Drosophila - Severo Ochoa - Universidad AutÃ³noma de Madrid

More documents

Recommendations

Info

$Medium Refractive index Disolved in 0.25% PPD, 0.0025% DABCO ...$

Jefe de Línea / Group Leader: Carlos Alonso Bedate Parasitología molecular Molecular parasitology E2 Publicaciones Personal Científico / Scientific Staff: Manuel Soto Álvarez Postdoctorales / Postdoctoral: Nuria Parody de la Fuente Becarios Predoctorales / Predoctoral Fellows: Salvador Iborra Martín Javier Carrión Herrero Daniel Ruiz Abanades Yago Pico de Coaña Técnicos de Investigación / Technical Assistance: Miguel Ángel Fuertes Regulación de la expresión génica Regulation of gene expression Resumen de investigación Las histonas de Leishmania son immunógenos relevantes tanto durante la infección por el parásito como durante la enfermedad. La administración de una mezcla de 4 plásmidos que codifican las histonas de L. infantum H2A, H2B, H3 y H4 indica que estas proteínas inducen una respuesta humoral de tipo Th1 IgG2a asociada a una producción de IFN-γ además de proteger de forma eficaz contra la infección por L. major. Nuestros esfuerzos se centran en la actualidad en la identificación de otros antígenos que puedan ser empleados como vacunas y en el diseño de modelos de infección. Hemos analizado si la administración de la proteína ribosómica PO es capaz de proteger contra la infección. Para ello hemos utilizado dos modelos o sistemas de infección: una inoculación subcutánea de los parásitos L. major a ratones BALB/c y una inoculación intradérmica de una dosis baja de parásitos infectivos a ratones resistentes C57BL/6. Demostramos que estos ratones vacunados con LiP0-DNA o con la proteína más un adyuvante formado por motivos CpG se protegen contra el desarrollo de una patología dérmica. En estos ratones la densidad de parásitos es mucho más reducida. La protección se asoció a la producción de IFN-γ localizada en el sitio de la lesión. La inmunización con rLiP0 más el adyuvante CpG indujo solamente una protección parcial en ratones BALB/c a pesar de que los anticuerpos generados fueron preferentemente de tipo IgG2a. Los datos indican que el empleo del modelo de infección BALB/c para el estudio de Leishmaniasis cutánea puede no ser útil para validar el valor vacunal de algunos antígenos de Leishmania. Nuestra investigación se ha dirigido también a entender el mecanismo de la alta flexibilidad conformacional del DNA. Se empleó para analizar esta flexibilidad la transición B-Z-B como modelo. Estudiamos la fuerzas que dirigen esta transición haciendo una revisión crítica de los modelos que se han presentado los últimos 30 años y las consecuencias que se desprendían de estos modelos. Hicimos algunas predicciones y presentamos un modelo unificado “probable” que puede explicar la flexibilidad conformacional del DNA. Research summary Leishmania histones are relevant immunogens during both Leishmania infection and disease. The intramuscular injection of a mixture of four plasmid DNAs, encoding the L. infantum histones H2A, H2B, H3 and H4 induced a specific Th1 immune response associated with an antigen-specific production of interferon (IFN-gamma) and an IgG2a response. The administration of these proteins as a DNA vaccine efficiently controls Leishmania major infection. The objective of our further efforts is to identify other antigens that may be used as vaccines. We tested the Leishmania infantum acidic ribosomal protein P0 (rLiP0) using two different models of infection: a subcutaneous inoculation of L. major parasites in BALB/c and the intradermal inoculation of a low infective dose in resistant C57BL/6. We demonstrated that C57BL/6 mice vaccinated with LiP0-DNA or rLiP0 protein plus CpG motifs were protected against the development of dermal pathology showing a reduction in parasite load. The protection was associated with production of IFN-γ in the dermal site. Immunization with rLiP0 plus CpG ODN is able to induce only partial protection in BALB/c. The antibodies generated against LiP0 were predominantly of the IgG2a subtype. The data indicated that the use of BALB/c model of cutaneous leishmaniasis may not be useful to value the potential efficacy of some vaccines based on defined proteins. Our research activity has been also centred in the understanding of the mechanisms of conformational DNA flexibility. The left-handed Z-DNA was used as a model system. We analyzed the mechanisms that drive the B-Z transition, reviewing with a critical approach the mechanisms presented in the last 30 years and the subsequent progression of ideas. We made some predictions and presented a “probable” unified model that may explain the B-Z-B conformation flexibility. Publications Nguewa, P. A., Fuertes, M. A., Iborra, S., Najajreh, Y., Gibson, D., Matínez, E., Alonso, C. and Perez, J. M. (2005). Water soluble cationic trans-platinum complexes which induce programmed cell death in the protozoan parasite Leishmania infantum. J. Inorg. Biochem. 99, 727-736. Mendieta, J., Fuertes, M. A., Kunjishapatham, R., Santa-Maria, I., Moreno, F. J., Alonso, C., Gago F., Munoz, V., Avila, J.and Hernandez, F. (2005). Phosphorylation modulates the alpha-helical structure and polymerization of a peptide from the third tau microtubule-binding repeat. Biochim. Biophys. Acta. 1721, 6-26. Nguewa, P. A., Fuertes, M. A., Valladares, B., Alonso, C. and Perez, J. M. (2005). Poly (ADP-ribose) polymerases: homology, structural domains and functions. Novel therapeutical applications. Prog. Biophys. Mol. Biol. 88, 143-172. Carvalho, L.P., Passos, S., Dutra, W.O., Soto, M., Alonso, C., Gollob, K. J., Carvalho, E.M. and Ribeiro de Jesus, A. (2005). Efect of LACK and KMP11 on IFN-gamma production by peripheral blood mononuclear cells from cutaneous and mucosal leishmaniasis patients. Scand. J. Immunol. 61, 337-442. Nguewa, P. A., Fuertes, M. A., Cepeda, V., Iborra, S., Carrion, J., Valladares, B., Alonso, C. and Perez J. M. (2005). Pentamidine is an antiparasitic and apoptotic drug that selectively modifies ubiquitin. Chem. Biodivers. 2, 1387-1400. Quijada, L., Soto, M. and Requena, J. M. (2005). Genomic DNA macroarrays as a tool for analysis of gene expression in Leishmania. Exp. Parasitol. 111, 64-70. Folgueira, C., Quijada, L., Soto, M., Abanades, D. R., Alonso, C. and Requena, J. M. (2005). The translational efficiencies of the two Leishmania infantum HSP70 mRNAs, differing in their 3'-untranslated regions, are affected by shifts in the temperature of growth through different mechanisms. J. Biol. Chem. 280, 35172-35183. Iborra, S., Carrion, J., Anderson, C., Alonso, C., Sacks, D. and Soto, M. (2005). Vaccination with the Leishmania infantum acidic ribosomal P0 protein plus CpG oligodeoxynucleotides induces protection against cutaneous leishmaniasis in C57BL/6 mice but does not prevent progressive disease in BALB/c mice. Infect. Immun. 73, 5842-5852. Nguewa, P, A., Fuertes, M, A., Cepeda, V., Alonso, C., Quevedo, C., Soto, M. and Perez, J.M. (2006). Poly(ADP-ribose) polymerase-1 inhibitor 3-aminobenzamide enhances apoptosis induction by platinum complexes in cisplatin-resistant tumor cells. Med. Chem. 2, 47-53. Carrion, J., Nieto, A., Iborra, S., Iniesta, V., Soto, M., Folgueira, C., Abanades, DR., Requena, J. M. and Alonso, C. (2006). Immunohistological features of visceral leishmaniasis in BALB/c mice. Parasite Immunol. 28, 173-183. Fuertes, M. A., Cepeda, V., Alonso, C. and Perez, J. M. (2006). Molecular mechanisms for the B-Z transition in the example of poly[d(G-C) x d(G-C)] polymers. A critical review. Chem. Rev. 106, 2045-2064. Morell, M., Thomas, M. C., Caballero, T., Alonso, C. and López, M. C. (2006). The genetic immunization with paraflagellar rod protein-2 fused to the HSP70 confers protection against late Trypanosoma cruzi infection. Vaccine. 24, 7046-7055. CBM 2005/2006 116 Figura 1. Evolución de las lesiones causadas por la infección con L. major en ratones C57BL/6. Los ratones fueron inmunizados dos veces con un espacio de 15 días. La infección se realizó 4 semanas después de la última inmunización. En el margen de la derecha se muestran las lesiones observadas a la sexta semana después de la infección. ALM: proteínas totales solubles de Leishmania. Figure 1. Evolution of the lesions induced by L. major infection in C57BL/6. The mice were immunized on days 0 and 15. The mice were infected 4 weeks after the second immunization. In the right hand of the figure the lesions observed at the sixth week are shown. ALM: soluble Leishmania antigens. 117
Jefe de Línea / Group Leader: Ricardo Amils Biología molecular de extremófilos Molecular biology of extremophylic microorganisms E3 Personal Científico / Scientific Staff: Irma Marín Francisco Santamaría José Luis Sanz Francisco Hernández Lola García Grávalos Postdoctorales / Postdoctoral: Moustafá Malki Emiliano Díaz Becarios Predoctorales / Predoctoral Fellows: Enrique Marín Antonio García Lucía Palacios Nuria Fernández Thorsten Köchling Alberto González Fairen Nicolás Raho Lilia Montoya Monika Oggerin de Orube Carlotta Vizioli Patxi San Martín-Üriz Eric Zettler Técnicos de Investigación / Technical Assistance: Nuria Rodríguez Científicos Visitantes / Visiting Scientists: Antonio Lazcano (U. Nacional de México, Mexico) Linda Amaral (MBL Woods Hole, USA) Vicente Marcano (Universidad de los Andes, Venezuela) Sarah Stewart Johnson (Harvard Medical School, USA) Konstantinos A. Kormas (University of Thessaly, Grecia) Mohieddine Moumni (Universidad Moulay Ismaïl, Meknès Marruecos) Rosa Martínez Silvestre (Universidad de Cantabria, España) Beatriz Reguera Ramirez (Instituto Oceanográfico Español, Vigo, España) Regulación de la expresión génica Regulation of gene expression Resumen de investigación El grupo de Biología Molecular de Extremófilos posee distintas líneas de investigación cuyos objetivos principales se resumen a continuación: Acidofilia: ecología molecular, biología molecular y biotecnología de microorganismos que se desarrollan en ambientes ácidos, con especial énfasis en los aspectos aplicados de los mismos: biohidrometalurgia, biodesulfuración de carbones, secuestro específico de metales pesados, fitorremediación. Ecología microbiana de ambientes extremos terrestres como modelos de interés en astrobiología: geomicrobiología de la cuenca del Tinto (análogo de Marte) y de las lagunas hipersalinas de la Mancha (análogos de Europa). Este trabajo se desarrolla en colaboración con el laboratorio de Extremofilia del Centro de Astrobiología (CSIC-INTA). Ecología molecular microbiana de ambientes anaerobios: I) Caracterización de la microbiota de sedimentos marinos y reactores desnitrificantes y su implicación, respectivamente, en la degradación anaerobia de alquilbenceno sulfonato (LAS) y en la eliminación simultánea de NO3 - y H2S/S2O3 2- (desnitrificación autotrófica). II) Metanogénesis en ambientes inusuales. III) Degradación anaerobia de xenobióticos (LAS, organoclorados). Microalgas tóxicas: I) Desarrollo de métodos moleculares para la detección de organismos productores de toxinas diarreicas (DSP) y paralizantes (PSP); II) Aislamiento y caracterización de bacterias asociadas a cepas tóxicas y no tóxicas del dinoflagelado Alexandrium minutum productor de toxinas paralizantes (PSP). Posible interés biotecnológico; III) Estudio de la variabilidad genética de Dinophysis spp. Figura 1.Hibridación de fitoplacton marino. Figure 1. Hybridization of marine phytoplankton. Research summary The Extremophiles group has different research projects in which the main objectives are the following: Acidophilia: molecular ecology, molecular biology and biotecnology of microorganisms developing in acidic environments, with special emphasis in their potential applications: biohydrometallurgy, coal biodesulfurization, specific metal sequestering, phytoremediation. Microbial ecology of terrestrial extreme environments as models of interest in astrobiology: geomicrobiology of the Tinto River Basin (Mars analog) and the hypersaline ponds from la Mancha (Europa analogs). This work is done in collaboration with the laboratory of Extremophiles of the Centro de Astrobiología (CSIC-INTA). Microbial molecular ecology of anaerobic environments: I) Characterization of the microbiota of marine sediments and denitrifying reactors and its respective implication in the anaerobic degradation of alkylbencene sulfonate (LAS) and in the elimination of NO3 - y H2S/S2O3 2- (autotrophic denitrification). II) Methanogenesis of unusual environments. III) Anaerobic degradation of xenobionts (LAS, organochlorides). Harmful algal blooms: I) Development of molecular methodologies for the detection of microalgae producing diarrhetic shellfish poisoning (DSP) or paralytic shellfish poisoning (PSP), II) Isolation and characterization of bacteria associated to toxic and non-toxic strains of Alexandrium minutum, a producer of paralytic shellfish poisoning (PSP); Posible biotechnological interest. III) Study of the genetic variability of Dinophysis spp. Publicaciones Publications Bruscella, P., Cassagnaud, L., Ratouchniak, J., Brasseur, G., Lojou, E., Amils, R. and Bonnefoy, V. (2005). Tat-dependent processing and translocation in Escherichia coli of the HiPIP from the acidophilic Acidithiobacillus ferrooxidans. Microbiology. 151, 1421-1431. Briones, C., Manrubia, S.C., Lázaro, E., Lazcano, A. and Amils, R. (2005). Reconstracting evolutionary relationships from functional data: a consistent classification of organisms based on translation inhibition response. Molec. Phylogen. Evol., 34, 371-381. González-Toril, E., Martínez-Frías, J., Gómez Gómez, J., Rull, F., Amils, R. (2005). Iron-meteorite eating bacteria. Astrobiology. 5, 406-414. López-Archilla, A.I., González, A.E., Terrón, M.C., Amils, R. (2005). Diversity and ecological relationships of the fungal populations of an acidic river of Southwestern Spain: the Tinto River. Canadian J. Microbiol. 50, 923-934. Amils, R. (2005). Extremofilia, interés astrobiológico. Rev. Esp. Física. 19, 24-28. Fernández-Remolar, D., Morris, R.V., Gruener, J.E., Amils, R. and Knoll, A.H. (2005). The Rio Tinto Basin, Spain: Mineralogy, Sedimentary Geobiology, and implications for interpretation of outcrop rocks at Meridiani Planum, Mars. Eart Planet.Sci.Lett. 240, 149-167. Amils, R, Gómez-Elvira, J. (2005). Río Tinto: en busca de vida marciana. Espacio. 2, 66-70. Schulze-Makuch, D., Irwin, L.N., Lipps, J.H., Lemote, D., Dohm, J.M. and Fiaren, A.G. (2005). Scenarios for the evolution of life on Mars. J. Geophys. Res. Vol 110, E12S23, doi:10.1029/2005JE002430,2005. Aguilera, A., Amils, R. (2005). Tolerante to cadmium in Chlamydomonas sp. (Chlorophyta) strains isolated from an extreme acidic environment, the Tinto River (SW, Spain). Aquatic Toxicology. 75, 316-329. Fairen, A.G., Dohm, J.M., Uceda, E.R., Rodríguez, A.P., Baker, V.R., Fernández-Remolar, D., Shulze-Makuch, D. and Amils, R. (2005). Prime candidate sites for astrobiological exploration through the hydrological history of Mars. Planetary and Space Science. 53, 1355-1375. Marín, I., Sanz, J.L. and Amils, R. (editores). (2005). Biotecnología y medioambiente. Editorial Ephemera. ISBN: 84-609-7344-1. González-Toril, E., Gómez, F., Malki, M. and Amils, R. (2006). Isolation and study of acidophilic microorganisms. In: Rainey, F., Oren, A. (eds.). Methods in Microbiology. Elsevier, Oxford, Vol. 35, pp. 463-502. Palacios, L., Reguera, B., Franco, J. and Marín, I. (2006). Phylogenetic diversity of bacteria associated with toxic and non-toxic strains of Alexandrium minutum. African J. Marine Science. 28, 409-414. Prieto-Ballesteros, O., Kargel, J.S., Fiaren, A.G., Fernández-Remolar, D., Dohm, J.M. and Amils, R. (2006). Interglacial clathrate destabilization on Mars: Posible contributing source of its atmospheric methane. Geology. 34, 149-152. Palacios, L., Arahal, D.R., Reguera, B. and Marín, I. (2006). Hoeflea alexandrii sp. Nov., isolated from the toxic dinoflagellate Alexandrium minutum AL1V. Int. J. System. Evol. Microbiol. 56, 1991-1995. Fernández, N., Gómez, R., Amils, R. and Sanz, J.L. (2006). Microbial community of autotrophic denitrifying UASB reactors. In IWC2006, Porto, Portugal, pp. 284-290. ISBN 972-8688-40-7. Aguilera, A., Manrubia, S.C., Gómez, F., Rodríguez, N. and Amils, R. (2006). Eukaryotic community distribution and its relationship to water physicochemical parameters in an extreme acidic environment, Río Tinto (Southwestern Spain). Appl. Environm. Microbiol. 72, 5325-5330. Navarro-González, R., Navarro, K.F., de la Rosa, J., Iñiguez, E., Molina, P., Miranda, L.D., Morales, P., Cienfuegos, E., Coll, P., Raulin, F., Amils, R. and MacKay, C. (2006). The limitations on organic detection in Mars-like soils by thermal volatilization-gas chromatography-MS and their implications for the Viking results. PNAS, 103, 16089-16094. Fernández, M., Gómez, R., Amils, R., Sierra-Alvarez, R., Field, J.A. and Sanz, J.L. (2006). Microbiological and structural aspects of granular sludge from autotrophic denitrifying reactors. Water Science and Technolog. 54, 11-17. Malki, M., González-Toril, E., Sanz, J.L., Gómez, F., Rodríguez, N. and Amils, R. (2006). Importance of the iron cycle in biohydrometallurgy. Hydrometallurgy. 83, 223-228. Díaz, E.E., Stams, A.J.M., Amils, R. and Sanz, J.L. (2006). Phenotypic properties and microbial diversity of methanogenic granules from a full-scale upflow anaerobic sludge bed reactor trating brewery wastewater. Appl. Environm. Microbiol. 72, 4942-4949. Aguilera, A., Gómez, F., Lospitao, E. and Amils, R. (2006). A molecular approach to the characterization of the eukaryotic communities of an extreme acidic environment: methods for DNA extraction and denaturating gradient gel electrophoresis analysis. Syst. Appl. Microbiol. 29, 593-605. Hutchinson, L., Mustard, J., Gendrin, A., Fernández-Remolar, D. Amils, R. and Amaral-Zettler, L. (2006). Finding mineralogically interesting targets for exploration from spatially coarse visible and near IR spectra. Earth Planet. Sci. Lett. 252, 201-214. CBM 2005/2006 118 Figura 2. Estructura de lodo granular. Figure 2. Structure of granular sludge. Schulze-Makuch, D., Dohm, J.M., Fiaren, A.G., Baker, V.R., Fink, W. and Strom, R.G. (2005). Venus, Mars, and the ices of Mercury and the Moon: astrobiological implications and proponed misión designs. Astrobiology. 5, 778- 795. González-Toril, E., García-Moyano, A. and Amils, R. (2005). Phylogeny of prokaryotic microorganisms from the Tinto River. In: Harrison, S.T.L., Rawlings, D.E., Petersen, J. (eds.), IBS2005. Cape Town University, Cape Town, pp. 737-749. Malki, M., González-Toril, E., Sanz, J.L. Gómez, F., Rodríguez, N. and Amils, R. (2005). Importance of the iron cycle in biohydrometallurgy. In: Harrison, S.T.L., Rawlings, D.E., Petersen, J. (eds.), IBS2005. Cape Town University, Cape Town, pp. 737- 749. Tesis doctorales Doctoral Theses Alberto González Fiaren. (2006). Datación de posibles procesos biológicos en Marte en función de su historia tectónica y de la evolución hidrogeológica y geoquímica de los océanos. 119
Page 1 and 2:
Memoria Científica 05-06 • Scien
Page 3 and 4:
Índice Index Comentarios del direc
Page 5 and 6:
CBM 2005/2006 6 Director´s Comment
Page 7 and 8:
Personal Personnel CBM 2005/2006 10
Page 9 and 10: CBM 2005/2006 Personal Personnel 14
Page 11 and 12: Jefe de Grupo / Group Leader: Ana B
Page 13 and 14: Jefe de Línea / Group Leader: Jos
Page 15 and 16: Jefe de Línea / Group Leader: Isab
Page 17 and 18: Jefe de Línea / Group Leader: Juan
Page 19 and 20: Jefe de Línea / Group Leader: Mar
Page 21 and 22: BBiología Celular Cell Biology La
Page 23 and 24: Jefe de línea / Group Leader: Isab
Page 25 and 26: Jefe de línea / Group Leader: Fran
Page 27 and 28: Jefe de línea / Group Leader: Igna
Page 29 and 30: CInmunología y Virología Immunolo
Page 33 and 34: Jefe de Línea / Group Leader: Este
Page 35 and 36: Jefe de Línea / Group Leader: Maur
Page 39 and 40: Jefe de Línea / Group Leader: Juan
Page 41 and 42: Jefe de Línea / Group Leader: Mar
Page 43 and 44: Jefe de Línea / Group Leader: Fran
Page 45 and 46: DNeurobiología Neurobiology Locali
Page 47 and 48: Jefe de Línea / Group Leader: Jes
Page 49 and 50: Jefe de Línea / Group Leader: F. J
Page 53 and 54: Jefe de Línea / Group Leader: Fede
Page 55 and 56: Jefe de Línea / Group Leader: Jorg
Page 57 and 58: Jefe de Línea / Group Leader: Fran
Page 59: Jefe de Línea / Group Leader: Migu
Page 65 and 66: Jefe de Línea / Group Leader: Cés
Page 67 and 68: Jefe de Grupo / Group Leader: Marí
Page 69 and 70: CBM 2005/2006 134 Jefe de Línea /
Page 71 and 72: Jefes de Línea / Group Leaderd: An
Page 75 and 76: Unidad de bioinformática Bioinform
Page 77 and 78: Cultura y divulgación científica
Page 79 and 80: Seminarios, servicios de apoyo y le
Page 81 and 82: Seminarios Seminars Seminarios del
Page 83 and 84: Servicios técnicos de apoyo a la i
Page 85 and 86: Lecciones conmemorativas Memorial l
show all

Drosophila - Severo Ochoa - Universidad AutÃ³noma de Madrid

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?