DIPLOMOVÁ PRÁCE - Vysoká škola chemicko-technologická v Praze

More documents

Recommendations

Info

2. Současný stav řešené problematiky 2.1 Retroviry Retroviry tvoří skupinu virů s diploidním RNA genomem tvořeným dvěma identickými kopiemi RNA. Hlavním znakem retrovirů je, že během replikace jejich genomu je RNA přepsána do DNA pomocí virem kódované RNA dependentní DNA polymerasy (reversní transkriptasa, RT) a tato DNA je poté inkorporována do genomu hostitelské buňky pomocí dalšího virového enzymu, integrasy. Dalším charakteristickým znakem retrovirů je jejich maturace mimo hostitelskou buňku. Retroviry patří do čeledi Retroviridae. Do této čeledi patří DNA a RNA viry s reversní transkriptasou. Další členění je odvozeno od struktury genomu, morfogenese virionu a způsobu tvorby kapsidy. Z hlediska struktury genomu se retroviry dělí na jednoduché a komplexní. Genom komplexních retrovirů oproti jednoduchým obsahuje geny pro různé regulační proteiny, vznikající po alternativním sestřihu m-RNA, které ovlivňují průběh infekce. Z hlediska tvorby retrovirových kapsid jsou známy dvě základní skupiny retrovirů (Obr. 1). Do první spadají retroviry typů A, B a D a vyznačuje se tím, že se nezralá virová částice skládá uvnitř buňky. Nezralé částice typů B, D a intracytoplasmatického podtypu typu A se skládají z bílkovinných prekursorů v cytoplasmě, a poté jsou transportovány k cytoplasmatické membráně. Retroviry intracysternálního podtypu typu A skládají částice podobným mechanimem jako typ C s tím rozdílem, že virus pučí do endoplasmatického retikula. Mezi nejznámější zástupce patří MMTV (Mouse Mammary Tumor Virus, typ B) a M- PMV (Mason-Pfizer Monkey Virus, typ D). Druhou skupinu tvoří typ C. U tohoto typu se nezralá virová částice skládá na cytoplazmatické membráně a současně pučí ven z buňky. Do této skupiny patří několik lidských patogenů, například HIV (Human Imunodeficiency virus) a HTLV (Human T-cells Leukemia Virus) 1 . 2
Obr. 1. Elektronmikroskopické snímky dokumentující skládání virové částice různých retrovirů, převzato z knihy 7 . A) HIV-1 jako zástupce C-typu retrovirů. Skládání i pučení probíhá na membráně, poslední snímek v řadě je zralý virion B) MMTV jako zástupce D-typu retrovirů. Skládání proběhlo v cytoplasmě, poslední snímek zralý virion s typickým excentrickým core Retroviry se dnes člení do 7 rodů (Tab. I) 2 . 3
Page 1 and 2: VYSOKÁ ŠKOLA CHEMICKO-TECHNOLOGIC
Page 3 and 4: SOUHRN Mason-Pfizerův opičí viru
Page 5 and 6: Obsah 1. Úvod.....................
Page 7: 1. Úvod HIV je dnes, vzhledem k pa
Page 11 and 12: kónický 6 , u M-PMV je válcový
Page 13 and 14: Životní cyklus viru (Obr. 3) lze
Page 15 and 16: frekvence mutací během replikace
Page 17 and 18: 2.3 Matrixový protein Matrixový p
Page 19 and 20: k stabilnímu udržení proteinu na
Page 21 and 22: nitř této domény jsou také zbyt
Page 23 and 24: Pro časnou fázi životního cyklu
Page 25 and 26: Některé mutace v MA jak u HIV-1 t
Page 27 and 28: Matrixový protein HIV-1 obsahuje 1
Page 29 and 30: 2.4.1 Významné mutace v HIV-1 MA
Page 31 and 32: Mutace L13E, K18I, R20G, R22A, L31E
Page 33 and 34: 3. Experimentální část 3.1 Mate
Page 35 and 36: Roztoky pro tricin - SDS PAGE Vzork
Page 37 and 38: Roztok IV 1 g AgNO 3 0,38 ml 37% HC
Page 39 and 40: laminární box - Clean air Woerden
Page 41 and 42: 3.2.3.1 Produkce izotopově obohace
Page 43 and 44: 3.2.9 Příprava vzorků pro NMR ex
Page 45 and 46: esiduální dipolární kaplingy by
Page 47 and 48: Dráha 4 Supernatant po lýzi Dráh
Page 49 and 50: A B Obr. 12 Srovnání HN-HSQC T41I
Page 51 and 52: 0,5 0,4 0,3 0,2 0,1 0 2 12 22 32 42
Page 53 and 54: 4.3.2 Výpočet struktury Základem
Page 55 and 56: A B Obr. 17 Porovnání 13 C-NOESY
Page 57 and 58: Obr. 19 Průměrná struktura dvoji
Page 59 and 60:
Obr. 20 Ramachandranův diagram pro
Page 61 and 62:
Obr. 21 Srovnání změřených (č
Page 63 and 64:
T41I/T78I Divoký typ Obr. 23 Srovn
Page 65 and 66:
5. Diskuze 5.1 Příprava rekombina
Page 67 and 68:
turních prvků proteinu. Z minimá
Page 69 and 70:
6. Závěr • Podařilo se připra
Page 71 and 72:
7. Literatura 1. Strnad P, Haubová
Page 73 and 74:
20. Barabas,O. et al. dUTPase and n
Page 75 and 76:
40. Nagar,B. et al. Structural Basi
Page 77 and 78:
59. Freed,E.O., Englund,G., Maldare
Page 79 and 80:
79. Gasteiger,E. et al. Protein Ide
Page 81 and 82:
8. Seznam použitých symbolů a zk
Page 83 and 84:
R55F mutant matrixového proteinu,
show all

DIPLOMOVÁ PRÁCE - Vysoká škola chemicko-technologická v Praze

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?