macroinvertebrati acquatici e direttiva 2000/60/ec (wfd) - IRSA - Cnr
macroinvertebrati acquatici e direttiva 2000/60/ec (wfd) - IRSA - Cnr
macroinvertebrati acquatici e direttiva 2000/60/ec (wfd) - IRSA - Cnr
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
ICMEASY 1.2: A SOFTWARE FOR THE<br />
INTERCALIBRATION COMMON METRICS AND<br />
INDEX EASY CALCULATION.<br />
USER GUIDE<br />
Andrea Buffagni 1 & Carlo Belfiore 2<br />
1<br />
CNR-<strong>IRSA</strong>, Water Research Institute, Brugherio<br />
Italy, buffagni@irsa.cnr.it<br />
2<br />
DECOS, Università della Tuscia, Viterbo Italy,<br />
c.belfiore@unitus.it<br />
SUMMARY<br />
Instructions on the use of a new software, named<br />
ICMeasy, are provided for the purpose of corr<strong>ec</strong>tly<br />
calculating Intercalibration Common Metrics (ICMs)<br />
and Indices (ICMi) for European rivers based on<br />
aquatic invertebrate information. All the<br />
Geographical Intercalibration Groups (GIGs) defined<br />
for the Water Framework Dir<strong>ec</strong>tive Intercalibration<br />
process are considered. Starting from a txt input file,<br />
the software is able to calculate ICMs and ICMi<br />
based on: invertebrate families found at a site; a<br />
quality classification of the samples (at least for<br />
those in High status or coll<strong>ec</strong>ted from Reference<br />
sites). The software always calculates a standard<br />
set of IC metrics (STAR_ICMs) and the derivative<br />
index (STAR_ICMi). In combination with<br />
STAR_ICMs and index, in formal use in the<br />
Central/Baltic, Mediterranean and Nordic GIGs, an<br />
additional set of metrics and index can be calculated<br />
according to the GIG area that samples were<br />
coll<strong>ec</strong>ted in. Mediterranean, Alpine and<br />
Eastern/Continental sets of IC metrics and IC<br />
indices, as they were finally defined for the formal IC<br />
process, can also be calculated. In addition, the<br />
software accepts data for pressures, National<br />
methods or environmental variables for dir<strong>ec</strong>t<br />
comparison with IC indices, via linear regression<br />
analysis. In the output file, single metrics and indices<br />
values are provided, together with summary<br />
information on data used and regression analysis.<br />
All the information needed to make calculations and<br />
use ICMeasy is supplied.<br />
RIASSUNTO<br />
Sono descritte le istruzioni d’uso di un nuovo<br />
software, denominato ICMeasy, al fine di consentire<br />
il calcolo corretto delle principali metriche e degli<br />
indici in uso per i <strong>macroinvertebrati</strong> <strong>acquatici</strong> dei<br />
fiumi nell’ambito del processo europeo di<br />
Intercalibrazione per la WFD i.e. Intercalibration<br />
Common Metrics (ICMs) and Indices (ICMi). Tutti i<br />
Notiziario dei Metodi Analitici<br />
101<br />
n. 1 (2007)<br />
Gruppi Geografici di Int<strong>ec</strong>alibrazione (GIGs) definiti<br />
a livello europeo sono considerati dal software.<br />
Partendo da un file di input in formato txt, il software<br />
è in grado di calcolare le ICMs e gli ICMi sulla base<br />
di: a) famiglie di invertebrati rinvenute in un sito<br />
fluviale; b) classificazione di qualità dei campioni<br />
(almeno per una parte di quelli provenienti da siti di<br />
Riferimento o considerati in Stato Elevato). Il<br />
software calcola automaticamente una lista standard<br />
di metriche dell’Intercalibrazione (STAR_ICMs) e<br />
l’indice da esse derivato (STAR_ICMi), in uso come<br />
metodo ufficiale nei GIG Centrale/Baltico,<br />
Mediterraneo e Nordico. In combinazione con le<br />
STAR_ICMs a lo STAR_ICMi, possono anche<br />
essere calcolate le metriche IC ufficiali dei GIG<br />
Alpino e Eastern/Continental e i relativi indici, in<br />
accordo con il GIG di appartenenza. Inoltre, il<br />
software è in grado di gestire dati su pressioni,<br />
metodi nazionali o relativi a variabili ambientali per<br />
effettuare un confronto diretto con gli indici<br />
dell’Intercalibrazione mediante analisi di regressione<br />
lineare. Nel file di output sono riportati i valori di<br />
ciascuna metrica singola e degli indici multimetrici,<br />
insieme ad una sintesi dell’informazione relativa ai<br />
dati analizzati ed all’analisi di regressione. Nel<br />
presente contributo sono fornite tutte le informazioni<br />
n<strong>ec</strong>essarie per effettuare i calcoli delle metriche e<br />
degli indici di Intercalibrazione e per utilizzare<br />
correttamente il software ICMeasy.<br />
INTRODUCTION AND GENERAL STRUCTURE<br />
OF THE SOFTWARE<br />
The scientific context of the Intercalibration Common<br />
Metric (ICM) approach and its general relevance to<br />
the European Water Framework Dir<strong>ec</strong>tive (WFD)<br />
Intercalibration process has been explained<br />
elsewhere (Buffagni et al., 2005; 2007; Buffagni &<br />
Furse, 2006; Furse et al., 2006a; 2006b). The need<br />
for a calculation tool able to corr<strong>ec</strong>tly compute ICMs<br />
and indices, based appropriately on the founding<br />
principles of the ICM approach (Buffagni et al., 2005;<br />
2006), is being emphasized elsewhere (Buffagni &<br />
Belfiore, in preparation). The REBECCA proj<strong>ec</strong>t<br />
(Rekolainen, 2005), the context of which ICMeasy<br />
was developed (Buffagni & Belfiore, op. cit.),<br />
focuses on defining relationships between biological<br />
elements and pressures in the context of the WFD. It<br />
also aims at providing validation for some of the<br />
scientific assumptions currently proposed in the<br />
implementation of the WFD, including the IC metrics<br />
and indices approach to describe pressure<br />
gradients. The conceptual basis of the ICMeasy<br />
software structure can be found in Buffagni &<br />
Belfiore (in preparation). In this paper, the aim is to<br />
provide end-users with the n<strong>ec</strong>essary information to<br />
corr<strong>ec</strong>tly make calculations and use ICMeasy.