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écologie des virus influenza aviaires en Camargue - IRD

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Chapitre I1. Activités humaines et évolution <strong>des</strong> pathogènes.Les activités humaines peuv<strong>en</strong>t <strong>en</strong>traîner <strong>des</strong> modifications de l'<strong>en</strong>vironnem<strong>en</strong>t à très largeéchelle. Tout comme les organismes libres, les pathogènes doiv<strong>en</strong>t faire face à ceschangem<strong>en</strong>ts et évoluer <strong>en</strong> conséqu<strong>en</strong>ce. A partir d'exemples issus de travaux théoriques etexpérim<strong>en</strong>taux, l'Article 1 décrit la manière dont l'homme peut, directem<strong>en</strong>t ouindirectem<strong>en</strong>t, influer l'évolution de nombreux traits d'histoire de vie <strong>des</strong> pathogènes (e.g. laspécificité <strong>en</strong> hôte, la virul<strong>en</strong>ce, le polymorphisme). Les rôles directs et indirects <strong>des</strong> facteurstels que la fragm<strong>en</strong>tation de l'habitat, la pollution, la perte de biodiversité, l'utilisation devaccins et d'antibiotiques ou <strong>en</strong>core le vieillissem<strong>en</strong>t de la population, sont discutés dans cetarticle de synthèse.Ce travail a été publié suite à une invitation de Frédéric Thomas par la revue« Molecular Ecology ». Cet article est paru dans le cadre d'un numéro spécial portant sur leschangem<strong>en</strong>ts évolutifs dans les <strong>en</strong>vironnem<strong>en</strong>ts altérés par les activités humaines(« Evolutionary change in human­altered <strong>en</strong>vironm<strong>en</strong>ts »), suite au congrès s'étant déroulé àl'Université de Californie (Los Angeles), du 8 au 10 février 2007.2. Surpeuplem<strong>en</strong>t <strong>des</strong> espaces protégés et transmission de pathogènes.Quelles sont les conséqu<strong>en</strong>ces de la gestion de la biodiversité sur les communautés deparasites, par exemple à travers la création d'espaces protégés ? Si les étu<strong>des</strong> portant sur lesinteractions <strong>en</strong>tre parasitisme et écosystèmes sont de plus <strong>en</strong> plus nombreuses, l'intégrationde ces connaissances dans les programmes de gestion de la biodiversité reste très limitée. Ilest aujourd'hui largem<strong>en</strong>t reconnu que de nombreuses pratiques de conservation (e.g.translocation d'animaux sauvages, supplém<strong>en</strong>tation <strong>en</strong> nourriture) peuv<strong>en</strong>t conduire à <strong>des</strong>problèmes parasitaires chez <strong>des</strong> espèces au statut de conservation défavorable. A partird'exemples choisis dans la littérature nous discutons, dans l'Article 2, <strong>des</strong> interactions <strong>en</strong>trela surpopulation <strong>en</strong> espèces hôtes et la dynamique <strong>des</strong> populations de parasites, l'évolution dela virul<strong>en</strong>ce ou <strong>en</strong>core les effets indirects sur la structure <strong>des</strong> communautés d'hôtesintermédiaires.10

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