Modelowanie molekularne - metody Monte Carlo

More documents

Recommendations

Info

Wprowadzenie Pola siłowe Klasyczna metoda Monte Carlo Kwantowe metody Monte Carlo Pola siłowe V = ∑ X −Y + ∑ XY 1 2 k XY (r − r 0 ) 2 + ∑ q 1 q 2 r X −Y −Z + ∑ tors A XYZW (1 − cos nω) 1 2 k XYZ (α − α 0 ) 2 + ∑ V LJ (X , Y )+ XY Dodatkowa zaleta - pole siłowe daje funkcję V (R) w postaci wzoru dla dowolnego R. Zwykle dla tego samego zagadnienia jest wiele pól siłowych - często rezultaty bardzo podobne ale nie zawsze (nawet z tej samej geometrii początkowej). Parametrów z jednego pola siłowego nie powinno się używac w innym, gdyż są one optymalizowane dla danej postaci funkcyjnej, która w innym polu może być inna.
Wprowadzenie Pola siłowe Klasyczna metoda Monte Carlo Kwantowe metody Monte Carlo Pola siłowe Funkcje i parametry w polach siłowych mogą pochodzić z eksperymentów (spektroskopia, rtg, entalpia parowania) lub obliczeń kwantowomechanicznych. Pola siłowe zjednoczonego atomu (united-atom FF) - parametry nie są dane dla każdego atomu ale grupy typu CH 3 traktuje się jako pojeyncze centrum oddziaływania. Gruboziarniste pola siłowe (coarse-grained FF) - nawet większe części molekuły traktują jako pojedynczy punkt np. w symulacji białek.
Page 1 and 2: Wprowadzenie Pola siłowe Klasyczna
Page 39: Wprowadzenie Pola siłowe Klasyczna
Page 91 and 92:
Wprowadzenie Pola siłowe Klasyczna
Page 93 and 94:
Page 95 and 96:
Page 97 and 98:
Page 99 and 100:
Page 101 and 102:
Page 103 and 104:
Page 105 and 106:
Page 107 and 108:
Page 109 and 110:
Page 111 and 112:
Page 113 and 114:
Page 115 and 116:
Page 117 and 118:
Page 119 and 120:
Page 121 and 122:
Page 123 and 124:
Page 125 and 126:
Page 127 and 128:
Page 129 and 130:
Page 131 and 132:
Page 133 and 134:
Page 135 and 136:
Page 137 and 138:
Page 139 and 140:
Page 141 and 142:
Page 143 and 144:
Page 145 and 146:
Page 147 and 148:
Page 149 and 150:
Page 151 and 152:
Page 153 and 154:
Page 155 and 156:
Page 157 and 158:
Page 159 and 160:
Page 161 and 162:
Page 163 and 164:
Page 165 and 166:
Page 167 and 168:
Page 169 and 170:
Page 171 and 172:
Page 173 and 174:
Page 175 and 176:
Page 177 and 178:
Page 179:
show all

Modelowanie molekularne - metody Monte Carlo

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

Delete template?

Save as template?