UNIVERSIDAD INTERNACIONAL DE ANDALUCÍA - Justicia Forense

Análisis de las secuencias de la región ITS para la identificación dehongosEl análisis comparativo de una secuencia desconocida con las bases dedatos públicas, EMBL o Gen Bank, puede ser un método útil de identificaciónde especie. Estas bases de datos disponen, via Internet, de programas decomparación de secuencias: FASTA y BLAST (Based Local Alignment SearchTool). Comentarios: aunque existen muchas secuencias publicadas de lasregiones ITS todavía son insuficientes para identificar algunos hongos. Elconstante aumento de secuencias permitirá ir identificando las setasresponsables de producir intoxicaciones.Diseño de test rápidos para la identificación de especieEl alineamiento y comparación de las secuencias nucleotídicas de unadeterminada región diana entre ejemplares de la misma y de distinta especie,permite conocer la variabilidad de la región y si es apta para el diseño denuevos test. Cada vez se investiga más el diseño de iniciadores específicos deespecie o sondas TaqMan mediante Real-Time PCR (RT-PCR). Comentarios:son sistemas de identificación menos problemáticos y más rápidos que lasecuenciación.