DIPLOMOVÁ PRÁCE - Vysoká škola chemicko-technologická v Praze

2.3 Matrixový protein
Matrixový protein tvoří N-koncovou doménu polyproteinového prekurzoru Gag. Během maturace
virionu je odštěpen virovou proteasou a zůstává asociován s virovou membránou (MA
pochází z Membrane Associated). MA je téměř u všech retrovirů na N-konci kotranslačně
kovalentně modifikován připojením zbytku kyseliny myristové, která je zodpovědná
za interakci Gag proteinu s buněčnou membránou a za interakci MA, s fosfolipidovým obalem
virionu 25 . MA také hraje ústřední roli při transportu Gag na místo skládání kapsidy. U
M-PMV bylo prokázáno, že mutace v MA způsobí změnu morfogenese z typu D na typ C 13 .
Dále se podílí na inkorporaci komplexu SU-TM a pravděpodobně hraje roli ve směrování
preintegračního komplexu do jádra infikované buňky.
Doposud byla určena struktura nemyristoylovaných MA HIV-1, M-PMV, SIV, HTLV-II,
BLV a RSV. Přestože sekvenční homologie mezi MA různých savčích retrovirů je nízká,
jejich struktura je velmi podobná (viz. kapitola 2.3.3.).
V primární struktuře MA byly nalezeny následující oblasti:
M doména – série basických aminokyselin argininu a lysinu. Díky kladnému náboji jejich
postranních řetězců interaguje MA s fosfolipidy a spolu se zbytkem kyseliny myristové
zprostředkovávají vazbu na membránu.
CTRS sekvence – signál pro cílení polyproteinu Gag do cytoplasmy (Cytoplasmatic Targeting-Retention
Signal) se vyskytuje pouze u B/D typů retrovirů. Je zodpovědná za transport
molekul Gag na specifické místo v cytoplasmě, kde probíhá skládání kapsidy.
NLS – signál pro cílení do jádra (Nuclear Localization Signal) pravděpodobně hraje roli při
cílení preintegračního komplexu do jádra infikované buňky.
11