écologie des virus influenza aviaires en Camargue - IRD

Influenza aviaires en Camargue3.2. Premiers résultats.Aucun des 150 virus influenza aviaires détectés ne correspond à une forme hautementpathogène (une partie des résultats est publié dans l'Article 7). Ce résultat estparticulièrement important dans le contexte actuel de la propagation de ces virus à l'échellemondiale, et du rôle potentiel des oiseaux migrateurs. Au moment de la rédaction de cettethèse, les virus détectés sont pour la plupart des virus H5 faiblement pathogènes (40%;Figure 8). Ce résultat est très intéressant puisque les sous­types majoritaires décrit en Europesont habituellement H4, H6 et H7 (Munster et al. 2007). La forte fréquence de virus H9 estégalement à noter puisque la circulation de ce sous­type semblait jusqu'alors anecdotiquedans la faune sauvage, du moins en Europe. Afin de mettre en valeur le type d'informationsque peuvent révéler les caractéristiques génétiques de ces virus, une première étudephylogénétique a été réalisée sur un virus H9N2, détecté sur une mouette mélanocéphale auprintemps 2006. Les résultats sont détaillés dans l'Article 4.Figure 8. Fréquence des sous­types identifiés.43