User Guide: ekspert™ nanoLC 400 Systems Operator ... - Eksigent

ContentsA/D Converter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .105Appendix B Theory of Operation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .107Microfluidic Flow Control Plus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .107How the MFC Plus System Works . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .108Calculating the Flowrate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .108Appendix C External Interface Connections . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .109ekspert nanoLC 400 Pump . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .109Pin Assignment . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .110ekspert nanoLC 400 Autosampler . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .111Pin Assignment . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .112A/D Converter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .114Pin Assignment . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .114Appendix D Standard Plumbing Diagrams . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .115ekspert nanoLC 415 Systems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .115ekspert nanoLC 425 Systems . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .117Appendix E Autosampler Method Editor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .119Create a Basic Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .119Method Editor Options . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .120Create an Advanced Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .122Advanced Editor Options . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .124Direct Inject Method—Commands . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .127Appendix F Basic Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .129Direct Inject Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .129Trap-and-elute Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .134Gradient 1 Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .139Appendix G Working with Analyst® Software . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .145Example Experiment . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .145Verify the Hardware Profile . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .146Create a Hardware Profile . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .147Enable the Column Oven . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .147Equilibrate the System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .148Create the Autosampler and LC Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .149Create the Acquisition Method and the Batch . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .149Create the Acquisition Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .149Create the Acquisition Batch . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .150Submit the Batch . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .151Monitor the Run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .151Appendix H 2-D Reverse-phase/Reverse-phase LiquidChromatography Workflow . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .153The Example Experiment . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .154Workflow Steps . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .154Plumb the System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .154Create the Autosampler Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .156The Injection Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .156Operator Guideekspert nanoLC 400 SystemsD5033460 C 7 of 174