21.03.2014 Views

Last ned 2/2012 - Kirurgen.no

Last ned 2/2012 - Kirurgen.no

Last ned 2/2012 - Kirurgen.no

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

Gjenbruk av digital<br />

laparoskopisk video<br />

Karl Øyri, Ronny Kristiansen, Bjørn Edwin<br />

Intervensjonssenteret, Klinikk for Diag<strong>no</strong>stikk<br />

og Intervensjon, Oslo universitetssykehus HF<br />

I Oslo CoMet studien studeres utfall etter<br />

åpen eller laparoskopisk levermetastasekirurgi<br />

ved colorectal cancer. Intervensjonssenteret,<br />

OUS pågår et tilstøtende prosjekt<br />

kalt MECMED der informasjon fra pasienter<br />

inkludert i CoMet studien bearbeides i helt<br />

nye IKT-plattformer. MECMED studien er<br />

et OFU-prosjekt finansiert med midler fra<br />

In<strong>no</strong>vasjon Norge. Samarbeidspartnere er<br />

OUS og Pubgene AS (Oslo, Norge). Data<br />

fra OUS interne applikasjoner som EPJ,<br />

histopatologi, PACS (radiologisk bildeinformasjon),<br />

laparoskopisk video og molekylærbiolgiske<br />

data fra pasienter (fra blod og<br />

tumorceller) sammenstilles i en nyutviklet<br />

versjon av Coremine Medical (CM). CM er<br />

en domenespesifikk medisinsk søkemotor<br />

med unik tek<strong>no</strong>logi. CM henter oppdatert<br />

informasjon fra eksterne informasjonsdatabaser<br />

som PubMed, Clinical Trials,<br />

Drugbase, og en rekke andre kvalitetssikrede<br />

kilder med tema som Gene/Protein,<br />

Anatomy, Molecular Function etc., og<br />

genererer grafiske nettverk der brukeren<br />

kan søke detaljert informasjon basert på<br />

MeSH (Medical Subject Headings)- termer<br />

fra National Library of Medicine. Til venstre<br />

i figuren vises et dynamisk (klikkbart)<br />

informasjonsnettverk generert i CM med<br />

termen «Liver surgery», og i listen til høyre<br />

i figuren emnebasert kategorier som er<br />

tilgjengelig i systemet. Skjermbildet viser<br />

bare en begrenset del av de ressursene<br />

som er tilgjengelige for videre bearbeiding<br />

av informasjon relatert til søkebegrepet.<br />

Vanligvis lagres laparoskopisk video på<br />

DVCAM-tape, og videre prosessering av<br />

videoen må foretas i et videoediteringsprogram.<br />

For å kunne integrere laparoskopisk<br />

video med CM-plattformen streames<br />

digital laparoskopisk video til en server med<br />

spesial-softwaren Seekuence utviklet av<br />

Posicom AS (Kongsberg, Norge). Videre<br />

kreves det at interessante sekvenser i videoen<br />

merkes (tagges) som hendelser med<br />

tilknyttede termer og tidspunkt, som så kan<br />

kobles opp mot for eksempel operasjonsbeskrivelsen<br />

i EPJ, NCSP-prosedyrekode,<br />

eller andre ontologier og kontrollerte<br />

vokabularer som omfattes av CM. Video<br />

tagges enten underveis under inngrepet<br />

eller i etterkant. Fra Seekuence-databasen<br />

kan videoer importeres til CM-plattformen<br />

og knyttes opp mot lignende termer i OUS´<br />

interne databaser. Eventuelt kan en trekke<br />

termer ut i generelle søk i CM-plattformen.<br />

Konkrete kliniske problemstillinger (termer)<br />

kan sammenstille informasjon fra multiple<br />

og omfattende kunnskapskilder på en helt<br />

ny, og meget rask, måte som ikke har vært<br />

tilgjengelig som en samlet løsning tidligere.<br />

Strukturering av<br />

laparoskopisk video<br />

For å systematisere bruken av laparoskopisk<br />

video og bearbeide den videre i<br />

CM-plattformen er det laget en liste over<br />

sekvenser av inngrepet som skal merkes/<br />

tagges i videoen. Ved laparoskopisk leverreseksjon<br />

består tagge-listen av 12 termer;<br />

Adverse Event, Control&Haemostasis,<br />

Insufflation& Overview, IntraOP-US-<br />

Diag<strong>no</strong>stic, IntraOP-US-Resection, Large<br />

structure- artery, Large structure-vein, Large<br />

structure-bile duct, Liver mobilization, Mark<br />

resection area, Resection metastasis 1, 2,3<br />

etc, Tumor catch 1,2,3 etc, Tumor free. I tillegg<br />

er det mulig å legge inn fritekstbaserte<br />

kommentarer. Når videoen først er tagget,<br />

vil det i ettertid ta kort tid å se igjen<strong>no</strong>m<br />

høydepunktene i videoen som en ellers ville<br />

ha brukt lang tid på å finne frem til. Tiden<br />

vil vise om videre utprøving av listen med<br />

termer for laparoskopisk leverreseksjon vil<br />

føre til revidering av termer basert på erfaringene<br />

som høstes. De taggede videoene<br />

knyttes CM plattformen i en sikker versjon<br />

på OUS lukkede sykehusnettverk. Alle perso<strong>no</strong>pplysninger<br />

vil bli avidentifisert. Derfra<br />

kan de knyttes mot tilsvarende problemstillinger<br />

i OUS interne database, eller til<br />

eksterne kilder tilknyttet CM-plattformen.<br />

Det er mange ubesvarte spørsmål som<br />

knytter seg til nytteverdien av å kunne<br />

gjenbruke laparoskopisk video i seg selv.<br />

Muligheten for sammenkobling av taggede<br />

elementer med andre relevante termer gir<br />

nye muligheter for generering av oversikt<br />

og ny kunnskap. Informasjonssammensettingen<br />

kan bli helt forskjellig utfra hvorvidt<br />

perspektivet er undervisning, forskning eller<br />

kvalitetssikring.<br />

Systematisk gjenbruk og gjen<strong>no</strong>mgang<br />

av informasjon fra laparoskopisk video gir<br />

isolert sett mulighet for å generere nyttig<br />

informasjon. I MECMED-prosjektet inngår<br />

laparoskopisk video som et av mange<br />

elementer som sammenstilt med andre<br />

informasjonskilder om pasienten vil kunne<br />

øke nytteverdien ytterligere.<br />

Siden prosjektet er i startfasen foreligger<br />

det ingen bearbeidede resultater enda.<br />

Prosjektdeltagerne forventer at en ved hjelp<br />

av sammenstilling av informasjon fra mange<br />

kilder knyttet til behandling av enkeltpasienter,<br />

vil kunne nærme seg muligheten for å gi<br />

individbasert og skreddersydd behandling til<br />

den enkelte. Dette gjelder særlig koblingen<br />

mellom molekylærbiologiske data og andre<br />

kliniske data. Laparoskopisk behandling<br />

inngår som en sentral del av behandlingen.<br />

Grunnlaget for strukturering av laparoskopisk<br />

video er etablert, og i tiden som kommer<br />

vil resultatene og erfaringene vise om<br />

de forventede resultatene nås •<br />

NTLF-Nytt<br />

<strong>Kirurgen</strong> nr. 2, <strong>2012</strong><br />

143

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!