MASTERARBEIT - Fachhochschule Salzburg

2. Allgemeine Grundlagen 10Buchstabencode Aminosäure CodoneA Alanin (Ala) GCA, GCC, GCG, GCTC Cystein (Cys) TGC, TGTD Aspartat (Asp) GAC, GATE Glutamat (Glu) GAA, GAGF Phenylalanin (Phe) TTC, TTTG Glycon (Gly) GGA, GGC, GGG, GGTH Histidin (His) CAC, CATI Isoleucin (Ile) ATA, ATC, ATTK Lysin (Lys) AAA, AAGL Leucin (Leu) CTA, CTC, CTG, CTT, TTA, TTGM Methionin (Met) ATGN Asparagin (Asn) AAC, AATP Prolin (Pro) CCA, CCC, CCG, CCTQ Glutamin (Gln) CAA, CAGR Arginin (Arg) AGA, AGG, CGA, CGC, CGG, CGTS Serin (Ser) AGC, AGT, TCA, TCC, TCG, TCTT Threonin (Thr) ACA, ACC, ACG, ACTV Valin (Val) GTA, GTC, GTG, GTTW Tryptophan (Trp) TGGY Tyrosin (Tyr) TAC, TATTabelle 2.1: Standardisiertes Alphabet zur Codierung der Proteinsequenzen [22].In Tabelle 2.1 werden die Dreierkombinationen (Codone) und die jeweiligen Aminosäuren,die daraus gebildet werden, gelistet. Betrachtet man die Codonspalte derAminosäuren so fällt auf, dass bestimmte Aminosäuren aus unterschiedlichen Codonebestehen können. Ebenso auffallend ist, dass eine Mutation der dritten Base im Codondie Art der Aminosäure nicht zwingend ändert. Die größten Änderungen der Eigenschaftenerfährt eine Aminosäure, wenn die mittlere der drei Basen mutiert. Die inder Tabelle nicht aufgelisteten Tripletts sind keine Aminosäuren, sondern übernehmenandere Funktionen innerhalb einer DNA-Sequenz. Als Beispiele können spezielle Codoneangeführt werden, die den Beginn (Startcodon) oder das Ende (Stoppcodon) einerProteinsequenz markieren [32].