DIPLOMOVÁ PRÁCE - Vysoká škola chemicko-technologická v Praze

More documents

Recommendations

Info

A B Obr. 16 Porovnání H-C HSQC spekter uniformně 13 C značeného T41I/T78I mutantu (A) a T41I/T78I mutantu se selektivně 13 C značeným pouze isoleucinem (B). 48
A B Obr. 17 Porovnání 13 C-NOESY spekter uniformně 13 C značeného T41I/T78I mutantu MA (A) a T41I/T78I mutantu MA se selektivně 13 C značeným pouze isoleucinem (B). Finální běh výpočtu byl proveden se všemi získanými experimentálními omezeními, tj. s 1442 vzdálenostními omezeními, 39 vodíkovými vazbami, 69 omezeními dihedrálních úhlů a 43 RDC. Celkem bylo vypočteno 100 struktur, z nichž byl vybrán soubor 18, které nejlépe odpovídaly jak z hlediska energetických parametrů, tak měly minimální problémy s experimentálními parametry (NOE interakce….). Superpozice těchto struktur je na obrázku 18. Podle předpokladů se vypočtená struktura (Obr. 19) skládá ze čtyř α-helixů v oblastech aminokyselin 5-22, 28-44, 53-70 a 79-91, které jsou navzájem propojeny smyčkami. Ve většině struktur se vyskytuje, na rozdíl od divokého typu, krátká α-helikální otáčka mezi aminokyselinami 72-74. 49
Page 1 and 2:
VYSOKÁ ŠKOLA CHEMICKO-TECHNOLOGIC
Page 3 and 4: SOUHRN Mason-Pfizerův opičí viru
Page 5 and 6: Obsah 1. Úvod.....................
Page 7 and 8: 1. Úvod HIV je dnes, vzhledem k pa
Page 9 and 10: Obr. 1. Elektronmikroskopické sní
Page 11 and 12: kónický 6 , u M-PMV je válcový
Page 13 and 14: Životní cyklus viru (Obr. 3) lze
Page 15 and 16: frekvence mutací během replikace
Page 17 and 18: 2.3 Matrixový protein Matrixový p
Page 19 and 20: k stabilnímu udržení proteinu na
Page 21 and 22: nitř této domény jsou také zbyt
Page 23 and 24: Pro časnou fázi životního cyklu
Page 25 and 26: Některé mutace v MA jak u HIV-1 t
Page 27 and 28: Matrixový protein HIV-1 obsahuje 1
Page 29 and 30: 2.4.1 Významné mutace v HIV-1 MA
Page 31 and 32: Mutace L13E, K18I, R20G, R22A, L31E
Page 33 and 34: 3. Experimentální část 3.1 Mate
Page 35 and 36: Roztoky pro tricin - SDS PAGE Vzork
Page 37 and 38: Roztok IV 1 g AgNO 3 0,38 ml 37% HC
Page 39 and 40: laminární box - Clean air Woerden
Page 41 and 42: 3.2.3.1 Produkce izotopově obohace
Page 43 and 44: 3.2.9 Příprava vzorků pro NMR ex
Page 45 and 46: esiduální dipolární kaplingy by
Page 47 and 48: Dráha 4 Supernatant po lýzi Dráh
Page 49 and 50: A B Obr. 12 Srovnání HN-HSQC T41I
Page 51 and 52: 0,5 0,4 0,3 0,2 0,1 0 2 12 22 32 42
Page 53: 4.3.2 Výpočet struktury Základem
Page 57 and 58: Obr. 19 Průměrná struktura dvoji
Page 59 and 60: Obr. 20 Ramachandranův diagram pro
Page 61 and 62: Obr. 21 Srovnání změřených (č
Page 63 and 64: T41I/T78I Divoký typ Obr. 23 Srovn
Page 65 and 66: 5. Diskuze 5.1 Příprava rekombina
Page 67 and 68: turních prvků proteinu. Z minimá
Page 69 and 70: 6. Závěr • Podařilo se připra
Page 71 and 72: 7. Literatura 1. Strnad P, Haubová
Page 73 and 74: 20. Barabas,O. et al. dUTPase and n
Page 75 and 76: 40. Nagar,B. et al. Structural Basi
Page 77 and 78: 59. Freed,E.O., Englund,G., Maldare
Page 79 and 80: 79. Gasteiger,E. et al. Protein Ide
Page 81 and 82: 8. Seznam použitých symbolů a zk
Page 83 and 84: R55F mutant matrixového proteinu,
show all

DIPLOMOVÁ PRÁCE - Vysoká škola chemicko-technologická v Praze

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?