écologie des virus influenza aviaires en Camargue - IRD

Influenza aviaires en CamargueP < 0,001). Ce résultat est intéressant puisque à ce jour très peu de canards plongeurs ont étééchantillonnés et testés pour la présence de virus influenza aviaires. L'origine d'une tellevariation n'est pas expliquée à ce jour. Les virus subsistant principalement dans la couchesuperficielle de la colonne d'eau, les différences liées aux stratégies d'alimentation entre cesdeux genres pourraient éventuellement expliquer ce résultat.Concernant les autres espèces échantillonnées, seules deux espèces de Laridés, lamouette mélanocéphale et le goéland leucophée (respectivement Larus melanocephalus et L.michahellis) ont montré des infections aux virus influenza aviaires. Les faibles prévalencesobservées pour ces espèces (Tableau 1) sont du même ordre que celles enregistrées enEurope du Nord (Fouchier et al. 2003). Olsen et al. (2006) ont en effet estimé une prévalencemoyenne d'infection pour ces oiseaux (mouettes et goélands, i.e. Larus sp) de 1,4%. Chez cesoiseaux cependant, les virus influenza aviaires sont divisés en lignées Européenne etAméricaine, et certains sous­types (H13 et H16) semblent être restreints au genre Larus(Fouchier et al. 2005, Olsen et al. 2006).Comme les laridés, les hérons et flamants roses sont des oiseaux d'eau coloniaux. Latransmission de virus influenza aviaires est donc théoriquement possible dans cespopulations. Malgré un effort d'échantillonnage relativement important (N = 177 pour héronset aigrettes, N = 113 flamants roses) aucun oiseau ne s'est avéré positif (Article 3), suggérantun rôle limité de ces oiseaux dans l'épidémiologie de la maladie. Ce rôle limité concerneégalement les passereaux (Olsen et al. 2006), en effet, en Camargue, aucun virus n'a étédétecté sur les 1599 échantillons analysés, pendant les migrations de printemps (Article 3) etd'automne.Le détail des effectifs et espèces analysées est présenté en Annexe 4. Les résultatscorrespondant à la première saison d'échantillonnage, hivernage 2005­2006 et migration deprintemps 2006, ont été publiés respectivement dans l'Article 7 (présenté dans leChapitre III) et l'Article 3.41