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Effekt selektiver und nicht selektiver nichtsteroidaler Antiphlogistika ...

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Material <strong>und</strong> Methoden<br />

10 x Inkubationspuffer mit MgCl 2 5 µl<br />

DNase, RNase free (10 U/µl) 1 µl<br />

RNase Inhibitor (40 U/µl) 0,5 µl<br />

RNase freies Wasser ad 50 µl<br />

Anschließend wurden die Proben im Thermocycler (Peqlab Biotechnology GmbH,<br />

Erlangen) nach einem festen Programm behandelt. Zunächst erfolgte eine<br />

20-minütige Inkubation bei 37 °C, die zu einer Aktivierung der DNase führte. Danach<br />

erfolgte eine 10-minütige Inkubation bei 75 °C, die zu einer Deaktivierung <strong>und</strong> zu<br />

einem Abbau der DNase führte. Anschließend erfolgte eine Lagerung bei 4 °C. Das<br />

Ergebnis des DNase Verdaus waren 10 µg DNA-freie RNA in 50 µl.<br />

3.4.2.4 cDNA-Synthese<br />

Die DNA-freie RNA wurde im Anschluss in cDNA (complementary DNA)<br />

umgeschrieben. Dazu wurden 6 µl DNA-freie RNA eingesetzt. Zu dieser wurden<br />

folgende Reagenzien in vorgegebener Reihenfolge pipettiert:<br />

10 x RT Gold Buffer 5 µl<br />

MgCl 2 (25 mM) 11 µl<br />

dNTP Mix (10 Mm) 10 µl<br />

RandomHexamers (50 µM) 2,5 µl<br />

RNAse Inhibitor (20 U/µl) 1 µl<br />

MultiScribe TM Reverse Transcriptase (50 U/µl) 3,125 µl<br />

Dies wurde mit RNase freiem Wasser auf ein Gesamtvolumen von 50 µl aufgefüllt.<br />

Die sich anschließende Probenbearbeitung im Thermocycler begann mit einer 10-<br />

minütigen Inkubation bei 25 °C, die der Anlagerung der Primer (RandomHexamers)<br />

an die RNA diente. Es folgte eine 60-minütige Inkubation bei 37 °C, in der die<br />

Transkription stattfand, bevor die Reverse Transkriptase während der sich<br />

anschließenden 5-minütigen Inkubation bei 95 °C abgebaut wurde.<br />

3.4.2.5 Konventionelle PCR für Cyclooxygenase-1 <strong>und</strong> -2<br />

Bei der RT-PCR wird in vitro ein genau definierter Abschnitt der DNA, bzw. cDNA mit<br />

Hilfe der DNA-Polymerase vervielfältigt. Sie wurde durchgeführt, um die Proben der<br />

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