écologie des virus influenza aviaires en Camargue - IRD
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Influ<strong>en</strong>za <strong>aviaires</strong> <strong>en</strong> <strong>Camargue</strong>biologiques <strong>en</strong> <strong>Camargue</strong> a débuté à l'automne 2005. Les analyses moléculaires etvirologiques on été réalisées à l'Institut Pasteur de Paris, au sein de l'unité de « GénétiqueMoléculaire <strong>des</strong> Virus Respiratoires » dirigé par Sylvie van der Werf. Ces analyses ont étéréalisées par (i) Saliha Azebi, Frédérique Cuvelier, Patricia Jeannin et Vanessa Roca(Technici<strong>en</strong>nes, Institut Pasteur), p<strong>en</strong>dant la première année; (ii) ChungMing Chang(Ingénieur, CNRS) p<strong>en</strong>dant la seconde année; (iii) Viviane Grandhomme (Ingénieur, CNRS)p<strong>en</strong>dant la troisième année. J'ai égalem<strong>en</strong>t pris part à l'analyse de ces échantillons à travers<strong>des</strong> séjours réguliers de travail à l'Institut Pasteur (14 semaines au total).2.1. Échantillonnage.L'échantillonnage <strong>des</strong> oiseaux a été réalisé à l'aide de plusieurs métho<strong>des</strong> de capture, <strong>en</strong>fonction de l'accessibilité aux individus (Annexe 3). Chaque oiseau capturé est marqué avecune bague alphanumérique du Muséum National d’Histoire Naturelle (Paris). Il est <strong>en</strong>suiteid<strong>en</strong>tifié (espèce et év<strong>en</strong>tuellem<strong>en</strong>t sousespèce), sexé et âgé (âge non déterminé, juvéniled’un an ou adulte) selon <strong>des</strong> critères de mue <strong>des</strong> plumes spécifiques. Des mesuresmorphométriques sont égalem<strong>en</strong>t réalisées: indice d’adiposité, mesure de l’aile et pesée.Pour chaque oiseau, un prélèvem<strong>en</strong>t cloacal est réalisé à l'aide d'un écouvillon (Annexe 3).P<strong>en</strong>dant la période d'hivernage <strong>des</strong> canards (septembre à décembre) nous avonségalem<strong>en</strong>t eu l'opportunité de réaliser <strong>des</strong> prélèvem<strong>en</strong>ts sur <strong>des</strong> oiseaux tués à la chasse(Annexe 3). Plusieurs propriétaires et gestionnaires de « chasses camarguaises » nous ontpermit <strong>en</strong> effet de réaliser régulièrem<strong>en</strong>t <strong>des</strong> prélèvem<strong>en</strong>ts sur un grand nombre d'individusfraîchem<strong>en</strong>t tués. Enfin, pour les mouettes, goélands et sternes, <strong>des</strong> fi<strong>en</strong>tes fraîches ont étédirectem<strong>en</strong>t récoltées au sol sur <strong>des</strong> îlots de reproduction dans <strong>des</strong> colonies monospécifiques(Annexe 3).Les prélèvem<strong>en</strong>ts ont été placés dans <strong>des</strong> tubes individuels cont<strong>en</strong>ant un milieu deconservation (Viralpack, Biolys). Il ont <strong>en</strong>suite été transportés dans une glacière réfrigéréepuis conservés à 80°C jusqu'à leur analyse.35
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