple Corrected Score undHMM Corrected Score. Die Scores fädeln sich mit geringer Streuung entlang eines engenKanals auf. Andere Diagramme zeigen zwar deutlichere Streuungen, trotzdem aber imVerlauf noch deutliche Abhängigkeiten. In allen Scorekombinationen heben sich die Familiesgut und die Superfamilies teilweise vom Rest der Sequenzen ab, was aufgrund derErfahrungen aus den Dichtediagrammen keine Überraschung darstellt. Eine komplette