MASTERARBEIT - Fachhochschule Salzburg

7. Bewertung der Ergebnisse 80• Das Profil-MSA wurde in jedem Zyklus um maximal 3 Sequenzen erweitert.Jedes der in der Tabelle 7.1 angeführten multipler Sequenzalignments zum Trainingeines Profil-HMMs wurde aus den alignierten Sequenzen einer bestimmten Familie gebildet.In der Tabelle sind sowohl die Familiennamen der Profil-MSA-Sequenzen alsauch die Anzahl der Spalten der Profil-MSA und die Anzahl der im Profil-HMM enthaltenenEmissionsspalten angegeben.Tabelle 7.1: Multiple Sequenzalignments zur Beschreibung von Profil-HMMs. Die in derSpalte ’MSACols’ angegebenen Werte beschreiben die Länge der Sequenzen im Profil-MSA, die Spalte ’Col.Emiss’ beschreibt die Anzahl der Emissionsspalten im HMM.Die Werte der Spalten ’Modell-Sequenzen’ von ’Z1’ bis ’Z6’ nennen die Anzahl derSequenzen, aus denen im jeweiligen Zyklus das Profil-MSA gebildet wurde. Der Test indiesem Beispiel führte über sechs Zyklen, in dem in jedem Zyklus drei neue Sequenzenzum Profil-MSA hinzugefügt wurden.