écologie des virus influenza aviaires en Camargue - IRD

Influenza aviaires en Camargue1.3. Évolution virale.Afin d'échapper au système immunitaire de l'hôte, les virus influenza aviaires sontconstamment soumis à sélection de nouveaux variants antigéniques (e.g. Earn et al. 2002).Les deux principaux mécanismes génétiques permettant à ces virus de modifier lacomposition de leurs génomes sont la dérive génétique et les réassortiments viraux. Ladérive génétique est caractérisée par des changements de séquence du génome viral quipeuvent se traduire par des changements de la structure des antigènes de surface(l'hémagglutinine et la neuraminidase) liés à des mutations ponctuelles affectant lessegments viraux codant pour ces protéines. Ces mutations apparaissent fréquemment du faitde l'absence de mécanismes de réparation des segments d'ARN lors de la réplication virale.En effet, Chen & Holmes (2006) ont récemment mis en évidence des taux de substitutiontrès élevés, pour les huit segments composant le génome viral, caractéristique partagée cheztous les virus à ARN (e.g. Chao 1992 pour synthèse).Le caractère segmenté des virus influenza aviaires permet également à ces virusd'échapper aux défenses immunitaires de l'hôte par l'intermédiaire de réassortiments viraux.Ces derniers correspondent à des échanges de segments d'ARN entre deux virus différentslors de l'infection d'une même cellule hôte et représentent un moyen efficace de productionde nouvelles formes virales (sous­types ou souches). Les mécanismes permettant lacoinfection d'un oiseau hôte et favorisant l'émergence de nouveaux variants viraux ont ététrès peu étudiés (e.g. Sharp et al. 1997; Hatchette et al. 2004; Spackman et al. 2005), bienqu'un fort taux de réassortiments génétiques au sein des populations de canards sauvages aitrécemment été décrit (Dugan et al. 2008).1.4. Virus hautement pathogènes.Les virus influenza aviaires se divisent en formes faiblement et hautement pathogènes. Lesformes faiblement pathogènes provoquent une infection localisée des voies respiratoires etdigestives, causant des symptômes légers voire inexistants (Webster et al. 1992, van Gils etal. 2007). Au contraire, les formes hautement pathogènes sont la plupart du tempsresponsables d’infections généralisées, mais ont rarement été isolées chez les oiseaux33