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LABORWELT 

Nr. 5 / 2007 - Vol. 8 Das -Themenheft 

RNA-Integrität nimmt 

Einfluss auf quantitative 

real-time PCR 

Expressionsanalyse 

von Genen ohne 

Amplifikation 

PCR & DNA-Prep 

Im Interview: 

Arbeitsgruppe Life 

Science Research 

Marktübersicht: 

Thermocycler 

Hochsensitive 

Detektion viraler 

Nukleinsäuren 

Schnell und billig: 

Nanoliter-PCR 

Automatische DNA- 

Aufreinigung im 

mittleren Durchsatz 

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vom 9.-11. Oktober 2007 

auf der Biotechnica 

in Halle 9 am Stand B 12 

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Zum Thema 

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Life Sciences-Firmen 

bitten um Input 

„Wir wollen den Wissenschaftlern eine Möglichkeit bieten, ihre 

Bedürfnisse, ihre Wünsche an die Industrie zu formulieren und 

uns wirklich zu sagen, welche Tools fehlen, wo verbessert werden 

müsste, von Seiten der Industrie, um die Forschung dort schneller 

voranzubringen.“ Das sagt Dr. Ralf Hermann (Eppendorf AG) im 

Gespräch mit LABORWELT (vgl. Seite 24). Dass der erst Ende Juli 

frisch gewählte Vorsitzende der vor einem Jahr offiziell gestarteten 

‚Arbeitsgruppe Life Science Research‘ (LSR AG, vgl. LABORWELT 

5/06) innerhalb des VDGH es ernst meint, zeigen Planungen mit der 

Deutschen Gesellschaft für Proteomforschung (DGPF) gemeinsam 

einen Workshop zu veranstalten, in dem es genau um diese Fragen 

gehen wird. Dass LABORWELT dies an dieser exponierten Stelle 

ankündigt, hat zwei Gründe: 

Erstens, weil wir gerne in LABORWELT ein Forum schaffen 

würden, in dem Wissenschaftler und Unternehmen sich über die 

dringend benötigten Forschungswerkzeuge verständigen können. 

Denn der gegenseitige Nutzen scheint klar: Die Unternehmen wollen 

nicht am Markt vorbei entwickeln, und die Wissenschaftler brauchen 

Bitte nutzen Sie unseren Kennziffer-Service: online unter 

www.biocom.de oder auf unserer Fax-Seite (S. 56). Wenn 

Sie ein Produkt interessiert, einfach Nummer ankreuzen, 

Name und Adresse angeben und faxen/mailen – Sie 

erhalten umgehend Informationen unserer Inserenten. 

effiziente Forschungswerkzeuge. Wenn Sie das auch interessant finden, 

bitten wir um Ihre Zuschriften (laborwelt@biocom.de). Denn nur 

durch Ihr Engagement kann die Chance zum Dialog auch genutzt 

werden. 

Zweitens freut sich die Redaktion LABORWELT, mit der LSR AG 

einen weiteren neuen Partner – diesmal aus der Anwendung – hinzugewonnen 

zu haben, der schon 2008 deutlich mehr als 50% des 

Life Sciences-Forschungsmarktes in Deutschland repräsentieren und 

gemeinsam mit den Forschungsverbänden für mehr Transparenz bei 

der Forschungsförderung streiten will. 

Für die Wissenschaft gilt es, aus der neuen Partnerschaft Nutzen 

zu ziehen. Nutzen Sie also die Möglichkeit, zu kommentieren, 

wünschenswerte Technologieentwicklungen zu formulieren und 

uns zu schreiben, welche Themenfelder Sie gerne in LABORWELT 

abgebildet sehen möchten. 

Übrigens: Wenn Sie die BIOTECHNICA in Hannover besuchen, 

freuen wir uns, wenn Sie an unserem Stand E12 in Halle 9 vorbeischauen. 

Viel Lesevergnügen bei der aktuellen Themenausgabe PCR & 

DNA-Probenvorbereitung wünscht Ihnen 

Thomas Gabrielczyk 

Stilisierte Darstellung der PCR-Amplifikation 

Montage: Heiko Fritz 

Kennziffer 11 LW 05 · Informationen ordern? · www.biocom.de 

I N T R O 

INHALT 

B L I T Z L I C H T 

� Einfluss der RNA-Integrität auf die 

quantitative real-time RT-PCR 4 

Dr. Michael Pfaffl und Dr. Simone Fleige, 

Technische Universität München 


� Schnelle SNP-Diagnostik mit rapid-PCR 

und Fluoreszenz-Endpunktdetektion 10 

Dr. Alexander Berka et al., Analytik Jena AG 

W I S S E N S C H A F T 

� Hochempfindliche PCR-freie 

Genexpressionsanalyse einzelner cDNAs 13 

Prof. Dr. Gerhard Schütz et al., Universität Linz 


� Einfache, robuste und flexible DNA-Aufreinigung 17 

Dr. Tanja Lopez, Promega GmbH, Mannheim 


� Hochempfindliche Detektion viraler Nukleinsäuren 20 

Dr. Herrmann Nieper, LUA Dresden; Dr. Andreas Ockhardt, 

InVi Tek, Berlin; Dr. Arha Lamberg, Thermo-Fisher Scientific, 

Vantaa, Finnland 

I N T E R V I E W 

� „Als Verband wollen wir mit der Wissenschaft reden“ 24 

Dr. Ralf Hermann, Vorsitzender LSR AG; Dr. Thorsten Ebel, 

Sprecher LSR AG 


� Schnelle Zyklen und geringe Kosten: 

Nanoliter-PCR 26 

Dr. Holger Eickhoff, Scienion AG, Berlin 


� „Appleras PCR-Motordeckel-Patent ist nichtig“ 30 

Dr. Christian Kilger, Vossius & Partner, München/Berlin 

N E T Z W E R K 

� Die nächste Welle an Biotech-Wirkstoffen; 

Oligonukleotide 32 

Dr. Joachim Klein, RiNA-Netzwerk, Berlin 


� Keine unvorhergesehenen Ereignisse mehr 

bei PCR und real-time qPCR 24 

Dr. Marcus Neusser, Bio-Rad GmbH, München 

M A R K T Ü B E R S I C H T 

� Thermocycler 39 

� Stellenmarkt 47 

� Verbände 52 

� Produktwelt 53 

� Fax-Seite 56 

� Termine/Impressum 58 

LABORWELT 8. Jahrgang | Nr. 5/2007 | 3

PCR 

� 


Einfluss der RNA-Integrität 

auf die quantitative real-time 

RT-PCR 

Simone Fleige und Michael W. Pfaffl 

Lehrstuhl für Physiologie, Zentralinstitut für Ernährungs- und Lebensmittelforschung, 

Technische Universität München, 

Die mRNA-Quantifizierung via real-time RT-PCR (qRT-PCR) findet heute Anwendung 

in einer Vielzahl molekularbiologisch orientierter Labore. Die Methode birgt allerdings 

– gerade im Bereich der Prä-Analytik – zahlreiche Fehlerquellen. Vor allem die Messung 

der RNA-Qualität führt bis dato noch ein Schattendasein. Das führt häufig zu ungenauen 

Ergebnissen oder zu erheblichen Variationen in den Expressionsergebnissen. Die Optimierung 

und Standardisierung der prä- und post-PCR stellen somit eine besondere 

Herausforderungen bei einer validen mRNA-Quantifizierung dar. Einmal mehr zeigt 

sich die Gesetzmäßigkeit, dass die Präzision der mRNA-Genexpressionsanalyse durch 

die Quantität und Qualität des Ausgangsmaterials, der total-RNA, signifikant beeinflusst 

wird. Die größte Verbesserung verspricht die Optimierung der Probenaufbereitung und 

die Bestimmung der RNA-Integrität sowie die verbesserte Verrechnung der erhaltenen 

real-time RT-PCR-Daten. 

Die Existenz bestimmter mRNA-Sequenzen 

ist Ausdruck der Genexpressionsaktivität 

zugehöriger Gene. Allerdings handelt es 

sich bei der mRNA um ein relativ instabiles 

Molekül. In der Zelle wird mRNA ständig 

aufgebaut und mit Hilfe der Ribonukleasen 

nach der Translation wieder zerlegt. Dies 

macht eine besonders aufmerksame Quali- 

tätskontrolle der RNA erforderlich. Da die 

Genexpressionsanalyse von der Extraktion 

bis hin zu post-qPCR-Applikationen sehr 

zeitaufwendig und laborintensiv ist, sind 

auch die Laborkosten ein nicht unbedeutender 

Faktor. Somit ist das Arbeiten mit 

einer hohen Probenqualität für alle molekularbiologischen 

und diagnostischen 

Abb. 1: Box-Plot der durchschnittlichen RNA-Integritätsnummer (RIN) boviner Gewebe und 

Zelllinien (= rechte fünf Gewebe). Analyse der RNA-Qualität mit dem Bionalyzer 2100. 

Kennziffer 12 LW 05 · www.biocom.de � 

Anwendungen wünschenswert. Vor allem 

vor der Anwendung der quantitativen RT- 

PCR oder vor Array-Applikationen sollte 

die Integrität der RNA deshalb überprüft 

werden. 

RNA-Analytik 

Konventionelle Methoden der RNA- 

Analytik zeigen häufig das Problem der 

Sensitivität oder Spezifität gegenüber 

einzelsträngiger RNA. Zudem werden 

einige Methoden stark beeinflusst durch 

Kontaminationen oder Verunreinigungen 

des Probenmaterials 1 . Unterschiedlichste 

Methoden für die Qualitätsbestimmung 

stehen zur Verfügung: die klassische Messung 

der optischen Dichte (OD), die moderne 

OD-Messung mittels Nanodrop, die 

altbekannte Agarose-Gel-Elektrophorese 

oder die innovative Lab-on-Chip-Technologie 

2,3 . Um die Qualität und die Quantität 

der extrahierten RNA zu testen, empfiehlt 

es sich, die RNA-Integrität mittels Kapillargelelektrophorese 

zu überprüfen. Die 

Kapillargelelektrophorese ist in den letzten 

Jahren auf ein immer größeres Interesse 

gestoßen, vor allem in Hinblick auf die 

Bedeutung der RNA-Integrität. Sowohl der 

Bioanalyzer 2100 (Agilent Technologies, 

Waldbronn, Deutschland) als auch der 

Experion (Bio-Rad Laboratories, Hercules, 

CA,) bieten die Möglichkeit einer schnellen 

und sensitiven RNA-Qualitätsbestimmung 

via Lab-on-Chip im pg-Bereich. 

Die sogenannte RNA-Integritätsnummer 

(RIN) stellt ein Qualitätslabel dar, das von 

Agilent Technologies und Quantiom Bioinformatics 

entwickelt wurde. Bei diesem 

System wird der RNA-Qualität ein Zahlenwert, 

der RIN-Wert, zugeordnet. Auf Basis 

der ribosomalen Untereinheiten 28S- zu 

18S-rRNA und deren Verhältnis sowie degradierten 

Abbauprodukten wird von der 

Software ein RIN-Wert auf einer Skala von 

1 bis 10 ermittelt. Dabei entspricht 1 einer 

vollständig degradierten RNA und 10 einer 

völlig intakten RNA. Mit der RIN-Skala hat 

sich inzwischen ein weltweiter RNA-Qualitätsstandard 

entwickelt. 

Sorgfältige Probennahme und 

Aufbereitung – das A und O 

Die Probennahme stellt in der medizinischen 

und veterinärmedizinischen Forschung fast 

immer ein Problem dar. Oft werden Proben 

von Menschen oder Tieren mittels Biopsie 

entnommen, oder die Gewebeproben 

stammen von inhomogenen Tieren vom 

Schlachthof. Zudem ist die Integrität der 

Probe sehr stark vom beprobten Gewebe 

abhängig 3 . Bessere RNA-Integritätswerte 

4 | 8. Jahrgang | Nr. 5/2007 LABORWELT

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Passenger 

strand 

Target degradation


Abb. 2: Regression der Genexpressionsdaten (Ct) aus einer bovinen Corpus luteum-Zellkultur 

versus RIN. Alle vier Gene wurden durch die RNA-Integrität signifikant beeinflusst (P

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SNP-Diagnostik 

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Schnelle SNP-Diagnostik mit 

rapid-PCR und Fluoreszenz- 

Endpunktdetektion 

Melanie Trenkmann, Elmara Graser, Timo Hillebrand, Alexander Berka 

Analytik Jena AG, Business Unit ‘Bio Solutions’ 

Die Ansprüche an ein PCR-System und die benötigten Geräte steigen, wenn mehrere 

Fragmente innerhalb eines Reaktionsraumes amplifiziert werden sollen. Auch ist eine 

elektrophoretische Auswertung der PCR-Produkte nur dann möglich, wenn diese 

sich in der Größe unterscheiden. Bei der Diagnostik von Single Nukleotid-Polymorphismen 

(SNPs), wie dem SNP309 in der Promotorregion des Mdm2-Gens (vgl. Abb. 

3), der mit der Entwicklung von Tumoren in Verbindung gebracht wird, scheitert die 

Elektrophorese. Um dennoch spezifische Ergebnisse in kürzester Zeit zu generieren, 

können PCR-Produkte über Fluoreszenzsignale ausgewertet werden. Rapid-PCR und 

die anschließende Endpunktdetektion ermöglichen die parallele Analyse des Wildtyp- 

und des mutanten (SNP309) Allels im Mdm2-Gen innerhalb nur einer Stunde. 

Das Verfahren der PCR (engl. Polymerase 

Chain Reaction) ist eine der wichtigsten 

molekularbiologischen Methoden überhaupt 

und wird für ständig neue Anwendungen 

herangezogen. Da jedoch die Zusammenhänge 

zwischen Temperatur und Wechselwirkung 

der Einzelkomponenten sehr 

komplex sind, gestaltet sich die Entwick- 

lung von Experimenten zum Teil immer 

noch schwierig und vor allem langwierig. 

Mit der Entwicklung der rapid-PCR und 

entsprechender Thermocycler, wie dem 

SpeedCycler (Abb. 2) kann die Gesamtlaufzeit 

einer PCR erheblich reduziert werden. 

Der Endpunktdetektor SpeedScan (Abb. 2), 

dessen Funktionalität in der Aufnahme und 

Abb. 1: Die schematische Darstellung des p53-Signalweges als Stressantwort zeigt die Regulation 

von p53 über Mdm2 als negative Rückkopplung und die Funktion des Tumorsuppressors in 

der Zellentwicklung 2,5,7 . 

Analyse von Fluoreszenzsignalen liegt, ermöglicht 

anschließend über ein Analysentool 

zur Gerätesoftware ASpectFA eine einfache 

und schnelle SNP-Diagnostik. 

Der Single Nukleotid-Polymorphismus 

SNP309 im Mdm2-Promotor wird direkt der 

beschleunigten Tumorentstehung erblich 

Abb. 2: Die Rapid-PCR mit dem SpeedCycler 

erlaubt sehr schnelle PCR-Amplifikationen in 

Anlehnung an die erheblich verkürzten Haltezeiten 

bei gleichzeitiger Reduktion der Probenvolumina. 

Durch die Endpunktdetektion der 

amplifizierten PCR-Produkte über Fluoreszenz 

mittels SpeedScan entfällt die Notwendigkeit 

zeitintensiver und zum Teil gesundheitsschädlicher 

Elektrophoresen vollständig. 

bedingter und sporadisch auftretender Krebsarten 

zugeordnet. Das Mdm2-Protein nimmt 

hierbei eine zentrale Stellung im Signalweg 

des Tumorsuppressors p53 (Abb. 1) ein und 

fungiert als direkter Negativregulator von 

p53 1 . 

Anhand der spezifischen SNP309-Diagnostik 

wird nachfolgend die hohe Präzision der 

genannten Analysengeräte und die enorme 

Reduktion des Zeitaufwandes verdeutlicht. 

Bei zellulärem Stress, wie DNA-Schäden 

oder Anomalien im Zellzyklus, wird der Tumorsuppressor 

p53 aktiviert. Dieser initiiert 

Transkriptionsprozesse, die zur Reparatur 

schadhafter DNA, zum Wachstumsarrest von 

Zellen und zum Teil zur Apoptose führen. In 

Folge dessen kann die Vermehrung anomaler 

DNA und somit die Tumorentstehung verhindert 

werden 1-4 . 

In intakten Zellen ist die Konzentration 

an p53 gering und muss streng kontrolliert werden, 

um einen beschleunigten Alterungsprozess 

aufgrund übermäßiger Apoptose zu hemmen 2 . 

Der p53-Hauptregulator ist Mdm2, ein Protein, 

das zum einen als E3-Ubiquitin-Ligase 

und zum anderen als Inhibitor der p53-Transkriptionsaktivität 

fungiert. Darüber hinaus 

regelt p53 die Expression des Mdm2-Proteins 

und somit die eigene Konzentration über eine 

negative Rückkopplung 1-6 . 

Als Antwort auf DNA-Schäden wird 

zunächst eine Proteinkinase aktiviert, 

die p53 phosphoryliert und zur Dissoziation 

des p53-Mdm2-Komplexes führt. 

Unmittelbar nachdem die zelluläre und 

genetische Stabilität wieder erreicht ist, 

erfolgt die Deaktivierung der Proteinki- 



mRNA-Expression des Zielgens mit der 

eines Referenzgens normalisiert, auch als 

delta-Ct (ΔCt)-Methode bekannt 10,11 . Der 

Vorteil der Normalisierung mit einem internen 

Standard liegt in der Reduzierung 

der Varianz der Expressionsergebnisse. 

Gewebe- und Matrixeffekte, unterschiedliche 

RNA-Extraktionseffizienzen und Fehler 

bei der reversen Transkription innerhalb 

einer experimentellen Probe werden 

normalisiert, da sie gleichermaßen beide 

Gene – das Referenz und auch das Zielgen 

– betreffen. Inwieweit sich auch der Einfluss 

der RNA-Integrität durch die relative 

Quantifizierung, sprich durch Normalisierung, 

herausrechnet, zeigt Abbildung 3. Der 

signifikante Einfluss der RNA-Integrität auf 

die Genexpressionsdaten konnte hier auf 

ein Minimum reduziert werden. 

Die normalisierten Werte der untersuchten 

Gene zeigen auch nach der Normalisierung 

eine unterschiedliche Reaktion auf 

die RNA-Integrität. Die stark exprimierten 

Gene für 18S- und 28S-rRNA unterliegen 

auch nach der Normalisierung einer Beeinflussung 

durch die RNA-Integrität. 

Die normalisierten Daten des niedrig 

exprimierten Gens IL-1β werden nach 

der Normalisierung nicht mehr durch die 

Qualität der RNA beeinflusst. Vor allem 

RIN-Werte kleiner als fünf zeigen einen 

stärkeren Einfluss auf die Ct-Werte und auf 

die ΔCt-Werte. 

RIN-Werte über fünf sind somit unabdingbar 

für eine erfolgreiche Genexpressionsanalyse. 

Proben mit einer Integrität 

kleiner als RIN 5 eignen sich auch nach 

einer Normalisierung nur sehr bedingt zur 

Genexpressionsanalyse. Zudem spielen 

auch hier die Gewebe- und Matrixeffekte 

eine bedeutende Rolle 2,3 . 

Zu beachten ist weiterhin, dass nur mit 

einem Referenzgen (β-Actin) normalisiert 

wurde. Die oft übliche Praxis, die Daten 

gegen ein einziges Referenzgen abzugleichen, 

ist wegen der Fehleranfälligkeit nur 

mäßig geeignet. Die Normalisierung gegen 

mehrere Referenzgene, in der Regel zwei 

bis drei, ist unabdingbar für eine korrekte 

Behandlung von Expressionsdaten und 

deshalb in der Regel ein entscheidender 

Schritt bei der Erstellung valider qRT-PCR- 

Expressionsprofile 12 . 

Die relative Quantifizierung lässt sich 

weiter optimieren, indem die unterschiedlichen 

qPCR-Effizienzen der untersuchten 

Gene in die Analyse miteinbezogen werden. 

Die Effizienz-korrigierte relative Quantifizierung 

mittels real-time qRT-PCR stellt bis 

dato die eleganteste Form der Quantifizierung 

dar 10 . Diese Quantifizierungsstrategie 

ist gerade im Hinblick auf den geringen 

Einfluss der RNA-Integrität auf die PCR- 

Effizienz von wichtiger Bedeutung 2,3 . Aus 

diesem Grund kann das Modell auch bei geringfügig 

verschiedener RNA-Qualität an- 


Abb. 3: Normalisierte Daten des bovinen Corpus luteum. Der signifikante Einfluss der RNA- 

Integrität konnte auf ein Minimum reduziert werden. 

gewandt werden, da eine Normalisierung 

bei diesem Modell vorausgesetzt wird. 

Fazit 

Die Studie hat damit gezeigt, wie wichtig 

die Qualitätskontrolle der RNA vor der 

Genexpressionsanalyse ist. Eine RNA kann 

mit einer Qualität von einem RIN > 5 für die 

qRT-PCR verwendet werden. Optimal sind 

RIN-Werte von 8 bis 10. Zwar muss auch hierbei 

Gewebe- und Matrixeffekten und dem zu 

untersuchendem Gen große Aufmerksamkeit 

geschenkt werden. 

Da wir uns erst am Beginn der Entwicklung 

der Prä-qRT-PCR-Datenanalyse befinden, erscheint 

es notwendig, bei zukünftigeren Datenanalysemethoden 

die Integrität der RNA 

mit einzubeziehen. Auf diese Weise können 

Fehlinterpretationen der Daten vermieden 

und Kosten reduziert werden. Weitere Informationen 

und Publikationen auf: http://RNAintegrity.Gene-Quantification.info 

Literatur 

[1] Imbeaud S, Graudens E, Boulanger V, Barlet X, Zaborski P, Eveno E, 

Mueller O, Schroeder A, Auffray C (2005) Toward standardization of RNA 

quality assessment using user-independent classifiers of microcapillary. 

Electrophoresis traces. Nucleic Acids Res 33(6):e56. 

[2] Fleige S, Pfaffl MW (2006) RNA integrity and the effect on the real-time 

qRT-CR performance. Mol Asp Med 27:126–139. 

[3] Fleige S, Walf V, Huch S, Prgomet C, Sehm J, Pfaffl MW (2006) 

Comparison of relative mRNA quantification models and the impact 

of RNA integrity in quantitative real-time RT-PCR. Biotechnol Lett 

28:1601–1613. 

[4] Perez-Novo CA, Claeys C, Speleman F, Cauwenberge PV, Bachert C, 

Vandesompele J (2005) Impact of RNA quality on reference gene 

expression stability. Biotechniques 39:52–56. 

[5] Bustin SA, Nolan T (2004) Pitfalls of Quantitative Real-Time Reverse- 

Transcription Polymerase Chain Reaction. J Biomol Tech 15:155–166. 

[6] Bar T, Sta˚hlberg A, Muszta A, Kubista M (2003) Kinetic outlier detection 

(KOD) in real-time PCR. Nucleic Acids Research 31 (17), e105. 

[7] Wang T, Brown MJ (1999) mRNA quantification by real time TaqMan 

polymerase chain reaction: validation and comparison with RNase 

protection [In Process Citation]. Analytical Biochemistry 269:198–201. 

[8] Wilson IG (1997) Inhibition and facilitation of nucleic acid amplification. 

Appl Environ Microbiol 63:3741–3751. 

[9] Tichopad A, Dilger M, Schwarz G, Pfaffl MW (2003) Standardized 

determination of real-time PCR efficiency from a single reaction setup. 

Nucleic Acids Res 31(20):e122. 

[10] Pfaffl MW, Horgan GW, Dempfle L (2002) Relative expression software 

tool (REST_) for group-wise comparison and statistical analysis of 

relative expression results in real-time PCR. Nucleic Acids Res 30(9): 

e36. 

[11] Livak KJ, Schmittgen TD (2001) Analysis of relative gene expression 

data using real-time quantitative PCR and the 2[-Delta Delta C(t)] 

method. Methods 25:402–408. 

[12] Vandesompele J, De Preter K, Pattyn F, Poppe B, Van Roy N, De Paepe 

A, Speleman F (2002) Accurate normalization of real-time quantitative 

RT-PCR data by geometric averaging of multiple internal control genes. 

Genome Biology 3: research 0034.1–0034.11 (http://genomebiology. 

com/2002/3/7/research/0034.1) 

Korrespondenzadresse 

PD Dr. Michael W. Pfaffl 

Lehrstuhl für Physiologie 

Technische Universität München 

Zentralinstitut für Ernährungs- und 

Lebensmittelforschung 

Weihenstephaner Berg 3, D-85354 Freising 

eMail: michael.pfaffl@wzw.tum.de 

www.gene-quantification.info 



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Abb. 3: Der SNP309 ist im ersten Intron an 

Position 309 des Mdm2-Gens lokalisiert und 

verstärkt die Bindungsaffinität des Transkriptionsaktivators 

Sp1 an den Mdm2-Promotor 4,5 . 

nase, und p53 wird dephosphoryliert 1-4 . 

Die E3-Ubiquitin-Ligase-Aktivität von Mdm2 

zielt auf beide Proteine ab und veranlasst die 

Ubiquitinierung von p53 und Mdm2 selbst 

für den Abbau durch Proteasome. Dementsprechend 

ist auch die Expression von Mdm2 

aufgrund des degradierten p53 gehemmt, 

womit beide Proteine im Gleichgewicht in 

der Zelle vorliegen (Abb. 1) 5 . 

Eine Überexpression des Mdm2-Proteins 

kann somit onkogen wirken. Der natürlich 

vorkommende Single Nukleotid Polymorphismus 

SNP309 (Abb. 3), bei welchem 

ein Nukleotidaustausch von T nach G an 

Position 309 im ersten Intron des Mdm2- 

Promotors stattgefunden hat, erhöht die 

Affinität für die Bindung des zellulären Sp1- 

Transkriptionsfaktors. Daraus resultierend 

ergibt sich ein zellulär erhöhtes Niveau des 

Mdm2-Proteins, wodurch wiederum der 

p53-Signalweg abgeschwächt wird. Die übermäßige 

Mdm2-Expression verhindert die 

Dissoziation des p53-Mdm2-Komplexes. Das 

notwendige Transkriptionsprogramm zur 

DNA-Reparatur kann somit nicht gestartet 

werden, schadhafte DNA wird unkontrolliert 

vermehrt und kann zur Tumorbildung 

führen 1, 4-6 . 

Experimentdesign zum 

SNP309-Nachweis 

Die für den PCR-Ansatz benötigte DNA 

wurde durch die neuartige DC-Technologie 

A B C 


aus verschiedenen Patientenproben isoliert. 

Diese verbindet einen sehr schnellen und 

hocheffizienten Lyseschritt mit einer extrem 

effizienten Bindung der Nukleinsäure an 

einer festen Phase. Die DNA-Aufreinigung 

ist in ca. 30 Minuten abgeschlossen. 

Die Vervielfältigung des Wildtyp- und des 

mutanten Mdm2-Allels erfolgte anschließend 

unter Anwendung der rapid-PCR 

im SpeedCycler. Hierbei wurde die Differenzierung 

der parallelen Amplifikation 

aufgrund sequenzspezifischer Sonden mit 

unterschiedlicher Farbstoffmarkierung 

realisiert. Nach einer Laufzeit von ca. 25 Minuten 

konnte die vollständige Reaktion mit 

40 Zyklen abgeschlossen werden. 

Auf chemische und oft auch limitierende 

Additive konnte bewusst verzichtet werden, 

da die Geschwindigkeit ausschließlich 

durch den apparativen Aufbau gewährleistet 

wird und nicht von den eingesetzten 

Reagenzien abhängig ist. 

Die darauffolgende Endpunktdetektion 

(Abb. 4 A) beider Flurophore im Endpunktdetektor 

SpeedScan wurde in wenigen Minuten 

durchgeführt. Da der SpeedScan vier 

verschiedene Filtereinheiten beinhaltet, ist 

die kompakte Messeinheit in der Lage, die 

Detektion eines breiten Spektrums PCR-typischer 

Fluoreszenzfarbstoffe abzudecken. 

Die Analyse des SNP erfolgte nach der 

Definition des Plattenlayouts (Abb. 4 B) 

automatisch und wird in Kombination 

mit den Messergebnissen in einem separaten 

Fenster dargestellt (Abb. 4 C). 

Auswertung der SNP-Diagnostik 

mit ASpectFA 

Die Abbildungen 4 und 5 zeigen die klare 

Unterscheidung zwischen Wildtyp, heterozygoten 

und homozygot mutanten Proben, 

sowohl im SNP-Layout der Gerätesoftware 

als auch in der parallel dargestellten Grafik 

(Abb. 5). Basis für die Differenzierung der 

unterschiedlichen Proben ist eine neuartige 

und zum Patent angemeldete Methode. 

Durch den Vergleich beider Fluoreszenzsi- 

Abb. 4: Neben den aufgenommen Messwerten, ermöglicht die SpeedScan-Software weitere hilfreiche 

Varianten (A-C) der Ergebnisdarstellung, womit durchgeführte Analysen auf einen Blick 

erfasst werden können. A: Screening der gemessenen Proben (grün = Wildtyp-Allel; orange = 

mutantes Allel); B: Layout der 36-Well-Mikroplatte zur automatischen SNP-Diagnostik; C: Ergebnisdarstellung 

der Auswertesoftware ASpectFA-SNP 

gnale kann eindeutig bestimmt werden, ob 

das Mdm2-Gen homozygot oder heterozygot 

vorliegt. Die Gegenüberstellung beider 

Abbildungen veranschaulicht die enormen 

Vorteile der Schnelligkeit, Übersichtlichkeit 

und Funktionalität der Produktkombination 

aus SpeedCycler und SpeedScan mit zugehöriger 

Analysensoftware. 

In nur einer Stunde kann somit eine vollständige 

SNP-Diagnostik einschließlich der 

DNA-Isolation realisiert werden. Zusätzlich 

ist das Kontaminationsrisiko im Anschluss 

Abb. 5: SNP-Diagnostik der gemessenen 

Fluoreszenzsignale des Wildtyps und des mutanten 

Allels verschiedener Patientenproben 

(1-9), 1-3 Wildtyp, 4-6 Heterozygot, 7-9 Homozygot 

mutant 

an die PCR auf ein Minimum reduziert, 

da das Öffnen der Mikroplatte vollständig 

entfällt. 

Literatur 

[1] G.L. Bond, W. Hu, E.E. Bond, H. Robions, S.G. Lutzker, N.C. Arva, J. 

Bargonetti, F. Bartel, H. Taubert, P. Wuerl, K. Onel, L. Yip, S.-J. Hwang, 

L.C. Strong, G. Lozana, A.J. Levine; A Single Nucleotid Polymorphism 

in the MDM2 Promotor Attenuates the p53 Tumor Supressor Pathway 

and Accelerates Tumor Formation in Humans; Cell, Vol. 119 [Nov. 2004] 

591-602 

[2] www.web-books.com/MoBio/Free/Ch4Hp53.htm [09.07.2007] 

[3] D. Alarcon-Vargas, Z. Ronai; p53-Mdm2-the affair that never ends; 

Cacinogenesis, Vol. 23 No. 4 [2002] 541-547 

[4] G.L. Bond, W. Hu, A. Levine; A Single Nucleotide Polymorphism in the 

MDM2 Gene: From a Molecular and Cellular Explanation to Clinical 

Effect; Cancer Res 65 [July 2005] 5481-5484 

[5] N.C. Arva, T.R. Gopen, K.E. Talbott, L.E. Campell, A. Chicas, D.E. White, 

G.L. Bond, A.J. Levine, J. Bargonetti; A Chromatin-associated and 

Transcriptionally Inactive p53-Mdm2 Complex Occurs in mdm2 SNP309 

Homozygous Cells; J Biol. Chem. Vol. 208 No. 29 [July 2005] 26776- 

26787 

[6] C. Menin, M.C. Scaini, G.L. De Salvo, M. Biscuola, M. Quaggio, G. Esposito, 

C. Belluco, M. Montagna, S. Agata, E. D‘Andrea, D. Nitti, A. Amadori, 

R. Bertorelle; Association Between MDM2-SNP309 and Age at Colorectal 

Cancer Diagnosis According to p53 Mutation Status; J. Natl Cancer Inst. 

98(4) [Feb. 2006] 582-288 

[7] http://en.wikipedia.org/wiki/Mdm2 [09.07.2007] 

[8] http://en.wikipedia.org/wiki/P53 [09.07.2007] 


Melanie Trenkmann 

Analytik Jena AG, Business Unit ‘bio solutions’ 

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Fax.: +49-(0)-3641-77-76 77 76 

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Einzelmolekül-Mikroskopie 

� 

Hochempfindliche PCR-freie 

Genexpressionsanalyse 

einzelner cDNAs 

Gerhard J. Schütz, Institut für Biophysik, Johannes Kepler-Universität Linz; Jan Hesse, 

Zentrum für Biomedizinische Nanotechnologie, Upper Austrian Research GmbH, Linz, Austria 

Die Analyse des globalen genetischen Transkriptionsmusters einer geringen Zellpopulation 

stellt eine der großen Herausforderungen in der gegenwärtigen medizinischen Diagnostik, 

aber auch in der Grundlagenforschung dar. Insbesondere die präzise Charakterisierung des 

wenigen Probenmaterials eines Patienten soll es ermöglichen, auch heterogene Gewebe 

oder Teile eines Tumors selektiv zu untersuchen. Um diese Fragestellungen adressieren 

zu können, entwickelten wir eine neuartige Microarray-Plattform, welche mRNA-Expressionsprofile 

aus geringsten Probenmengen erstellen kann, ohne dazu auf die zeitaufwendige 

und fehleranfällige Probenamplifikation durch PCR zurückgreifen zu müssen. Das Auslesen 

der Microarrays erfolgt mittels eines auf der ultra-sensitiven Fluoreszenzmikroskopie basierenden, 

patentierten Chipreaders (PCT/AT99/00257, WO 00/25113), der es erlaubt, selbst 

einzelne, spezifisch am Biochip hybridisierte cDNA-Moleküle zu detektieren. Damit wird 

es möglich, Expressionsprofile von nur 10 4 Zellen zu erstellen, was einer hundertfachen 

Verbesserung der Sensitivität im verglichen mit konventionellen Produkten entspricht. 

Das Wissen über die genetische Veranlagung 

von Individuen hat in den letzten Jahren 

nicht nur die biomedizinische Forschung 

dramatisch verändert, auch scheinbar weit 

entfernte Gebiete wie die Forensik oder die 

Migrationsanalyse – in der die historische 

Ausbreitung von Populationen anhand genetischer 

Profile analysiert wird – profitierten von 

2 µm 

Abb. 1: Fluoreszenzmikroskopische Aufnahme 

einzelner Farbstoff-Moleküle. Auf dem 7x7µm 

großen Auschnitt sind sechs solcher Moleküle 

klar zu erkennen. Das Bild wurde mit einer 

Belichtungszeit von 10ms bei einer Pixelgröße 

von 200 nm aufgenommen. 

den neuen Methoden. Von der Kenntnis der 

exakten genetischen Disposition versprechen 

sich Biomediziner die Möglichkeit, künftig die 

Medikationsart und -dosis persönlich auf den 

einzelnen Patienten abstimmen zu können. In 

der Pharmakologie wird versucht, krankheitsauslösende 

Veränderungen des genetischen 

Profils für die zielgerichtete Suche nach neuen 

Medikamententargets zu verwenden. Insbesondere 

die Zusammensetzung der in einer 

Probe transkribierten Gensequenzen hat sich 

als charakteristisch für eine Vielzahl krankhaft 

veränderter Gewebe oder Zellen erwiesen. Das 

Expressionsprofil der mRNA wird gegenwärtig 

nicht nur in der Grundlagen-, sondern vor 

allem in der klinischen Forschung und in den 

pharmazeutischen Firmen zur Entwicklung 

von Markern zur Feinklassifizierung, Prognose 

und Vorhersage der Medikamentenresponse 

genutzt. Zum Beispiel wurde für Brustkrebs 

ein Set von 70 ausgewählten Markern auf 

mRNA-Niveau 1 klinisch getestet 2 . Die hohe 

Zahl von gleichzeitig analysierten Markern 

gibt der Methode mehr Aussagekraft, ist in 

der Anwendung aber anspruchsvoller als 

Proteintests, die darauf basierend entwickelt 

werden können. 

Eine rasche Bestimmung der Gensequenzen, 

welche in einer RNA-Probe vorhanden 

sind, erfolgt über Microarrays. Das Messprinzip 

beruht auf der Hybridisierung einer 

Sequenz der Probe an ihr komplementäres 


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LABORWELT 8. Jahrgang | Nr. 5/2007 | 13 

sterile, 

pyrogen free 

präzise sparen mit 

DNA-, RNase, ATP free

A 

B 

Gegenstück , welches an einen Chip gekoppelt 

ist. Verwendung vieler verschiedener 

Sequenzen am Chip ermöglicht die großflächige 

vergleichende Analyse der Probe; 

derzeit werden bis zu 35.000 solcher Sequenzen 

in einem charakteristischen Muster am 

Chip aufgebracht, weshalb sich der Name 

Microarray eingebürgert hat. Eine Sequenz 

nimmt eine Fläche von etwa 100x100 µm ein. 

Zum Nachweis der gebundenen Proben wird 

üblicherweise das Probenmaterial mit einem 

Farbstoff markiert, der dann fluoreszenzmikroskopisch 

detektiert wird. 

Aufgrund der sehr geringen Mengen an genetischem 

Material, das für die meisten Analysen 

zur Verfügung steht, wird oft ein Amplifi- 

zierungsschritt vorgeschaltet – die Polymerase-Kettenreaktion 

(Polymerase Chain 

Reaction, PCR). Dabei werden vor der Farbmarkierung 

multiple identische Kopien der 

DNA angefertigt. Dieser für die Genomanalyse 

kritische Schritt birgt allerdings auch die 

größten methodischen Probleme: während 

der Verstärkung kann es zu signifikanten 

Verzerrungen der relativen Anteile der 


Abb. 2. A. Illustration des Aufbaus. Ein Laser wird nach Anpassung des Strahlprofils in das Mikroskop 

eingekoppelt. Die Probe wird in Epi-Konfiguration über interne Totalreflexion beleuchtet 

und die emittierte Fluoreszenz durch dasselbe Objektiv gesammelt. Als Detektor haben wir eine 

hochsensitive, „backilluminierte“ CCD-Kamera verwendet. B. Schema des Auslesprozesses. Die 

Probe („Kaffekanne“) und deren Abbildung am Detektor („Kaffetasse“) werden synchron durch 

den belichteten Bereich verschoben. Dadurch gelangt Fluoreszenzlicht aus demselben Probenbereich 

immer in denselben Bildbereich, und wird aufsummiert, bis das Ende des Kamerachips 

erreicht ist; dort erfolgt der Ladungstransfer in das Ausleseregister. 

Sequenzen kommen 3 . So erwies es sich als 

besonders schwierig, die sehr häufigen GC- 

Inseln zu verstärken. Darüber hinaus ist die 

Durchführung der Amplifizierungsschritte 

zeitaufwendig. 

Detektion einzelner Moleküle 

Wir verfolgten einen alternativen Ansatz, 

der es uns ermöglichen sollte, eine nicht verzerrte 

genetische Analyse von geringen Probenmengen 

zu erhalten. Ziel unseres Projektverbundes 

aus Genetikern, Immunologen, 

Medizinern, Mathematikern, elektrischen 

Messtechnikern und Industriepartnern war 

es, die Sensitivität der verwendeten Nachweisinstrumente 

bis zu den prinzipiellen 

Grenzen auszureizen, um somit auf eine 

Amplifizierung des genetischen Materials 

verzichten zu können. Wir konnten dazu 

auf Technologie-Entwicklungen der letzten 

Jahre aufbauen, die die Abbildung selbst 

einzelner Farbstoffmoleküle ermöglichten 4 . 

Abbildung 1 (Seite 13) zeigt solche Einzelmoleküle 

in Falschfarbendarstellung. Der 

optische Abbildungsprozess lässt die Moleküle 

als durch die Lichtbeugungsgrenze 

limitierte Signalverteilungen erscheinen; 

deren Breite von ca. 200 nm ist durch die 

verwendete Lichtwellenlänge sowie die 

Abbildungseigenschaften des Mikroskops 

bestimmt. Die Höhe der Einzelmolekülsignale 

übersteigt das Hintergrundrauschen 

deutlich (Signal-zu-Rauschverhältnis ~30), 

so dass im Wesentlichen alle sich an der 

Oberfläche befindenden Moleküle auch 

detektiert werden (>99%). 

Die für Einzelmolekül-Experimente von 

uns konstruierten Geräte basieren auf einem 

Fluoreszenzmikroskop in Kombination mit 

Lasern als Lichtquellen sowie einer „backilluminierten“, 

mit flüssigem Stickstoff 

gekühlten CCD-Kamera als Detektor (Abb. 

2). Besondere Sorgfalt in der Auswahl der 

Komponenten – insbesondere der optischen 

Filter – ermöglicht eine Detektionseffizienz 

des gesamten Gerätes von bis zu 10%. Der 

angeregte Zustand von typischen Farbstoffen 

weist eine Lebensdauer von etwa 

1 ns auf, das heißt, es können maximal 10 9 

Photonen von einem solchen Molekül pro 

Sekunde emittiert werden. Die erreichbare 

Emissionsrate kann sich allerdings deutlich 

durch das Auftreten weiterer nichtstrahlender 

Übergänge reduzieren; meist steht 

auch die benötigte Anregungsintensität von 

mehreren kW/cm 2 nicht zur Verfügung. Real 

kann man von rund 10 5 -10 6 emitierten beziehungsweise 

etwa 10 4 -10 5 detektierten Photonen 

pro Sekunde und Molekül ausgehen. 

Wird also die Belichtungszeit auf wenige 

Millisekunden reduziert, ist noch ein Signal 

von einigen hundert Photonen zu erwarten, 

welches auf modernen, „backilluminierten“ 

Kameras eindeutig nachgewiesen werden 

kann. 

Die hohe Sensitivität des Gerätes erfordert 

die Verwendung hochwertiger Abbildungsoptiken. 

Eine optimale Detektion ist nur 

möglich, wenn an der Auflösungsgrenze von 

rund 200 Nanometern gearbeitet wird. Umgekehrt 

haben Biochips typische Abmessungen 

von mehreren Zentimetern. Wenn nun 

pro Gensequenz eine Fläche von 100x100 

µm am Microarray angenommen wird, ist 

mit typischerweise 10 Milliarden Bildpunkten 

pro Microarray zu rechnen. Diese Zahl 

übersteigt bei weitem die maximale Anzahl 

von Bildpunkten einer Digitalkamera. Wir 

entschieden uns daher, den Biochip in einem 

Rasterverfahren abzubilden. Dieses Abbildungsverfahren 

sollte allerdings zeitlich 

kompatibel zu herkömmlichen Geräten sein, 

welche für das Auslesen eines Biochips ca. 

15 Minuten benötigen. Deshalb verwendeten 

wir ein für solche Lesegeräte neuartiges 

Ausleseverfahren, welches für hochsensitive 

Aufnahmen in der Astrophysik entwickelt 



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GE12-07. First printed 07/2007.

wurde. Dabei werden sowohl Probe als auch 

die am Detektor akkumulierten Ladungen 

synchron bewegt. Somit kann die Aufnahme 

selbst einer beliebig großen Chipoberfläche 

kontinuierlich erfolgen, ohne zeitaufwendige 

Positionierungsschritte 5 . 

Ultra-sensitives mRNA-Profiling 

Die Anwendung des Gerätes auf Microarrays 

erwies sich zunächst als nicht ganz 

einfach. Aufgrund der hohen Sensitivität 

des von uns entwickelten Detektors beobachteten 

wir zunächst viele gebundene, 

fluoreszierende Biomoleküle, selbst auf 

unbehandelten Biochips. Offenbar waren 

alle kommerziell erhältlichen Trägermaterialien 

den hohen Ansprüchen an die Reinheit 

nicht gewachsen. Wir entwickelten daher 

Biochips mit einer wesentlich verbesserten 

Reinheit 6 – im Mittel befinden sich nur 

etwa 25 unspezifisch adsorbierte Moleküle 

innerhalb der Fläche eines DNA-Spots von 

100 µm Durchmesser 5,7 . 

Weiters stellten sich völlig neue Anforderungen 

an die Software zur Datenanalyse. 

Während marktübliche Microarrays gewöhnlich 

nur auf die Helligkeit der einzel- 


Abb. 3: Ein DNA-Microarray, auf Einzelmolekül-Ebene ausgelesen. Die einzelnen Spots entsprechen 

verschiedenen Gen-Sequenzen. Eine Ausschnittvergrößerung des Bildes zeigt einzelne 

helle Signale, die den einzelnen fluoreszierenden cDNA-Molekülen entsprechen. 

nen Spots untersucht werden, können in 

unserem Fall die Moleküle gezählt werden, 

was sich als viel genaueres Verfahren erwies. 

Projektpartner vom Fuzzy Logic Laboratory 

der Universität Linz entwickelten dafür die 

vollautomatischen Analyseroutinen. 

Damit stand einer Anwendung – also der 

Charakterisierung einer typischen Probe, 

wie sie im Routinebetrieb eines Analyselabors 

auftreten könnte – nichts mehr im Wege. 

Dieses Experiment wurde gemeinsam mit 

unseren Partnern vom Fachbereich für molekulare 

Biologie der Universität Salzburg 

durchgeführt. Um die hohe Sensitivität der 

Plattform zu demonstrieren, wählten wir 

zur Untersuchung nur 200 ng totale RNA 

– also eine hundertfach geringere RNA- 

Ausgangsmenge als mit herkömmlichen 

Geräten gerade noch messbar wäre. Die 

Probe wurde auf einem Microarray aus 125 

unterschiedlichen 67-70mer Oligonukleotiden, 

welche in acht Replikaten gespottet 

wurden, hybridisiert und ausgelesen (Abb. 

3). Wir fanden einerseits hochexprimierte 

Gensequenzen, welche eine homogene 

Signalverteilung über dem Spot bewirkten. 

Diese Gene wurden mit konventionellen 

Methoden ausgewertet. Für viele Gene war 

jedoch die Konzentration so niedrig, dass 

nur mehr einige wenige cDNA-Moleküle 

binden konnten (siehe Inset); in diesem Fall 

wurden für eine quantitative Analyse die 

Moleküle gezählt. Die Auswertung lieferte 

exakt die gleichen Resultate wie eine Vergleichsmessung 

an hundertfach höheren 

Ausgangsmengen mit einem kommerziellen 

Gerät 7,8 . 

Auch Proteindetektion möglich 

Die Anwendung der hier vorgestellten 

Technologie ist nicht beschränkt auf genetische 

Fragestellungen. So ist die Kenntnis 

des menschlichen Erbgutes nur der erste 

Schritt zu einer vollständigen Entschlüsselung 

von Zellfunktionen. Den wesentlichen 

zweiten Schritt stellt die Charakterisierung 

des im Genom kodierten Proteoms – des 

Proteingehalts einer Zelle in bestimmten 

Stadien ihrer Entwicklung – dar. Für Proteine 

existiert keine der PCR vergleichbare 

Methode zur Probenamplifizierung. Gerade 

in diesem Bereich wird ein Chip-Lesegerät 

mit Einzelmolekül-Sensitivität Grundvoraussetzung 

für viele diagnostische sowie 

grundlagenwissenschaftliche Fragestellungen 

sein. 

Literatur 

[1] Van‘t Veer, L.J., Paik, S., Hayes, D.F. Gene Expression Profiling of Breast 

Cancer: a new Tumor Marker, j. Clin. Oncol 23, 1631-1635 (2005) 

[2] Bogaerts, J., Cardoso, F., Buyse M., Braga S., Loi, S., Harrison, J.A., 

Bines, J., Mook, S., Decker, N., Ravdin, P., Therasse, P., Rutgers, W. , 

Van‘t Veer, L.J., Piccart, M. on behalf of the TRANSBIG consortium. Gene 

Signature Evaluation as a Prognostic Tool: Challenges in the Design of 

the MINDACT trial. Nat. Clin., Proct. Oncol. 10, 540-551 (2006) 

[3] Mutter, G.L., Bonyton, K.A. PCR Bias in Amplification of Androgen receptor 

Alleles, a Trinucleotide Repeat Marker Used in Clonality Studies. 

Nucleic Acids Res. 23, 1421-1428 (1995) 

[4] Schmidt, T., Schütz, G. J., Baumgartner, W., Gruber, H. J. & Schindler, H. 

Imaging of single molecule diffusion. Proc Natl Acad Sci USA 93, 2926- 

9. (1996). 

[5] Hesse, J., Sonnleitner, M., Sonnleitner, A., Freudenthaler, G., Jacak, J., 

Hoglinger, O., Schindler, H. & Schutz, G. J. Single-molecule reader for 

high-throughput bioanalysis. Anal Chem 76, 5960-4 (2004). 

[6] Schlapak, R., Pammer, P., Armitage, D., Zhu, R., Hinterdorfer, P., Vaupel, 

M., Fruhwirth, T. & Howorka, S. Glass surfaces grafted with high-density 

poly(ethylene glycol) as substrates for DNA oligonucleotide microarrays. 

Langmuir 22, 277-85 (2006). 

[7] Hesse, J., Jacak, J., Kasper, M., Regl, G., Eichberger, T., Winklmayr, M., 

Aberger, F., Sonnleitner, M., Schlapak, R., Howorka, S., Muresan, L., 

Frischauf, A. M. & Schutz, G. J. RNA expression profiling at the single 

molecule level. Genome Res 16, 1041-5 (2006). 

[8] Mir, K. U. Ultrasensitive RNA profiling: counting single molecules on 

microarrays. Genome Res 16, 1195-7 (2006). 


Dr. Gerhard J. Schütz 

Institut für Biophysik 

Johannes Kepler-Universität Linz 

Altenbergerstr. 69 

A-4040 Linz 

Dr. Jan Hesse 

Zentrum für Biomedizinische 

Nanotechnologie 

Upper Austrian Research GmbH 

Scharitzerstr. 6-8, A-4020 Linz, Austria 


DNA-Extraktion 

� 


Einfache, robuste und flexible 

DNA-Aufreinigung 

Tanja Lopez, Promega GmbH, Mannheim 

Das Maxwell 16-DNA-Aufreinigungssystem vereint eine kompakte Instrumentation, vorgefüllte 

Reagenzien-Kartuschen und optimierte automatisierte Methoden, um die Effizienz 

und Flexibilität der DNA-Aufreinigung einerseits zu maximieren und zugleich die Arbeitszeit 

zu minimieren. Das Gerät ist darauf ausgelegt, bis zu 16 Proben pro 16-minütigem Lauf 

zu bearbeiten. Die aufgereinigte DNA ist ohne Probenvorbereitung gebrauchsfertig für 

Folgeanalysen, Zentrifugation, Ausfällung oder Rehydratation von DNA-Pellets. In diesem 

Beitrag stellen wir das Maxwell 16-System vor und belegen seinen Nutzen bei der Aufreinigung 

genomischer DNA. 

Die Aufreinigung genomischer DNA 

(gDNA) ist ein molekularbiologisches Standardlaborverfahren. 

Die aufgereinigte DNA 

wird üblicherweise in Genotypisierungen, 

Kartierungen oder Genstrukturanalysen 

eingesetzt. 

Derzeit nutzen Wissenschaftler zahlreiche 

verschiedene Methoden mit diversen 

Probengrößen, -typen und -durchsätzen 

zur gDNA-Aufreinigung. Hochdurchsatz- 

Nutzer haben sich zunehmend der Automation 

zugewandt, um die Produktivität 

zu verbessern. Nutzer von Methoden mit 

niedrigem bis mittlerem Durchsatz verbringen 

bis zu 25-30% ihrer Zeit mit der 

DNA-Aufreinigung und hatten bis dato 


wenige, wenn überhaupt Möglichkeiten 

zur Automatisierung, ohne beachtliche finanzielle 

Ressourcen aufwenden zu müssen 

oder in Ausbildung, Betrieb und Wartung 

zu investieren. In großen Labors wird weniger 

teure Benchtop-Ausrüstung benötigt, 

die für bestimmte Zwecke, Bereiche des 

Labors oder geographisch vom Hauptlabor 

getrennte Orte an die benötigten Arbeitsabläufe 

angepasst werden kann. 

Um die Arbeitszeit und den Einsatz von 

Arbeitskraft zu reduzieren und gleichzeitig 

DNA in hoher Ausbeute und Reinheit zu erhalten, 

hat Promega das bedienungsfreundliche 

Maxwell 16-System entwickelt. 

Dieses System, das sich aus dem Maxwell 

16-Instrument und Kits zusammensetzt, 

die vorgefüllte Reagenzien-Kartuschen 

beinhalten, wurde für Anwendungen im 

niedrigen bis moderaten Durchsatz entwickelt. 

Das Maxwell 16-Instrument ist 

ein platzsparendes und extrem einfach zu 

bedienendes System. Seine einzigartigen 

Reagenzkassetten vereinfachen die DNA- 

Aufreinigung bei einem breiten Spektrum 

an Probentypen. Künftige Kits werden einen 

großen Bereich an Aufreinigungsanwendungen 

des Maxwell 16-Systems bereitstellen, 

die Anpassungen an sich verändernde Bedürfnisse 

gestatten. 


�

Das kompakte Design des Maxwell 16- 

Gerätes minimiert die Laborstellfläche auf 

31,4 x 37,4 x 29,5cm (Abb. 1). Optimierte 

Protokolle werden in das unmittelbar einsatzbereite 

Gerät geladen. Die Funktion von 

Maxwell 16 basiert auf der sequentiellen 

Bindung und Freisetzung paramagnetischer 

Partikeln (MagneSil ® , PMPs) in den Wells der 

Reagenzkartuschen, die mit vorgeladenen 

Reagenzien ausgeliefert werden. Das Gerät 

nutzt einen leistungsstarken Magneten und 

ein einzigartiges Stößeldesign, um Zielmaterial, 

wie etwa genomische DNA zu lysieren, 

zu binden und zugleich Verunreinigungen 

auszuwaschen. Die Fähigkeit des Gerätes, 

die paramagnetischen Partikel selektiv einzufangen 

und zu bewegen, erspart den Einsatz 

komplexer Liquid-Handling-Prozesse und 

von Reagenzienflaschen, die verstopfen oder 

verunreinigt werden können. Die Reagenzienkartusche 

und der Stößel kommen nur in 

Kontakt mit einer einzigen Probe; nach jedem 

Lauf werden sie entfernt und verworfen. 

Die Einmal-Reagenzienkartusche stellt zudem 

sicher, das neue Reagenzien fehlerfrei 

abgegeben werden und so die Effizienz und 

Reproduzierbarkeit eines Durchlaufs maximieren. 

1 bis 16 Proben können mit dem 

Maxwell 16-Gerät in zirka 30 Minuten 

bearbeitet werden. Das einzigartige Design 

des Stößels erlaubt eine Aufreinigung der 

meisten Probenmaterialien, inklusive Tier- 

und Pflanzenzellen, ohne dass Vorbehandlungen, 

etwa mit Proteinase K oder anderen 

Enzymen, durch mechanisches Zermahlen, 

die Fraktionierung von Blutzellen oder Zentrifugation 

erforderlich wäre. Beispielsweise 

kann zur DNA-Aufreinigung bis zu 1,2 cm 

Mausschwanz oder 25–50mg Gewebe direkt 

in die Kartusche gegeben werden. Die Möglichkeit, 

Vorbehandlungen zu vermeiden, 

sichert Stunden, verglichen mit dem bei 

Abb. 1: Maxwell 16-DNA-Aufreinigungssystem 


Routineverfahren der Probenvorbereitung 

eingesetzen Zermahlen oder der Proteinase 

K-Behandlung. Nachdem die Probe zugegeben 

wurde, werden die Reagenzkartuschen 

in das Maxwell 16-Gerät geladen und eine 

einfache Bildschirmauswahl gestattet die 

Auswahl des geeigneten opimierten Protokolls. 

Nach Beendigung des Durchlaufes ist 

die aufgereinigte DNA gebrauchsfertig für 

Folgeanalysen. 

DNA-Folgeanalysen 

Blut ist ein einfaches und oft genutztes Probenmaterial 

für die gDNA-Aufreinigung. 

Die mit dem Maxwell 16 Blut-DNA-Aufreinigungs-Kit 

ausgelieferten Maxwell 16 

Reagenzien-Kartuschen sind optimiert für die 

Prozessierung eines weiten Bereiches frischer 

oder gelagerter Human- und Tierblutproben. 

Bis zu 400 Milliliter Blut liefern etwa 8 bis 16 

Mikrogramm gDNA, abhängig von der Leukozytenanzahl, 

bei exzellenter DNA-Reinheit 

und Effizienz in Folgeapplikationen wie etwa 

PCR-Analysen. Die Blutausgangsmenge kann 

ohne Verluste bei den PCR-Ergebnissen oder 

der Ausbeute an linearer DNA auf bis zu 10 

Mikroliter verringert werden. DNA wurde 

mit ähnlicher Ausbeute und Reinheit und 

ohne Beeinträchtigung des Resultats ebenso 

aus Blut in Citrat, EDTA- oder Heparin-haltigen 

Röhrchen aufgereinigt. Auch PCR-Multiplex-Analysen, 

die eine hohe DNA-Qualität 

erfordern, belegen die Qualität der mit dem 

Maxwell 16 aufgereinigten DNA. Bei der direkten 

Isolierung von DNA aus Blut mit dem 

Maxwell 16 Blood DNA-Aufreinigungskit 

wurden durch die Lagerungsbedingungen 

bedingte, negative Effekte, die bei der Aufreinigung 

mit anderen Systemen auftreten, 

nicht beobachtet. Normalerweise ist vor der 

DNA-Isolierung zunächst die Aufreinigung 

der Blutzellen erforderlich, was die „Handson“-Zeit 

erhöht und zu signifikanten DNA- 

Verlusten führen kann, wenn die Proben 

durch ungünstige Lagerbedingungen oder 

mehrfaches Einfrieren und Wiederauftauen 

beschädigt werden. Das Maxwell 16-System 

reinigt DNA aus Blut auf, das bei 4° C 

–20° C oder Raumtemperatur gelagert wird. 

Das System erfasst effizient DNA verschiedenster 

Größe und maximiert die Ausbeute 

auch von beschädigten Proben. 

Vorgefüllte Reagenzkartuschen für 

diverse Applikationen 

Das Maxwell 16-System verwendet drei 

verschiedene Kits mit vorgefüllten Reagenzkartuschen 

zur Aufreinigung von gDNA 

aus einem breiten Spektrum verschiedener 

Probenmaterialien, darunter humane und 

tierische Ganzblutpräparate, Leukozytenfilme, 

Tier- und Pflanzenzellen, eukaryotische 

und prokaryotische Zellen sowie ganze 

Organismen wie Drosophila. Tierblut und 

verschiedene Tiergewebe wurden ohne 

vorherige Bearbeitung und Homogenisierung 

mit Hilfe von Maxwell 16 bearbeitet. 

Gewebestückchen (bis 50 mg) können direkt 

in die mit dem Maxwell 16 Tissue DNA- 

Aufreinigungskit ausgestatteten Maxwell 

16-Reagenzkartuschen appliziert werden. 

Die Eliminierung von Vorbereitungsschritten 

erlaubt es, die Produktivität zu steigern – Probensammlung 

und Datenanalyse benötigen 

anstelle von zwei Tagen nur noch einen Tag. 

Die aus verschiedensten Ausgangsmaterialien 

aufgereinigte DNA kann effektiv in 

Folgeanwendungen eingesetzt werden. DNA 

kann mit Hilfe von Reagenzkartuschen, die 

mit dem Maxwell 16 Cell DNA-Aufreinigungskit 

ausgestattet sind, direkt aus Zellen 

aufgereinigt werden. gDNA kann dabei aus 

in Suspension kultivierten Zellen sowie an 

Oberflächen angeheftete Zellen isoliert werden. 

Die Zellen werden dabei in Volumina 

von bis zu 400 Mikroliter gesammelt und 

bearbeitet, oder den Platten und zur Weiterbearbeitung 

gesammelten Zelllysaten kann 

Lyse-Puffer zugegeben werden. 

Auch eine Auswahl an prokaryotischen 

Organismen wurde getestet. Gram-negative 

Bakterien können ohne Vorbehandlung 

bearbeitet werden. Um optimale gDNA- 

Ausbeuten zu erzielen, empfiehlt sich bei 

Gram-positiven Bakterien eine einfache 

Vorbehandlung. 

Um die Flexibilität des Maxwell 16-Systems 

zu überprüfen, wurde seine Leistungsfähigkeit 

an unterschiedlichsten Probenmaterialien 

gestestet, wie etwa menschlicher 

Lunge, Pflanzenblättern und Drosophila. 

Die erhaltene DNA wurde durch Agarose- 

Gelelektrophorese visualisiert. Andere Probenmaterialien 

wie menschliches Haar und 

Mundschleimhautabstriche können ebenfalls 

unter Einsatz des Maxwell 16 Tissue DNA 


Purification-Kits bearbeitet werden. Die gDNA konnte effektiv in 

Folgeapplikationen eingesetzt werden und eine hohe Flexiblität des 

Systems nachgewiesen werden 

Zusammenfassung 

Das Maxwell 16-System wurde entwickelt, um Laborkosten zu 

sparen und eine einfache Aufreinigung von Biomolekülen im niedrigen 

bis mittleren Durchsatz zu ermöglichen. Das System kombiniert 

A 

Abb. 2: A. Maße des Maxwellgerätes, B. Schema des Stößels in der 

Reagenzienkartusche, C. Überblick der vorgelegten Reagenzien in 

der Kartusche 

ein kompaktes und einfaches Instrument, das wenig Routine und 

Wartung benötigt, mit vorgefüllten Reagenzkartuschen, die helfen, 

die Produktivität durch Minimierung des Bedienungsaufwandes 

zu steigern. Das Maxwell 16-System kann gDNA aus Ganzblut 

(10-400µl), Tier- und Pflanzengewebe sowie pro- und eukaryotischen 

Zellen in Kultur aufreinigen. Wir haben die durchgängig 

hohe Leistungsfähigkeit des Systems bei der Bearbeitung dieser 

Probentypen belegt und zugleich dessen Flexibilität durch den Einsatz 

verschiedenster Probenmaterialien wie ganzer Gewebe, ganzer 

Organismen und von Mundschleimhautabstrichen gezeigt. 


Tanja Lopez 

Promega GmbH 

Schildkrötstr. 15, 68199 Mannheim 

Tel.: +49-(0)621-8501-110 

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PCR/Probenvorbereitung 

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Hochempfindliche Detektion 

viraler Nukleinsäuren 

Dr. Hermann Nieper, LUA Sachsen, Standort Leipzig: Dr. Andrea Ockhardt, Invitek GmbH, 

Berlin; Dr. Arja Lamberg, Thermo Fisher Scientific, Vantaa, Finnland 

Dieser Anwendungsbericht beschreibt die Isolierung und Detektion des Erregervirus der Bovinen 

Virusdiarrhoe mit Hilfe des InviMag Virus DNA/RNA Mini Kit/KFmL (Invitek) und des Magnetpartikelprozessors 

Thermo Scientific KingFisher mL (Thermo Fisher Scientific) in Kombination 

mit dem Echtzeit-RT-PCR-Detektionsverfahren. Für dieses Experiment wurden Probenpools 

aus Rinderblut von maximal 50 Tieren hergestellt. Bis zu 15 Proben wurden automatisch im 

KingFisher mL verarbeitet. Die Ergebnisse belegen, dass mit Hilfe dieses Verfahrens selbst ein 

geringes Vorkommen viraler RNA nachgewiesen werden kann. 

Eine schnelle Detektion und Quantifizierung 

von Viren in der Veterinärmedizin kann zur 

effizienteren Bekämpfung von Seuchen wie 

der Vogelgrippe beitragen. Die hierfür eingesetzten 

Diagnoseverfahren müssen eine sehr 

hohe Effizienz und Sensitivität bei der Isolierung 

und Detektion von Nukleinsäuren in 

umfangreichen Individual- oder Probenpools 

aufweisen. 

Das Virus der Bovinen Virusdiarrhoe/Mucosal 

Disease (BVD-MD) – auch als BVDV bezeichnet 

– tritt sehr häufig bei Mastrindern auf 

und verursacht in dieser Branche große Verluste. 

Aufgrund der komplexen Pathogenese und 

des schleichenden Fortschritts der BVDV-Infektion 

stellt die Laboranalyse einen wesentlichen 

Faktor bei der Entwicklung von Maßnahmen 

zur Kontrolle und Prävention von Infektionen 

dar. Akute Infektionen immunkompetenter 

Tiere können zu unterschiedlichen klinischen 

Symptomen führen, darunter Leistungsabfall, 

Diarrhoe (Diarrhoevirus), respiratorische und 

reproduktive Störungen (Fehlgeburten und 

Fehlbildungen) bis hin zum tödlich verlaufenden 

Hämorrhagischen Syndrom. Des weiteren 

führt die mit der Infektion einhergehende 

Immunsuppression zu opportunistischen 

Infektionen und genereller Immunschwäche. 

Das Virus verbreitet sich über Nasal- und 

Oralsekrete sowie über Kot, Urin und Sperma 

infizierter Tiere, doch erfolgt die Ansteckung 

zumeist über persistent infizierte (PI) Tiere. 

Zur persistenten Infektion kommt es im Falle 

einer intrauterinen Ansteckung während des 

ersten Drittels der Trächtigkeit, also vor der 

Entwicklung der Immunkompetenz. PI-Tiere 

sind während ihres gesamten Lebens infiziert 

und weisen hohe Viruskonzentrationen ohne 

jegliche Immunreaktion auf. 

Prävention und Kosten 

Die deutsche Bundesregierung schätzt den 

finanziellen Verlust pro Kuh auf ca. a160 

(BMELF 1998). Laut Wolf (1997) kann sich 

der finanzielle Verlust einer tödlich verlaufenden 

Infektion bei einem Bestand von 

100 Tieren auf bis zu a12.000 belaufen. Seit 

November 2004 ist BVD in Deutschland eine 

anzeigepflichtige Tierkrankheit. Mit der für 

2007 erwarteten Verabschiedung einer Bundesverordnung 

zur BVD-Bekämpfung wird 

für jedes Tier eine tierärztliche Untersuchung 

vorgeschrieben werden, um die Ausbreitung 

Tab. 1: Pipettierschema für KingFisher mL und InviMag Virus DNA/RNA Mini Kit/KFmL 

Röhrchen Inhalt Proben-/ Reagenzienvolumen 

A Lysierte Probe 

MAP Solution A* 

1Bindungslösung 

der Seuche einzudämmen. Das primäre Ziel 

der BVD-Bekämpfung ist die Erkennung 

und Vernichtung aller PI-Tiere, die ca. 0,1% 

bis 2,0% des gesamten Rinderbestandes ausmachen. 

Um dieses Ziel zu erreichen, ist ein 

wirtschaftliches, schnelles, sinnvolles und 

sicheres Detektionsverfahren nötig. Detektionsverfahren 

anhand von Viruskultivierung 

und Antigen-ELISAs haben den Nachteil, dass 

Abb. 1: Der Thermo Scientific KingFisher mL- 

Magnetpartikelprozessor 

20 | 8. Jahrgang | Nr. 5/2007 LABORWELT 

200 µl 

20 µl 

400 µl 

B Waschpuffer R1 800 µl 

C Waschpuffer R2 800 µl 

D Waschpuffer R2 800 µl 

E Elutionspuffer R 120 µl 

sie bei großen Tierbeständen nicht einsetzbar 

oder aber sehr kostenintensiv sind. Mit RT- 

PCR-basierten Verfahren hingegen lassen 

sich Mischproben (Pools) von bis zu 50 Tieren 

untersuchen. 

Im Jahr 2002 wurde in Sachsen ein freiwilliges 

Programm zur BVD-Bekämpfung 

anhand eines RT-PCR-Verfahrens eingeführt. 

2004 wurde das Verfahren modernisiert und 

um eine semi-automatische Reinigung der 

Serumpools mit Hilfe des Thermo Scientific 

KingFisher mL in Kombination mit dem 

Invitek InviMag Virus DNA/RNA Mini 

Kit/KFmL ergänzt. Im Vergleich zum Einsatz 

vollautomatischer Instrumente bietet 

dieses System einen wichtigen Schritt hin 

zur kostengünstigen Standardisierung der 

bislang sehr arbeitsaufwendigen Reinigung 

von Nukleinsäuren im Labor. 

Isolierung viraler RNA 

Die virale RNA des BVD-Virus wird innerhalb 

von 45 Minuten mit Hilfe des InviMag ® Virus 

DNA/RNA Mini Kit/KFmL aus Serum- und 

Plasmapools gereinigt. Die Serum- und Plasmapools 

bestehen aus Rinderblutproben, die 

direkt beim tierhaltenden Betrieb entnommen 

werden. Die Qualität der verwendeten Proben 

kann je nach Alter und Gesundheitszustand 

des Tieres sowie entsprechend verschiedener 

Lager- und Transportbedingungen der Proben 

stark schwanken. Zur Herstellung eines 

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Diagnosepools von 5 ml werden nur 100 µl 

Serum oder Plasma pro Tier von maximal 50 

Tieren verwendet. 

Aus jedem Pool wird ein Aliquot von 200 µl 

zur Isolierung viraler RNA verwendet. Hierzu 

wird das Aliquot in das im Kit enthaltene 

Extraktionsröhrchen übertragen und vorsichtig 

mit 200 µl ddH O vermischt. Dieses 

2 

Extraktionsröhrchen verfügt innen über 

eine Beschichtung aus einer vorbereiteten 

Mischung fester Lysereagenzien (nicht-chaotroper 

Lysepuffer und Proteinase K), Carrier- 

Nukleinsäuren und präzise abgemessener 

interner RNA/DNA-Extraktionskontrollen. 

Die internen Kontrollen wurden mit den 

Zielsequenzen zusammen aufgereinigt und 

Norm. Fluoro. 

ermöglichen die Beurteilung der Extraktionseffizienz 

beziehungsweise der PCR-Amplifizierung. 

Hierdurch werden die Qualität 

der gereinigten Virus-RNA und/oder DNA 

sichergestellt und falsch-negative Ergebnisse 

0,1 ausgeschlossen. 

Nach dem Mischen werden sämtliche 

Proben für 15 Minuten bei 65 °C in einen 

Schüttelinkubator gegeben, um die Aktivität 

0,05 der Proteinase bei der Lyse des Viruskapsids 

und der Proteindigestion zu unterstützen. 

Zur Entfernung von Proteinresten von den 

Virusnukleinsäuren wird darüber hinaus 

eine Inkubation von 10 Minuten bei 95 °C 

0 

empfohlen. Dieser Schritt ist insbesondere 

bei sehr stabilen Virusnukleinsäure-Protein- 

Komplexen 0 10notwendig. 20 30 40 

Während der Lyse ist für jede Probe ein 

KingFisher mL-Röhrchenstreifen negative Probe in die 

Probenhalterung einzusetzen. Dann werden 

die Röhrchenstreifen B bis E gemäß Tabelle 1 

mit den mitgelieferten Puffern befüllt. Nach 

Abschluss der Lyse werden die Proben in 

die KingFisher mL-Röhrchenstreifen über- 

tragen (Röhrchen A), und es werden 400 µl 

Bindungslösung und 20 µl Magnetpartikellösung 

A hinzugefügt und mit jedem Lysat 

gemischt, um optimale Bindungsbedingungen 

herzustellen. 

Unter diesen Bedingungen wird die Virus-RNA 

quantitativ an die Magnetpartikel 

gebunden. Anschließend werden die Magnetpartikel 

in den Waschpuffer R1 und R2 

übertragen, um sämtliche Verunreinigungen 

wie Proteine, Nukleasen, PCR-Inhibitoren etc. 

zu entfernen. Nach der Entfernung des Ethanols 

von den Partikeln wird die Virus-RNA 

in Elutionspuffer R eluiert und ist bereit zur 

weiteren Verwendung. 

Nach dem Befüllen der Röhrchenstreifen 

Norm. Fluoro. 

wird das Tablett im Gerät plaziert und die 

Kammspitzen eingesetzt. Die Frontabdekkung 

0,05 wird geschlossen und die Proben mit 

dem „InviMAG-Virus-KFmL“-Reinigungsprotokoll 

verarbeitet. Nach Abschluss des 

Programms werden die Eluate zur weiteren 

Verwendung gelagert. 

positive Probe positive Probe 

BVDV-Detektion 

Schwellenwert Schwellenwert 

Norm. Fluoro. 

0,3 

0,25 

0,2 

0,15 

0,1 

0,05 

0 

Schwellenwert 

Standardmäßig wird ein Aliquot von 5 µl von 

jedem Eluat (1/24) zur BVDV-Detektion bei 

Probenpools von 50 Tieren verwendet. Primer 

und 0Bedingungen 

der Echtzeit-One-Step-RT- 

PCR beschreiben Gaede et al. Dieses System 

ermöglicht eine zuverlässige Detektion selbst 

bei nur 0 10 Genomkopien 10 20 pro Reaktion 30 und 40 

entspricht den Sensitivitätsanforderungen Zyklus 

der Bundesregierung. negative Dies entspricht Probe einer 

Verdünnung von mindestens 1 zu 1.000 bei 

jeder PI-Probe (Abb. 1). 

Des Weiteren wurde ein quantitativer Assay 

durchgeführt, um sicherzustellen, dass auch 

bei verdünnten Pools eine ausreichende Vi- 

Abb. 1: Amplifizierung der Verdünnungsreihe einer Kontroll-Nukleinsäure (rot; von links nach 

rechts 10.000/1.000/100/10 Kopien in Serumproben) und parallele Verdünnungsreihe von zwei 

PI-Tieren (persistent infizierte Tiere, grün; unverdünnte Serumprobe/1:10/1:100/1:1000 verdünnte 

Serumprobe), amplifiziert mittels Echtzeit-RT-PCR. 


Zyklus 

Genomkopien 

10 5 

0 5 10 15 20 25 30 35 40 Zyklus 

PI-Tier 1:10 1:100 1:1000 

10 3 

10 2 

10 1 

negativ

Norm. Fluoro. 

0,1 

0,05 

0 

Abbildung 2: (A) BVDV-Detektion bei vier positiven (rot) Serumproben aus unterschiedlichen Serumpools 

und bei vier negativen (blau) Serumpools; alle positiven Proben weisen ein Virusprodukt 

auf. (B) Detektion der internen Kontroll-RNA in den Eluaten von vier positiven (rot) und vier 

negativen (blau) Serumpools; alle Proben weisen ein detektierbares Produkt der Kontroll-RNA 

auf, was Norm. ein Fluoro. Beleg für die erfolgreiche Extraktion und Amplifizierung ist. 

rusdetektion gewährleistet ist. Hierzu wurde tät bei Virusverdünnungen bis mindestens 1 

eine Detektion 0,25 der internen Kontroll-RNA (der zu 1.000. Nach dem Gesetz müssen Systeme 

Beschichtung im Extraktionsröhrchen) anhand zukünftig in der Lage sein, 50 bis100 Kopi- 

von 5 µl 0,2jedes 

Eluats in einer spezifischen Echten/ml per Echtzeit-RT-PCR festzustellen. 

zeit-RT-PCR-Analyse durchgeführt (Assay von Das beschriebene Verfahren entspricht die- 

AJ Roboscreen). 0,15 Der Assay enthält alle Reaksen Kriterien in Bezug auf die BVD-Schutztionskomponenten, 

Primer und internen Konverordnung zur Erkennung von PI-Tieren. 

trollen. 0,1 Er erlaubt das Erkennen von Fehlern Seit Inkrafttreten der Schutzverordnung 

während der Extraktion der Virusnukleinsäure 10 wurden allein in Sachsen bereits knapp 

oder 0,05 von Inhibitoren während der Amplifi- 200.000 Tiere mit dem hier beschriebenen 

zierung (Abb. 2). Diese Kontrolle verhindert Virusextraktions- und -detektionssystem 

falsch-negative 0 Ergebnisse und ermöglicht die untersucht. 

Überwachung der Extraktion, Transkription Das für hochsensitive Virusdetektion 

und Amplifizierung. 0 5 Somit 10 ermöglicht 15 20 dieser 25 ausgelegte 30 35InviMag 40 Virus Zyklus DNA/RNA Mini 

Assay eine zuverlässige BVDV-Detektion. Kit/KFmL bietet eine schnelle, kostengün- 

PI-Tier 

stige simultane Reinigung viraler DNA 

Ergebnisse 

und RNA aus unterschiedlichen Quellen. 

In Kombination mit dem Thermo Scientific 

KingFisher mL wurde es im Labor ebenfalls 

bereits erfolgreich für andere RNA-Viren 

(Influenza A-Virus, Porcines Enterovirus, 

Aviäres Paramyxovirus 1) sowie für DNA- 

Viren (Porcines Circovirus 2) aus unterschiedlichen 

Quellen eingesetzt, etwa von 

Abstrichen, homogenisierten Gewebeproben 

und Exkrementen. 

5 

10 3 

10 2 

10 1 

0,3 

Genomkopien 

Schwellenwert 

negativ 

1:10 1:100 1:1000 

Das beschriebene Extraktionsverfahren bietet 

eine hocheffiziente Reinigung viraler RNA 

selbst bei geringer Kopienanzahl (siehe Abb. 1). 

Die Qualität der Extraktion wird durch ein internes 

Kontrollsystem überwacht (siehe Abb. 2). 

Die extrahierte BVDV-RNA und die Kontrollen 

werden durch Echtzeit-RT-PCR quantifiziert. 

Im Serum zweier PI-Tiere konnte virale RNA 

bei Verdünnungen bis zu 1:1.000 nachgewiesen 

werden. Eine künstliche Nukleinsäure wurde 

als Standard zur Quantifizierung von Genomkopien 

eingesetzt (Abb. 2). Acht Serumpools 

von bis zu 50 Tieren wurden zur BVDV-Detektion 

verwendet, und sämtliche Pools mit 

positiven Proben wurden korrekt erkannt. Alle 

Extraktionen und Amplifizierungen wurden 

anhand eines Assays mit positiver Kontrolle 

überprüft. Alle Proben wiesen korrekte Extraktion 

und Amplifizierung auf (Abb. 3). 

Schlussfolgerung 

positive Probe 

Norm. Fluoro. 

0,05 

positive Probe 

Schwellenwert Schwellenwert 

0 10 20 30 40 

Zyklus 

negative Probe 

Das Kombi-System für Extraktion und Detektion 

viraler RNA bewies seine Sensitivi- 

0 

0 10 20 30 40 

Zyklus 

negative Probe 

Literatur 

[1] Gaede et al. (2005). Berl. Münch. Tierärztl. Wschr. 118, 113-120 

Wolf (1997). ITB-Schriftreihe, Bd. 1, 87-98 

BMELV (1998). Leitlinien für den Schutz von Rinderbeständen vorm Virus der 

BVD/MD 


Timo Trageser 

Thermo Fisher Scientific 

Robert-Bosch-Str. 1 

63505 Langenselbold 

Tel.: +49-(0)-6184-90-6337 

Fax: +49-(0)-6184-90-7337 

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Interview 

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„Als Verband wollen wir mit 

der Wissenschaft reden“ 

Dr. Ralf Hermann, Vorsitzender; Dr. Thorsten Ebel, Sprecher 

Arbeitsgruppe Life Science Research innerhalb des VDGH 

Erst im vergangenen September hatten die acht global tätigen Unternehmen Becton 

Dickinson, Bio-Rad, Eppendorf, Perkin Elmer, Promega, Qiagen, Roche Diagnostics und 

Sigma-Aldrich Chemie die neue Interessenvertretung Life Science Research AG (LSR AG) 

aus der Taufe gehoben (vgl. LABORWELT 5/2006). Ein Jahr später hat die neue Unternehmensvertretung 

nicht nur Mitgliederzuwachs zu vermelden, sondern eine schlagkräftige 

Struktur und einen neuen Vorstand etabliert sowie in fünf Arbeitskreisen begonnen, ihre 

Ziele tatkräftig umzusetzen. Als Verband suchen die auf dem Markt in Konkurrenz zueinander 

stehenden Unternehmen das Gespräch mit der Wissenschaft, um ihre Entwicklungen mit 

den Bedürfnissen der Wissenschaftler abzugleichen. Doch auch die Politik, die Messegesellschaften, 

Anbieter von eCommerce-Plattformen und andere im Life Science-Sektor 

tätige Verbände zählen zu den Gesprächspartnern, mit denen die LSR AG bereits in Kontakt 

steht. LABORWELT sprach mit Dr. Ralf Hermann, dem im Juli neu gewählten Vorsitzenden 

der Life Science Research AG und Vice President Global Marketing & Customer Support 

der Eppendorf AG, und Dr. Thorsten Ebel, dem Sprecher der Arbeitsgruppe und Sales & 

Marketing Manager Biotechnologie der Sigma-Aldrich Chemie GmbH, über die Entwicklung 

und Ziele des wachsenden Herstellerverbandes. 

Laborwelt: 

Im vergangenen September hat sich die 

Arbeitsgruppe Life Science Research innerhalb 

des VDGH als Interessensvertretung 

der Hersteller von Forschungswerkzeugen 

und -Instrumenten gegründet. Was war Ihre 

Ausgangslage und welche Meilensteine 

haben Sie bislang erreicht? 

Hermann: 

Wir hatten eine recht homogene Ausgangslage. 

Die Firmen, die sich in der Life Science 

Research AG zusammengefunden haben, 

sind alle im gleichen Marktsegment tätig 

und haben im Grunde die gleichen Interessen 

und Bedürfnisse. Die eigentliche Triebfeder 

für die Gründung der Life Science Research 

AG war, dass wir nirgendwo einen Verband 

gesehen haben, der das spezielle Segment, für 

das unsere Mitgliedsfirmen stehen, im Fokus 

hat und konsequent vertritt. Es galt also einen 

neuen Gesprächspartner und Interessensvertreter 

der Hersteller im Life Science Research- 

Bereich zu etablieren, um unsere gemeinsamen 

Ziele sowohl auf wissenschaftlicher als 

auch auf wirtschaftlicher, politischer und 

Anwenderebene nach außen zu vertreten. 

Seit der Gründung im September 2006 haben 

wir versucht, fünf Arbeitskreise – Marktforschung, 

eCommerce/eProcurement, Messen, 

Öffentlichkeitsarbeit und Verbände – aufzubauen 

und für diese einen regelmäßigen 

Arbeitsmodus zu etablieren. Gleichzeitig 

haben wir die ersten Gespräche mit Politik, 

Verbänden und Presse aufgenommen. 



Sie sind mit acht Gründungsmitgliedern 

gestartet, die 30% des deutschen Life Science 

Research-Marktes repräsentieren. Ein 

erstes Ziel war es zu wachsen, um Ernst 

genommen zu werden und politische Ziele 

artikulieren zu können. Welchen Zwischenstand 

gibt es hier? 

Hermann: 

Wir haben im Februar diesen Jahres die 

erste größere Veranstaltung zur Mitgliederwerbung 

gehabt und dort regen Zuspruch 

erfahren. Seitdem sind drei neue Firmen als 

Mitglieder dem Verband beziehungsweise 

der LSR AG beigetreten, Merck, Thermo- 

Fisher Scientific und PEQLAB. Außerdem 

haben wir ein knappes Dutzend Kandidaten, 

darunter auch zwei große Laboranbieter, die 

erst 2008 vorhaben beizutreten. 

Ebel: … und die auch schon aktiv an Treffen der 

LSR AG teilgenommen haben und sich aktiv 

einbringen. Wenn die großen Laboranbieter, die 

wir an dieser Stelle noch nicht nennen wollen, 

beitreten, dann werden die Mitgliedsfirmen der 

LSR AG deutlich mehr als 50% des deutschen 

Life Science-Research-Marktes repräsentieren. 

Damit hätten wir unser erstes Ziel erreicht. 

Zudem hätten wir bereits die wesentlichen 

Marktführer in vielen Bereichen an Bord. 


Sie hatten es bereits angesprochen. Sie wollten 

auch Kooperationsmöglichkeiten mit 

Dr. Ralf Hermann ist der Vorsitzende der Arbeitsgruppe 

Life Science Research innerhalb 

des Verbandes der Diagnostica-Industrie 

(VDGH). Nach seiner Promotion im Fach 

Molekularbiologie an der Universität zu Köln 

begann der heute 46-jährige 1992 seine 

Karrierre als Produktmanager bei Qiagen 

und wechselte 1999 ins strategische Management. 

Von 2001 bis 2003 baute Hermann 

als Vorstandvorsitzender die Vivascience 

AG auf. Seit 2004 ist er bei der Eppendorf 

AG als Vice President Global Marketing und 

Customer Support tätig. 

Biotechnologie- und Forschungsverbänden 

ausloten. Wie ist da der Stand? 

Hermann: 

Wir haben mit der Forschung erste Kontakte. 

Mit der Deutschen Gesellschaft für Proteom- 

Forschung planen wir eine gemeinsame 

Veranstaltung. Zusätzlich haben wir mit 

sehr vielen Fachverbänden – ich glaube 10 

Industrie- und Biotechnologieverbänden 

sowie sieben Forschungsgesellschaften 

– gesprochen und erste Kontakte geknüpft. 

Jetzt geht es im nächsten Schritt darum, 

gemeinsame Interessen zu definieren und 

zu vertreten. 


Die LSR AG hat sich schon bei der Gründung 

eine intensive Zusammenarbeit auch mit der 

Forschung auf die Fahnen geschrieben. Was 

ist Ihnen hier besonders wichtig? 

Hermann: 

Unser Interesse liegt in erster Linie darin, 

wirklich ein kompetenter und neutraler Ansprechpartner 

für die Forschung zu sein, um 

gemeinsam an Lösungen für wissenschaftliche 

Probleme zu arbeiten. Es ist immer 

wieder der Fall, dass den Wissenschaftlern die 

geeigneten Tools fehlen, um in ihrer Forschung 

weiter voranzukommen. An uns als Verband 

können sie viel neutraler eine Rückmeldung 

geben, welche Tools fehlen, in welcher Richtung 

die Firmen entwickeln sollten, als an eine 


einzelne Firma, die naturgemäß einen sehr viel 

kommerzielleren Ansatz und Hintergrund 

hat. Wir wollen versuchen, diesbezüglich ein 

neutraler Ansprechpartner zu sein. Ein erster 

Schritt in diese Richtung ist der gemeinsame 

Workshop mit der Deutschen Gesellschaft 

für Proteomforschung (DGPF). Hier wollen 

wir den Proteomforschern eine Möglichkeit 

bieten, ihre Bedürfnisse an die Industrie zu 

formulieren und uns zu mitzuteilen, welche 

Tools fehlen. 


Was ist an dem Thema Messen so wichtig, 

dass die LSR AG diesem Thema einen eigenen 

Arbeitskreis widmet? 

Hermann: 

Messen sind für uns eine der wesentlichen 

Kommunikationsplattformen. Die Firmen 

stecken einen erheblichen finanziellen und 

personellen Aufwand in Messen. Letztlich 

muss uns allen daran gelegen sein, dass so 

eine Plattform auch genutzt wird – von unseren 

Kunden. Dazu muss man sich ansehen, 

wie man die Messen gestaltet und wie man 

es hinbekommt, dass die Messen mit der Zeit 

und mit den Ansprüchen des Kunden an so 

eine Veranstaltung tatsächlich mitwachsen. 

Deswegen ist es für uns ganz wesentlich, die 

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Ausrichtung der Messegesellschaften, die Gestaltung 

der für uns wesentlichen Messen mit 

zu beeinflussen. Es erscheint uns sehr sinnvoll, 

diese Anstrengungen zu bündeln und über 

den Verband glauben wir, dass wir deutlich 

größeren Einfluss auf die Messegesellschaften 

ausüben können, diese Messen wirklich 

interessant für den Kunden zu gestalten und 

somit den Aufwand, den die Firmen dort 

hereinstecken, auch zu rechtfertigen. Ganz 

besonders wichtig sind uns an dieser Stelle die 

beiden Hauptmessen für unseren Bereich, die 

Analytica und die Biotechnica. Wir haben mit 

beiden Messegesellschaften schon mehrfach 

Gespräche geführt. Wir versuchen uns wesentlich 

stärker in die Gestaltung der Messen einzubringen. 

Hier sehen wir bereits Fortschritte, 

unsere ersten Anregungen werden schon jetzt 

in der Umsetzung der Biotechnica sowie bei 

der Analytica im nächsten Jahr verwirklicht. 

Ebel: 

Der wichtigste Punkt ist, dass das Konzept 

der Messe viele Besucher anzieht. Da unterscheidet 

sich das Konzept der beiden 

großen Messen im Augenblick. Wir versuchen 

herauszufinden: Gibt es für die unterschiedlichen 

Standorte Möglichkeiten, die 

Besucheranzahl und den Besucherstrom so 

zu lenken, dass sich für uns ein erfolgreicher 


Dr. Thorsten Ebel ist Sprecher der Arbeitsgruppe 

Life Science Research (LSR AG) 

innerhalb des Verbandes der Diagnostica- 

Industrie (VDGH). Nach seiner Promotion im 

Fach Molekulare Genetik an der Universität 

Freiburg (Breisgau) ist der 41-jährige im 

Vertrieb bei Life Technologies, später 

Invitrogen tätig gewesen. Im Jahr 2004 

wechselte er zur Sigma-Aldrich Chemie 

GmbH in Taufkirchen, um den Verkauf zu 

führen, Seit 2005 hat Ebel die Leitung für 

Vertrieb (D, A) und Marketing (D, A, CH) für 

die Geschäftseinheit Biotechnologie inne. 

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Messeauftritt ergeben kann? Das beginnt 

bei dem Einzugsgebiet, geht weiter bei den 

begleitenden Veranstaltungen, über Möglichkeiten 

der Einladung oder des günstigen 

Zugangs für möglichst viele Besucher. 


Gibt es Wunschprojekte von Ihrer Seite oder 

bereits Spruchreifes? 

Hermann: 

Bei der nächsten Analytica werden wir uns am 

Rahmenprogramm zum Thema Life Sciences 

beteiligen. Da haben wir aus unserer Sicht für 

die Messebesucher interessante Themen vorgeschlagen 

und werden, wenn sie angenommen 

werden, für attraktive Referenten sorgen. Wir 

werden zudem versuchen, unsere Pressearbeit 

mit der der Analytica zu koordinieren. Bei der 

Biotechnica sind wir dabei, das neu vorgelegte 

Konzept zu hinterfragen und darauf hinzuwirken, 

dass man bei den Bestrebungen, die in 

Richtung europäische Leitmesse laufen, die sich 

ja auch in Turnusänderungen niederschlagen, 

die Interessen der Aussteller mit berücksichtigt. 

Denn nur gemeinsam werden wir es schaffen, 

die Messen attraktiv zu machen. 


Da scheint mit anzuklingen, dass Sie sich inhaltlich 

noch nicht so richtig wiederfinden? 

Hermann: 

Wir haben in der Vergangenheit, eigentlich bei 

allen Messegesellschaften beobachten müssen, 

dass Aspekte wie Technologietransfer oder 

Partnering ein immer größeres Schwergewicht 

bekommen. Dort sehen wir nicht den Schwerpunkt 

oder die Zukunft der Messen und auch 

nicht die Schwerpunktinteressen unserer 

Kunden. Das ist ein Thema, über das wir mit 

den Messegesellschaften diskutieren. 


Müsste es mehr um Technologien gehen? 


Der neugewählte Vorstand der Life Science Research AG: Wolfgang Barthel, Country Sales Manager 

Germany & Austria, Sigma-Aldrich Chemie GmbH, Dr. Ralf Hermann (Vorsitzender), Vice 

President Global Marketing & Customer Support, Eppendorf AG und Friedel Horneff, Group Manager 

Life Science Central Europe, Bio-Rad Laboratories GmbH 

Hermann: 

Richtig. Wir haben daher schon Ideen diskutiert, 

ob die Messegesellschaften nicht ein 

Interesse daran haben müssten, einen Technologiebereich 

auf der Messe darzustellen, 

und zwar ohne kommerziellen Hintergrund, 

also ohne begleitende Herstellerstände, sondern 

rein wissenschaftlich und neutral. Dort 

könnten Technologien vorgestellt werden, 

die auch die eine oder andere Firma in der 

Entwicklungspipeline hat, aber ohne dass 

die Firmen im Vordergrund stehen. Solche 

Dinge könnte ein Verband zwar koordinieren, 

aber vorangetrieben werden müssten 

sie von der Messegesellschaft. 


Weltweite Technologietrends zu erfassen, 

ist eine Aufgabe der Marktforschung. Was 

sind die Ziele und derzeitigen Aktivitäten 

des Arbeitskreises Marktforschung der 

LSR AG? 

Hermann: 

Der Arbeitskreis Marktforschung versucht 

primär, Transparenz über den deutschen 

Markt zu gewinnen – und zwar im internationalen 

Vergleich: Wo steht Deutschland 

tatsächlich in der Forschung, welcher Teil 

der Fördermittel fließt real in welche Forschungsprojekte, 

wo gibt es Doppelfinanzierungen, 

wo werden Förderschwerpunkte 

gesetzt, und wie vergleichen sich die verschiedenen 

Branchen, in die investiert wird, 

zum Beispiel Biotechnologie versus Nanotechnologie. 

Das primäre Ziel ist es, Transparenz 

zu schaffen, um sagen zu können, 

wo steht Deutschland, wo gibt es Defizite, 

wo müssten Schwerpunkte anders gesetzt 

werden? Alle Unternehmen betreiben individuell 

für sich Marktforschung und haben 

darüber hinaus ihre eigenen Umsatz- und 

Absatzzahlen, Abschätzungen von Marktanteilen 

etc. Wenn wir es schaffen, diese Daten 

neutral zu kombinieren, sollten wir ein sehr 

klares Bild der Life Science-Landschaft in 

Deutschland erhalten – also Fördermittel, 

firmeneigene Daten, Publikationen. 


Tritt nicht gerade bei der Marktforschung die 

Konkurrenzsituation der Firmen untereinander 

in Erscheinung? 

Hermann: 

Die Konkurrenzsituation ist in diesem Punkt 

sehr kritisch. Umso wichtiger ist es hier aber, 

dass wir im VDGH organisiert sind, der sehr 

viel Erfahrung hat, wie man diese Daten tatsächlich 

neutral zusammenführt, so dass keine 

Rückschlüsse auf die einzelnen Firmendaten 

gezogen werden können. Da hat der VDGH 

jahrzehntelange Erfahrung im Diagnostica- 

Bereich und auf die können wir natürlich 

zurückgreifen. Die Daten werden letztlich von 

der Geschäftsstelle des VDGH anonymisiert 

und zusammengeführt, so dass eine Konkurrenzsituation 

ausgeschlossen ist. 


Ihr Arbeitskreis Marktforschung führt derzeit 

schon entsprechende Befragungen durch. Was 

soll konkret an Daten abgebildet werden? 

Hermann: 

Wir fragen, weil wir neue Mitglieder gewonnen 

haben, in einem ersten Schritt bei den 

Unternehmen Mitarbeiterzahlen, Umsätze in 

Deutschland verglichen mit dem Weltumsatz, 

Umsatzentwicklung in bestimmten Forschungssegmenten, 

Produktgruppen etc. ab. Es 

geht uns also aktuell darum, die Firmendaten 

zu erheben. Der Arbeitskreis selbst arbeitet aber 

auch schon an der Zusammenführung der Daten, 

die die einzelnen Firmen zum Beispiel über 

die Fördermittelvergabe haben. Das passiert 

aber nicht im Rahmen einer Umfrage, sondern 

die Daten aus den Unternehmen werden innerhalb 

der Arbeitsgruppe zusammengeführt. 


Hat es diesbezüglich schon Gespräche mit 

den Fördermittelgebern gegeben, die ja eigene 

Datenbanken dazu vorhalten? 

Hermann: 

Es ist richtig, dass die Daten zum Teil vorhanden 

sind. Sie werden aber nicht so herausgegeben 

wie man das etwa aus den USA kennt. Die 

tatsächlichen Fördermittelflüsse beziehungsweise 

die genaue Verwendung dieser Mittel 

wird bei uns in Deutschland nicht wirklich 

transparent gemacht. Das ist in den USA, wo 

es den Freedom of Information Act gibt, ganz 

anders. Da können Sie ganz genau reinschauen, 

wie und für welche Zwecke die Mittel, die eine 

Arbeitsgruppe oder Institut bekommen haben, 

tatsächlich eingesetzt worden sind. Das ist in 

Deutschland so nicht der Fall, und das ist auch 

nichts, was die Fördermittelgeber tatsächlich 

herausgeben. Das ist der Punkt, den wir 


eigentlich angehen wollen, um zu versuchen 

anhand der Daten, die wir haben, verglichen 

mit dem, was offiziell berichtet wird, zu sehen, 

wie das denn zueinander passt. Wir wollen 

zuerst einmal die Datenlage auf unserer Seite 

so weit wie möglich absichern, bevor wir 

dann in die Gespräche mit den Mittelgebern 

gehen. 


Wollen Sie die Daten auch veröffentlichen? 

Hermann: 

Wo es sinnvoll ist, werden wir die Daten auch 

öffentlich manchen. Wir werden aber sicher 

nicht unsere gesamten Datenpakete unkommentiert 

auf den Tisch legen. 


Wie sieht denn die Zeitplanung für die Datenerhebung 

aus? 

Hermann: 

Die Firmenbasisdaten werden wir im Herbst 

in einer präsentablen Form erhoben haben. 

Das komplexere Fördermittelthema braucht 

natürlich wesentlich länger. Bis zur Mitte 

nächsten Jahres sollten wir in der Lage sein, 

die ersten Punkte anzugehen. 


Welche Ziele verfolgen Sie mit den Arbeitskreisen 

Öffentlichkeitsarbeit und eCommerce? 

Ebel: 

Eine Aufgabe der Öffentlichkeitsarbeit ist es, 

unsere Forderungen und Visionen an die Politik 

zu kommunizieren. Die andere Gruppe, die 

wir erreichen wollen, sind die Nutzer unserer 

Produkte, also unsere Kunden. Hier suchen 

wir den Dialog mit der Wissenschaft. Der 

dritte wichtige Aspekt ist die Interaktion mit 

den anderen Verbänden in Deutschland. 

Hermann: 

In dem Arbeitskreis eCommerce geht es uns 

darum, Transparenz hinsichtlich aller sichtbaren 

Plattformen, ihrer Leistungen und Konditionen 

zu gewinnen und letztlich dafür zu 

sorgen, dass die Benutzeroberflächen solcher 

Plattformen möglichst einheitlich gestaltet 

werden. Darüber hinaus ist uns ganz wichtig, 

dass sich diese Plattformen nicht als Selbstzweck 

verselbständigen. Sie müssen einen 

Nutzen schaffen – und zwar für den Kunden 

und den Hersteller. Es kann also nicht sein, 

dass es nur einen Nutzen für den Dienstleister 

gibt, der die Plattform anbietet. 


Im Juli wurde ein neuer Vorstand gewählt. 

Was hat sich bei der LSR AG personell verändert? 

Ebel: 

Die Neubesetzung war notwendig geworden, 

weil der bisherige Vorstand und sein Vertreter 

für ihre Firmen beruflich ins Ausland gegangen 

sind und deshalb ihre Tätigkeit nicht 

weiter wahrnehmen können. 

Hermann: 

Dr. Hans-Peter Fatscher (Qiagen), der bisherige 

Vorstand, ist in die USA gegangen, 

Dr. Bhuwnesh Agrawal hat für Roche eine 

Aufgabe in Indien übernommen. Der neue 

Vorstand besteht jetzt aus Wolfgang Barthel 

von Sigma-Aldrich und Friedel Horneff von 

Bio-Rad als Stellvertreter. Ich bin der Vorsitzende 

seit Juli. 


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Im Oktober wird die LSR AG auch politisch 

erstmals sichtbar. Gemeinsam mit der 

VDGH werden Sie eine Veranstaltung zum 

Thema personalisierte Medizin durchführen… 

Ebel: 

Es handelt sich um den zweimal jährlich 

stattfindenden Lokaltermin des VDGH, 

an dessen Planung die LSR AG erstmals 

mitbeteiligt ist. Wir haben ein Thema gefunden, 

das sowohl die Life Science Research- 

Firmen betrifft, als auch von besonderem 

Interesse für die diagnostischen Firmen 

ist. Hintergrund ist, dass es technologische 

Entwicklungen gibt, an denen auch einige 

unserer Unternehmen beteiligt sind, die 

es heute ermöglichen, Gewebebanken auf 

molekularer Ebene nachträglich zu analysieren. 

Auf Basis der entsprechenden Research 

Tools können diagnostische Tests entwickelt 

werden, die helfen zu verstehen, weshalb 

morphologisch-histologisch ähnliche Präparate 

auf verschiedene Therapieansätze 

nicht gleich reagieren. Das ist diagnostisch 

ein ganz neues Feld und auch von politischer 

Bedeutung, da es das Gesundheitssystem 

betrifft, dessen Finanzierung beansprucht 

und zahlreiche Fragen über den Umgang 

mit den Gewebeproben und erhaltenen 

Daten aufwirft. 


Was sind die Ziele der LSR AG für 2008? 

Ebel; 

Wir wollen die selbstgestellten Aufgaben unserer 

Arbeitskreise rasch umsetzen. Daneben 

wollen wir natürlich weiter wachsen. 

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Setting standards 

in analytical science 

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Liquid Handling 

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Schnelle Zyklen und geringe 

Kosten: Nanoliter-PCR 

Holger Eickhoff, SCIENION AG, Dortmund; 

Andreas Dahl, Max-Planck-Institut für molekulare Genetik, Berlin 

Die Kombination hochpräziser Dispenser im Piko- und Nanolitervolumenbereich und 

stark miniaturisierter Mikrotiterplattenformate ermöglicht die Durchführung von PCR- 

Reaktionen in Nanolitervolumina. Die kleinen Volumina erlauben schnelle Heiz- und 

Kühlschritte und die Durchführung einer kompletten PCR in weniger als 10 Minuten. 

Dabei werden im Vergleich zu Standardsystemen typischerweise maximal 10% der sonst 

üblichen Reagenzienmengen eingesetzt, was insbesondere im Hochdurchsatzbetrieb zu 

massiven Kosteneinsparungen führt. Kombiniert mit einer Online-Detektion für Real-time- 

oder Endpunktbestimmung ermöglicht die hier vorgestellte Kombination einen sensitiven, 

kosteneffektiven und schnellen Nachweis von Nukleinsäuren. 

Die Miniaturisierung von PCR-Reaktionen 

ist ein Forschungsfeld, welches in zwei 

generellen Ansätzen verfolgt wird. Neben 

Durchflusssystemen, bei denen sich ein 

kleiner Kanal durch mehrere Heiz- und 

Kühlzonen windet, werden in einem weiteren 

Ansatz auch miniaturisierte Mikroplattensysteme 

für PCR im Submikroliterbereich 

verwendet. Dabei gilt in beiden Ansätzen, 

dass das Verhältnis von Reaktoroberfläche 

zu Reaktionsvolumen im Gegensatz zu 

konventionellen Ansätzen stark in Richtung 

einer großen Oberfläche verändert wird. Dies 

führt zu effizienterer Wärmeübertragung auf 

das Reaktionsgemisch und ermöglicht so die 

Durchführung einer kompletten PCR in nur 

wenigen Minuten. 

Damit PCR-Reaktionen im Nanoliterbereich 

(nano-PCR) erfolgreich durchgeführt werden 

können, müssen sowohl die Präsenz 

von die Polymerasen inhibierenden Stoffen 

als auch die biochemischen Wechselwirkungen 

zu der vergrößerten Kontaktfläche mit 

dem Reaktionsgefäß minimiert werden. 

Während Durchflusssysteme und weiter 

integrierte Lab-On-A-Chip-Systeme große 

Skalierungseffekte durch die Verwendung 

von Siliziumtechnologie und der damit verbundenen 

günstigen Herstellung solcher 

Strukturen in der Zukunft versprechen, 

ist in den meisten Labors die Verwendung 

von PCR-Mikroplattensystemen Realität. 

Durchflusssysteme sind in der Regel geschlossene 

Systeme mit einem nicht standar- 

Abb. 2: Online-Volumenbestimmung von 

dispensierten Tropfen. Mit einem Stroboskopblitzlicht 

werden dispensierte Tropfen 

angeleuchtet und mit einer CCD-Kamera live 

aufgenommen. Die gezeigte Bildschirmaufnahme 

ist ein Ausschnitt aus der sciFLEXAR- 

RAYER-Software, auf dem die Düseneinstellungen 

links oben (blau hinterlegt: Pulshöhe 

88 Volt, Pulslänge 48 µs, Tropfenfrequenz 500 

Hertz), das Livebild der CCD-Kamera mit dem 

automatisch identifizierten Tropfen rechts 

(Tropfenschwerpunkt im Fadenkreuz) und 

das dispensierte Volumen von 285 Pikolitern 

unten links angezeigt werden 

disierten Interface für die Probenaufgabe, 

die spezifisch für einen bestimmten Assay 

gefertigt werden. Im Gegensatz dazu sind 

miniaturisierte Mikroplattensysteme offene 

Plattformen, die mit geeigneten Dispensern 

leicht und – wenn nötig – mehrfach befüllt 

werden können und so für eine Vielzahl von 

Assays nutzbar sind. Die Verwendung von 

offenen Kavitäten in PCR-kompatiblem Polypropylenmaterial 

erlaubt dabei eine freie 

Auswahl von einzelnen Reaktionsplätzen 

und die Adaptierbarbeit an verschiedene 

Assays und Detektionssysteme (Abb. 1). 

Diese im Vergleich zu geschlossenen Systemen 

größere Flexibilität in der Applika- 

Abb. 1: Links: Parallele Bestückung der nano-PCR-Platten mit vier Dispensern auf einem gekühlten sciFLEXARRAYER-Probenhalter zur Vermeidung 

von Evaporation und Kondensation. Rechts: Detailaufnahme während der Abgabe von Probengemischen in einzelne Kavitäten. Abstand der 

Kavitäten: 1mm. 


tionsentwicklung gab den Ausschlag für die 

Verwendung von miniaturisierten Testplatten 

für die hier dargestellten Ergebnisse. 

Dispensing 

In dem hier geschilderten Ansatz werden 

flexible, kontakt- und kontaminationsfrei 

arbeitende Dispensiersysteme für die Befüllung 

der entsprechenden Reaktionskavitäten 

verwendet. Die dabei dispensierten Volumina 

liegen zwischen 100 Pikolitern und 200 nl 

(Abbildung 2). Die Abgabe dieses Volumens 

erfolgt als einzelner Tropfen oder als eine 

Summe von Tropfen in weniger als einer 

A B 

Standardsystemen sehr viel kürzer. Dies ist 

im Wesentlichen auf kürzere Diffusionswege 

und einen effizienteren Wärmetransfer 

zurückzuführen, der durch die relativ zum 

Volumen großen Oberflächen erzeugt wird. 

Gleichzeitig wird durch die Miniaturisierung 

auch der Energieverbrauch pro Reaktion 

stark verringert. 

Schnelle PCR 

Die hier vorgestellte Plattform befindet sich 

in der fortgeschrittenen Prototypenentwicklung. 

Neben der weiteren Optimierung der 

verwendeten Werkstoffe, Materialien und 

Abb. 3: A. Real-time-Fluoreszenz-Monitoring: Amplifikationskurven für 200 nl real-time PCRs 

in einer Studie zur Untersuchung der gewebsspezifischen Genexpression in der Maus (Dahl et 

al., Biomol.Dev. 2007). B. Typischer Output eines TaqMan-basierten SNP-Genotypisierungsexperimentes 

in 200 nl nach Endpunktbestimmung. Proben mit gleichen Genotypen bilden leicht 

identifizierbare Cluster. 

Sekunde und weist dabei einen online gemessenen 

Dispensierfehler von weniger als 2,5% 

auf. Neben dieser hohen Präzision sorgt die 

Geschwindigkeit der abgegebenen Tropfen 

– typischerweise etwa 2-3 m/s – dafür, dass 

eine effiziente Mischung der Reaktionspartner 

erfolgt, bevor der erste Schritt im PCR-Protokoll 

gefahren wird. 

Die einzelnen experimentellen Schritte erfolgen 

dabei ähnlich wie in manuellen oder konventionellen 

Laborautomatisierungsystemen: 

Reaktionsmixe, Primer und Templates werden 

mit dem sciFLEXARRAYER-Dispenser in den 

miniaturisierten Testplatten gemischt und 

diese Testplatten mit transparenten Folien verschlossen. 

Nach Überführung in eine integrierte 

Temperatur- und Detektionseinheit kann die 

Intensität der Fluorophore in Echtzeit nach 

jedem Zyklus mit einer CCD-Kamera aufgenommen 

oder nur eine Detektion im Rahmen 

einer Endpunktbestimmung durchgeführt 

werden. Die dabei erfassten Intensitätsdaten 

werden für die einzelnen Kavitäten integriert, 

mit Standards abgeglichen und in den hier 

gezeigten Experimenten mit Standard-Tabellenkalkulationsprogrammen 

ausgewertet 

(Abb. 3). 

Die Zykluszeiten der nano-PCR sind 

verglichen mit den benötigten Zeiten von 

Protokolle ist aber schon jetzt eine leistungsfähige 

Plattform entstanden, deren Kapazität 

und Durchsatz etwa 10-fach höher ist als bei 

konventionellen Systemen. Dabei werden die 

Kosten durch die Miniaturisierung massiv gesenkt 

und betragen, abhängig vom Durchsatz, 

in der Regel nur noch etwa 10% der Kosten 

einer Standard-PCR-Reaktion. 

Zentrale Anwendungen der hier gezeigten 

Technologieplattform sind real-time 

PCR-basierte Genexpressionsanalysen und 

SNP-Genotypisierungen. Dabei können im 

miniaturisierten Format die Assaykomponenten 

für konventionelle PCR, qPCR oder 

sondenbasierte homogene Assays eingesetzt 

werden, so dass nach erfolgter Protokollanpassung 

schnell mit vergleichbaren Ergebnissen 

gerechnet werden kann. 

Korrespondemzadresse 

Dr. Holger Eickhoff 

SCIENION AG 

Otto-Hahn-Str. 15 

44227 Dortmund 

eMail: eickhoff@scienion.com 



Interview 

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„Appleras PCR-Motordeckel- 

Patent ist nichtig!“ 

Dr. Christian Kilger, VOSSIUS & PARTNER, Berlin 

Streitigkeiten um PCR-Patente sind wegen der großen Bedeutung des Verfahrens in der Molekularbiologie 

und der damit verbundenen Marktbedeutung seit langem an der Tagesordnung. Anfang 

August traf die Technische Beschwerdekammer des Europäischen Patentamtes in München eine 

Entscheidung, die den exklusiven Marktanspruch einer Firma auf die in den neunziger Jahren 

entwickelten Thermocycler mit Motordeckel bricht. Weil das Patentierungskriterium der Neuheit 

zum Zeitpunkt der Patentanmeldung nicht gegeben war, erklärte die Beschwerdekammer das 

Patent für nichtig und ermöglicht es so den Firmen, die gegen den damit verbunden Anspruch 

Einspruch erhoben hatten, ihre PCR-Maschinen mit Motordeckel wieder in Europa zu vertreiben. 

LABORWELT sprach kurz nach der Entscheidung mit Dr. Christian Kilger, Leiter des Berliner Büros 

der Kanzlei Vossius & Partner, die die protestierenden deutschen Firmen vertrat. 


Herr Dr. Kilger, Anfang August haben Vossius 

& Partner bekanntgegeben, dass die Technische 

Beschwerdekammer des Europäischen 

Patentamtes eine Entscheidung im Konflikt 

um das so genante PCR-Motordeckelpatent 

getroffen hat, die den Wettbewerb unter 

verschiedenen Thermocycler-Anbietern wiederzubeleben 

verspricht. Was sind überhaupt 

diese Motordeckel, und was macht sie so interessant 

für Firmen, dass vor Gericht darum 

gestritten wird? 

Kilger: 

Zunächst will ich festhalten, dass schutzwürdige 

Patente den Wettbewerb per Saldo 

nicht behindern. Ein Patent ist in aller Regel 

ein „Incentive“, um Innovation zu schaffen. 

Wir sind dem rechtsbeständigen Patentschutz 

verpflichtet, um so den Wettbewerb durch 

Belohnung schutzwürdiger Erfindungen 

anzuregen. Im Motordeckel-Fall hat die 

Patentinhaberin allerdings aus einem aus 

unserer Sicht offensichtlich schutzunfähigen 

Patent mehrere Wettbewerber mit Patentverletzungsklagen 

überzogen; dem sind wir 

erfolgreich entgegengetreten. 

In den späten Achtzigern und frühen 

neunziger Jahren haben verschiedene Konsortien 

versucht, als erste das menschliche 

Erbgut und andere Genome zu sequenzieren. 

Angesichts des zur Gensequenzierung erforderlichen 

gewaltigen technischen Aufwands 

wurde eine Automatisierung vieler molekularbiologischer 

Verfahren notwendig. Hierzu 

wurden die PCR-Geräte in Pipettierroboter 

integriert und die Motordeckel für die PCR- 

Maschinen entwickelt. 

Heute sollen die motorbetriebenen Heizdekkel 

in erster Linie dazu dienen, verschiedene 

PCR-Gefäße sicher mit einem einstellbaren 

und reproduzierbaren Druck automatisch 


zu verschließen. Dies ist vor allem bei 96er 

Thermoplatten mit Gummimattensystemen 

oder bei 384er-Thermoplattensystemen sehr 

wichtig. 

Mittlerweile gibt es viele Hersteller, die 

fast nur noch über Cycler verfügen, die diese 

Motorfunktion beinhalten. Ein manuelles 

Einstellen ist bei diesen Instrumenten nicht 

mehr vorgesehen. Wie bei jeder Technologie 

ist auch bei Thermocyclern so, dass ein 

Kunde bei einem Hersteller alle Varianten 

im Programm erwartet, also auch einen 

Motordeckel. Bin ich als Hersteller aus 

Patentgründen nicht in der Lage, einen 

bestimmten Markt zu bedienen, dann habe 

ich ein Problem. Unter Umständen geht 

dann das gesamte PCR-Geschäft an einen 

Wettbewerber. 


Zurück zur jetzt getroffenen Entscheidung. 

Wie sieht sie aus, was war ihre faktische Basis, 

und was macht sie so besonders? 

Kilger: 

Das Europäische Patent „Thermocyclervorrichtung“ 

mit der Nummer EP 1 013 342 B1 

wurde am 7. August 2007 um zirka 20.00 Uhr 

von der Technischen Beschwerdekammer 

3.3.05 des Europäischen Patentamtes widerrufen. 

Kurzum – das Patent ist weg. 

Das Patent wurde aufgrund mangelnder 

Neuheit widerrufen. Gemeinsam mit meinem 

Kollegen, Dr. Dieter Heunemann, und der Einsprechenden 

Eppendorf AG haben wir geltend 

gemacht, dass der „Power Bonnet“ der PTC 

200-Maschine der Firma MJ Research schon 

vorher alle Merkmale des Patentanspruchs 

offenbart hatte. Aus unserer Sicht hatte auch 

Roche bereits zuvor einen automatischen 

PCR-Deckel der Art entwickelt, wie Applera 

versucht hat, ihn in vielen Patentverletzungs- 

Dr. Christian Kilger ist in den USA geboren 

und wuchs sowohl in Deutschland als auch in 

den USA auf. Nach seinem Biologiestudium 

mit Schwerpunkt Genetik und Biochemie 

hat er im Labor von Svante Pääbo seine 

Doktorarbeit über Techniken der Nukleinsäure-Sequenzierung 

geschrieben. Als 

Post-Doc am MPI für Evolutionäre Genetik 

hat Dr. Kilger häufig auch am EMBL doziert. 

Im Jahre 1997 nahm Dr. Kilger eine Stelle 

bei der LION bioscience AG an, wo er für alle 

Schutzrechtsangelegenheiten verantwortlich 

war. Dr. Kilger wurde 2003 als Europäischer 

Patentanwalt zugelassen und 2006 als deutscher 

Patentanwalt zugelassen. Nach seiner 

Zeit bei LION war Herr Kilger Geschäftsführer 

der ipal GmbH in Berlin bevor er in die 

Kanzlei Boehmert & Boehmert eintrat. Seit 

Januar 2007 leitet Christian Kilger das Büro 

von VOSSIUS & PARTNER in Berlin. Schwerpunkt 

seiner Tätigkeit sind Bio/Pharma 

Patenterteilungsverfahren, Nichtigkeits- und 

Einspruchsverfahren sowie Patentverletzungsverfahren. 

klagen zu monopolisieren. Wie häufig bei 

diesen Verfahren, die bisweilen einige Jahre 

zurückreichen, hängt ein Teil der Erfolgschancen 

neben der Arbeit des Patentanwalts an einer 

guten Recherche. Es war unseren Parteien 

PEQLAB, Clemens und Sensoquest gelungen, 

die Gebrauchsanweisung des Power Bonnet 

aufzuspüren. Eppendorf hat es gar geschafft, 

ein altes Gerät zur Verhandlung mitzubringen, 

welches dann aber nicht benötigt wurde. Ich 

denke, dass das Patent wegen mangelnder 

Neuheit widerrufen wurde, ist aus unserer 

Sicht erfreulich. So war es nicht mehr nötig, 

über die erfinderische Tätigkeit zu diskutieren, 

und damit haben wir uns den zweiten 

Verhandlungstag gespart. 


Wie sah die rechtliche Situation davor aus und 

wie kam sie zustande? 

Kilger: 

Das Patent wurde im Jahre 1999 von der 

MWG Biotech AG angemeldet. Im Rahmen 


einer außergerichtlichen Einigung in einer Patentverletzungssache 

zwischen Applera und MWG, hat MWG das Motordeckelpatent im 

Jahre 2005 auf Applera übertragen. Bei dieser Patentverletzungssache 

ging es um ein weiteres Applera-Patent, das Heizdeckelpatent. Der 

Beschwerdesache T 868/06 war ein Einspruch der Firma Eppendorf 

gegen das Motordeckelpatent vorausgegangen. In diesem Einspruchverfahren 

wurde das Patent jedoch in Gänze aufrechterhalten. Dagegen 

hat Eppendorf Beschwerde eingelegt. In der Folge hat Applera 

eine Vielzahl von Firmen in Deutschland aus dem Motordeckelpatent 

wegen Patentverletzung verklagt – und zwar ohne Berechtigungsanfrage 

und Abmahnung – die Firmen wurden also mit der Klage 

überfallen. Wir haben eine ganze Reihe von Parteien vertreten. Die 

Firmen PEQLAB, Clemens und Sensoquest sind auf unseren Rat hin 

dem Beschwerdeverfahren am EPA beigetreten. Dadurch dass das 

Patent widerrufen wurde, konnten wir zeigen, dass die Klage unbegründet 

war. Andere Parteien haben sich aber wohl aus verschiedenen 

Gründen im Vorfeld mit Applera geeinigt. Eine Partei hat sogar in 

der Nacht vor der mündlichen Verhandlung am EPA ihren Beitritt 

zurückgezogen. Ich gehe davon aus, dass es auch hier eine Einigung 

gegeben hat. 


Wer profitiert von der neuen Rechtslage? Gibt es nun ein neues Schlüsselpatent 

und eine damit verbundene Monopolstellung eines einzelnen 

Unternehmens? 

Kilger: 

Von der Rechtslage profitieren zunächst die von uns vertretenen Firmen 

und Eppendorf. Grundsätzlich kann nun aber jeder einen Thermocycler 

mit Motordeckel herstellen, soweit es das jetzt widerrufene EP 1 013 342 

B1-Patent betrifft. Ob jene Parteien von der Entscheidung profitieren, 

die sich im Vorfeld geeinigt haben, kann ich nicht sagen. Mir ist nur 

bedingt bekannt, wie die Einigungsverträge zwischen Applera und 

diesen Parteien gestaltet sind. 


Ist die Entscheidung endgültig und die Rechtslage klar, oder ist nach 

Ihrer Einschätzung mit weiteren Verfahren zu rechnen? 

Kilger: 

Nein, die Entscheidung ist endgültig – das Patent wurde widerrufen. 


Sind ähnliche Verfahren auch außerhalb Europas anhängig und wie 

ist deren Stand? 

Kilger: 

Das kann ich Ihnen leider nicht sagen. 


Was bedeutet die Entscheidung für Nutzer entsprechend ausgestatteter 

Thermocycler in Europa? 

Buffy Coat, Vollblut, Gewebe, Zellkultur, 

Bakterien, Pflanzen, Mausschwanz, 

Mundschleimhaut, Haare, Knochen, 

Abstriche, Zecken, Pilze, „HOPE“-Gewebe, LGAs, 

Viren, RNA, HisTag-Proteine und weitere 

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Wären die von uns vertretenen Parteien unterlegen, so wäre Applera 

berechtigt gewesen, den Vertrieb und den Besitz von PCR-Maschinen, 

welche mit einem Motordeckel ausgerüstet sind, zu untersagen. Des 

Weiteren könnten sie Auskunft darüber zu verlangen, wer einen 

Motordeckel geliefert bekommen hat. Sie können sich vorstellen, wie 

unangenehm die Preisgabe von Kundeninformationen sein kann. Insbesondere, 

weil auch der Nutzer solcher Maschinen ein potentieller 

Patentverletzer gewesen wäre. Auch die Vernichtung des Patent-verletzenden 

Gegenstandes wäre eine Option gewesen. 

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Schildkrötstr. 15 · D-68199 Mannheim 

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Meeting 

� 

Die nächste Welle an Biotech- 

Wirkstoffen: Oligonukleotide 

Dr. Joachim Klein, RiNA Netzwerk RNA-Technologien GmbH, Berlin 

Führende internationale Experten aus Pharma- und Biotech-Unternehmen sowie der Wissenschaft 

geben Anfang Oktober in Berlin einen Überblick über eines der derzeit wissenschaftlich 

wie wirtschaftlich dynamischsten Forschungsfelder: Oligonukleotid-Wirkstoffe. Was 

die Organisatoren um Tom Tuschl (New York) und Gunther Hartmann (Bonn) an Sprechern 

nach Berlin zum 3. Treffen der Oligonukleotide Therapeutic Society (OTS, 4.–6. Oktober 2007) 

gebracht haben, verspricht einen exzellenten Blick in die Unternehmenspipelines und auf den 

aktuellen Forschungsstand. 

Die fortgeschrittensten Arzneimittelkandidaten 

der bekanntesten Wirkstoffklasse, die siRNAs, 

die sich bereits in Phase-III-Studien der klini- 

Tab. 1: Oligonukleotid-Wirkstoffe in klinischer Prüfung 


schen Entwicklung befinden, sind unlängst auf 

den Radarschirm großer Pharmaunternehmen 

geraten. Dies scheinen die Akquisitionen von 

Kategorie Firma Wirkstoff Phase Target/Krankheit 

Antisense (RNase H aktiv) ISIS Vitravene zugelassen CMV Retinitis/CMV 

ISIS 301012 Phase 2 Hoh. Cholesterin/ApoB-100 

ISIS 113715 Phase 2 Diabetes/PTB-TB 

ISIS (with Antis.Therap.) ATL 1102 Phase 2 Multiple Sklerose/VLA-4 

ISIS (with OncoGenex) OGX-011 Phase 2 Krebs/Clusterin 

ISIS (with ATL) ATL 1101 Psoriasis 

ISIS (with Lilly) LY2181308 Phase 1 Krebs/Survivin 

ISIS (with Lilly) LY2275796 Phase 1 Krebs/eIF4E 

Geron GRN163L Lymphocyt. 

Leukäm.(Telomerase) Genta Genasense Phase 3 Fortgeschrittenes Melanom 

Topigen ASM8 Phase 2 Asthma 

Lorus Therapeutics GTI-2040 Phase 2 AML/Ribonucleotid-Reduktase 

Antisense Pharma AP 12009 Phase 2 malignes Gliom/TGF-B2 

Santaris SPC 2996 Phase 1 Lymphocyt. Leukemie/Bcl-2 

Ester Neuroscience Monarsen (1) Phase 1 Myastenia Gravis/AChE 

Morpholinos (Translationsarrest) AVI Biopharma Resten-MP (AVI-4126) Phase 2 Cardiov. Restenose/c-myc 

AVI Biopharma AVI-4557 Phase 1 Drug Metabl./Cytochrome P450 

AVI Biopharma AVI-4065 Phase 1 HCV 

Ribozyme SiRNA ANGIOZYME Phase 2 Krebs/VEGF-Rezeptor/FLT1 

siRNAe Alnylam RSV01 Phase 2 RSV/Nucleocapsid (N) protein 

OpkoCorp. (Acuity Pharma) Bevasiranib Phase 3 AMD (VEGF) 

Aptamere EyeTech/Pfizer Macugen zugelassen AMD (VEGF) 

Regardo Biosciences RB006 Phase 1 Coagulation/factor IXa 

Regardo Biosciences RB007 Phase 1 Coagulation/Antidote to RB006 

TLR9-Agonisten (CpG, immunstimulator.) Coley CPG 7909 Phase 2 Melanom/TLR 9 

Coley (with Pfizer) PF-3512676 Phase 2 Cancer (not appr. by FDA)/TLR9 

Coley (for Sanofi-Aventis) AVE 7279 Phase 1 Asthma/TLR9 

Dynavax 1018 Phase 3 Asthma 

Idera HYB 2055 Phase 2 Krebs 

SIRNA durch Merck & Co. (Volumen 1,1 Mrd 

US-$) oder Alnylam Europe durch F. Hoffmann-LaRoche 

(Gesamtvolumen 800 Mio. 

US-$) zu belegen. Die Firmenentwicklung bei 

den RNA-Interfeerenzspezialisten ist derzeit 

durch den Aufbau eines möglichst guten Patentportfolios 

gekennzeichnet. So haben der 

Antisense-Spezialist Isis Pharmaceuticals und 

der RNA-Interferenz-Pionier Alnylam Inc. unlängst 

ein Joint-Venture namens Regulus Therapeutics 

LLC. gebildet um Wirkstoffe, gegen die 

körpereigenenen micro-RNA-Regulatoren der 

Genexpression zu entwickeln. Neben neuesten 

Entwicklungen aus dem Gebiet der siRNA- und 

miRNA-Wirkstoffe werden sich zahlreiche 

Unternehmenspräsentationen um Antisense- 

Wirkstoffe, Ribozym-, und Aptamerwirkstoffe 

drehen. Daneben bildet die Immunstimulation 

durch RNAs wie CpG-Oligonukleotide, 

immunstimulatorische isRNAs, RNA-Immunstimulatoren, 

die an sogenannte Toll-like 

Rezeptoren (TLRs) binden, und 5‘Triphosphat- 

RNAs (3PRAs) einen zweiten Schwerpunkt der 

wissenschaftlichen Tagung. 

Decoys Avontec AVT-01 (3) Phase 2 Asthma/STAT-1 

Antisoma AS1411 Phase 2 Krebs/Nucleolin 

Anesiva Avrina Phase 1 Ekzem/NF-κB 


Quelle: Fritz Eckstein, MPI für experimentelle Medizin, Göttingen

Die ersten durch die US Food and Drug 

Administration (FDA) zugelassenen RNA- 

Wirkstoffe scheinen zu belegen, dass nach der 

Welle monoklonaler Antikörper eine zweite 

Generation zulassungsfähiger Biomoleküle 

heranreift (vgl. Tabelle). Die Hauptentwicklungsrichtungen 

in Forschung und Industrie 

sind dabei derzeit die RNA-Interferenz und 

die Immunerkennung von Nukleinsäuren. 

Vielfalt der Technologieplattformen 

„Die Entdeckung der Genregulation durch 

kleine RNAs und ihre Anwendung zur Entwicklung 

von Wirkstoffen ist derzeit eine der 

spannendsten Gebiete der biomedizinischen 

Forschung“, erklärt der Alnylam-Mitgründer 

und Co-Organisator der OTS-Tagung Tom 

Tuschl (Rockefeller University). „Neue Entdeckungen 

im Feld der Immunerkennung 

von Nukleinsäuren markieren einen Durchbruch 

im Verständnis viraler Infektionen und 

werden zu neuen antiviralen und Krebs-Therapien 

führen“, erkärt Gunther Hartmann 

(Universität Bonn), Co-Chair der OTS-Tagung. 

Antivirale Strategien, die die TLR-Bindung 

nutzen, befinden sich derzeit in der klinischen 

Phase III-Testung. 

Leitende Wissenschaftler von Elli Lilly, 

Merck & Co., Santaris Pharma, Archemix, 


Freude beim Börsengang der im vergangenen Jahr von Merck & Co übernommenen SIRNA 

Sirna Therapeutics, Isis Pharmaceuticals, 

OncoGenex, Antisense Pharma und Topigen 

Pharma geben auf der Tagung einen 

Einblick in ihre klinische Entwicklung und 

dikutieren Themen wie Qualitätskontrolle 

von siRNA-Wirkstoffen, Herstellung und 

Zielsteuerung/Verabreichung. Internationale 

Spitzenforscher präsentieren wissenschaftlich 

heiße Eisen, wie neue Technologien für das 

Aptamer-Screening, lichtprogrammierbare 

Oligonukleotide oder RNAs als Krebs-Diagnostika 

und -Therapeutika. 


Das BioMedizinZentrumDortmund BMZ bietet als Einrichtung des 

TechnologieZentrumDortmund optimale Bedingungen für Start-Ups 

und junge Unternehmen im Bereich der Life Sciences. 

Für die Bereiche Biomedizin, Bioinformatik und Biomikrostrukturtechnik 

bietet das BMZ seinen Nutzern folgende Dienstleistungen an: 

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Spezielle Veranstaltungsthemen fokussieren 

auf die Mechanismen des Gene Silcencing und 

das Ansprechen von Nukleotidsequenzen auf 

Wirkstoffe, auf Tiermodelle und die präklinische 

Entwicklung. Das von Volker Erdmann 

initiierte RiNA RNA-Netzwerk ist verantwortlich 

für die Organisation der Veranstaltung. 


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Innerhalb des BMZ bietet das Zentrum 

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für Angewandte Proteomik ZAP 

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täten Bochum und Dortmund 

Dortmund und des Max-Planck-Instituts 

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PCR 

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Keine unvorhergesehenen 

Ereignisse mehr bei PCR und 

quantitativer real-time PCR 

Dr. Marcus Neusser, Bio-Rad Laboratories, München 

Seit der Erfindung der Polymerase-Ketten-Reaktion (PCR) 1,2 -Methode durch Kary Mullis 1985, 

für die dieser 1993 den Nobelpreis für Chemie erhielt, wurde diese Methode zu einem der bedeutendsten 

Handwerkszeuge der modernen Molekularbiologie. Die PCR dient der spezifischen 

Amplifikation von RNA/DNA-Sequenzen, zu deren Nachweis und neuerdings auch zu deren 

exakter Quantifizierung mittels quantitativer real-time PCR und Fluoreszenzmarkierung. 

Neueste technologische Entwicklungen dienen dem quantitativen Nachweis seltener Proteine 

mit Immuno-PCR 3,4 und dem schnellen Nachweis von Einzelbasenaustauschen 5 , sogenannten 

SNPs. Die SNPs sind unter anderem Indikatoren spezifischer Krankheitsbilder und haben 

prognostische Bedeutung dafür, ob und wie hoch das individuelle Erkrankungsrisiko ist. Viele 

Anwender der PCR-Methode sind bereits einmal den „Geistern“ in der PCR begegnet. Gemeint 

sind damit „unerklärliche“ Ergebnisse wie falsch-positive Nachweise oder die Amplifikation 

unerwünschter PCR-Produkte, die eine Konkurrenz zu den eigentlichen spezifischen PCR- 

Produkten darstellen. Auch das Ausbleiben jeglicher Amplifikationsprodukte unterliegt dem 

Einfluss dieser vermeintlichen „PCR-Geister“. Dieser Beitrag soll helfen, unerwünschte PCR- 

Resultate zu vermeiden. Zugleich ist er Anleitung, effektive Maßnahmen zu ergreifen, um den 

unerklärlichen Phänomenen auf den Grund zu gehen. 

Anwender, für die die PCR eine neue Methodik 

darstellt, unterschätzen häufig die hohe 

Nachweisempfindlichkeit und das damit 

einhergehende Risiko falsch-positiver und 

artifizieller PCR-Ergebnisse. Bereits bei der 

Probenisolierung sollten bestimmte Richtlinien 

eingehalten werden, um Frustration und 

Verwirrung in den nachfolgenden Schritten 

zu vermeiden. Der Laborbereich, in dem die 

Probenaufarbeitung (DNA-/RNA-Isolierung) 

durchgeführt wird, ist räumlich strikt von den 

übrigen Laborbereichen, in denen die Amplifikation 

und der Nachweis der PCR-Produkte 

erfolgt, zu trennen. Es werden in allen Bereichen 

ausschließlich gestopfte Pipettenspitzen 

und nicht gepuderte Handschuhe verwendet; 

PCR-Wasser sollte kommerziell bezogen und 

in kleinen Mengen zum Einmalgebrauch gelagert 

werden. Laborbekleidung und Pipetten 

verbleiben im jeweiligen Laborbereich, um 

ein Verschleppen von PCR-Endprodukten 

in den Bereich der Probenisolierung und 

Abb.1: SmartSpec TM Plus Spectrophotometer (Bio-Rad Laboratories GmbH) 

34 | Kennziffer 8. Jahrgang | Nr. 26 5/2007 LW 05 · www.biocom.de 

LABORWELT

PCR-Vorbereitung zu vermeiden. Der Grund: 

PCR-Produkte lassen sich sehr einfach, etwa 

über einen Luftstrom, übertragen. 

Isolierung der DNA/RNA 

Es werden im wesentlichen zwei Methoden 

verwendet. Die klassische Phenol/Chloroform-Extraktion 

ist sehr gut geeignet, um 

große Mengen an DNA/RNA und auch um 

aus sehr fetthaltigem Material (z.B. Hirngewebe) 

DNA zu isolieren. Der Nachteil dieser 

Methode ist der Umgang mit den toxischen 

Substanzen Chloroform und Phenol, die zusätzlich 

eine kostenaufwendige Entsorgung 

beanspruchen. 

Ein weiterer Nachteil – in der PCR können 

Phenolreste eine Inhibition der Reaktion 

verursachen. Die auf Kieselsäure basierende 

Extraktion mittels Säulchen stellt eine 

moderne, sehr zeiteffiziente und saubere 

Aufarbeitungsmethode dar, die auch für 

Kleinstmengen geeignet ist sowie die parallele 

Aufarbeitung einer großen Anzahl 

von Proben ermöglicht (high throughput 

analysis). Die Aufarbeitung kann unter Verwendung 

einer Vakuumstation vereinfacht 

werden, indem die Waschschritte für alle 

Proben (bis zu 96 in der Aurum Vacuum- 


Station) gleichzeitig erfolgen. RNA-Proben 

werden während der Isolierungsschritte mit 

DNAse behandelt, damit kontaminierende 

DNA nicht als Konkurrenz zur eigentlichen 

RNA beziehungsweise cDNA in der anschließenden 

PCR co-amplifiziert wird und damit 

zu falschen Ergebnissen führt. Es ist kein Umgang 

mit toxischen Substanzen erforderlich, 

und Inhibitoren (z.B. Häm aus Blutproben) 

werden effizient beseitigt. 

DNA/RNA-Qualitätskontrolle 

Bevor die isolierte DNA/RNA im PCR-Prozess 

verwendet wird, sollte immer eine Qualitätskontrolle 

erfolgen. Spektralphotometer 

wie das SmartSpec TM Plus (Bio-Rad Laboratories 

GmbH) geben Auskunft über die Menge 

und Reinheit der isolierten DNA, und die 

Resultate können zur Datendokumentation 

direkt ausgedruckt werden (Abb. 1) oder auf 

einen Rechner übertragen werden. 

Für eine Qualitätskontrolle der RNA kann 

bei ausreichender Menge (minimal 100ng) die 

klassische Gelelektrophorese verwendet werden. 

Das Verhältnis der ribosomalen 28S- und 

18S-RNA-Banden sollte 2 zu 1 betragen. Ein 

RNA-Hintergrund durch Abbaufragmente 

sollte nicht sichtbar sein, da dies die Degra- 


dation des wertvollen Materials anzeigt und 

somit die Wahrscheinlichkeit einer effizienten 

Amplifikation reduziert ist. 

Stehen nur geringste Mengen der wertvollen 

RNA zur Verfügung, so resultiert daraus 

die Notwendigkeit, die Qualitätskontrolle mit 

Kleinstmengen durchzuführen, um nicht zu 

viel Material für die anschließenden Experimente 

zu verlieren. In diesem Fall erfolgt 

die Analyse in einem Microfluidic-System, 

das auf einem Microchip alle Laborbereiche 

der konventionellen Gelanalyse vereint. Nur 

geringste Mengen (0,1-500ng) der kostbaren 

DNA/RNA werden in die gelbefüllten Mikrokanäle 

des Chips injiziert und durchlaufen 

in wenigen Sekunden eine Elektrophoreseauftrennung 

mit gleichzeitiger Färbung und 

Fluoreszenzdetektion in Form eines Elektropherogramms. 

Die gemessenen Mengen 

sowie die Reinheit und Unversehrtheit der 

RNA-Probe werden durch das charakteristische 

Profil der Mengen an 28S- und 18S-RNA 

angezeigt und zusätzlich optisch in Form 

eines simulierten Gelbildes anschaulich präsentiert 

(Abb.2). Eine RNA-Degradation lässt 

sich auf diese Weise einfach detektieren, und 

die Proben werden bei schlechter Qualität 

von weiteren Untersuchungen ausgeschlossen. 

Dadurch werden Material und Zeit 

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Tom Tuschl, Rockefeller University, and Gunther Hartmann, University of Bonn 

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eingespart, und es werden keine unnützen 

oder irreführenden Daten erhoben. 

PCR-Setup 

Der Bereich, in dem die PCR-Vorbereitung 

erfolgt, also Mastermix und DNA/RNA-Proben 

zusammengeführt werden, ist strikt vom 

Detektionsbereich zu trennen. Im übrigen 

gelten hier die gleichen Richtlinien wie für den 

Probenisolierungsbereich genannt. 

In der modernen PCR-Methodik ist ein 

Pipettieren der Proben auf Eis bei 4 °C nicht 

mehr erforderlich, denn es werden sogenannte 

HotStart-Taq-Polymerasen verwendet. Diese 


PCR Base Line Subtracted CF RFU 

10000 

1000 

100 

10 

10 

0 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20 22 24 26 28 30 32 34 36 38 40 42 44 46 

Cycle 

Abb. 2: CT-Shift in degradierten RNA-Proben, Qualitätskontrolle mit dem Experion TM Microfluidic system (Bio-Rad Laboratories GmbH) und anschließende 

Amplifikation mit dem iQ5 TM Real-Time-PCR-System 6 . 

�� 

intakt degradiert 

Enzyme sind initial inaktiv und werden erst 

durch einen einleitenden Hitzedenaturierungsschritt 

bei 95° C bis 98° C unmittelbar 

vor der PCR-Reaktion aktiviert. Je nachdem, 

ob antikörperassoziierte oder chemisch modifizierte 

Taq-Polymerasen verwendet werden, 

dauert die initiale Aktivierung von 15 Sekunden 

bis zu 15 Minuten. Durch den HotStart 

ist gewährleistet, dass beim ersten Anbinden 

der genspezifischen Startermoleküle (Primer) 

an die Ziel-DNA/cDNA unmittelbar die 

gewünschte Neustrangsynthese durch die 

Taq-Polymerase erfolgt. 

Wenn es darum geht, möglichst uniforme 

und gut reproduzierbare Ergebnisse zu erzie- 


�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

len, ist die Verwendung von Fertigreagenzien 

zu empfehlen. Diese unterliegen strengen 

Qualitätskontrollen und verwenden hochwertige 

Einzelkomponenten und optimierte 

Puffer, die eine maximale Produktausbeute 

garantieren. 

Primer-Stammlösungen sollten in TE-Puffer 

gelagert werden, und ein wiederholtes 

Auftauen und Einfrieren ist zu vermeiden. 

Idealerweise wird eine solche Primer-Stammlösung 

einmalig in kleinere Einheiten abgefüllt, 

bei –20° C gelagert und die Portionen 

nur einmalig aufgetaut. Die als Gebrauchslösung 

verdünnten Primer werden für einen 

begrenzten Zeitraum von weniger als 10 Tagen 

�� 

�� 

�� 

36 | 8. Jahrgang | Nr. 5/2007 �� 

LABORWELT 

10000 

1000 

100 

PCR Base Line Subtracted CF RFU 

10000 

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10 

0 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20 22 24 26 28 30 32 34 36 38 40 42 44 46 

Cycle 

10000 

1000 

100 

�



bei 4° C gelagert und im PCR-Prozess verwendet. Gleichermaßen wird 

mit DNA-Standards und positivem und negativem Kontrollmaterial 

verfahren. Um Konzentrationsverluste der titrierten DNA-Standards 

zu vermeiden, kann mit einer Hintergrund-DNA oder -RNA gearbeitet 

werden. Diese stammt aus einer anderen Spezies und hat keinerlei 

Homologie zu den zu amplifizierenden Zielgenen der spezifischen 

DNA oder RNA. Schließlich soll hier auch noch die Temperaturgradientenfunktion 

genannt werden, über die viele Thermocycler verfügen. 

Der Temperaturgradient hilft dabei zu überprüfen, bei welcher 

Annealingtemperatur die spezifischen Primermoleküle ihre maximale 

Bindung zur Zielstrang-DNA und damit ihre höchstmögliche Amplifikationseffizienz 

erzielen. 

Fast-PCR 

Um eine möglichst schnelle und sichere PCR zu erzielen, lassen sich 

Standard-PCR-Applikationen auf einfache Weise beschleunigen, ohne 

dass die Verwendung von speziellen Verbrauchsmaterialien, Reagenzien 

oder PCR-Geräten erforderlich ist. 

Die hohen Heiz-/Kühlraten der modernen PCR-Geräte spielen 

dabei eine untergeordnete Rolle. Eine große Bedeutung haben jedoch 

die speziell für die Fast-PCR konstruierten Primer, deren Design es 

ermöglicht, dass sie bereits bei einer hohen Temperatur um 70° C, also 

im Temperaturoptimum der Taq-Polymerase, an die gewünschten 

Zielsequenzen binden. Die Amplifikationsprodukte sollten klein sein 

(80-150bp), um eine vollständige Neusynthese aller Komplementärstränge 

zu erreichen. 

Aus einer klassischen 3-Schritt-PCR: (HotStart: 95° C x 3 min, Denaturierung: 

95° C x 15 s, Annealing: 62° C x 30s x 35 Wiederholungen, 

Neustrangsynthese: 72° C x 30 s) lässt sich sehr einfach eine schnelle 

2-Schritt-PCR entwickeln (HotStart: 98° C x 30s, Denaturierung: 

92° C x 1s, Annealing/Neustrangsynthese: 70° C x 5s x 35 Wiederholungen). 

Während die klassische Polymerase-Kettenreaktion eine Laufzeit 

von 90 Minuten hat, reduziert sich dieser Zeitraum in der beschriebenen 

Fast-PCR auf unter 30 Minuten. 

Als Kary Mullis die PCR-Methode erfand, wurden die PCR-Produkte 

ausschließlich mit klassischer Gelelektrophorese und Ethidiumbromidfärbung 

nachgewiesen. 

PCR-Detektion und quantitative real-time PCR 

Die modernen PCR-Systeme bieten die Möglichkeit des gelfreien 

Nachweises der PCR-Produkte mit dem wenig toxischen SYBR-Green 

oder fluoreszierenden Hybridisierungssonden mittels quantitativer 

real-time PCR. 

Die dazu verwendeten real-time PCR-Systeme verwenden Halogen- 

oder LED-Licht und Fluoreszenzfilter, um die PCR-Produkte in jedem 

Zyklus der PCR zu messen. Es wird dadurch ein großer dynamischer 

Detektionsbereich für Proben unterschiedlichster DNA-Mengen erzielt. 

Im Vergleich mit DNA-Standards bekannter Quantität lassen sich 

unbekannte Proben absolut quantifizieren, das heißt, ihnen kann mit 

hoher Genauigkeit eine DNA-Ausgangsmenge im Vergleich mit den 

bekannten Standards zugewiesen werden. 

Im Bereich der Genexpression ist es üblich, die zu untersuchenden 

Gene (Kandidatengene) mit sogenannten Referenzgenen (Gene, 

die bekanntermaßen keiner Regulation unterliegen) zu vergleichen 

und anhand von Rechenalgorithmen die n-fache Regulation dieser 

Kandidatengene zu berechnen. Die hierzu entwickelten Softwareprogramme 

bieten zur Auswertung Algorithmen nach Livak 7 , Pfaffl 8 

oder Vandesompele 9 an. Die Unterschiede bestehen darin, ob nur 


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times, high development expenses and high project failure 

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Holldack presents an approach for using project management 

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Abb. 3: iQ5 TM High End real-Time PCR-System zur absoluten und relativen 

Quantifizierung und Verwendung von einem oder mehreren Referenzgenen. 

Selbst große Genstudien mit bis zu 5.000 Proben lassen sich innerhalb der 

Software nach Algorithmen von Livak, Pfaffl oder Vandesompele verarbeiten. 

eines oder mehrere Referenzgene in die Berechnung einfließen und 

ob unterschiedliche Produktbildungseffizienzen der PCR-Produkte 

mitberechnet werden. 

All diese Algorithmen führen zu sehr exakten und miteinander vergleichbaren 

Resultaten, sofern die erforderliche Umsicht bei der Wahl 

der nichtregulierten Referenzgene gewährt wird. 

High end-Systeme wie das iQ5 TM - oder MyiQ TM -System können 

innerhalb der real-time PCR-Software sogar Genstudien mit bis zu 

5.000 Proben auswerten. 

Bei Berücksichtigung aller genannten Maßnahmen im Rahmen 

einer „Good Laboratory Practice“ (GLP) ist man hervorragend gegen 

die „Geister der PCR“ geschützt. Sollte aber dennoch einmal einer in 

Erscheinung treten, dann rufen Sie einen unserer „Ghost Buster“-PCR- 

Spezialisten an. 

Literatur 

[1] Saiki R.K., Scharf S., Faloona F., Mullis K.B., Horn G.T., Ehrlich H.A., Arnheim N.: Enzymatic amplification of β3-globin 

genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of sickle cell anemia. Science 230 (1985), 1350-1354 

[2] Mullis K.: Dancing Naked in the Mind Field. Pantheon Books, New York, 1998 

[3] Sano et al: Immuno-PCR: very sensitive antigen detection by means of specific antibody-DNA conjugates. Science 258 

(1992), 120-122 

[4] Lind, K. and Kubista, M.: Technical Note 2805 BioRadiations 109 (2002), 32-33 

[5] Wittwer, Carl T., Reed, Gudrun H., Gundry, Cameron N., Vandersteen, Joshua G. and Pryor, Robert J.: High-Resolution 

Genotyping by Amplicon Melting Analysis Using LCGreen, Clinical Chemistry 49 (2003), 853-860 

[6] Strong, William and Rubio, Theresa: Using the ExperionTM Automated Electrophoresis System to assess RNA Quality and 

Quantity in siRNA-induced Gene Silencing Experiments, Bio-Rad Technical Note 5315 

[7] Livak K.J., Schmittgen T.D.: Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2(-Delta 

Delta C(T)) Method. Methods 25 (2001), 402-8. 

[8] Pfaffl M.W.: A new mathematical model for relative quantification in real-time RT-PCR. Nucleic Acids Res 29 (2001), :e45. 

[9] Vandesompele J., De Preter K., Pattyn F., Poppe B., Van Roy N., 

De Paepe A., Speleman F.: Accurate normalization of real-time quantitative RT-PCR data by geometric averaging of 

multiple internal control genes. Genome Biol 3 (2002) RESEARCH0034.1-RESEARCH0034.11 


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38 | 8. Jahrgang | Nr. 5/2007 Kennziffer 31 LW 05 · Informationen ordern? · www.biocom.de LABORWELT

Biometra GmbH 

Dr. Stefanie Navabi 

Rudolf-Wissell-Straße 30 

37079 Göttingen 

Tel.: +49-(0)551-50 686-0 

Fax: +49-(0)551-50686-66 

info@biometra.de 

www.biometra.de 

Biometra GmbH 




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1. Firmendaten, Ansprechpartner Applied Biosystems, Applera Deutschland GmbH, 

Frankfurter Straße 129 B 

64293 Darmstadt 

Tel.: +49-(0)6151-9670-0 

Fax: +49-(0)6151-9670-5599 

2. Produktname Veriti TM Thermal Cycler TPersonal Thermocycler T1 / TGradient Thermocycler 

3. Anwendungsbereich PCR, Cycle Sequencing PCR, Cycle Sequencing PCR, Cycle Sequencing 

Thermocycler Thermocycler 

Mit der zusätzlichen Steuerung der VeriFlexTM-Blöcke stehen dem 

Benutzer sechs unabhängige Temperaturblöcke zur Verfügung, 

die eine präzise Kontrolle zur Optimierung der PCR-Parameter 

ermöglichen. Eine leistungsfähige Benutzerschnittstelle vereinfacht 

mit einem Farb-Touch-Screen Einstellung und Anwendung. 

Der Benutzer kann mit dem Fast-PCR-Master Mix die Zeit eines 

PCR-Zyklus verkürzen. • 96well Thermal Cycler: 0,1 ml und 0,2 ml 

Reaktionsvolumen • Außerdem als 384-well-Block und als 60-well- 

Block erhältlich. 

4. Kurzbeschreibung des Produktes, 

Komponenten etc. 

T H E R M O C Y C L E R 

Marktübersicht: Thermocycler 

Ob in der Forschung oder zunehmend auch in der medizinischen Diagnostik - die Polymerase-Kettenreaktion ist in gut 20 Jahren zum molekularbiologischen 

Arbeitspferd molekularbiologisch arbeitender Labors aufgestiegen. Damit verbundenen war eine ständige Optimierung des 

zeitraubenden Amplifikationsprozesses. Einen Überblick über die aktuellen Instrumente der Hersteller, die sich an unserer Geräteumfrage 

beteiligt haben, gibt die vorliegende Marktübersicht. 

Temperaturzyklen mit schnellen Heiz- und Kühlraten Temperaturzyklen mit schnellen Heiz- und Kühlraten 

Besonderheiten: Die Kühlluft strömt durch die Front ein und auf 

der Rückseite wieder heraus. Dadurch lassen sich mehrere Geräte 

platzsparend Seite an Seite stellen. Durch die VeriFlexTM-Blocks im VeritiTM 96-well Thermal Cycler lässt sich die PCR exakter optimieren 

als mit Gradienten-Blöcken. • Die sechs separaten Peltier- 

Blöcke ermöglichen eine präzise Steuerung der Temperatur-Einstellungen, 

z. B. für das Primer-Annealing, etc., und erleichtern die 

Optimierung des PCR-Protokolls. 

5. Funktionsprinzip 

Anzahl der Heizblöcke: 1 

Material der Heizblöcke: Silber 

Probenkapazitäten der erhältlichen Blöcke: 

48 x 0,5ml, 96 x 0,2ml oder MTP, 384well MTP, 4 Objektträger 

(in situ) 

Art des Kühl/Heizsystems: Peltier 

Programmspeicherplätze: ca. 250 

Schritte pro Programm: 99 

Deckelheizung: 30 °C – 99 °C 

Heizrate: 4.0°C/sek. 

Kühlrate: 3.0°C/sek. 

Temperaturbereich: 3 bis 99°C 

Regelgenauigkeit: ± 0,1°C 

Temperaturverteilung bei 95°C: ± 0,5°C 

Geräteabmessung: 25 x 15 x 34 (B x H x T) 

Gewicht: 8,8 kg 


Material der Heizblöcke: Aluminium 

Probenkapazitäten der erhältlichen Blöcke: 20 x 0,5 ml, 48 x 0,2 ml 





Heizrate: 3.0°C/sek. 






Gewicht: 6,7 kg 

0.2 mL patentierter Alloy-Block, ermöglicht Standard- oder Fast- 

Chemie, max. Aufheizgeschwindigkeit des Blocks 3,90° C/sec, max. 

Aufheizgeschwindigkeit der Probe 3.35° C/sec, Temperaturgenauigkeit 

±0,25° C (35-99,9° C), Temperaturbereich von 4,0° C bis 99,9° 

C, Gerät speichert 800 Protokolle on-board und unbegrenzt viele auf 

USB-Memory Sticks, VeriFlex Block maximal zulässiger Temperaturunterschied 

25° C (jeweils 5° C von Bereich zu Bereich). Bis zu 

zwölf Geräte können über ein Ethernet-Hub vernetzt werden, und 

mit dem VeritiLink Feature können alle Geräte von einem einzigen 

Instrument gesteuert werden – eine wertvolle Option für Labore im 

Produktionsmaßstab. 


6. Technische Daten 

Protokoll-abhängig Protokoll-abhängig 

Das Target p53 (1.4kb) kann mit dem Fast-PCR-Master-Mix in 35 

Minuten und mit Standard-PCR-Chemie in zwei Stunden generiert 

werden. 

7. Zeit pro run 

Zuverlässiger Kundenservice durch wissenschaftlichen Außendienst 

vor Ort und Servicezentrale in Göttingen 

8. Kundenservice Die deutsche Hotline ist werktags von 8 Uhr bis 17.30 Uhr erreichbar Zuverlässiger Kundenservice durch wissenschaftlichen Außendienst 

vor Ort und Servicezentrale in Göttingen 

VeriFlex-Block: Exaktere PCR-Optimierungen als bei Gradienten- 

Blöcken. Wiederherstellungs-Tool bei Stromausfall. 9600 Protocol 

Konvertierungs-Tool. 

9. Extras 

10. Preis für Basisgerät auf Anfrage 2.990,– C T1: 5.250,– C TGradient: 6.250,– C

BIOCOM Event: 

Weiße Biotechnologie 2007 

1 st European Convention on Industrial Biotechnology 

BIOTECHNICA, 10.10.2007, 10 Uhr, Saal 3A, Convention Center, Messegelände Hannover 

10 bis 12 Uhr: Weiße Biotechnologie – 

Clusterbildung in Deutschland, Schweiz und Österreich: 

Biopolymere/Biowerkstoffe: Dr. Ralf Kindervater, BIOPRO GmbH, Stuttgart 

CLIB 2021: Dr. Manfred Kircher, Degussa GmbH, Marl 

IBP Switzerland: Prof. Dr. Oreste Ghisalba, Novartis AG, Basel (Industrial Biotech Platform Switzerland) 

Biokatalyse Graz: Dr. Markus Michaelis, Angewandte Biokatalyse Kompetenzzentrum GmbH, Graz 

Industrielle Prozesse IBP: Prof. Dr. Haralabos Zorbas, BioM Biotech Cluster Development GmbH, Martinsried 

Industrieverbund Genomik: Dr. Karl-Heinz Maurer, Henkel KGaA, Düsseldorf 

Integrierte BioIndustrie: Dr. Detlef Terzenbach, FBA Frankfurt Bio Tech Alliance, Frankfurt 

BIOKATALYSE2021: Dr. Helmut Thamer, TuTech Innovation GmbH, Hamburg 

12 bis 12.30 Uhr: Networking und Mittagsimbiss 

12.30 bis 14 Uhr: Podiumsdiskussion „Mitteleuropa: führender Standort 

der industriellen Biotechnologie – jetzt und in Zukunft!?“ 

Prof. Dr. Michael Dröscher, Leiter Innovation Management Chemicals, Degussa GmbH, Essen 

Prof. Dr. Wim Soetaert, Fachbereich Biochemische und mikrobielle Technologie, Universität Gent/Belgien 

Prof. Dr. Wiltrud Treffenfeldt, Global Leader Bioprocess R&D, Dow AgroSciences, Indianapolis/USA 

Dr. Marco Ziegler, Associate Principal, McKinsey & Company, Zürich 

Dr. Holger Zinke, Vorstandsvorsitzender der BRAIN AG, Zwingenberg 

Moderation: Andreas Mietzsch, BIOCOM AG 

Freier Eintritt im Rahmen der BIOTECHNICA, doch Anmeldung erbeten unter www.biotechnica.de/tc_d 

Simultaneous translation in � English. Entrance is free, but please register at www.biotechnica.de/tc_e 

Eine Veranstaltung der BIOCOM AG, Berlin, in Zusammenarbeit mit der Deutschen Messe AG, Hannover. 

Mit freundlicher Unterstützung von: Medienpartner: 

Trinationale Clustertagung

Bio-Rad Laboratories GmbH 

Dr. Marcus Neusser 

Heidemannstr. 164, 80939 München 

Tel.: +49-(0)89-318 84-177 

Fax: +49-(0)89-318 84-123 

marcus_neusser@bio-rad.com 

Biometra GmbH 




Tel.: +49-(0)551-50 686-0 

Fax: +49-(0)551-50686-66 



Biometra GmbH 




Tel.: +49-(0)551-50 686-0 

Fax: +49-(0)551-50686-66 



1. Firmendaten, Ansprechpartner Biometra GmbH 




Tel.: +49-(0)551-50 686-0 

Fax: +49-(0)551-50686-66 



2. Produktname T3000 Thermocycler TProfessional Thermocycler TProfessional Basic Thermocycler MJ Mini TM 

3. Anwendungsbereich PCR, Cycle Sequencing PCR, Cycle Sequencing PCR, Cycle Sequencing Konventionelle Polymerase-Ketten-Reaktion (PCR) und Cycle 

Sequencing 

Thermocycler Thermocycler Thermocycler Kleiner Personal Cycler im 48 well Format, Peltier-gesteuert. 

Durch höchste Temperaturgenauigkeit excellente PCR Ergebinsse 

auch bei sehr anspruchsvollen PCR Applikationen. 8 

unterschiedlicheTemperaturen im Temperaturgardienten. 



5. Funktionsprinzip Temperaturzyklen mit schnellen Heiz- und Kühlraten 48 well-PCR-Thermocycler, Peltier-gesteuert 


Peltier-Block mit hoher Genauigkeit 

± 0,2°C, Uniformität: ± 0,4°C, Temperaturbereich: 0-99°C, 

Ramping-Rate: 2.5°C/s, Heizen/Kühlen, einstellbare Ramping-Rate, 

Temperaturgradient: 1-16°C in 8 Zeilen, Temperaturbereich 

35-99°C • Plattenformat: 48-well Platten 

und single tubes, 12x0,5ml Tubes • Probenvolumen: 10- 

100µl • Display: 64 x 128, hintergrundbeleuchtetes Display • 

400 typische Programme • beliebige Reagenzien verwendbar, 

offene Plattform • Größe: 31.1 x 54.6 x 34.3 cm •Gewicht: 

4.1 kg • Schnittstellen: 2xUSB 



Probenkapazitäten der erhältlichen Blöcke: 96 well 





Heizrate: 3,0°C/sek. 

Kühlrate: 2,0°C/sek. 



Temperaturverteilung: ± 0,20°C bei 55°C, ± 0,30°C bei 

70°C, ± 0,60°C bei 95°C 


Gewicht: 13 kg 



Probenkapazitäten der erhältlichen Blöcke: 60 x 0,5 ml, 

96 x 0,2ml oder MTP, 384 MTP 






Kühlrate: 3,5°C/sek. 



Temperaturverteilung: ± 0,15°C bei 55°C, ± 0,25°C bei 

70°C, ± 0,50°C bei 95°C 





Probenkapazitäten der erhältlichen Blöcke: 

3 x 20 x 0,5ml, 3 x 48 x 0,2ml, 3 x kombi (0,2 oder 0,5ml) 







Temperaturbereich: -3 bis 99°C 







7. Zeit pro run Protokoll-abhängig Protokoll-abhängig Protokoll-abhängig 30 Minuten für schnelle PCR-Protokolle 

bis zu 90 Minuten für konventionelle PCR-Protokolle 

Bio-Rad Laboratories Service Team erreichbar unter 

089-31884-222 

Zuverlässiger Kundenservice durch wissenschaftlichen 

Außendienst vor Ort und Servicezentrale in Göttingen 





8. Kundenservice 

9. Extras Extras: auch mit Gradientenfunktion erhältlich Extras: auch mit Gradientenfunktion erhältlich vier Geräte können in Reihe geschaltet und über PC 

gesteuert werden 

auf Anfrage 

TProfessional Basic: 4.950,- C 

TProfessional Basic Gradient: 5.950,- C 

10. Preis für Basisgerät 9.490,- C TProfessional: 5.950,- C 

TProfessional Gradient: 6.950,- C




Tel.: +49-(0)89-318 84-177 

Fax: +49-(0)89-318 84-123 





Tel.: +49-(0)89-318 84-177 

Fax: +49-(0)89-318 84-123 





Tel.: +49-(0)89-318 84-177 

Fax: +49-(0)89-318 84-123 


1. Firmendaten, Ansprechpartner Bio-Rad Laboratories GmbH 



Tel.: +49-(0)89-318 84-177 

Fax: +49-(0)89-318 84-123 


2. Produktname MyCycler TM iCycler TM DNA Engine ® PTC-0200G DNA Engine Dyad ® PTC-0220G 

konventionelle PCR, in situ-PCR, high throughput-PCR, 

Robot integrated PCR, aufrüstbar für Real-Time-PCR 

3. Anwendungsbereich konventionelle PCR konventionelle PCR, aufrüstbar für Real-Time-PCR konventionelle PCR, in situ-PCR, high throughput-PCR, 

Robot integrated PCR, aufrüstbar für Real-Time-PCR 

modulares 2-4 Platz-PCR-System zur Intergration unterschiedlicher 

PCR-Thermoblöcke, auch in Roboterstationen 

integrierbar für einen komplett automatisierten PCR-Prozess 

modulares PCR-System zur Integration unterschiedlicher 

PCR-Thermoblockmodule und aufrüstbar für die Real- 

Time-PCR 

Personal 96 well Thermocycler modulares PCR-System zur Integration unterschiedlicher 

PCR-Thermoblockmodule und aufrüstbar für 

Real-Time-PCR 




Multiformat-PCR-Thermocycler für 10 austauschbare 

Thermoblöcke „Alpha Blöcke“: 30, 60, 96, 384, 2x48, 48/48, 

30/48, 30/30 (± Motor-gesteuertem Heizdeckel 

für 96-well- und 384-well-Thermoblock) in situ und 

Objektträgerkammer 16/16-Thermoblock 

Multiformat-PCR-Thermocycler für 10 austauschbare 

Thermoblöcke „Alpha Blöcke“: 30, 60, 96, 384, 2x48, 48/48, 

30/48, 30/30 (± Motor-gesteuertem Heizdeckel 

für 96-well- und 384-well-Thermoblock) in situ und 

Objektträgerkammer, 16/16 Thermoblock. Aufrüstbarkeit 

für die Real-Time-PCR 

Multiformat-PCR-Thermocycler für 96, 2x48, 60 und 384 

well-Thermoblöcke. 96 well-Block mit 8 unterschiedlichenTemperaturen 

im Temperaturgardienten. Großes 

VGA Display zur intuitiven PCR-Programmierung. 

Leicht zu reinigende Folientastatur. 

96 well Thermocycler, Peltier-gesteuert. 8 unterschiedliche 

Temperaturen im Temperaturgardienten. Großes Display 

zur intuitiven PCR-Programmierung. Leicht zu reinigende 

Folientastatur. 


Peltier-Block mit hoher Genauigkeit, Heiz-/Kühlrate: ± 0,3°C, 

Uniformität: ± 0,4°C, Ramping-Rate: bis zu 3.0°C, 1,2°C für 

Objektträgerkammer, einstellbare Ramping-Rate, Temperaturgradient: 

9-well-Thermoblock 1-24°C in 12 Spalten, in 

8 Zeilen, Temperaturbereich 30-105°C • Plattenformat: 384 

/ 96-well Platten, 8-well Stripes, Single Tubes (auch „low 

profile“verwendbar) • Probenvolumen: 10-100µl • Display: 

20 x 4 alphanumerisches LCD • 1000 typische Programme • 

beliebige Reagenzien verwendbar, offene Plattform • Größe: 

47 x 29 x 21 cm • Gewicht: 17 kg (inklusive 2 Alpha Blöcken) 

Schnittstellen: RS-232 , Ethernet, Dyad Disciple expansion 

Peltier-Block mit hoher Genauigkeit, Heiz- /Kühlrate: ± 

0,3°C, Uniformität: ± 0,4°C, Ramping-Rate: bis zu 3.0°C, 

1,2°C für Objektträgerkammer, einstellbare Ramping- 

Rate, Temperaturgradient: 96well-Thermoblock 1-24°C 

in 12 Spalten, Temperaturbereich 30-105°C • Plattenformate: 

384 / 96-well Platten, 8-well Stripes, Single 

Tubes (auch „low profile“verwendbar) • Probenvolumen: 

10-100µl • Display: 1/4 VGA, 320 x 240 pixel, 256 colors 

• 400 typische Programme in 4 Passwort-schützbaren 

Verzeichnissen • beliebige Reagenzien verwendbar, 

offene Plattform • Größe: 24 x 35 x 25 cm • Gewicht: 9 kg 

• Schnittstellen: IEEE-488 bidirektional 25- Pin und 8- Pin 

paralelle Drucker- und Remoteschnittstelle 


0,3°C, Uniformität: ± 0,4°C, Temperaturbereich: 40-99°C, 

Ramping-Rate: Heizen 96 well bis zu 3.3°C • Heizen 

60 well bis zu 2.0°C • Heizen 384 well bis zu 2.0°C • 

Heizen 2x48 well bis zu 2.2°C • einstellbare Ramping- 

Rate, Temperaturgradient: 1-25°C in 8 Zeilen, 40-99°C 

• Plattenformat: 96-well plate 8-well-, 12-well-stripes 

and single tubes• Probenvolumen: 15-100µl, hochauflösendes 

graphisches Display 14,5 cm • 255 typische 

Programme • beliebige Reagenzien verwendbar, offene 

Plattform • Größe: 26 x 55 x 33 cm Gewicht: 11,8 kg 

Schnittstellen: 9 Pin RS232, Parallel Printer Port 


0,5°C, Uniformität: ± 0,5°C, Temperaturbereich: 4-100°C, 

Ramping-Rate: 2.5°C/s, Heizen/Kühlen, einstellbare Ramping-Rate, 

Temperaturgradient: 1-25°C, in 8 Zeilen/35-99°C, 

Temperaturbereich • Plattenformat: 96-well plate und 

single tubes, Probenvolumen: 15-100µl • hochauflösendes, 

grafisches Display 12cm, 99 typische Programme, beliebige 

Reagenzien verwendbar, offene Plattform • Größe: 24 x 44 x 

21 cm • Gewicht: 10 kgSchnittstellen: 1xUSB 



30 Minuten für schnelle PCR-Protokolle 








7. Zeit pro run 

Bio-Rad Laboratories Service Team erreichbar unter 089-31884-222 


Dyad User-Software zur Kontrolle von 2 Dyad-Geräten 

und zur unabhängigen Steuerung von bis zu 8 

unabhängigen Thermoblöcken 48well alpha units). 

Modulares Upgrade von PTC0200-Basisgerät auf Real- 

Time-PCR-System Chromo4 möglich 

9. Extras Sonderpreis 4.290,- C (bis 30.11.2007) Modulares Upgrade von iCycler-Basisgerät auf Real- 

Time-PCR-System iQ5 oder MyiQ möglich 

10. Preis für Basisgerät auf Anfrage auf Anfrage auf Anfrage auf Anfrage

Eppendorf AG 

Eppendorf Vertrieb Deutschland GmbH 

22331 Hamburg, Germany 

Tel.: 01803/ 255911, 

eMail: vertrieb@eppendorf.de 

Eppendorf AG 

Eppendorf Vertrieb Deutschland GmbH 

22331 Hamburg 

Tel.: 01803/ 255911, 

vertrieb@eppendorf.de 

Biozym Scientific GmbH 

Helmut Prechel 

Steinbrinksweg 27, 31840 Hess. Oldendorf 

Tel.: +49-(0)5152-9020 

Fax: +49-(0)5152-2070 

eMail: support@biozym.com 

www.biozym.com 

1. Firmendaten, Ansprechpartner Biozym Scientific GmbH 

Helmut Prechel 

Steinbrinksweg 27, 31840 Hess. Oldendorf 

Tel.: +49-(0)5152-9020 

Fax: +49-(0)5152-2070 

eMail: support@biozym.com 

www.biozym.com 

2. Produktname FlexCycler-System (Analytik Jena) Piko Thermocycler (Finnzymes Instruments) Mastercycler ® ep realplex Mastercycler ® , Mastercycler ® gradient, Mastercycler ® 

personal, Mastercycler ® ep 

real-time PCR (z.B. in Forschung, Forensik, Industrie) PCR (z.B. in Forschung, Forensik, Industrie) 

3. Anwendungsbereich PCR, Genotyping (SNP-Analyse), Cycle Sequencing High Performance- und Standard-PCR, Genotyping 

(SNP-Analyse), Cycle Sequencing 

Höchste Flexibilität, leichte Programmierung, variable 

und schnelle Heizraten, hohe Reproduzierbarkeit 

Höchste Flexibilität, leichte Programmierung, intuitive 

Software, Quick Start-Funktion, Auto-Series-Funktion für 

die schnelle Programmierung von Verdünnungsreihen, 

variable und schnelle Heizraten, hohe Reproduzierbarkeit, 

sehr leise, Einzelwellanregung 

Thermocycler für High Performance- und Standard- 

PCR mit überragender Genauigkeit und Uniformität. 

Grundfläche des Gerätes deutlich kleiner als ein DIN 

A 4-Blatt 

Thermocycler mit Wechselblocksystem. Dualblöcke zur 

simultanen Ausführung von zwei Programmen und Gradientenfunktion 

zur Optimierung von Annealing- und Denaturierungstemperatur 



Triple Circuit Technology, Peltier-Elemente, 

Heizdeckel, Zeit- und Temperaturinkremente, 

Gradientenfunktion über 12 bzw. 24 Reihen 


5. Funktionsprinzip Peltiertechnologie Peltiertechnologie Triple Circuit Technology, Peltier-Elemente, 

Heizdeckel, Zeit- und Temperaturinkremente, 

Gradientenfunktion über 12 Reihen, 96 LEDs 

(470nm), Channel Photomultiplier 

Mastercycler ® : Probenkapazität: 96 x 0,2ml PCR-Gefäße 77 x 

0,5ml PCR-Gefäße 1 PCR-Platte 8x12 • Temperaturbereich: 

4°C bis 99°C • Temperiergeschwindigkeit: 3°C/s (Heizen), 

2°C/s(Kühlen) • Größe: 26x41x27 cm • Automation: nein • 

Gradient: nein 

Probenkapazität: 96 x 0,2ml PCR-Gefäße 

1 PCR-Platte 8x12 

Temperaturbereich: 4°C bis 99°C 

Temperiergeschwindigkeit: bis zu 6°C/s (Heizen) 

bis zu 4,5°C/s(Kühlen) 

Größe: 26x41x39,6 cm 

Automation: nein 

Gradient: ja, über 12 Reihen 

Fluoreszenz-Anregung: 96 LEDs (470nm) 

Detektion: Channel-Photomultiplier 

Emissionsfilter: bis zu 4 Filter (520/ 550/ 580/ 605 nm) 

Heiz-/Kühlrate: max. 8°C/s 

Genauigkeit: ±0,2°C 

Uniformität: ±0,3°C 

Motorisierter Deckelmechanismus mit automatischer 

Anpressdruckjustierung 

Semi-Grafisches Display 

RS-232 und Ethernet-Port für Remote Control und 

Software-Upgrades 

3 Blockformate: 

24 0,2 ml Tubes oder Slidetiterplate 

96 Well Slidetiterplate 

384 Well Slidetiterplate 

Heiz-/Kühlrate: max. 4°C/s 

Temperaturgradient max. 30°C im Bereich von 4 bis 99°C 

Multisensor-Technologie 

Justierbarer Heizdeckelanpressdruck 

Grafisches Display 

RS-232 für Software-Upgrades 

Wechselblocksystem mit 8 Formaten: 

Monoblöcke: 

60 0,5 ml Tubes 

96 0,2 ml Tubes, 96 Well MT-Platte 

96 0,2 ml Tubes, 96 Well MT-Platte inkl. Gradient 

384 Well MT-Platte 

4 Microarrays/Slides 

Dualblöcke: 

2 x 30 0,5 ml Tubes 

2 x 48 0,2 ml Tubes, 48 Well MT-Platte 

48 0,2 ml Tubes + 30 0,5 ml Tubes 


Mastercycler ® gradient: Probenkapazität: 96 x 0,2ml PCR-Gefäße 

77 x 0,5ml PCR-Gefäße 1 PCR-Platte 8x12 

Temperaturbereich: 4°C bis 99°C • Temperiergeschwindigkeit: 

3°C/s (Heizen), 2°C/s(Kühlen) • Größe: 26x41x27 cm 

Automation: nein • Gradient: ja, über 12 Reihen 

Mastercycler ® personal: Probenkapazität: 25 x 0,2ml PCR- 

Gefäße 16 x 0,5ml PCR-Gefäße, 1 PCR-Platte 5x5 • Temperaturbereich: 

4°C bis 99°C • Temperiergeschwindigkeit: 3°C/s 

(Heizen), 2°C/s(Kühlen) • Größe: 18x35x25 cm • Automation: 

nein • Gradient: nein 

Mastercycler ® ep: Probenkapazität: 96 x 0,2ml PCR-Gefäße 

1 PCR-Platte 8x12 • Temperaturbereich: 4°C bis 99°C • 

Temperiergeschwindigkeit: bis zu 6°C/s (Heizen), bis zu 

4,5°C/s(Kühlen) • Größe: 26x41x30,5 cm • Automation: ja • 

Gradient: ja, über 12 Reihen 

Mastercycler ® ep 384: Probenkapazität: 1 PCR-Platte 384 • 

Temperaturbereich: 4°C bis 99°C • Temperiergeschwindigkeit: 

4°C/s (Heizen), 3°C/s(Kühlen) • Größe: 26x41x30,5 cm 

Automation: ja • Gradient: ja, über 24 Reihen 


< 30 Minuten Je nach Gerät in bis zu < 30 Minuten 

High Speed-PCR (Beispiel):

PEQLAB Biotechnologie GmbH 

Dr. Christian Lohmann 

Carl-Thiersch-Str. 2B, 91052 Erlangen 

Tel.: +49-(0)9131-6107020, Fax: +49-(0)9131-6107099 

info@peqlab.de, www.peqlab.de 

MoBiTec GmbH 

Arne Schulz 

Tel.: +49-(0)551-70722-70 

Fax: +49-(0)551-70722 22 

info@mobitec.de 

LTF-Labortechnik 

Dr. Rudolf Walser 

Obere Hattnauerstraße 18, 88142 Wasserburg 

Tel.: +49-(0)8382-98520, Fax: +49-(0)8382-9852-32 

info@labortechnik.com, www.labortechnik.co 

1. Firmendaten, Ansprechpartner LTF-Labortechnik 

Dr. Rudolf Walser 

Obere Hattnauerstraße 18, 88142 Wasserburg 

Tel.: +49-(0)8382-98520, Fax: +49-(0)8382-9852-32 

info@labortechnik.com, www.labortechnik.co 

peqSTAR Thermocycler 

2. Produktname Rotor-Gene 6000 Palm-Cycler Gradient TaKaRa Dice Thermal Cycler, Standard Model (TP650), 

Gradient Model (TP600), Dice Mini (TP100) 

PCR, RT-PCR, siRNA, in vitro mutagenesis Alle Arten klassischer PCR 

Kompakter, high performance Gradienten-Cycler mit 

Micro-Computer-Steuerung mit integrierter Temperatur- 

Kalibration, On-Line Help-Funktion und Oligo-Calculator 

Thermoanalyser für die Nukleinsäure-Quantifizierung und 

Produktdiskriminierung über Schmelzanalyse 

3. Anwendungsbereich 

Neu entwickelter, extrem schneller Thermocycler mit 96 

well, 384 well oder in situ-Block. Gradientenfunktion optional. 

The Takara PCR Thermal Cycler Dice offers convenience, 

reliability, multi-functionality and high performance at 

a price that is affordable for all users. • Three versions: 

Standard model (cat # TP 650), Gradient model (cat # TP 

600), 24 tubes model (Dice Mini; cat # TP 100) • Multifunctional: 

Gradient function spanning up to 20 °C (TP 600 

only), adjustable temperature ramping rates, extension 

of time and/or temperature, up to 10 users and 100 

programs. • Easy Operation: 8 preprogrammed protocols 

(10kb PCR, RT-PCR, siRNA, in vitro mutagenesis), 

intuitive software, sliding and heated lid, adjustable 

front panel. • Reliability: Heating and cooling with Peltier 

element, reduced heat interference, Authorized Thermal 

Cycler, CE marked. 

Blöcke aus Aluminiumspezial-Legierung für 96 well- 

Mikrotiter-Platten (0,2 ml-Strip-Tubes + 0,2 ml Einzeltubes) 

oder 384 Mikrotiter-Platten. 

Thermoanalyser für die Nukleinsäure-Quantifizierung (RNA 

und DNA) und Produktdiskriminierung über Schmelzanalyse. 




Peltiertechnologie Peltiertechnologie Peltiertechnologie 

Real-time PCR-Zentrifugal-Cycler mit hochauflösendem 

Temperatur-Ramping und besonders schnellen Temperaturwechseln 

• High Resolution Melt (HRM)-fähig für 

Mutations-Screening und besonders schnellen Temperaturwechseln 

für High speed runs (30 Zyklen/30 Min) mit bis zu 

6 Detektionskanäle gleichzeitig. Für preiswertes Standard 

verbrauchsmaterial im flexiblen Reaktionsvolumen (5µl – 70 

µl) • Offenes System für alle real-time PCR-Techniken 


Heiz- und Kühlrate von bis zu 5 °C/s. Sechs Regelkreise für 

überragende Blockhomogenität von ± 0.25°C. Interner Speicher 

für 1000 Programme in frei erstellbaren Ordnern/Unterordnern. 

USB-Anschlüsse für individuelles Speichern von 

Programmen auf USB-Memory-Sticks. Ethernet-Anschluss 

für zentrale Programmarchivierung über Netzwerkrechner. 

Großzügiges, tochsensitives TFT-Display. Kostenlose PC- 

Software zum Erstellen von PCR-Programmen am Computer. 

Optional mit High Pressure Lid oder Motor Lid. 

Größe: 260 (W) - 345 (D) - 260 (H) mm (with panel closed) 

± Gewicht: 11.5 kg (actual unit) • Rated voltage: 100 - 240 

V, AC 50/60 Hz, 490 W • Temperature control mechanism: 

Peltier element • Heating rate Maximum: 3.0 °C/sec • 

Cooling rate Maximum: 2.0 °C/sec • Temperature control 

Range: 4 - 99.9 °C (0.1 °C units) • Temperature accuracy: 

± 0.5 °C • Temperature uniformity: ± 0.5 °C • Overshoot 

Within: 0.5°C • Heat lid: 110°C • Temperature extension*: 

Maximum ± 9.9 °C • Time extension*: Maximum ± 9.59 

min • Number of samples: 96 - 0.2 ml tubes or one 

96-well tube plate • Display: Blue / white dot matrix (LCD 

240 - 60 dots) • No. of stored programs: max. 100 • No. of 

registered users: max. 10 • Gradient function: Adjustable 

range 40 – 75 °C (temperature variance 6 – 20 °C) * Touch 

down PCR 

Peltier/Peltier (8 Peltierelemante + 4 PlatinSensoren) 

Peltier, 4°C bis 99°C • 2,5°C /2, 5°C Temperaturgradient 

über 24°C • 0,5°C Regelgenauigkeit, 0,2°C Temperatur- 

Uniformität • Einzelblock-System mit Deckelheizung 

• 24°C-Gradient über den Block, (Gradient einstellbar, 

Abnehmbare Steuereinheit (Micro-Computer) mit 

Farb-Touchscreen, Simultane Kontrolle der Gradiententemperatur 

für alle 12 Reihen, touch-down-Funktion, 

long-range-Funktion, Ramp-Rate einstellbar, Temperaturdaten-Aufzeichnung, 

Auto-restart (z.B. Nach 

Stromausfall), „post-run“ Reports 

Höchste Temperaturpräzision und Uniformität (0,01°C) für 

hochauflösende Schmelzanalysen zur SNP-Detektion mit 

Interkalationsfarbstoffen durch Zenrifugalprinzip • Heiz- 

/Kühlrate: 10°C/10°C • Fluoreszenz-Anregung/-Detektion: 

• 6-channel LED/Photomultiplierdetektion • Software: 

Softwaremodule absolute Quantifizierung, für relative 

Quantifizierung (Genexpressionsstudien), DNA und RNA 

Konzentrations-Messung, Allelische Diskriminierung, • 

Schmelzanalyse und High Resolution Melt-Analyse • Format: 

36 x 0,2 ml, 72 x 0,1 ml und 100 x 30 µl • Automation: 

Volle Automatisierung mit CAS-1200 Liquidhandling System 

möglich • Schnittstellen: Offenes System mit Schittstellen 

zu Robotik und Windows-SoftwareSystemen 



Variable Aufgrund hoher Heiz- und Kühlrate äußerst kurz 

7. Zeit pro run 30 -70 min (je nach Applikation) Durchsatz bis >400 Proben/Tag (96 well), >1000 Proben/Tag 

384 well 

Gerätevorführung und Probestellung. Installation und Einweisung 

vor Ort. 2 Jahre Garantie. 

Technical Service 

info@mobitec.de 

Tel.: +49 551 70722 70 

Fax: +49 551 70722 22 

CAS-1200 (Probenvorbereitungs-System) • Heiz/Kühleinheit 

und Steuersystem sind getrennt. Software-updates 

können einfach aus dem Internet heruntergeladen 

werden. • Temperatur-Rekalibration kann einfach 

und zuverlässig vom Anwender durchgeführt werden 

(Automatic Temperature Calibration). 

Overnight-Austauschservice, Applikations-Service, Trainings-Sites,online 

Hilfe, Kostenlose Software-updates 


Präsentation auf Biotechnica 2007. 

WIN-CE-Betriebssystem, integrierte Software Temperatur-Rekalibration, 

Oligo Calculator-Software zur 

Bestimmung der Schmelztemperatur, O.D. 

Molekulargewicht und „secondary structure location“, 

Monitoring und Aufzeichnen aller Temperatur-Daten 

(im Gradienten-Modus (auch für alle 12 Reihen separat), 

incl. Hewlett-Packard Journada (Micro-Handcomputer) 

Win-CE 

Rotor-Gene 6000 HRM mit hochintensivem Optiksystem, 

RG-high-speed-Datenaufnahme (bis 1.000 Datenmesspunkte 

pro °C Temperaturramping) mit einer extrem hohen 

Temperaturauflösung (0,02°C) und einer automatisierten 

Analyse-Software. Daher eignet sich die das 6000HRM 

hervorragend zum preiswerten Matations-Screening (GeneScanning), 

DNA-Fingerprinting, SNP-Genotyping, Methylierungsstudien, 

Artenidentifikation usw. 

9. Extras 

4.995,- C 

10. Preis für Basisgerät ab 4.700,- C 4.900,- C Standard-Modell (TP650) 5130,- C, Gradient Model 

(TP600) 5430,- C, Dice Mini (TP100) 3800,- C

SensoQuest GmbH 

Dr. Kay Terpe, Tel.: +49-(0)551-2503244, 

Hannah-Vogt-Str. 1, D-37085 Göttingen, 

Tel.: +49-(0)551-389195-23, Fax.: +49-(0)551-389195-24 

www.sensoquest.com 

k.terpe@sensoquest.de, info@sensoquest.de 


Mannheim 

Fachliche Information, Tel.: +49-(0)621-759-8568 

mannheim.biocheminfo@roche.com 



Mannheim 




1. Firmendaten, Ansprechpartner Roche Diagnostics GmbH 

Mannheim 




2. Produktname LightCycler ® 1.5 System LightCycler ® 2.0 System LightCycler ® 480 System LabCycler 

Assemby PCR, Assymetric PCR, Colony PCR, Hot Start PCR, 

ISSR PCR, Inverse PCR, Ligation mediated PCR, Multiplex 

PCR, Race PCR 

Multiwell-Real-Time PCR-System für Forschungsanwendungen 

im Hochdurchsatzbereich. • qualitative u. 

quantitative Detektion von Nukleinsäuren • Hochspezifische 

Mutationsanalyse und SNP-Genotypisierung • Mono 

Colo-r und Multiplex-PCR • High Resolution Melting 

(HRM) Farbstoff in Kombination mit der LightCycler ® 480 

Gene Scanning Software, ideal geeignet zur Detektion 

von bekannten und unbekannten SNPs • Dank der 

großen Flexibilität bei den Detektionsformaten, wie z.B. 

SYBR Green I, Hybridisierungs- und Hydrolysesonden 

kann jede gängige Applikation durchgeführt werden. 

Real-Time PCR-System, geeignet für Forschung und 

Diagnostik (CE-IVD): qualitative u. quantitative Detektion 

von Nukleinsäuren • einfache PCR-Produktidentifizierung 

und Charakterisierung über Schmelzkurvenanalyse 

• hochspezifische Mutationsanalyse und SNP-Genotypisierung 

• Mono Color und Multiplex PCR • Dank der 

großen Flexibilität bei den Detektionsformaten, wie z.B. 

SYBR Green I, Hybridisierungs- und Hydrolysesonden 

kann jede gängige Applikation durchgeführt werden. 

Real-Time PCR-System für Forschungsanwendungen: 

qualitative u. quantitative Detektion von Nukleinsäuren 

• einfache PCR-Produktidentifizierung und Charakterisierung 

über Schmelzkurvenanalyse • hochspezifische 

Mutationsanalyse und SNP-Genotypisierung • Mono 

Color- und Duplex-PCR • Dank der großen Flexibilität bei 

den Detektionsformaten, wie z.B. SYBR Green I, Hybridisierungs- 

und Hydrolysesonden kann jede gängige Applikation 

durchgeführt werden. 

3. Anwendungsbereich 


Langlebiges hochwertiges Gerät mit Peltierelementen der 

neusten Generation. Robustes futuristisches Design 

Erstmals in einem Mikrotiterplattensystem: perfekte 

Temperaturhomogenität bei gleichzeitig hoher Geschwindigkeit. 

Sehr schnelle PCR in 20 min bei systembedingt perfekter 

Temperaturhomogenität und online-Detektion. 

Sehr schnelle PCR in 20 min bei systembedingt perfekter 

Temperaturhomogenität und online-Detektion. 



Mikroprozessor gradientenfähiger Block mit einzeln gesteuerten 

Peltierelementen für besondere Temperaturhomogenität 

bei hohen Heiz- und Kühlraten mit einzigartigem Schnell- 

Block-Wechselsystem 

Die simultane Amplifikation und Detektion der PCR-Produkte 

mittels Fluoreszenzfarbstoffen erfolgt in Mikrotiterplatten 

(96 bzw. 384). 

Die simultane Amplifikation und Detektion der PCR- 

Produkte mittels Fluoreszenzfarbstoffen erfolgt in 

Kapillaren. 

Die simultane Amplifikation und Detektion der PCR-Produkte 

mittels Fluoreszenzfarbstoffen erfolgt in Kapillaren. 


Heizrate: 4.2°C, Kühlrate: 3.2°C • Elektrischer, programmierbarer 

Motordeckel, Andruck bis 120 N, Folienversiegelung 

möglich • Farbiger TFT Touch Screen • Schnell-Block-Wechselsystem, 

48 Well, 96 Well und 384 Well Silberblöcke •Temperaturgradient 

0 bis ±20°C zwischen den Schmalseiten des 

Blocks • Rampenrate 0,001°C bis 5°C • Temperaturincremente 

-9,99°C bis + 9,99°C • Zeitinkremente -99,99 sec bis 

+99,99 sec • Ordner in vier Ebenen • Speicherplatz für 680 

fünf Schritt-Programme • Protokollfunktion der letzten 16 

Programmdurchläufe • Schnittstellen 2*RS232 • Verbrauch 

maximal 350 W • Temperaturregelung über 6 Zonen mit 

einzeln gesteuerten Peltierelementen •Lebensdauer über 

500.000 Zyklen SensoQuest-Software 

Patentiertes Therma-Base Element sorgt für optimale 

well-to-well Temperaturhomogenität und verhindert 

Randeffekte: Heizen: 4,8°C/s, Kühlen; 2,5°C/s • Hardware: 

modulares System: wahlweise 96 oder 384 well 

Format • präzise Signaldetektion unabhängig von Probenposition 

durch patentierte Optik • 6 Detektionskanäle 

für große Flexibilität bei der Wahl der Detektionsfarbstoffe 

• Software: bedienerfreundliche Software mit 

hochgenauen Auswertealgorithmen • LightCycler ® Gene 

Scanning Software • Reagenzien: große Flexibilität bei 

den Detektionsformaten, wie z.B. SYBR Green I, Hybridisierungs- 

und Hydrolysesonden 

Das extrem günstige Oberflächen-Volumen Verhältnis 

bei den Kapillaren sorgt für schnelle Heiz- und 

Kühlzeiten: 20°C/s • Hardware: 32 Kapillaren • 6 

Detektionskanäle für große Flexibilität bei der Wahl der 

Detektionsfarbstoffe • große Flexibilität bei den Detektionsformaten, 

wie z.B. SYBR Green I, Hybridisierungsund 

Hydrolysesonden • Probenvolumen wahlweise 20µl 

oder 100µl • Software: bedienerfreundliche Software 

mit hochgenauen Auswertealgorithmen • Reagenzien: 

umfangreiches funktionsgetestetes Reagenzienangebot 

für RT-PCR und PCR 

Das extrem günstige Oberflächen-Volumen-Verhältnis bei 

den Kapillaren sorgt für schnelle Heiz- und Kühlzeiten: 

20°C/s • Hardware: 32 Kapillaten • 3 Detektionskanäle • 

große Flexibilität bei den Detektionsformaten, wie z.B. SYBR 

Green I, Hybridisierungs- und Hydrolysesonden • geringes 

Probenvolumen: 20µl • Software: bedienerfreundliche Software 

mit hochgenauen Auswertealgorithmen • Reagenzien: 

umfangreiches funktionsgetestetes Reagenzienangebot für 

RT-PCR und PCR 



Hängt vom Programm ab. 

7. Zeit pro run sehr schnelle PCR mit online-Detektion: 20 min sehr schnelle PCR mit online-Detektion: 20 min sehr schnelle PCRmit online-Detektion: 40 min im 384er 

Format; 60 min im 96er Format 

8. Kundenservice Einarbeitung inklusive; sehr anwendungsfreundliche Bedienung; Workshops, umfangreiches und aktuelles Informationsmaterial Ja, eigene Geräteentwicklung & Produktion. 

Rabattstaffelung beim Kauf mehrerer Geräte 

LightCycler ® Letter mit aktuellen Informationen rund um das LightCycler ® System • Mit der Universal ProbeLibrary kann ein komplettes Transkriptom einer selektierten Spezies 

mit 90 vorvalidierten Detektionsproben abgedeckt werden. Weitere Spezies können mit einem Erweiterungsset abgedeckt werden. Ein kompetter qPCR Assay kann innerhalb von 

24 Stunden etabliert werden. www.universalprobelibrary.com 

9. Extras 

10. Preis für Basisgerät auf Anfrage 5.875,- C LabCycler Basic


Robert-Bosch-Straße 1, 63505 Langenselbold 

Tel.: 0800-1-536 376 

Fax: 0800-1-112 114 

info.labequipment.de@thermo.com 

www.thermo.com 



Tel.: 0800-1-536 376 

Fax: 0800-1-112 114 





Tel.: 0800-1-536 376 

Fax: 0800-1-112 114 



1. Firmendaten, Ansprechpartner Thermo Fisher Scientific 


Tel.: 0800-1-536 376 

Fax: 0800-1-112 114 



Thermo Scientific PXE05 / Thermo Scientific PXE02 

2. Produktname Thermo Scientific Multi-Block System MBS Thermo Scientific PX2 Thermo Scientific PCR Sprint 02 / Thermo Scientific PCR 

Sprint 05 

3. Anwendungsbereich PCR mit und ohne Gradient PCR mit und ohne Gradient PCR ohne Gradien PCR ohne Gradient 

Gerät mit 0,5 ml- oder 0,2 ml-Block fest eingebaut • Blöcke 

nicht austauschbar • Probenkapazitäten der erhältlichen 

Blöcke: 24 x 0,2 ml oder 20 x 0,5 ml • Material der Heizblöcke: 

Aluminium 

Gerät mit 0,5 ml- oder 0,2 ml-Block fest eingebaut • 

Blöcke nicht austauschbar • Probenkapazitäten der erhältlichen 

Blöcke: 96 x 0,2 ml oder 48 x 0,5 ml • Material 

der Heizblöcke: Aluminium 

Grundgerät mit 6 Wechselblöcken • Blöcke austauschbar 

•Probenkapazitäten der erhältlichen Blöcke: 48 x 

0,5ml (mit und ohne Gradient) oder 96x0,2ml (mit und 

ohne Gradient) oder 384 x 0,04ml, In-Situ-Flachblock für 

Objektträger • Material der Heizblöcke: Aluminium 

Bis zu 30 Blöcke zentral von einem PC zu steuern • einfache, 

komfortable MBS-Software, Blöcke mit und ohne 

Gradient • Blöcke austauschbar • Probenkapazitäten der 

erhältlichen Blöcke: 48 x 0,5ml (mit und ohne Gradient) oder 

96 x 0,2ml (mit und ohne Gradient) oder 384 x 0,04ml 

Material der Heizblöcke: Aluminium 




5. Funktionsprinzip Peltier-Element Peltier-Element Peltier-Element Peltier-Element 

Programmspeicherplätze: 60 • Schritte pro Programm: 5 

Programmabschnitte mit 5 Schritten pro Abschnitt • Externer 

Speicher: nein • Größe: 18 x 13 x 30 cm • Gewicht:7,5 kg • 

Deckelheizung in der Höhe einstellbar • Heizrate (°C/s): 3°C/s 

• Kühlrate (°C/s): 2°C/s • Temperaturbereich 4°C - 99°C • 

Regelgenauigkeit (°C): 0,1°C • Temperaturverteilung bei 95 

°C: ± 0,5°C in 15s • Fluoreszenz-Anregung nicht möglich • 

Automation/Motordeckel • Schnittstelle: keine 

Programmspeicherplätze: 99 • Schritte pro Programm: 

10 Programmabschnitte mit 10 Schritten pro Abschnitt • 

Externer Speicher: nein • Größe: 24,4 x 28,5 x 40,5 cm 

Gewicht: 7,2 kg • Deckelheizung in der Höhe einstellbar 

• Heizrate (°C/s): 3°C/s • Kühlrate (°C/s): 2°C/s •Temperaturbereich: 

4°C - 99°C • Regelgenauigkeit (°C): 0,1°C • 

Temperaturverteilung bei 95 °C: ± 0,5°C in 30s 

Fluoreszenz-Anregung nicht möglich • Automation/Motordeckel 

• Schnittstelle: keine 

Schritte pro Programm: 10 Programmabschnitte mit 

10 Schritten pro Abschnitt • Externer Speicher: Nein, • 

Möglichkeit über RS232-Schnittstelle •Größe: 24 x 28 x 

39 cm • Gewicht: 9 kg • Deckelheizung: Deckelheizung 

in der Höhe einstellbar • Heizrate (°C/s): 3°C/s • Kühlrate 

(°C/s): 2°C/s • Temperaturbereich 4°C - 99°C 

Regelgenauigkeit (°C): 0,1°C • Temperaturverteilung 

bei 95 °C: ± 0,3°C in 30s • Fluoreszenz-Anregung nicht 

möglich • Automation/Motordeckel • Schnittstelle: 

RS232 

Programmspeicherplätze: Unbegrenzte Speicherkapazität 

auf dem PC • Schritte pro Programm: 35 Programmabschnitte 

mit 44 Schritten pro Abschnitt • Externer Speicher: 

Im PC • Größe: 20 x 29 x 30 cm pro Block • Gewicht: 8,4 kg 

Deckelheizung: Deckelheizung in der Höhe einstellbar • 

Heizrate (°C/s): 3°C/s • Kühlrate (°C/s): 2°C/s • Temperaturbereich 

4°C - 99°C • Regelgenauigkeit (°C): 0,1°C • 

Temperaturverteilung bei 95 °C: ± 0,3°C in 30s • Fluoreszenz-Anregung 

nicht möglich • Automation/Motordeckel • 

Schnittstelle: RS48 



7. Zeit pro run Programmabhängig Programmabhängig Programmabhängig Programmabhängig 

8. Kundenservice Thermo Fisher Scientific Service Techniker Thermo Fisher Scientific Service Techniker Thermo Fisher Scientific Service Techniker Thermo Fisher Scientific Service Techniker 

9. Extras 

10. Preis für Basisgerät Ein MBS-Block mit Software ab 6.558,- C PX2 Grundgerät mit einem Wechselblock ab 5.772,- C ab 4.383,- C ab 2.652,- C

S T E L L E N M A R K T 

Enter the 

circle 

Zum weiteren Auf- und Ausbau unseres Geschäftsfeldes Zentrifugation suchen wir zum nächstmöglichen 

Zeitpunkt einen 

Produktlinienmanager m/w 

Zentrifugation 

Als Mitglied unserer global agierenden Teams werden Sie in einem Wachstumsmarkt für eine 

Produktgruppe verantwortlich sein und maßgeblich an der Erstellung der Produktstrategie 

mitarbeiten. Auf Basis der strategischen Planung und Ihrer Marktkenntnis entwickeln Sie In touch with life 

in Zusammenarbeit mit Marketing und Vertrieb neue Produktkonzepte und definieren 

hierfür die Marktzieldaten. 

Überall in den Bereichen 

der Life Sciences, wie Zell- 

Darüber hinaus initiieren und betreuen Sie eigenverantwortlich neue Entwicklungsbiologie, 

Molekularbiologie 

projekte und stimmen diese mit den Entwicklungs- und Produktionsmanagern der 

und klinischer Forschung, 

Kompetenzzentren ab. Sie sind mitverantwortlich für die operative Planung Ihrer 

steht der Name Eppendorf 

Produktlinie sowie für die Umsetzung von Maßnahmen und der Kontrolle hinsichtlich 

für Qualität und Innovation. 

Markterfolg und Profitabilität. In Zusammenarbeit mit Marketing und Vertrieb sorgen 

Diesen Unternehmenserfolg 

Sie für geeignete Gegenmaßnahmen bei Planungsabweichungen. Zusätzlich verant- 

verdanken wir in erster Linie 

worten Sie die Erstellung der Primärbedarfsplanung auf Basis der Budgetplanung 

unseren fast 2.000 Mitarbei- 

des betroffenen Werks mit. Sie berichten direkt an den Leiter der Produktgruppe. 

tern in aller Welt. Zusammen 

Für diese umfangreichen Aufgaben erwarten wir eine Ausbildung im naturwissen- 

mit Ihnen wollen wir diese 

schaftlichen Bereich und mehrere Jahre Berufspraxis im Produkt-/Projektmanagement, 

hervorragende Position 

idealerweise von Zentrifugen. Sie bringen verhandlungssicheres Englisch und betriebs- 

behaupten und weiter 

wirtschaftliche Kenntnisse mit. Der sichere Umgang mit modernen IT- und Kommunika- 

ausbauen. 

tionsmitteln rundet Ihr Profil ab. 

Persönlich zeichnen Sie sich durch Kommunikations- und Teamfähigkeit, Überzeugungskraft 

sowie eine hohe soziale und interkulturelle Kompetenz aus. Sie sind durchsetzungsstark, innovativ, 

kreativ und besitzen die Fähigkeit, betriebliche wie wirtschaftliche Zusammenhänge 

zu erkennen. 

Fühlen Sie sich angesprochen? Dann freuen wir uns auf Ihre aussagefähigen Bewerbungsunterlagen 

mit Gehaltswunsch und frühestmöglichem Eintrittstermin. 

Für Vorabinformationen steht Ihnen Herr Torsten Gnädinger (Telefon 040 53801-580, 

E-Mail gnaedinger.t@eppendorf.de) gern zur Verfügung. 

Eppendorf AG · Personalabteilung · Barkhausenweg 1 · 22339 Hamburg · www.eppendorf.com 



Akademischer Stellenmarkt 

Veröffentlichen Sie Ihre Stellenanzeigen zielgruppengerecht in unserem akademischen Stellenmarkt, der allen nicht-kommerziellen Instituten für ihre 

Stellenausschreibungen kostenlos zur Verfügung steht. Bitte senden Sie dazu Ihre Anzeige (1/4 Seite 90 mm breit x 122,5 mm hoch, Logo – jpg oder tiff, 

300 dpi Auflösung) an a.macht@biocom.de. Annahmeschluß für die nächste LABORWELT-Ausgabe 6/07 (Erscheinungstermin 19.11.2007) ist der 26. Oktober. 

A Post-doctoral 

research position 

is available at the Centre for Cell Biology & Dept. of Biology 

at the University of Aveiro, Portugal starting 1.01.2008. 

Successful candidates will join a newly settled research program on the biogenesis 

of intracellular organelles and their role in disease. The overall goal 

of the projects is to characterize the molecular mechanisms driving organelle 

formation in mammalian cells. Particular attention is being paid to the dynamics 

and biogenesis of peroxisomes. 

Applicants will have a completed degree in biology, biochemistry or a related 

field in natural sciences, good knowledge of basic molecular biology and protein 

biochemistry, and enthusiastic interest in cell biological research. Expertise in cell 

culture, confocal microscopy, organelle isolation, protein purification, proteomics 

and mass spectrometry will be considered as an advantage. 

To apply, please send your complete CV (including names and addresses 

of referees) to: Dr. Michael Schrader, Centro de Biologia Celular & Dpto. 

de Biologia, Universidade de Aveiro, 3810-193 Aveiro, Portugal; Email: 

mschrader@ua.pt 

In der Arbeitsgruppe “Tumor Angiogenese Forschung” 

der Universitäts-Neurochirurgie sind folgende Stellen 

zum nächstmöglichen Zeitpunkt zu besetzen: 

1 Postdoktorand/in (Biologie) und 

1 Techn. Assistent/in (BTA) 

In dem zu bearbeitenden Forschungsprojekt wird die Rolle inflammatorischer 

Zellen bei dem Tumorwachstum und der Tumorvaskularisierung untersucht. 

Die vorgesehenen experimentellen Studien basieren auf einem breiten Methodenspektrum, 

das molekularbiologische, zellbiologische und immunologische 

Techniken und den Umgang mit Knock-out- und transgenen Tiermodellen 

umfasst. 

Wir suchen motivierte Mitarbeiter mit starkem Interesse an immunologischen 

und onkologischen Themen und mit der Fähigkeit zu eigenständiger und engagierter 

Aufgabenübernahme nach entsprechender Einarbeitung. Erfahrung mit 

Tierversuchen sind für das Projekt von Vorteil. 

Die Stellen sind zunächst auf 18 Monate befristet. 

Bitte richten Sie Ihre Bewerbung mit den üblichen Unterlagen innerhalb 2 

Wochen nach Erscheinen an: PD Dr. Marcia Machein, Neurozentrum, 

Abt. Allg. Neurochirugie, Breisacher Straße 64, 79106 Freiburg 

Weitere Informationen finden Sie unter: http://www.uniklinik-freiburg.de/ 

neurozentrum/live/forschung/tumorangiogenese.html 

Rückfragen an PD Dr. Machein, Email: marcia.machein@uniklinik-freiburg.de 

Postdoktorand/in (Expressionsanalysen) 

Das Labor für Microarray-Anwendungen des IZKF Würzburg sucht eine/n 

Bioinformatiker/in. 

Die Stelle steht ab sofort zur Verfügung. Die Vergütung erfolgt nach den Bestimmungen 

des TV-L in der Entgeltgruppe 13. 

Aufgabengebiet: Im Vordergrund steht die Erfassung und Auswertung von 

Expressionsdaten und Daten aus whole-genome-Assoziationsstudien sowie 

die Beratung von Diplomandinnen und Diplomanden, Doktorandinnen und 

Doktoranden und wissenschaftlichen Mitarbeiterinnen und Mitarbeitern. 

Voraussetzungen: Erforderlich sind ein abgeschlossenes Hochschulstudium mit 

Promotion in der Richtung Biologie/Bioinformatik sowie fundierte Kenntnisse der 

Genomanalyse. Bereitschaft zur interdisziplinären Zusammenarbeit und Programmierkenntnisse 

werden vorrausgesetzt. Kenntnisse in R sind von Vorteil. 

Bei gleicher Eignung werden Schwerbehinderte bevorzugt eingestellt. 

Kontakt: Dr. Susanne Kneitz (kneitz@klin-biochem.uni-wuerzburg.de) 

IZKF Labor für Microarray Anwendungen, Universität Würzburg, 

Versbacher Str. 7, 97078 Würzburg, Tel.: 0931 201 49942, 

Georg-August-Universität Göttingen – DFG Research 

Center for Molecular Physiology of the Brain (CMPB) 

The Department of Neuro- und Sensory Physiology (AG Neuroglia) is seeking a 

Ph.D. Student 

starting December 1st 2007 or later. The successful candidate will enter the 

PhD-Program of the DFG Research Center for Molecular Physiology of the Brain 

(CMPB) within the Göttingen Graduate School for Neurosciences and Molecular 

Biosciences (GGNB). 

The PhD-project will be on “Astrocytic physiology and pathophysiolgy in network 

function and plasticity” , using electrophysiology and multiphoton microscopy. 

More information about our laboratory can be found on our website: http://www. 

user.gwdg.de/~shuelsm2. 

We expect: 

– an excellent grade in a recent university degree: M.Sc. or diploma in Biology, 

Neuroscience or related field. 

– Interest and dedication to a career in Neuroscience 

– The ability to independently think and design own experiments 

– Applicants with experience in histology and/or in electrophysiology will be 

preferred. 

For application please send your CV, two references that can be contacted. 

Handicapped candidates are given priority, if equally qualified. The University 

of Göttingen is determined to increase the percentage of female scientists. 

Therefore, we strongly encourage qualified female scientists to apply. 

PD Dr. Swen Hülsmann, Department of Neuro- und Sensory Physiology 

Humboldtallee 23, 37073 Goettingen, Germany 

Phone: +49-(0)551-399592, Fax: +49-(0)551-399676 

E-mail: shuelsm2@gwdg.de, Web: http://wwwuser.gwdg.de/~shuelsm2 


In der Abteilung Klinische Pharmakologie, Fachbereich Medizin, Ruhr-Universität 

Bochum ist eine 

Postdoc-Stelle (BAT IIa/Ib) 

auf dem Gebiet der kardiovaskulären Grundlagenforschung zu besetzen. 

Es handelt sich um eine unbefristete universitätsinterne Stelle mit Limitationen 

gemäß HRG. Gesucht wird ein/e Post-Doktorand/in mit nachgewiesener eigener 

Projekterfahrung und Publikationsleistung, idealerweise mit Erfahrungen im 

Umgang mit Thrombozyten, Endothel- oder glatten Gefäßmuskelzellen. 

Bisheriger Schwerpunkt der Arbeitsgruppe ist die Signaltransduktion glatter 

Gefäßmuskelzellen bei Proliferations- und Differenzierungsprozessen. Der 

Postdoc sollte neben der Durchführung eigener Projekte an der Anleitung junger 

Wissenschaftler (Diplomanden und Doktoranden) Interesse zeigen und diese in 

seine Projekte integrieren. Neben ausreichendem Laborplatz stehen leistungsorientiert 

technische Assistenz und Verbrauchsmittel zur Verfügung. 

Ihre Bewerbungsunterlagen richten Sie bitte an: 

Prof. Dr. Peter Reusch, Abteilung Klinische Pharmakologie 

Universitätsstrasse 150, D-44801 Bochum 

Tel.: 0234 32-24884, e-mail: peter.reusch@rub.de 

BERUFSAUSBILDUNG BIOTECHNOLOGIE 2008 

Im Rahmen eines Ausbildungsverbundes werden die Dortmunder Forschungseinrichtungen: 

Max-Planck-Institut für molekulare Physiologie 

Institut für Arbeitsphysiologie (IfADo) 

ISAS - Institute for Analytical Sciences 

Universität Dortmund 

zum 11.08. 2008 gemeinsam zehn Auszubildende für den Beruf des/der 

Biologielaboranten/in 

einstellen. 

Wir möchten Sie kennenlernen, wenn Sie 

– naturwissenschaftlich interessiert 

– lern- und leistungsbereit sind und 

– gerne im Team arbeiten. 

Wir bieten eine hochqualifizierte, moderne und forschungsnahe Fachausbildung 

für eine expandierende Zukunftsbranche. Viele Forschungsprojekte, die in den 

Forschungseinrichtungen der Verbundpartner bearbeitet werden, haben medizinische 

Relevanz und tragen dazu bei, die Ursachen und Entwicklung von Krebs, 

viralen Infektionen, Stoffwechsel- und Berufskrankheiten zu verstehen. 

Die Ausbildungsvergütung richtet sich nach dem Ausbildungsvergütungstarifvertrag 

für Auszubildende. Bewerbungen von Abiturienten/ Abiturientinnen 

und Realschüler/innen (mit Fachoberschulreife bei Ausbildungsbeginn) sind 

besonders erwünscht. 

Die Institute sind bemüht, mehr schwerbehinderte Menschen zu beschäftigen. 

Bewerberinnen und Bewerber werden gebeten, ihre Bewerbungsunterlagen 

(Bewerbungsschreiben, Lebenslauf und Kopien der letzten drei Schulzeugnisse) 

bis zum 02.11.2007 zu senden an das 

Max-Planck-Institut für molekulare Physiologie 

z.H. Herrn Dr. Peter Herter, e-Mail: peter.herter@mpi-dortmund.mpg.de 

Otto-Hahn-Str. 11, 44227 Dortmund 

Tel.: 0231 133 2500 


At the University of Bern (Switzerland), Institute of 

Plant Sciences, a 

PhD position 

in Molecular Plant Physiology is available, to work on 

the characterization of transport processes in plants. 

The project focuses on membrane transporters and 

their role in nitrogen translocation. Molecular, biochemical 

and physiological methods will be used to investigate the physiological 

function of individual transport proteins in planta, their regulation and transport 

characteristics. 

We are looking for a motivated student interested in joining our research 

team. 

The position requires a diploma or M.Sc. degree in biology, biochemistry or 

equivalent and qualifications in plant molecular biology, plant physiology, cell 

biology or biochemistry. 

Salary will be according to the Swiss National Science Foundation and is limited 

to 36 month. Starting at earliest convenience. Applications should include a 

curriculum vitae, description of research interests and name and address of 

two references. 

Please send your application to Prof. Dr. Doris Rentsch, 

plantphys@ips.unibe.ch, http://www.ips.unibe.ch/plantphys 

Georg- August-Universität Göttingen 

Herzzentrum Göttingen 

Arbeitsgruppe Kardiovaskuläre 

Molekulargenetik 

Naturwissenschaftliche (r) 

Doktorandin/Doktorand 

In der Arbeitsgruppe von Prof. Dr. Ralph Knöll (Kardiovaskuläre Molekulargenetik, 

gentechnisch veränderte Tiermodelle) am Herzzentrum Göttingen ist zum 

nächstmöglichen Zeitpunkt eine Post-Doktoranden als auch eine Doktoranden- 

Stelle zu besetzen. 

Die Aktivitäten der Arbeitsgruppe konzentrieren sich auf mechanosensorische 

Prozesse, die sowohl Ursache als auch Folge einer Herzmuskelschwäche, einer 

Hypertrophie oder einer diastolischen Dysfunktion sein können. 

Die Arbeitsgruppe ist beteiligt an diversen Koordinationsprogrammen der 

Deutschen Forschungsgemeinschaft (DFG, Klinische Forschergruppe), des 

Nationalen Genomforschungsnetzes (NGFN) und der Europäischen Union (EU- 

Gene-Heart). 

Voraussetzungen sind: Abgeschlossenes Hochschulstudium vorzugsweise im 

Bereich Biologie. Gute Kenntnisse der englischen Sprache in Wort und Schrift 

sind erforderlich. 

Solide methodische Kenntnisse in der Biochemie, Zell- und Molekularbiologie 

sowie Erfahrungen bei der Generierung und /oder kardiovaskulären Analyse von 

gentechnisch veränderten Tieren wären ein zusätzlicher Gewinn. 

Weitere Informationen erhalten Sie unter der Telefon-Nr. +49(0)551 39 5316. 

Formlose Anfragen können auch an die E-Mail-Adresse rknoell@med.unigoettingen.de 

gesandt werden. 

Ihre Bewerbung mit den üblichen Unterlagen richten Sie bitte an: 

Prof. Dr. R. Knöll, Arbeitsgruppe Kardiovaskuläre Molekulargenetik 

Herzzentrum Göttingen, Georg-August-Universität 

Robert-Koch-Straße 40, 37099 Göttingen 

Telefon: +(49 (0)551 39 5316, Fax: +49 (0)551 39 13592 


Universitätsmedizin Göttingen 

Georg–August-Universität 

Zentrum Anatomie 

Abteilung Anatomie und Zellbiologie 

Im Zentrum Anatomie, Abteilung Anatomie und Zellbiologie, der Universitätsmedizin 

Göttingen sind zum 01.03.2008 zwei Vollzeit-Stellen (38,5 WoStd.) für 

Wissenschaftliche Mitarbeiter/Innen 

zu besetzen. 

Die Einstellung erfolgt für 3 Jahre mit der Aussicht auf Verlängerung der Stelle. 

Die Vergütung erfolgt je nach Qualifikation und Aufgabenübertragung nach 

Entgeltgruppe 13/14 TV-L. 

Die Abteilung beteiligt sich am Unterricht in den Fächern Anatomie und Molekulare 

Medizin sowie im GRK 1034 ‚Pharmacogenomics‘. Die Forschungsinteressen 

der Abteilung liegen im Bereich der embryonalen und Tumor-induzierten 

Lymph-/Angiogenese und des hämato- und lymphogenen Metastasierens von 

Tumoren. 

Ihr Profil: Sie verfügen über ein abgeschlossenes Hochschulstudium der Medizin 

oder eines naturwissenschaftlichen Faches, über Erfahrungen in der Lehre und 

Begeisterungsfähigkeit für Fragestellungen rund um die Endothelzelle. Erfahrungen 

in den Bereichen Embryologie, Zellkultur, morphologische Techniken und 

Molekularbiologie sind für die Positionen von besonderem Vorteil. Idealerweise 

haben sie ihre bisherigen Tätigkeiten durch Publikationen belegt. 

Bewerbungen von Frauen sind besonders willkommen und werden bei 

gleicher Qualifikation im Rahmen der rechtlichen Möglichkeiten mit Vorrang 

berücksichtigt. 

Schwerbehinderte werden bei gleicher Eignung bevorzugt berücksichtigt. 

Fragen beantwortet ihnen gerne Herr Prof. Dr. Jörg Wilting (Telefon (0551) 39- 

7050; Email: joerg.wilting@med.uni-goettingen.de). 

Bewerbungen mit Lebenslauf, Zeugniskopien und Publikationsliste (keine 

Sonderdrucke) richten sie bitte bis zum 30.11.2007 an: Prof. Dr. J. Wilting, 

Zentum Anatomie, Abteilung Anatomie und Zellbiologie, Universitätsmedizin 

Göttingen, 37099 Göttingen. 

Am Institut für Strukturbiologie des Rudolf-Virchow-Zentrums ist eine Stelle 

für eine/einen 

BTA/CTA/MTA 

zum 1.12.2007 zu besetzen. 

Das Tätigkeitsfeld umfasst primär das selbstständige Arbeiten auf dem Gebiet 

der Proteinbiochemie. 

Die Beherrschung folgender Methoden/Kenntnisse wird erwartet: 

– Aufreinigung von Proteinen mittels moderner chromatographischer 

Methoden 

– Charakterisierung der gewonnen Proteine bezüglich ihrer Reinheit und 

Aktivität 

– Anzucht von Bakterien und Hefezellen 

– Klonierung und ortsgerichtete Mutagenese 

Die Vergütung erfolgt nach TV-L. Schwerbehinderte Bewerberinnen und Bewerber 

werden bei ansonsten im Wesentlichen gleicher Eignung im Rahmen der 

geltenden Bestimmungen bevorzugt eingestellt. 

Bewerbungsunterlagen mit Lebenslauf richten Sie bitte an: 

Prof. Dr. Caroline Kisker, Prof. Dr. Hermann Schindelin 

Rudolf-Virchow-Zentrum 

DFG-Forschungszentrum für Experimentelle Biomedizin 

Institut für Strukturbiologie, Versbacher Straße 9, 97078 Würzburg 


Fach/Institut: Physiologie Abteilung: Molekulare Neurophysiologie 

Gesucht werden: 

Doktoranden, Diplomanden, PhD, 

Post-Doktoranden und 

Wissenschaftliche Mitarbeiter 

Aus den Bereichen: Medizin, Biologie, Chemie, Pharmazie, Physik 

Art der Arbeit: experimentell 

Funktionelle Einzelzell-Genomik dopaminerger Neurone beim Morbus Parkinson 

und dessen Mausmodellen. 

Am Institut für Allgemeine Physiologie des Fachbereichs Medizin der Universität 

Ulm in der AG Molekulare Neurophysiologie (Prof. Birgit Liss) ist eine Position als 

Wissenschaftliche Mitarbeiterin / Mitarbeiter (Doktorand/in) zu besetzen. 

Die Vergütung erfolgt nach Verg.-Gr. BAT IIa (1/2). Der Besetzungszeitpunkt ist 

flexibel. Die Stelle ist für zunächst 24 Monate befristet (eine Verlängerung ist 

möglich). 

Aufgabengebiet: Wissenschaftliche Arbeiten im Rahmen eines von der Gemeinnützigen 

Hertiestiftung und vom BMBF geförderten Drittmittelprojekts 

„Funktionelle Einzelzell-Genomik dopaminerger Neurone beim Morbus Parkinson 

und dessen Mausmodellen“. Durch Kombination von molekularbiologischer 

Einzelzell-Genexpressionsanalyse mit Laser-Mikrodissektionstechniken und 

patch-clamp Hirnschnitt Elektrophysiologie untersuchen wir die differentielle 

Funktion und Genexpression dopaminerger Neuronenpopulationen vor dem 

Hintergrund Ihrer Pathophysiologie im Morbus Parkinson (und auch anderer 

Krankheitsbilder des dopaminergen Systems, wie Schizophrenie und Drogensucht). 

Literatur siehe z.B. Liss&Roeper, 2004 TINS; Liss et al, 2005 Nature 

Neuroscience; Ramirez et al, 2006 Nature Genetics. Weitere Informationen zur 

Arbeitsgruppe unter: http://www.uni-ulm.de/med/allgphys.html. 

Voraussetzungen: Bewerben sollten sich hochmotivierte Naturwissenschaftler 

oder Mediziner, die in einem jungen Team mit internationalen Kooperationen 

arbeiten möchten. Erfolgreiche Bewerber sollten ein besonderes Interesse an 

neurobiologischen Fragestellungen mitbringen, sowie idealerweise Kenntnisse in 

der Analyse von Ionenkanal- und Rezeptorfunktion aufweisen. Vorerfahrungen in 

elektrophysiologischen, molekularbiologischen und/oder immunzytochemischen 

Techniken sollten ebenfalls vorhanden sein. 

Beginn ab: sofort Vor. Dauer: 36 Monate 

Arbeitsaufwand: ganztags, Vollzeit 

Doktorvater und Betreuer: Prof. Dr. Birgit Liss 

Bemerkungen: Das Labor zieht gerade von der Universität Marburg an die 

Universität Ulm. 

Neben naturwissenschaftlichen Doktoranden werden auch Diplomanden/ 

medizinische Doktoranden und Postdocs gesucht. 

Die Universität Ulm bietet Stipendien für Medizinstudierende an, die Aufgrund 

einer experimentellen Doktorarbeit mit dem Studium temporär aussetzen. 

Auch für Diplomanden bzw Masterarbeiten sind bei entsprechender Eignung 

Stipendien möglich! 

Rückfragen und Bewerbungen (in Deutsch oder Englisch) mit den üblichen 

Unterlagen sind zu richten an: Prof. Dr. Birgit Liss, Institut für Allgemeine Physiologie, 

AG Molekulare Neurophysiologie, Albert Einstein Allee 11, 89081 Ulm. 

E-mail: birgit.liss@uni-ulm.de, http://www.uni-ulm.de/med/allgphys.html 

Wir bitten, nur Kopien vorzulegen, da die Unterlagen nicht zurückgesandt werden; 

diese werden nach Abschluss des Auswahlverfahrens vernichtet. Vorstellungskosten 

können nicht erstattet werden. 


Korea Institute of Science and Technology Europe Forschungsgesellschaft mbH 

KIST Europe (Korea Institute of Science and Technology Europe Forschungsgesellschaft 

mbH), eine international ausgerichtete Forschungsgemeinschaft 

mit Sitz in Saarbrücken, setzt sich für eine globale Kooperation von natur- und 

ingenieurwissenschaftlichen Projekten zwischen Korea und der Europäischen 

Union ein. Mit zusammen 40 Kolleginnen und Kollegen entwickeln wir innovative 

Verfahren für die Umwelt- und Medizintechnik. 

Zur Unterstützung unserer Arbeit auf dem Gebiet der Medizintechnik (Partikelsynthese) 

suchen wir zum nächstmöglichen Zeitpunkt noch als engagierten 

Diplomand/in oder Praktikant/in 

(Möglichkeit zur Promotion bzw. Post-Doc) eine(n) 

Fortgeschrittene(n) Studenten/Studentin der Fachrichtungen Chemie, 

Werkstoff-/ Materialwissenschaften, Nanotechnologie, Chemieingenieurwesen 

u.ä. mit Vordiplom 

oder eine(n) 

Diplom-Chemiker/in, -Chemieingenieur/in, Diplom-Ingenieur/in für 

Werkstoff-/ Materialwissenschaften oder Nanotechnologie u.ä. 

Sie werden in ein Projekt integriert, das sich mit der Entwicklung von funktionalisierten 

Nanopartikeln bzw. biomimetischen Strukturen und ihrer Anwendung 

in der Krebstherapie beschäftigt. 

Innerhalb der Weiterentwicklung dieses Projektes führen Sie eigenverantwortlich 

sowohl die Synthese, Aufarbeitung und Charakterisierung neuartiger nanoskaliger 

Materialien und die dazugehörigen Analysen als auch Testversuche 

mit diesen Polymeren durch, in enger Zusammenarbeit mit Chemiker/innen, 

Biologen/innen und Ingenieuren/innen. Ferner gehört die Dokumentation der 

Resultate zu Ihren Aufgaben. 

Wir erwarten: 

– Erfahrung in der anorganischen und/oder organischen Synthese 

– Kenntnisse in der Synthese von und im Umgang mit Nanopartikeln 

– Interesse an angewandter Forschung und die Bereitschaft, sich in dem 

Projekt mit einzubringen und eigene Strategien zu entwickeln 

– selbständiges Arbeiten, Engagement und Zuverlässigkeit 

– Erfahrung mit Internet- und Datenbankrecherchen 

– Englisch-Grundkenntnisse 

Nach erfolgreich absolvierter Praktikumszeit bzw. Diplomarbeit besteht die Möglichkeit 

der Übernahme in eine Doktoranden- oder Postdoktorandenstelle. 

Zeit (Praktikum): 6 Monate, ganztägig; Vergütung (Praktikum): mind. ca. 700 Euro 

monatlich brutto (mit Diplom); danach Umwandlung in eine Doktoranden- oder 

Postdoktorandenstelle möglich 

Geboten werden eine interessante, abwechslungsreiche und anspruchsvolle 

Tätigkeit in einem praxisnahen und relevanten Themengebiet mit modernster 

Laborausstattung und ein interdisziplinäres und internationales Umfeld. 

Bewerbungen bitte per e-mail oder Post an: 

Dr. rer.nat. U. Steinfeld: steinfeld@kist-europe.de 

Dipl. Chem. Barbara Palm: barbara.palm@kist-europe.de 

Korea Institute of Science and Technology (KIST) Europe 

Forschungsgesellschaft mbH 

Universität des Saarlandes, Campus E 71 

Stuhlsatzenhausweg 97, D-66123 Saarbrücken, Germany 

Tel.: +49(0)681/9382-220, www.kist-europe.de 


The Division of Molecular and Experimental Surgery is a basic and translational 

research oriented unit within the Department of Surgery at the University 

Hospital Erlangen. The group consists of 15 – 18 research scientists and 

PhD students in very well equipped laboratories. Research focuses on molecular 

mechanisms of angiogenesis in tumors, inflammation and infectious 

diseases. 

To strengthen our team we are offering the following positions: 

Postdoc 

Topic: Characterization of mutual interactions of guanylate binding proteins 

and isolation of cellular binding factors of these proteins. 

The candidate should have proof for research ability in molecular biology 

and protein biochemistry, at least one significant first author 

paper and good English communication skills. Experience in the identification 

of protein-protein interactions is preferred but not required. 

The position will be initially for 2 years with a potential elongation for 3 further 

years. Salary according to TV-L 13. 

PhD student 

Research topic: High through put gene function analysis (array transfection, 

cell chip) to characterize cooperative activities of tumor-associated genes on 

cell invasiveness. 

The candidate should have a Master/Diploma degree in Biology, Molecular 

Medicine, Chemistry of Biochemistry with competitive grades. Knowledge of 

basic techniques in Cell Biology and Biochemistry are required. 

The position will be initially for 2 years with an elongation for 1 year. Salary 

according to TV-L 13/2. 

The University Hospital of Erlangen is an equal opportunity employer, and 

therefore specifically encourages the application of female candidates. Handicapped 

applicants will be favoured when qualification is equal. 

Further information: http://www.chirurgie.klinikum.uni-erlangen.de/e1846/ 

e37/index_ger.html 

Please send applications with CV, list of publications, address of two references, 

description of previous and future research interest until October 15, 2007 

to:Division of Molecular and Experimental Surgery Department of Surgery 

Prof. Dr. Michael Stürzl: Schwabachanlage 10, D-91054 Erlangen 

E-mail: michael.stuerzl@uk-erlangen.de 


Kontakt zu Verbänden 


Im Jahr 2007 erscheint LABORWELT zweimonatlich, IVW geprüft. Alle Abonnenten des Branchen-Magazins |transkript sowie die 

Mitglieder der nachfolgenden Gesellschaften erhalten LABORWELT regelmäßig mit freundlicher Empfehlung ihrer Organisationen. 

Wer sich darüber hinaus für einen Beitritt interessiert, erreicht die Gesellschaften unter folgenden Kontaktdaten: 

DECHEMA 

Fachsektion Biotechnologie 

Theodor-Heuss-Allee 25 

60486 Frankfurt/Main 

Tel.: +49-(0)-69-7564-289 

Fax: +49-(0)-69-7564-272 

www.dechema.de 

Deutsche Gesell. für Proteomforschung 

c/o MPI für Biochemie 

Am Klopferspitz 18a 

82152 Martinsried 

Tel.: +49-(0)-89-8578-3964 

Fax: +49-(0)-89-8578-2802 

c.kleinhammer@dgpf.org 

www.dgpf.org 

Österreichische Gesell. für Biotechnologie 

DGHM 

c/o Boehringer Ingelheim 

Austria GmbH 

Dr. Boehringer-Gasse 5-11 

A-1121 Wien 

Tel.: +43-(0)-1-80105-2311 

Fax: +43-(0)-1-80105-9311 

www.boku.ac.at/oegbt/ 

c/o Gesellschaft für 

Hygiene & Mikrobiologie 

Josef-Schneider-Str. 2 

97080 Würzburg 

Tel.: +49-(0)-931-201-46936 

Fax: +49-(0)-931-201-46445 

www.dghm.de 

Universitätsmedizin Göttingen – Georg–August-Universität 

Zentrum Anatomie – Abteilung Neuroanatomie 

Im Zentrum Anatomie der Universitätsmedizin Göttingen ist in der Abteilung Neuroanatomie, Schwerpunktprofessur zelluläre Neuroanatomie 

(Leiter: Prof. Dr. rer. nat. Bernhard Reuss) zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine 

Assistentenstelle (Vergütung nach TV-L) 

zu besetzen. Die Stelle ist zunächst auf 2 Jahre befristet, es besteht jedoch die Möglichkeit einer Verlängerung um weitere 3 Jahre. 

Das vorgesehene Projekt soll sich mit der Wirkung von Testosteron und Testosteron-Analoga auf die Gap Junction-Kopplung embryonaler Karzinomzellinien beschäftigen. 

Voraussetzung für eine Bewerbung ist ein abgeschlossenes medizinisches oder naturwissenschaftliches Hochschulstudium mit abgeschlossener Promotion. 

Kenntnisse und Fähigkeiten molekularbiologischer, zellbiologischer, histologischer und elektrophysiologischer Arbeitstechniken wären wünschenswert. Die Bereitschaft 

zur Beteiligung am vorklinischen medizinischen Unterricht wird vorausgesetzt, es besteht die Möglichkeit zur Habilitation. 

Bewerbungen von Frauen sind besonders willkommen und werden bei gleicher Qualifikation im Rahmen der rechtlichen Möglichkeiten mit Vorrang berücksichtigt. 

Schwerbehinderte werden bei gleicher Eignung bevorzugt berücksichtigt. 

Ihre Bewerbungen senden Sie bitte schriftlich innerhalb von zwei Wochen nach Erscheinen dieser Anzeige an: Prof. Dr. rer. nat. Bernhard Reuss, 

Zentrum Anatomie, Universitätsmedizin Göttingen, 37099 Göttingen. 

LSR (Life Science Research AG) 

LSR AG 

Mainzer Landstraße 55 

60329 Frankfurt 

Tel.: +49-(0)-69-255-61-730 

Fax: +49-(0)-69-236-650 

vdgh@vdgh.de 

Deutsche Gesellschaft für Genetik 

c/o Genetisches Institut 

der Universität Gießen 

Heinrich-Buff-Ring 58-62 

35392 Gießen 

Tel.: +49-(0)-641-99-35463 

Fax: +49-(0)-641-99-35469 

www.gfgenetik.de 

Gesellschaft für Signaltransduktion 

c/o Prof. Dr. Ralf Hass 

Med. Hochschule Hannover 

AG Biochemie u. Tumorbiol. 

30625 Hannover 

Tel.: +49-(0)-511-532-6070 

Fax: +49-(0)-511-532-6071 

www.sigtrans.de 

Gesellschaft für Pharmakologie u.Toxikologie e.V. 

Geschäftsstelle der DGPT 

Achenbachstr. 43 

40237 Düsseldorf 

Tel.: +49-(0)-211-600-692-77 

Fax: +49-(0)-211-600-692-78 

mitglieder@dgpt-online.de 

www.dgpt-online.de 

Nationales Genomforschungsnetz 

c/o DLR – Koblenzerstr. 112 

53177 Bonn-Bad Godesberg 

Tel.: +49-(0)-228-3821-331 

Fax: +49-(0)-228-3821-332 

pm-ngfn@dlr.de 

www.ngfn.de 

Deutsche Gesellschaft für Neurogenetik 

c/o Institut für Humangenetik 

Uni Gießen/Schlangenzahl 14 

35392 Gießen 

Tel.: +49-(0)-641-99-41600 

Fax: +49-(0)-641-99-41609 

www.med.uni-giessen.de 

/genetik/dgng.html 

Netzwerk Nutrigenomforschung 

Netzwerk RNA-Technologien 

Arthur-Scheunert-Allee 114 

14558 Bergholz-Rehbrücke 

Tel.: +49-(0)-33200 88 385 

Fax: +49-(0)-33200 88 398 

verein@nutrigenomik.de 

www.nutrigenomik.de 

c/o Prof. Dr. Volker A. Erdmann 

Freie Universität Berlin 

Thielallee 63, 14195 Berlin 

Tel.: +49-(0)-30-8385 6002 

Fax: +49-(0)-30-8385 6413 

erdmann@chemie.fu-berlin.de 

www.rna-network.com 


P R O D U K T W E L T 


Neue Tisch-Ultrazentrifuge Optima MAX-XP 

Beckman Coulter hat eine neue Tischzentrifuge 

eingeführt, die zur neuen Generation der 

erfolgreichen Optima-Ultrazentrifugen des 

Unternehmens gehört: die Optima MAX-XP. 

Das Gerät arbeitet zwar mit hohen Geschwindigkeiten 

bis zu 150.000 U/min (2.500 Umdrehungen 

pro Sekunde), ist dabei aber nur halb 

so laut wie andere Tischzentrifugen. Der neue 

Festwinkelrotor MLA-150 der Optima MAX- 

XP sorgt für einen niedrigen k-Faktor, was eine 

rasche Trennung bei kleinen Probenvolumina 

wie subzellulären Partikeln, Viren und Prote- 

inen gewährleistet. Die bedienerfreundliche 

Software der Tischzentrifuge Optima MAX- 

XP verfügt über eine intuitive, mittels eines 


Kostengünstiger Lösungsmittelverdampfer für Mikroplatten 

Der Lösungsmittelverdampfer MiniVap 

von Porvair Sciences Ltd. hilft Wissenschaftlern, 

den labortypischen Engpass der 

Lösungsmittelverdampfung bei Mikroplatten 

vor der Analyse oder dem Wiedereinsetzen 

im Zwischenspeicher zu überwinden 

Mit dem kostengünstigen MiniVap 

dauert das Trocknen einer Platte nur wenanderen 

gängigen Verfahren zum Entfernen 

der Lösungsmittel aus 96er-Mikroplatte, die 

in der Regel mehrere Stunden benötigen. 

Das kompakt gestaltete Instrument kann 

in jedem standardmäßigen Dampfschrank 

untergebracht werden. MiniVap ist 

speziell auf den Einsatz in Forschung und 

Entwicklung ausgelegt, wo eine geringe 

Anzahl einzelner Platten getrocknet werden 

muss. 

Der MiniVap lässt sich einfach installieren, 

bedienen und warten. Zur Installation 

sind nur eine Verbindung zur Gaszufuhr 

und eine Standard-Steckdose erforderlich. 

Die Betriebssicherheit ist dahingehend gewährleistet, 

dass die kompakte CE-gekennzeichnete 

Einheit in alle Dampfschränke 

passt. Der vielseitig einsetzbare MiniVap 

farbigen Berührungsbildschirms zu steuernde 

Benutzeroberfläche und lässt sich entsprechend 

den Kundenanforderungen individuell 

einrichten. Das System ist wahlweise auch 

mit Fernüberwachung und Fernsteuerung 

erhältlich. Der Nutzer kann zwischen Upm- 

und RZB-Modus wählen. 

Wichtige Daten, etwa detaillierte „Run- 

Histories“, lassen sich über einen USB-Port 

exportieren. Die Software unterstützt die 

Übereinstimmung mit US-Verordnung 21 

CFR Teil 11 sowie den GLP- und GMP- 

Richtlinien, und die neuen Benutzer-ID- und 

Login-Funktionen sind wichtige Labormanagement-Tools. 

Die Optima MAX-XP wird mit mehreren 

Biocontainment-Stufen angeboten und ist 

so konzipiert, dass sie unter einen Standard- 

Biosicherheitsabzug passt. Als zusätzlicher 

Schutz wird die neue Ultrazentrifuge auch in 

einer Biosicherheits-Ausführung mit HEPA- 

Filter (High Efficiency Particle Arresting) 

angeboten. Darüber hinaus gibt es eine Auswahl 

von Laborutensilien und Rotoren, die 

den Anforderungen für biologische Sicherheit 

genügen. Alle Optima MAX- und Optima 

TLX-Rotoren sind mit der neuen Ultrazentrifuge 

kompatibel. 

ist auf die Nutzung mit SBS/ANSI-Mikroplatten 

mit 96 Vertiefungen ausgelegt. 

Das gleichzeitige Einspritzen von erhitztem 

Stickstoff direkt in jede der 96 Vertiefungen 

sorgt für eine kurze Trocknungsdauer durch 

den MiniVap. 


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Kennziffer 36 LW 05 · www.biocom.de 

Produkte zum Multiplex- 

Nachweis von Pathogenen 

Die QIAplex-Panels – das ResPlex I-, 

ResPlex II- und StaphPlex-Panel, der Firma 

Qiagen wurden für den parallelen Nachweis 

von mehr als zehn Pathogenen in einer einzigen 

Reaktion entwickelt. Die ResPlex-Panels weisen 

Erreger von Atemwegserkrankungen nach: 

Das ResPlex I- Panel erlaubt die Detektion der 

häufigsten bakteriellen respiratorischen Erreger 

sowie von Adenoviren. Das ResPlex II-Panel 

weist respiratorische Viren nach, darunter Influenza-, 

Metapneumo-, RSV und Rhinoviren. 

Das StaphPlex-Panel detektiert verschiedene 

Staphylokokken-Arten, identifiziert MRSA 

(Methicillin-resistente Staphylococcus aureus) 

und unterscheidet zwischen CA-MRSA und 

HA-MRSA. Allen QIAplex Panels basieren 

auf einer patentierten Technologie, die einen 

sensitiven und spezifischen Multiplex-Nachweis 

ermöglicht. Die Multiplex-Testtechnologie 

wurde für die Luminex-Detektionsplattformen 

entwickelt und ist optimiert für die 

LiquiChip ® 200 Workstation* von QIAGEN. 

* QIAplex-Panels und die LiquiChip 200- Workstation 

sind nur für den Forschungsgebrauch. 


HydroFlex-ibel 

Die kompakte 3-in-1 HydroFlex-Plattform von 

Tecan, die automatische Vakuum-Filtrationen 

und Separationen von magnetischen Beads 

ermögicht sowie Platten waschen kann, liefert 

erhöhte Produktivität und zuverlässige Ergebnisse 

für eine ganze Reihe von Applikationen 

im 96-Well-Format, wie PCR-Aufreinigung, 

Assays mit magnetischen Beads, ELISA, zelluläre- 

und Protein Assays. HydroFlex automatisiert 

wichtige Schritte wie das Ansaugen der 

Filtrationsplatte, die on-line-Vakuum-Kontrolle 

und das schnelle Dispensieren von Waschpuffer. 

Das Vakuum kann für unterschiedliche 

Applikationen flexibel in dem Bereich von -50 

mbar bis -850 mbar eingestellt werden. 

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Neue Microfuge ® 16 

Die neue Microfuge ® 16 von Beckman Coulter 

benötigt wenig Standfläche, wiegt nur 6,4 kg 

und ist knapp 176 mm hoch. Die Mikrozentrifuge 

arbeitet leise bei 16.163 x g (14.800 U/min) 

und ermöglicht eine schnelle Pelletierung oder 

Isolierung von DNA, RNA, Proteinen und 

Viren. Die Microfuge 16 ® ist in einer Kühlraumumgebung 

einsetzbar. Der 24-Platz-Rotor ist 

auf hohen Durchsatz ausgelegt und zentrifugiert 

Mikroröhrchen mit 0,2 bis 2,2 ml Volumen. 

Ein automatisches Verriegelungssystem 

gewährleistet, dass der Zentrifugationslauf erst 

beginnt, wenn das Gerät korrekt geschlossen ist. 

Die Microfuge 16 ® verfügt über ein leicht ablesbares 

Display sowie ein Drucktasten-Bedienfeld 

zur bequemen Programmierung. Sie ist mit 

Beckman Coulters robustem, bürstenlosem Induktionsantrieb 

ausgestattet und wird von dem 

branchenführenden Service- und Betreuungsprogramm 

des Unternehmens unterstützt. 


Neues Nukleinsäure- 

Aufreinigungssystem 

� 

� 

Die Promega Corp. (Madison, Wisconsin, USA), 

mit deutscher Niederlassung in Mannheim 

bringt mit Maxwell ® 16 das erste vollautomatische 

Reinigungssystem für klinische und 

klinisch-diagnostische Labore auf den Markt. 

Das System unterstützt alle DNA-basierten 

Anwendungen. Mit dem Maxwell ® 16 werdn 

bis zu 16 Proben gleichzeitig in etwa 30 Minuten 

gereinigt. Darüber hinaus sind Ertrag und 

Reinheit der gereinigten DNA hochwertiger als 

bei vergleichbaren Methoden. Das Maxwell ® 16- 

System ist auf die DNA-Reinigung von bis zu 

400 µl Blut oder 500 µl Leukozytenfilm ausgelegt. 

Es besteht aus dem vorprogrammierten 

platzsparenden Gerät sowie aus vorgefüllten 

Reagenzienkartuschen. Maxwell ® 16 weist 

keinerlei Kreuz-Kontamination auf und wurde 

auf der Grundlage eines Systems erstellt, das 

ISO13485:2003-zertifiziert ist – es entspricht 

damit dem weltweiten Qualitätsstandard der 

Medizin-Branche. 



BSA-freie Blockierungslösung für Proteinassays 

SmartBlock ist eine neuartige Blockierungslösung 

von Candor Biosciences für ELISA, RIA, 

Western Blots, Protein Arrays und Immuno- 

PCR. In allen Immunoassays sind Oberflächen 

zu blockieren, wie zum Beispiel die Kunststoff- 

Oberflächen von ELISA-Platten, Western-Blot- 

Membranen oder andere proteinbindende 

Flächen. Dadurch lässt sich unspezifische Bindung 

an freie Bindungsstellen verhindern und 

somit hoher Hintergrund vermeiden. Wichtig 

ist hierbei die ausreichende und flächige Absättigung 

der freien Bindungsstellen. 

SmartBlock ist eine neuartige, gebrauchsfertige 

Lösung – einfach, effizient und ökonomisch 

im Einsatz. SmartBlock ist frei von 

Serum-Proteinen wie BSA, so dass Interferenzen 

aufgrund von BSA von vornherein 

ausgeschlossen sind. SmartBlock ist sehr 

effektiv, aber auch günstig im Vergleich zu 

anderen kommerziellen Fertig-Blockierern. 

SmartBlock wird in Deutschland unter DIN 

ISO 9001:2000 produziert. 


Nanovolumina küvettenlos messen mit dem 

NanoPhotometer 

Das neue NanoPhotometer TM von Implen 

(www.nanophotometer.com) ermöglicht spektrophotometrische 

Analysen von Proben im 

Submikroliter-Bereich (0,7 - 5 µl) mittels 

der integrierten der LabelGuard-Mikroliter-Messzelle. 

Durch eine automatische 

Verdünnung der Proben um den Faktor 

10 oder 50 wird eine exzellente Reproduzierbarkeit 

erreicht und eine physikalische 

Verdünnung der Proben meist unnötig. 

Die Proben können im Anschluss an die 

Messung zur weiteren Verwendung zurückgewonnen 

werden. 

Neben der küvettenlosen Messung sind 

auch Messungen mit Standard- und Ultramikroküvetten 

(Quarz- oder Kunststoffküvetten) 

möglich. Der Konzentrationsbereich 

für dsDNA liegt bei 15-4.250 ng/µl. 

Das NanoPhotometer TM ist sehr einfach 

zu bedienen und zu reinigen. Kreuzkontaminationen 

können ausgeschlossen 

werden. Mit dem NanoPhotometer TM ist 

ein kompletter Scan von 200 nm bis 950 nm 

möglich. Der Wellenlängenbereich für Einzel- 

oder Mehrfachwellenlängenmessungen 

liegt zwischen 190 nm und 1100 nm. 

Es existieren vorprogrammierte Methoden 

für Einzel- und Mehrfachwellenlängenmessungen, 

Konzentrationsbestimmungen, 

Kinetiken, Standardkurven und Verhältnisberechnungen. 

Ein umfangreiches Softwarepaket 

enthält Berechnungsfunktionen für 

die Auswertung von Scans, voreingestellte 

Methoden zur Nukleinsäureanalytik 

(dsDNA, ssDNA, RNA, Oligos), zur Bestimmung 

der Labelingeffizienz (Farbstoffeinbauraten 

z.B. für Microarray-Experimente), 

zur Konzentrationsbestimmung von Proteinen 

(Bradford, Lowry, BCA, Biuret, Protein 

A280) und zur Bestimmung der Zelldichte 

(OD600). 

Daneben ist auch die Erstellung Anwender-spezifischer 

Methoden möglich und 

wird durch vordefinierte Funktionen unterstützt. 

Es können bis zu 81 Anwender-definierte 

Methoden gespeichert werden. Der 

Platzbedarf ist minimal, und für den Betrieb 

ist kein zusätzlicher Computer notwendig. 

Für den Datentransfer auf einen PC (Excel- 

Spreadsheets, Ausdrucke auf Netzwerkdruckern, 

Datenspeicherung in ASCII, etc.) 

ist ein USB-Anschluss und eine Bluetooth 

Wireless-Option verfügbar. Ein eingebauter 

Drucker ist optional erhältlich. 


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Neue Waffe gegen Volkskrankheit Sepsis: VYOO 

Internationale Untersuchungen belegen, dass 

die sogenannten „goldenen Stunden“ der 

Infektionsbehandlung entscheidend für die 

individuelle Prognose der betroffenen Patienten 

sind. SIRS-Lab hat mit VYOO einen 

neuen DNA-basierten Test für die Detektion 

von Sepsis-Erregern auf den Markt gebracht. 

Das System liefert die entscheidenden Informationen 

innerhalb dieser ersten „goldenen 

Stunden“. Mit der spezifischen und schnellen 

Identifizierung von Bakterien, Pilzen und 

deren Resistenzen hat VYOO erhebliches 

Potential, die antibiotische Therapie bei Patienten 

mit lebensbedrohlichen Infektionen zu 

verbessern. Der PCR-basierte Test detektiert 

40 Bakterien- und Pilz-Spezies. Zeitgleich 

werden fünf wichtige Antibiotika-Resistenzen 

identifiziert. Innerhalb von sechs Stunden 

stehen die Ergebnisse von bis zu 16 Patienten 

pro Anwendertag zur Verfügung. 

Mit dem neuen System wird mikrobiologischen 

Laboren ein effektives System zur 

Analyse komplexer Blutproben mit üblichen 


PreCR Repair Mix ermöglicht PCR an geschädigter DNA 

Der neue PreCR Repair Mix von New 

England Biolabs ist ein Enzym-Cocktail 

zur Reparatur geschädigter DNA, die nicht 

mehr durch PCR amplifizierbar ist, zum 

Beispiel forensische DNA-Spuren, DNA aus 

Herbarien oder fossilen Ursprungs etc. Aber 

auch anderweitig durch UV-Strahlung oder 

Hydrolyse geschädigte DNA wird durch die 

PreCR-Behandlung „fehlerfrei” repariert 

und kann wieder als PCR-Template dienen. 

PCR-Instrumenten zur Verfügung gestellt. Erste 

retrospektive Untersuchungen belegen eine 

erhöhte Trefferquote bei dramatisch reduzierter 

Nachweiszeit und einfacher Anwendung. 

VYOO erreicht höchste Sensitivität durch 

Looxster ® , dessen Herzstück die von SIRS- 

Lab entwickelte Pureproove ® -Technologie 

zur Anreicherung von Bakterien- und Pilz- 

DNA ist. VYOO wurde in einem mehrjährigen 

Entwicklungsprozess gemeinsam mit 

führenden Mikrobiologen und Klinikern zur 

Marktreife entwickelt. 

Insbesondere bei DNA-Analysen, für die 

die Sequenz des Amplifikates von entscheidender 

Bedeutung ist, kann PreCR ein 

zuverlässiges, genaues Ergebnis sichern: So 

entstehen durch natürliche Desaminierung 

desaminierte Cytosin-Reste (also Uracil). 

Diese U-haltigen DNA-Stränge sind mit 

proofreading-Enzymen nicht amplifizierbar, 

da das Uracil die Polymerase-Aktivität von 

proofreading-Polymerasen „verstopft“. Mit 

Taq-Polymerase hingegen wird zwar ein 

Amplifikat erhalten, aber eines mit einer 

Mutation – denn gegenüber dem Uracil 

(„Desamin-Cytosin”) wird ein Adenin in 

den zweiten Strang eingebaut. Richtig wäre 

hier ein Guanin gewesen. Diese so dauerhaft 

eingefügte Punktmutation erschwert die 

Auswertung und Interpretation so mancher 

Daten. 

Das FBI hat den PreCR Repair Mix 

bereits in seinen Laboren an verschiedenen 

DNA-Spuren getestet und für gut befunden 

New England Biolabs einzigartiges Gemisch 

aus DNA-Reparaturenzymen entfernt 

beziehungsweise repariert fehlerfrei PCRblockierende 

DNA-Schäden. Es gestattet 

eine PCR an bisher ungeeigneten forensischen 

oder „historischen” DNA-Proben. Mit 

PreCR behandelte DNA ist kompatibel mit 

allen PCR-Polymerasen 


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Erstes automatisiertes 

Kraftspektroskop 

ForceRobot ist das Ergebnis eines mehr als 

dreijährigen Entwicklungsprozesses des 

Dresdner Unternehmens nAmbition, das sich 

auf nanotechnologische Lösungen für die molekulare 

Analytik spezialisiert hat. Die Kraftspektroskopie 

erforscht wie einzelne Biomoleküle, 

Polymere und Oberflächen miteinander 

interagieren und welche Kräfte dabei wirken. 

Anders als traditionelle Kraftspektroskope, die 

nur geringe Mengen brauchbarer Daten liefern 

und auf häufige manuelle Justierungen angewiesen 

sind, laufen Routineprozeduren, wie 

zum Beispiel Kalibrierungen, beim ForceRobot 

erstmals vollständig automatisiert ab. 

Optimierte Piezoelemente ermöglichen 

Bewegungen im Nanometerbereich. Daneben 

erleichtern neuentwickelte Softwaretools die 

flexible Planung und Gestaltung eines Experiments 

sowie die Auswertung der gewonnenen 

Daten. Das Gerät generiert selbstständig zehntausende 

Kraftkurven innerhalb weniger Stunden, 

muss dabei nicht beaufsichtigt werden und 

kann sogar über Netzwerkverbindungen online 

aus der Ferne überwacht werden. Ereignislose 

Kraftkurven werden automatisch gefiltert, 

während die nutzbaren Daten für die weitere 

Auswertung verfügbar gemacht werden. 

Mögliche analytische Anwendungen umfassen: 

Molekulares Design, Materialwissenschaften, 

Strukturcharaktersierung, Bestimmung von 

Energielandschaften, Faltungs- und Entfaltungsdynamik 

sowie die Lokalisierung von 

Bindungsstellen und Affinitätsstudien. 


Technologie-Präsentation 

Die Firma Thermo Fisher Scientific präsentiert 

am 10.10.2007 (16:00-16:25 Uhr, Convention 

Center, Saal Hamburg) im Rahmen der Biotechnica 

einen Vortrag von Dr. Arja Lamberg zum 

Thema „Nukleinsäuren- und Proteinaufreinigung 

aus vielfältigen Ausgangsmaterialien mit 

Hilfe der Magnetpartikeltechnologie“. 

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LABORWELT 

INFOSERVICE 

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+49 (0)30 26 49 21-11 

Wünschen Sie weitere Informationen von unseren Inserenten? 

Ganz einfach: Kreuzen Sie die gewünschten Kennziffern an, Absender drauf und 

ab ins Fax! Ihre gewünschten Infos kommen umgehend. 

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� 20LW 05 � 32LW 05 � 44LW 05 � 56LW 05 

� 21LW 05 � 33LW 05 � 45LW 05 � Beilage 

� 22LW 05 � 34LW 05 � 46LW 05 � Beilage 

INFOSERVICEFax 

Name: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 

Institution: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 

Anschrift: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 

Tel./Fax: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 

Auch im Internet unter www.biocom.de



DNA-Aufreinigung aus klinischen Proben 

Die Bioron GmbH (www.bioron.net) ist Produzent 

und Händler für Produkte in der 

Molekularbiologie. Die Entwicklung neuer, 

innovativer Produkte steht im Mittelpunkt 

um steigenden Kundenanforderungen gerecht 

zu werden. In der PCR-Diagnostik ist 

es wichtig, schnelle, zuverlässige Ergebnisse 

zu erzielen. Die DNA-Aufreinigung aus 

Probenmaterial stellt dabei den größten 

Zeitfaktor dar. Mit den neuen DNA-Aufreinigungssystemen 

der Firma Bioron ist eine 

DNA-Isolierung in weniger als 30 Minuten 

möglich. 

Biorons One-Tube-Purification-System 

(OTP-Reagent) ist optimiert für die DNA- 

Aufreinigung aus Schleimhautabstrichen 

(Cervix, Vagina, Mundschleimhaut), 

Urin, Speichel, Sperma und verschiedene 

Flüssigbiopsien (Gelenkflüssigkeit, Gehirnflüssigkeit, 

Prostata-Flüssigkeit, Zellextrakt 

aus diffusen Tumoren). Biorons PCR-ready 

Reagent ist optimiert für die einfache und 

effektive DNA-Aufreinigung aus Blutproben. 

Die Technik der beiden Systeme basiert 

auf der Thermo-Koagulation von Proteinen, 

Polysachariden und anderen Biomolekülen 

unter definierten Bedingungen. 

OTP-Reagent und PCR-ready Reagent sind 

auch ohne Farbstoff für die quantitative 

PCR (qPCR) und Real-time PCR-Anwen- 

Neue Steppergeneration: ripette ® genX 

Der Umgang mit Steppern im Labor benötigt 

ein präzises Vorgehen, um exakte 

Ergebnisse zu erzielen. Egal ob Stepper 

mit manueller oder motorbetriebener 

Lade- und Abgabevorrichtung, die Berechnung 

der Abgabeschritte in den verschiedenen 

Tipgrößen ist oft umständlich. 

Eine neue Generation der Stepper kommt 

nun als Lösung von Ritter medical care 

aus Schwabmünchen auf den Markt: die 

ripette ® genX. 

Das professionelle System ist universell 

einsetzbar und auf präzises Arbeiten 

ausgelegt. Die neu konzipierte Technik ermöglicht 

im Display die Auswahl von neun 

verschiedenen Tipgrößen. Neu sind die 

Anzeige der Anzahl von Wiederholungen 

sowie die stufenlose Auswahl von 1µl bis 

50.000 µl. Das Arbeitsmaterial wird per Motor 

aufgezogen und abgegeben. Die ripette ® 

genX ist sowohl bedienungsfreundlich als 

auch ergonomisch gestaltet und geht damit 

auf die modernen Laborbedürfnisse ein. 

dungen erhältlich. Einsatzgebiete sind die 

Infektionsdiagnostik, Gerichtsmedizin und 

Vaterschaftstests. 

Neben diesen innovativen Produkten bietet 

Bioron Produkte für die Molekularbiologie 

aus eigener Produktion. Spezialisiert auf 

quantitative PCR hält Bioron eine große 

Auswahl an entsprechenden Polymerasen 

und Mastermixen bereit. 



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Zudem überzeugt sie durch 

ihr geringes Gewicht und ist 

dadurch ideal für Routinearbeiten. 

Passende Dispensertips 

neu auf dem Markt: ritips ® 

genX 

Für die ripette ® genX, die 

auch in Verbindung mit vielen 

gängigen Systemen universell 

einsetzbar ist, wurden die Verbrauchs-Materialien 

neu konzipiert. 

Eine verfeinerte Spitze 

ermöglicht es, selbst kleinste 

Dosiermengen hochpräzise 

abgeben zu können. 

Die ritips ® genX sind im 

niedrigen µl-Bereich ohne 

zusätzliche Pipettenspitze einsetzbar 

und erzielen dadurch 

ein besonders gutes Abgabeverhalten. 

Ein Musterpaket 

kann ab sofort angefordert 

werden. 


High Resolution Melt 

HRM von LTF Labortechnik charakterisiert 

die Nukleinsäureprodukte anhand ihres 

Schmelzverhaltens. Die Proben können 

entsprechend ihrer Sequenz, Länge, ihres 

GC-Gehaltes und ihrer Strang- Komplementarität 

unterschieden werden. Neuartige 

Farbstoffe, wie SYTO ® 9 EvaGreen 

und LC Green können hierfür universell 

und preiswert eingesetzt werden. Sie liefern 

optimale Ergebnisse, da sie in deutlich höheren 

Konzentrationen eingesetzt werden 

können, als die traditionellen Interkalations-Farbstoffe. 

Sogar Einzel-Basenaustausche wie SNPs 

(single nucleotide polymorphisms) können 

zuverlässig identifiziert und zugeordnet 

werden. 

Daher eignet sich die High Resolution 

Melt hervorragend zum preiswerten 

Mutations-Screening (GeneScanning), 

DNA-Fingerprinting, SNP- Genotyping, 

Methylierungsstudien, Artenidentifikation 

usw. Der Rotor-Gene 6000 wurde speziell 

für die HRM entwickelt. Er kombiniert ein 

hochintensives Optiksystem und die RGhigh-speed-Datenaufnahme 

(bis 1000 Datenmesspunkte 

pro °C Temperaturramping) 

mit einer extrem hohen Temperaturauflösung 

(0,02°C) und einer automatisierten 

Analyse-Software. 

Beispiele für die Einsatzmöglichkeiten 

des HRM sind das Aufspüren von Mutationen 

(gene scanning), die Charakterisierung 

von Haplotypen im Rahmen von Populationsanalysen, 

das DNA-Fingerprinting, 

SNP-Genotypisierungen, die Analyse der 

DNA-Methylierung, die DNA-Kartierung, 

die Analyse erworbener somatischer Mutationen, 

Die Identifizierung und Systematisierung 

von Arten, HLA-Kompatibilitätstests, 

Assoziationstests, die Identifikation 

von Suszeptibilitätsgenen sowie das Screening 

auf „loss of heterozygosity“. 

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Impressum 

LABORWELT (ISSN 1611-0854) 

erscheint zweimonatlich im Verlag der 

BIOCOM AG 

Stralsunder Str. 58-59, D-13355 Berlin 

Tel./Fax: 030/264921-0 / 030/264921-11 

E-Mail: laborwelt@biocom.de 

Internet: www.biocom.de 

Redaktion: 

Dipl.-Biol. Thomas Gabrielczyk 

Tel.: 030/264921-50 

Anzeigenleitung: 

Oliver Schnell 

Tel.: 030/264921-45, eMail: o.schnell@biocom.de 

Leserservice: 

Angelika Werner, Tel. 030/264921-40 

Bildtechnik und Layout: 

Heiko Fritz 

Graphik-Design: 

Michaela Reblin 

Druck 

Mayer & Söhne, D- 86551 Aichach 

Mitglieder der DECHEMA-Fachsektion 

Biotechnologie, der Österreichischen 

Gesellschaft für Biotechnologie ÖGBT, der 

Gesellschaft für Genetik GfG, der Deutschen 

Gesellschaft für Proteomforschung DGPF, der 

biotechnologischen Studenteninitiative btS, 

der Deutschen Gesellschaft für Neurogenetik 

DGNG, der Deutschen Gesellschaft für 

Pharmakologie und Toxikologie DGPT, der 

Gesellschaft für Signaltransduktion STS, 

der Life Science Research AG innerhalb 

des VDGH, des Vereins zur Förderung der 

Nutrigenomforschung, der Deutschen 

Gesellschaft für Hygiene und Mikrobiologie 

DGHM, des RiNA RNA-Netzwerkes sowie 

die Wissenschaftler des Nationalen 

Genomforschungsnetzes NGFN erhalten die 

Zeitschrift im Rahmen ihrer Mitgliedschaft. 

Für einen regelmäßigen Bezug von 

LABORWELT ist eine kostenlose 

Registrierung unter www.biocom.de oder per 

Fax (siehe Seite 56) erforderlich. 

Namentlich gekennzeichnete Beiträge 

stehen in der inhaltlichen Verantwortung der 

Autoren. Alle Beiträge sind urheberrechtlich 

geschützt. Ohne schriftliche Genehmigung 

der BIOCOM AG darf kein Teil in irgendeiner 

Form reproduziert oder mit elektronischen 

Systemen verarbeitet, vervielfältigt oder 

verbreitet werden. 

Beilagen: Angewandte Biokatalyse- 

Kompetenz-Zentrum GmbH, Perkin Elmer 

Die Druckauflage von 20.000 

Exemplaren ist IVW-geprüft: 

© BIOCOM AG, Berlin 

® BIOCOM ist eine geschützte Marke der 

BIOCOM AG, Berlin 

BIOCOM ® AG 

S E R V I C E 

30.09.-04.10.07: 59. Jahrestagung der Deutschen 

Gesellschaft für Hygiene und Mikrobiologie 

(DGHM), Göttingen 

Info: Conventus Congressmanagement 

(Web: www.dghm2007.de) 

02.-04.10.07: L.A.B. 2007, London (UK) 

Info: Dietrich Meier, Messe Leipzig GmbH/SPECTARIS e.V. 

(Tel.: +49-341-678-8104, E-Mail: D.Meier@leipziger-messe. 

de, Web: www.lab-uk.de) 

02.-04.10.07: ICSE 2007 - International Contract 

Services Expo, Milano (IT) 

Info: (E-Mail: icse@cmpi.biz, Web: www.icsexpo.com) 

02.-05.10.07: RICHMAC 2007, Milano (IT) 

Info: Antonella Scuderi, Fiera Milano Tech (E-Mail: antonella. 

scuderi@fieramilanotech.it, Web: www.richmac.it) 

04.-06.10.07: 3 rd Annual Meeting of the 

Oligonucleotide Therapeutics Society, Berlin (D) 

Info: Stefan Bauer, RiNA Netzwerk RNA-Technologien GmbH 

(Tel.: +49-30-844-166-34, E-Mail: coordination@rna-network.com, 

Web: www.ots-symposium.org) 

04.-06.10.07: 2. Kongress der Deutschen 

Gesellschaft für Stammzellforschung, Würzburg 

Info: Meike Weber, Julius-Maximilians-Universität Würzburg 

(Tel.: +49-931-803-1584, E-Mail: m-weber.klh@mail.uniwuerzburg.de, 

Web: www.kmb-lentzsch.de/gsz2007) 

06.-10.10.07: HUPO 2007, Seoul (VRC) 

Info: KHUPO (Tel.: +82-2-3476-7700, 

E-Mail: hupo2007@proteomix.org, Web: www.hupo2007.com) 

07.-10.10.07: ProkaGENOMICS 2007, Göttingen 

Info: Heike Geiling, DECHEMA e.V. (Tel.: +49-69-7564-176, 

E-Mail: geiling@dechema.de, 

Web: www.dechema.de/prokagenomics2007) 

08.-09.10.07: 4 th International Meeting Stem Cell 

Network NRW, Düsseldorf 

Info: Ira Herrmann, Kompetenznetzwerk Stammzellforschung 

NRW (Tel.: +49-211-896-4042, E-Mail: info@stammzellen. 

nrw.de, Web: www.kongress.stammzellen.nrw.de) 

08.-10.10.07: Molekularbiologische Methoden 

in der Umweltmikrobiologie, Eggenstein- 

Leopoldshafen 

Info: GDCh (Tel.: +49-69-7917-364, E-Mail: fb@gdch.de, 

Web: www.gdch.de/fortbildung) 

08.-09.10.07: Deutsche BiotechnologieTage, 

Hannover 

Info: Carola Triebsch, Deutsche Messe AG 

(Tel.: +49-511-89-31139, E-Mail: Carola.Triebsch@messe.de, 

Web: www.deutsche-biotechnologietage.de/) 

09.-11.10.07: BIOTECHNICA, Hannover 

Info: Oliver Wedekind, Deutsche Messe AG 

(Tel.: +49-511-89-321-28, E-Mail: oliver.wedekind@messe. 

de, Web: www.biotechnica.de) 

09.-10.10.07: 3. BMBF-Symposium Nanobiotechnologie, 

Hannover 

Info: (Web: www.nanobio.de/symposium2007) 

09.10.07: Scanning Probe Microscopy in Life 

Sciences , Berlin 

Info: Mandy Rückert, JPK Instruments/Charité Universitätsmedizin 

Berlin (E-Mail: workshop@jpk.com, 

Web: www.spm-workshop.jpk.com) 

09.-11.10.07: 2 nd VPM Vaccine Development Days, 

Hannover 

Info: Dr. Heiner Völk, Vakzine Projekt Management GmbH 

(Tel.: +49-511-169908-16, E-Mail: vpm-days@vakzine-manager.de, 

Web: www.vakzine-manager.de) 

09.-12.10.07: Eschericia coli – Facets of an 

versatile pathogen, Bad Staffelstein 

Info: Gabriele Blum-Oehler, Universität Würzburg (E-Mail: 

ecoli2007@mail.uni-wuerzburg.de, Web: www.ecoli2007. 

uni-wuerzburg.de) 

10.-13.10.07: 17 th Annual Meeting of the German 

Society of Cytometry, Regensburg 

Info: Angelika Graf, DGFZ (E-Mail: conference@dgfz.org, 

Web: www.dgfz.org) 

11.-13.10.07: Genetics of Aging – Jahrestreffen 

der Deutschen Genetischen Gesellschaft, Jena 

Info: (Web: www.conventus.de/genetics) 

11.-13.10.07: Molecular Biology of the 21 st 

Century: From Molecules to Systems – 

A Quantum Jump in Complexity, Berlin 

Info: Deutsche Akademie der Naturforscher Leopoldina 

(Web: www.leopoldina-halle.de) 

16.-18.10.07: GVC/DECHEMA-Jahrestagungen 

2007, Aachen 

Info: DECHEMA e.V., Frankfurt/M. 

(Tel.: +49-69-7564-152, Web: www.dechema.de) 

16.-17.10.07: GMP- und Technologiekongress, 

Freiburg i. Br. 

Info: Reinhard Schnettler, PTS 

(Tel.: +49-2932-514-77, 

E-Mail: info@pts.eu, Web: www.pts.eu) 

18.10.07: Innovative Science for Successful 

Business – 4. Partnering Day für Biomedizinische 

Forschung, Graz (A) 

Info: Dr. Heidi Schmitt, Medizinische Universität Graz 

(Tel.: +43-316-385-72018, 

E-Mail: heidi.schmitt@meduni-graz.at, 

Web: www.meduni-graz.at/partneringday) 

24.-25.10.07: Virtual Discovery, London (UK) 

Info: Karen Saunders, Select Biosciences 

(Tel.: +44-1787-315110, 

E-Mail: ksaunders@selectbiosciences.com, 

Web: www.selectbiosciences.com/conferences/rnaieurope07/) 

24.-26.10.07: 3 rd International PAT Conference, 

Heidelberg 

Info: University of Heidelberg/European Compliance Academy 

(E-Mail: info@gmp-compliance.org, 

Web: ww.pat-conference.org) 

24.-25.10.07: Symposium Energiepflanzen, Berlin 

Info: Fachagentur Nachwachsende Rohstoffe e.V. 

(E-Mail: info@fnr.de, Web: www.fnr.de/energiepflanzen2007) 

30.-31.10.07: Pharmakovigilanz 2007, Berlin 

Info: (Tel.: +49-30-209-133-12, Web: www.iqpc.com) 

30.-01.10.07: BioProduction 2007, Berlin 

Info: IIR (Tel.: +44-20-7017-7481, 

E-Mail: registrations@informa-ls.com, 

Web: www.bio-production.com/BioTop) 

02.-03.11.07: 8 th EMBL/EMBO Conference: The 

Future of our Species – Evolution, Disease and 

Sustainable Development, Heidelberg 

Info: Sylke Helbing, EMBL Heidelberg 

(E-Mail: helbing@embl.de, 

Web: www-db.embl.de/jss/EmblGroupsOrg/events_2.html ) 

05.-06.11.07: Lebensmittelwissenschaften im 

Fokus – Lipide und Lipoide – Proteine und 

Enzyme, Frankfurt am Main 

Info: German Federation of Food Science and Technology 

(Web: http://events.dechema.de/Lebensmittel) 

05.-08.11.07: Biological Mass Spectrometry 

„From Peptides to Proteins and Beyond“, Bochum 

Info: Nadine Palacios Bustamante, MPC, Ruhr-Universität 

Bochum (Tel.: +49-234-32-292-63, 

E-Mail: nadine.palaciosbustamante@rub.de, 

Web: www.medizinisches-proteom-center.de) 

05.-07.11.07: Protein Purification – Quo vadis?, 

Tutzing 

Info: DECHEMA e.V./VBU (Web: www.dechema.de/ProPur) 



BUILDING VALUE THROUGH PARTNERSHIPS 

Join the biotech elite for three days of intense networking and partnering 

BIO-EUROPE 

13TH ANNUAL INTERNATIONAL 

PARTNERING CONFERENCE 

2007 

NOVEMBER 12–14, 2007, CONGRESS CENTER, HAMBURG, GERMANY 

BIO-EUROPE 2007 brings together companies from across the biotechnology value-chain in a 

forum specifically designed to facilitate the creation of strategic partnerships. 

Producers 

Major Sponsors 

BIO Double Helix Sponsors 

BIO Helix Sponsors 

High Level Sponsors 

Contributing Sponsors 

Media Sponsors 

www.ebdgroup.com/bioeurope 

Host Sponsor 

SPONSORS OF 

2007 

BIO-EU ROPE


PreCR Repair Mix from New England Biolabs 

REPAIR A BROAD RANGE OF DNA DAMAGE PRIOR TO PCR 

Increase your chances for successful PCR with the PreCR Repair Mix. This innovative blend 

of recombinant proteins is designed to repair damaged DNA prior to its use in PCR reactions. 

All it takes is a simple 20 minute reaction to repair a wide range of DNA damage due to heat, 

low pH, oxygen, and UV light.* 

*Not recommended for highly fragmented DNA or for damage due to DNA crosslinks 

Proven Repair with the PreCR Repair Mix 

kb 

10 

3.0 

1.0 

0.5 

PreCR Treatment 

— + — + — + — + — + — + 

M A B C D E F 

A: UV exposure (λ DNA) E: hydrolysis & UV exposure (λ DNA) 

B: heat treatment (λ DNA) F: hydrolysis (λ DNA) 

C: oxidation (plasmid) M: 2-Log DNA Ladder (NEB #N3200) 

D: UV exposure (human genomic DNA) 

Ihr zuverlässiger Partner für die Molekularbiologie: 

Advantages: 

� Suitable for PCR, microarrays and other 

DNA technologies 

� Does not harm DNA template 

� Can be used in conjunction with any 

thermophilic polymerase 

� PCR can be done directly on repair reaction 

� Easy-to-use protocols included 

Product information: 

PreCR Repair Mix ........... M0309S/L 

� New England Biolabs GmbH 

Frankfurt/Main Deutschland Tel. +49/(0)69/305-23140 Fax +49/(0)69/305-23149 email: info@de.neb.com 

� New England Biolabs Inc. 

Ipswich, MA USA 1-800-NEB-LABS email: info@neb.com internet: www.neb.com 

N E W 

E N G L A N D 

B I O L A B S 

lose the damage, keep the genes. 

DNA Damage 

Cause 

Repaired by 

PreCR Repair Mix 

abasic sites hydrolysis � 

hydrolysis 

nicks nucleases � 

shearing 

thymidine 

dimers 

blocked 

3´-ends 

oxidized 

guanine 

oxidized 

pyrimidines 

deaminated 

cytosine 

UV radiation � 

multiple � 

oxidation � 

oxidation � 

hydrolysis � 

hydrolysis 

fragmentation nucleases X 

shearing 

Protein-DNA 

crosslinks 

I N T E R N E T- B E S T E L L U N G E N , N E U I G K E I T E N U N D T E C H N I S C H E I N F O R M AT I O N E N . www.neb-online.de 

Visit us in Hall 009 

Booth No. B23 

formaldehyde X 

New England Biolabs, Inc. is an ISO 9001 certified company 

the leader in enzyme technology

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