Untersuchungen zum Vorkommen und zur gesundheitlichen ...

Actinomycetales besitzen L-Lysin, L-Ornithin oder L-Diaminobuttersäure als
diagnostische Diaminosäure der Zellwand. Von den Sporoactinomyceten haben nur
4 Gattungen: Couchioplanes, Catenuloplanes, Actinomyces, Actinobaculum L-Lysin
anstelle von Diaminopimelinsäure in ihrer Zellwand. Diese Diaminosäuren kommen
als Bestandteile von Peptiden im Zytoplasma vor, deshalb ist bei Isolaten, in denen
keine LL- bzw. meso-DAP gefunden wird, eine aufwändige Präparation reiner
Zellwände nötig, um die vernetzende Diaminosäure im Peptidoglycan nachzuweisen.
Die große Variabilität der vernetzenden Diaminosäure und der Interpeptidbrücke des
Peptidoglycans ist im „Key to Murein (Peptidoglycan) Types“ im DSM-Katalog bzw.
auf der Web-Seite der DSMZ dokumentiert.
Weitere chemotaxonomische Marker wie die Menachinonmuster, Fettsäuremuster
und das Vorhandensein von Mycolsäuren tragen zur sicheren Gattungsdiagnose bei.
Innerhalb der Actinomyceten sind die vorkommenden Menachinonmuster sehr
vielfältig und charakteristisch für die einzelnen Gattungen.
Fettsäuren kommen als Bestandteile von Phospholipiden und Glycolipiden in der
Zytoplasmamembran der Bakterien vor. Mehr als 300 unterschiedliche Strukturen mit
Kettenlängen bis zu 90 C-Atomen wurden bisher bei Bakterien gefunden. Ihre Vielfalt
in Bezug auf die Anzahl der C-Atome, die Position von Doppelbindungen und
unterschiedliche Substituenten sowie ihre streng regulierte Biosynthese machen sie
zu wertvollen taxonomischen Markern. Von besonderer diagnostischer Bedeutung
sind Fettsäuren mit Kettenlängen zwischen C10 und C24 (Suzuki et al., 1983).
Die gaschromatographische Analyse von Fettsäuremethylestern (FAME) ist eine
effektive Methode, die in vielen Fällen übereinstimmende Ergebnisse mit DNA-DNA
Hybridisierungen gegeben hat und findet heute eine breite Anwendung bei der
Identifizierung von klinischen, aber auch von Umweltisolaten. Sie erfordert jedoch
streng standardisierte Kultivierungsbedingungen und Probenvorbereitungen. Eine
Identifizierung bis zur Art kann nur auf der Basis der Analyse der relativen
Zusammensetzung der Fettsäuren eines Isolates und des Vergleichs mit den in der
Datenbank hinterlegten Stämmen (Gattung/Art) erfolgen. Die Fettsäureanalytik zeigt
vor allem die Diversität von Isolaten innerhalb von Gattungen oder taxonomischen
Gruppen.
Die Differenzierung und Klassifizierung von Actinomyceten hat sich mit der
Entwicklung moderner Analyseverfahren und dadurch möglichen großen Anzahl von
Analysen unterschiedlicher Zellbestandteile als chemotaxonomische Marker
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