Revista Newslab Edição 159

MEDICINA GENÔMICA
Metagenômica: inovação no diagnóstico
e vigilância de vírus emergentes
Por: Deyvid Amgarten e Fernanda Malta
A cada dia que passa tem se tornado mais
evidente a eficiência e adequabilidade dos
testes moleculares no diagnóstico de doenças
infecciosas, sobretudo aquelas causadas
por vírus como é o caso da atual pandemia
de COVID19. Os testes moleculares são capazes
de detectar o material genético do
patógeno, atestando de forma direta sua
presença na amostra.
Colocando em perspectiva, os diferentes
testes disponíveis para o diagnóstico de CO-
VID19 têm a sua utilidade bem definida. O
teste molecular de RT-qPCR é especialmente
importante para identificar indivíduos com
carga viral, permitindo que medidas de restrição
como a quarentena sejam aplicadas
com o objetivo de bloquear a disseminação
viral. Já os testes imunológicos podem ser
usados para identificar indivíduos que já
foram expostos ao patógeno e podem ser
utilizados para conferir “Passaportes imunológicos”,
de forma a atestar sua imunidade à
doença. Todavia, nenhum destes testes mostrou-se
adequado para o diagnóstico inicial
em surtos, ou seja, para a identificação de
novos patógenos virais no momento que eles
são emergentes.
O novo coronavírus, nomeado posteriormente
de SARS-CoV-2, foi identificado rapidamente
na cidade de Wuhan por uma técnica
de pesquisa e diagnóstico denominada
“Metagenômica”. Trata-se de uma técnica
molecular que também é capaz de identificar
diretamente o material genético do vírus,
mas diferentemente da técnica de RT-qPCR,
a metagenômica não é uma técnica direcionada,
ou seja, com um alvo específico. Ao invés
disso, a técnica faz uso da extração total
do material genético da amostra, seguida do
sequenciamento massivo paralelo (também
conhecido como sequenciamento de nova
geração NGS) e da análise bioinformática
para buscar o genoma e identificar o patógeno
de forma precisa.
Do momento da identificação do patógeno
associado ao surto da síndrome respiratória
aguda em Wuhan até o final de janeiro de
2020, o diagnóstico dos pacientes foi possível
somente através da metagenômica. A
partir do depósito do genoma em bancos
públicos, ensaios de RT-qPCR começaram
a ser desenvolvidos no mundo através de
estudos detalhados das regiões do genoma
viral.
Enquanto isso, os primeiros casos suspeitos
de COVID19 eclodiam no Brasil,
sendo descartados um a um pela técnica
de metagenômica desenvolvida internamente
no Hospital Israelita Albert Einstein.
Por se tratar de uma técnica que não
possui um patógeno viral específico como
alvo, a mesma é capaz de diagnosticar
arboviroses, hepatites virais e síndrome
respiratórias de uma miríade de vírus diferentes,
incluindo todos os vírus da família
Coronaviridae.
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Revista NewsLab | Abr/Mai 2020