écologie des virus influenza aviaires en Camargue - IRD

IntroductionDe nombreux facteurs favorisent, ou ont favorisé, l'émergence des maladiesinfectieuses au sein des populations humaines. Historiquement, la domestication animale està l'origine de l'augmentation de la diversité et de la gravité de maladies telles que la rougeole,les oreillons, la grippe ou encore la variole (Polgar 1964; Armelagos et al. 1991). Le contactrapproché et prolongé entre populations humaines et animales n'est cependant pas la seulesource d'émergence de maladies zoonotiques. Des facteurs aussi variés que la destructiond'habitats, le transport et commerce d'animaux de compagnie, ou les changementsclimatiques, ont un véritable effet catalyseur sur l'incidence et la répartition de nombreusesmaladies (e.g. Patz et al. 2000; Rogers & Randolph 2000; Chomel et al. 2007; Greger 2007).De manière générale, l'origine de nombreuses zoonoses émergentes est donc à relierdirectement avec les perturbations générées par l'homme sur son environnement naturel(Jones et al. 2008), à plus ou moins grande échelle.La faune sauvage et domestique est également concernée par l'émergence denombreux pathogènes (Daszak et al. 2000; Dobson & Foufopoulos 2001) et, là encore, lephénomène est à rapprocher des activités humaines et leurs impacts sur le fonctionnementnaturel des écosystèmes. Concernant la faune sauvage, l'émergence des maladies peuts'avérer particulièrement problématique en terme de conservation d'espèces protégées et demaintien de la biodiversité (e.g. May 1988; Scott 1988; Harvell et al. 2002). Chez les espècesdomestiques, l'apparition de nouveaux pathogènes peut provenir, directement ouindirectement, d'échanges avec la faune sauvage (e.g. Gortázar et al. 2007), et avoir desconséquences désastreuses en terme de santé vétérinaire et humaine, mais également de fortsimpacts économiques. L'apparition récente 5 de la forme hautement pathogène du virus H5N1montre comment une maladie émergente peut à la fois causer des épizooties rapides et degrande ampleur au sein des populations d'oiseaux domestiques, être transmise aux oiseauxsauvages et présenter un risque majeur de pandémie pour l'espèce humaine.Ainsi, malgré la répartition inégale des pathogènes responsables de ces maladies à lasurface de la planète (Guernier et al. 2004), le phénomène d'émergence est un problèmed'ordre global, qui concerne à la fois les populations d'animaux sauvages, domestiques ethumaines. Si la gestion des pathogènes semble primordiale en terme de santé publique(Morens et al. 2004) par la mise en place de réponses médicales rapides (e.g. vaccination,5 Détecté pour la première fois en 1996, en Chine.3