DIPLOMOVÁ PRÁCE - Vysoká škola chemicko-technologická v Praze

More documents

Recommendations

Info

Tab V. Statistické údaje získané z programů X-PLOR NIH a Procheck charakterizující 18 nejlepších vypočtených struktur Omezení vzdáleností a dihedrálních úhlů Vzdálenostní omezení Celkový počet NOE 1442 Intra-residuální 596 Inter-residuální, z toho: sekvenční (|i-j| = 1) 494 na střední vzdálenost (|i-j| ≤ 5) 275 na dlouhou vzdálenost (|i-j| > 5) 77 Počet omezení dihedrálních úhlů Φ 69 Ψ 69 Statistika struktury Počet porušených parametrů průměr sm. odchylka Vzdálenostní omezení 4,6 2,8 RDC 8,5 5,6 Odchylky od idealizované geometrie Délka vazby (Ǻ) 0,0019 0,00096 Vazebné úhly (°) 0,41 0,04 Dihedrální úhly (°) 1,02 0,27 Odchylka od planarity 0,426 0,077 Statistiky z Ramachandranova diagramu Nejvýhodnější oblast (%) 90,4 2,1 Dodatečná povolená oblast (%) 7,1 2,2 “Velkoryse” povolená oblast (%) 1,8 1,3 Nepovolená oblast (%) 0,68 0,68 Průměrná RMSD (Å)* Přes všechny těžké atomy 0.7312 Přes těžké atomy páteře 1,3606 * RMSD byly vypočteny jako průměr odchylek pozic příslušných atomů všech 18 struktur a průměrné struktury pro dobře definované oblasti (aminokyseliny 7-41 a 53-91). 52
Obr. 20 Ramachandranův diagram pro jednu z vypočtených struktur. 53
Page 1 and 2:
VYSOKÁ ŠKOLA CHEMICKO-TECHNOLOGIC
Page 3 and 4:
SOUHRN Mason-Pfizerův opičí viru
Page 5 and 6:
Obsah 1. Úvod.....................
Page 7 and 8: 1. Úvod HIV je dnes, vzhledem k pa
Page 9 and 10: Obr. 1. Elektronmikroskopické sní
Page 11 and 12: kónický 6 , u M-PMV je válcový
Page 13 and 14: Životní cyklus viru (Obr. 3) lze
Page 15 and 16: frekvence mutací během replikace
Page 17 and 18: 2.3 Matrixový protein Matrixový p
Page 19 and 20: k stabilnímu udržení proteinu na
Page 21 and 22: nitř této domény jsou také zbyt
Page 23 and 24: Pro časnou fázi životního cyklu
Page 25 and 26: Některé mutace v MA jak u HIV-1 t
Page 27 and 28: Matrixový protein HIV-1 obsahuje 1
Page 29 and 30: 2.4.1 Významné mutace v HIV-1 MA
Page 31 and 32: Mutace L13E, K18I, R20G, R22A, L31E
Page 33 and 34: 3. Experimentální část 3.1 Mate
Page 35 and 36: Roztoky pro tricin - SDS PAGE Vzork
Page 37 and 38: Roztok IV 1 g AgNO 3 0,38 ml 37% HC
Page 39 and 40: laminární box - Clean air Woerden
Page 41 and 42: 3.2.3.1 Produkce izotopově obohace
Page 43 and 44: 3.2.9 Příprava vzorků pro NMR ex
Page 45 and 46: esiduální dipolární kaplingy by
Page 47 and 48: Dráha 4 Supernatant po lýzi Dráh
Page 49 and 50: A B Obr. 12 Srovnání HN-HSQC T41I
Page 51 and 52: 0,5 0,4 0,3 0,2 0,1 0 2 12 22 32 42
Page 53 and 54: 4.3.2 Výpočet struktury Základem
Page 55 and 56: A B Obr. 17 Porovnání 13 C-NOESY
Page 57: Obr. 19 Průměrná struktura dvoji
Page 61 and 62: Obr. 21 Srovnání změřených (č
Page 63 and 64: T41I/T78I Divoký typ Obr. 23 Srovn
Page 65 and 66: 5. Diskuze 5.1 Příprava rekombina
Page 67 and 68: turních prvků proteinu. Z minimá
Page 69 and 70: 6. Závěr • Podařilo se připra
Page 71 and 72: 7. Literatura 1. Strnad P, Haubová
Page 73 and 74: 20. Barabas,O. et al. dUTPase and n
Page 75 and 76: 40. Nagar,B. et al. Structural Basi
Page 77 and 78: 59. Freed,E.O., Englund,G., Maldare
Page 79 and 80: 79. Gasteiger,E. et al. Protein Ide
Page 81 and 82: 8. Seznam použitých symbolů a zk
Page 83 and 84: R55F mutant matrixového proteinu,
show all

DIPLOMOVÁ PRÁCE - Vysoká škola chemicko-technologická v Praze

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

Delete template?

Save as template?