DIPLOMOVÁ PRÁCE - Vysoká škola chemicko-technologická v Praze

Tab V. Statistické údaje získané z programů X-PLOR NIH a Procheck charakterizující 18
nejlepších vypočtených struktur
Omezení vzdáleností a dihedrálních úhlů
Vzdálenostní omezení
Celkový počet NOE 1442
Intra-residuální 596
Inter-residuální, z toho:
sekvenční (|i-j| = 1) 494
na střední vzdálenost (|i-j| ≤ 5) 275
na dlouhou vzdálenost (|i-j| > 5) 77
Počet omezení dihedrálních úhlů
Φ 69
Ψ 69
Statistika struktury
Počet porušených parametrů průměr sm. odchylka
Vzdálenostní omezení 4,6 2,8
RDC 8,5 5,6
Odchylky od idealizované geometrie
Délka vazby (Ǻ) 0,0019 0,00096
Vazebné úhly (°) 0,41 0,04
Dihedrální úhly (°) 1,02 0,27
Odchylka od planarity 0,426 0,077
Statistiky z Ramachandranova diagramu
Nejvýhodnější oblast (%) 90,4 2,1
Dodatečná povolená oblast (%) 7,1 2,2
“Velkoryse” povolená oblast (%) 1,8 1,3
Nepovolená oblast (%) 0,68 0,68
Průměrná RMSD (Å)*
Přes všechny těžké atomy 0.7312
Přes těžké atomy páteře 1,3606
* RMSD byly vypočteny jako průměr odchylek pozic příslušných atomů všech 18 struktur a průměrné struktury
pro dobře definované oblasti (aminokyseliny 7-41 a 53-91).
52