DIPLOMOVÁ PRÁCE - Vysoká škola chemicko-technologická v Praze

0,5
0,4
0,3
0,2
0,1
0
2 12 22 32 42 52 62 72 82 92
Obr. 14 Histogram rozdílů chemických posunů amidických atomů mezi divokým typem a
mutantem T41I/T78I. Pozice mutovaných aminokyselin jsou znázorněny červeně.
Z histogramu rozdílů chemických posunů vyplývá, že k největším změnám chemického posunu
došlo v okolí mutací a v oblastech aminokyselin 26-34, 63-79 a 83-86.
4.3 Výpočet struktury
4.3.1 Odhad sekundární struktury pomocí výpočtu indexu
chemických posunů (CSI)
Po přiřazení chemických posunů bylo možno pomocí výpočtu CSI odhadnout sekundární
strukturu proteinu. V diagramu na obrázku 16 je vynesen tzv. „konsensuální“ index
chemických posunů, vycházející z chemických posunů atomů N, H N , H α a H β . Oblasti α-
helixu odpovídá index -1, oblasti extendované struktury (β-skládaného listu) odpovídá index
+1 a index 0 přísluší oblastem s neuspořádanou strukturou. Pro srovnání je na obrázku 15
index chemického posunu wt MA.
45