Last ned 2/2012 - Kirurgen.no
Last ned 2/2012 - Kirurgen.no
Last ned 2/2012 - Kirurgen.no
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
Gjenbruk av digital<br />
laparoskopisk video<br />
Karl Øyri, Ronny Kristiansen, Bjørn Edwin<br />
Intervensjonssenteret, Klinikk for Diag<strong>no</strong>stikk<br />
og Intervensjon, Oslo universitetssykehus HF<br />
I Oslo CoMet studien studeres utfall etter<br />
åpen eller laparoskopisk levermetastasekirurgi<br />
ved colorectal cancer. Intervensjonssenteret,<br />
OUS pågår et tilstøtende prosjekt<br />
kalt MECMED der informasjon fra pasienter<br />
inkludert i CoMet studien bearbeides i helt<br />
nye IKT-plattformer. MECMED studien er<br />
et OFU-prosjekt finansiert med midler fra<br />
In<strong>no</strong>vasjon Norge. Samarbeidspartnere er<br />
OUS og Pubgene AS (Oslo, Norge). Data<br />
fra OUS interne applikasjoner som EPJ,<br />
histopatologi, PACS (radiologisk bildeinformasjon),<br />
laparoskopisk video og molekylærbiolgiske<br />
data fra pasienter (fra blod og<br />
tumorceller) sammenstilles i en nyutviklet<br />
versjon av Coremine Medical (CM). CM er<br />
en domenespesifikk medisinsk søkemotor<br />
med unik tek<strong>no</strong>logi. CM henter oppdatert<br />
informasjon fra eksterne informasjonsdatabaser<br />
som PubMed, Clinical Trials,<br />
Drugbase, og en rekke andre kvalitetssikrede<br />
kilder med tema som Gene/Protein,<br />
Anatomy, Molecular Function etc., og<br />
genererer grafiske nettverk der brukeren<br />
kan søke detaljert informasjon basert på<br />
MeSH (Medical Subject Headings)- termer<br />
fra National Library of Medicine. Til venstre<br />
i figuren vises et dynamisk (klikkbart)<br />
informasjonsnettverk generert i CM med<br />
termen «Liver surgery», og i listen til høyre<br />
i figuren emnebasert kategorier som er<br />
tilgjengelig i systemet. Skjermbildet viser<br />
bare en begrenset del av de ressursene<br />
som er tilgjengelige for videre bearbeiding<br />
av informasjon relatert til søkebegrepet.<br />
Vanligvis lagres laparoskopisk video på<br />
DVCAM-tape, og videre prosessering av<br />
videoen må foretas i et videoediteringsprogram.<br />
For å kunne integrere laparoskopisk<br />
video med CM-plattformen streames<br />
digital laparoskopisk video til en server med<br />
spesial-softwaren Seekuence utviklet av<br />
Posicom AS (Kongsberg, Norge). Videre<br />
kreves det at interessante sekvenser i videoen<br />
merkes (tagges) som hendelser med<br />
tilknyttede termer og tidspunkt, som så kan<br />
kobles opp mot for eksempel operasjonsbeskrivelsen<br />
i EPJ, NCSP-prosedyrekode,<br />
eller andre ontologier og kontrollerte<br />
vokabularer som omfattes av CM. Video<br />
tagges enten underveis under inngrepet<br />
eller i etterkant. Fra Seekuence-databasen<br />
kan videoer importeres til CM-plattformen<br />
og knyttes opp mot lignende termer i OUS´<br />
interne databaser. Eventuelt kan en trekke<br />
termer ut i generelle søk i CM-plattformen.<br />
Konkrete kliniske problemstillinger (termer)<br />
kan sammenstille informasjon fra multiple<br />
og omfattende kunnskapskilder på en helt<br />
ny, og meget rask, måte som ikke har vært<br />
tilgjengelig som en samlet løsning tidligere.<br />
Strukturering av<br />
laparoskopisk video<br />
For å systematisere bruken av laparoskopisk<br />
video og bearbeide den videre i<br />
CM-plattformen er det laget en liste over<br />
sekvenser av inngrepet som skal merkes/<br />
tagges i videoen. Ved laparoskopisk leverreseksjon<br />
består tagge-listen av 12 termer;<br />
Adverse Event, Control&Haemostasis,<br />
Insufflation& Overview, IntraOP-US-<br />
Diag<strong>no</strong>stic, IntraOP-US-Resection, Large<br />
structure- artery, Large structure-vein, Large<br />
structure-bile duct, Liver mobilization, Mark<br />
resection area, Resection metastasis 1, 2,3<br />
etc, Tumor catch 1,2,3 etc, Tumor free. I tillegg<br />
er det mulig å legge inn fritekstbaserte<br />
kommentarer. Når videoen først er tagget,<br />
vil det i ettertid ta kort tid å se igjen<strong>no</strong>m<br />
høydepunktene i videoen som en ellers ville<br />
ha brukt lang tid på å finne frem til. Tiden<br />
vil vise om videre utprøving av listen med<br />
termer for laparoskopisk leverreseksjon vil<br />
føre til revidering av termer basert på erfaringene<br />
som høstes. De taggede videoene<br />
knyttes CM plattformen i en sikker versjon<br />
på OUS lukkede sykehusnettverk. Alle perso<strong>no</strong>pplysninger<br />
vil bli avidentifisert. Derfra<br />
kan de knyttes mot tilsvarende problemstillinger<br />
i OUS interne database, eller til<br />
eksterne kilder tilknyttet CM-plattformen.<br />
Det er mange ubesvarte spørsmål som<br />
knytter seg til nytteverdien av å kunne<br />
gjenbruke laparoskopisk video i seg selv.<br />
Muligheten for sammenkobling av taggede<br />
elementer med andre relevante termer gir<br />
nye muligheter for generering av oversikt<br />
og ny kunnskap. Informasjonssammensettingen<br />
kan bli helt forskjellig utfra hvorvidt<br />
perspektivet er undervisning, forskning eller<br />
kvalitetssikring.<br />
Systematisk gjenbruk og gjen<strong>no</strong>mgang<br />
av informasjon fra laparoskopisk video gir<br />
isolert sett mulighet for å generere nyttig<br />
informasjon. I MECMED-prosjektet inngår<br />
laparoskopisk video som et av mange<br />
elementer som sammenstilt med andre<br />
informasjonskilder om pasienten vil kunne<br />
øke nytteverdien ytterligere.<br />
Siden prosjektet er i startfasen foreligger<br />
det ingen bearbeidede resultater enda.<br />
Prosjektdeltagerne forventer at en ved hjelp<br />
av sammenstilling av informasjon fra mange<br />
kilder knyttet til behandling av enkeltpasienter,<br />
vil kunne nærme seg muligheten for å gi<br />
individbasert og skreddersydd behandling til<br />
den enkelte. Dette gjelder særlig koblingen<br />
mellom molekylærbiologiske data og andre<br />
kliniske data. Laparoskopisk behandling<br />
inngår som en sentral del av behandlingen.<br />
Grunnlaget for strukturering av laparoskopisk<br />
video er etablert, og i tiden som kommer<br />
vil resultatene og erfaringene vise om<br />
de forventede resultatene nås •<br />
NTLF-Nytt<br />
<strong>Kirurgen</strong> nr. 2, <strong>2012</strong><br />
143